EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-38231 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr6:109638270-109641630 
Target genes
Number: 8             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 3             
IDChromosomePositionGenome Version
rs4945829chr6109638828hg19
rs77243579chr6109640864hg19
rs4946957chr6109641411hg19
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr6:109641530-109641541TAATCTAATCA+6.32
EWSR1-FLI1MA0149.1chr6:109640987-109641005CTCTCCCTCCTTCATTCC-6.04
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr6:109638314-109638329TGACCTTTTACCCTT-6.11
Nr2f6MA0677.1chr6:109638314-109638328TGACCTTTTACCCT-6.21
Nr5a2MA0505.1chr6:109638896-109638911TCTGACCTTGACCCT-6.16
Nr5a2MA0505.1chr6:109638948-109638963AGGGTCAAGGTCAGG+6.55
RARAMA0729.1chr6:109638311-109638329AAATGACCTTTTACCCTT-6.18
RxraMA0512.2chr6:109638314-109638328TGACCTTTTACCCT-6.13
ZNF263MA0528.1chr6:109640979-109641000TTCTCTCCCTCTCCCTCCTTC-8.31
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
SE_23447chr6:109638522-109640900Colon_Crypt_1
SE_23447chr6:109640914-109641588Colon_Crypt_1
SE_49848chr6:109637605-109641746RPMI-8402
SE_51064chr6:109638206-109640912Sigmoid_Colon
SE_53197chr6:109638523-109641544Small_Intestine
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr6109639185109640141
chr6109640399109640498
chr6109641314109641561
chr6109639600109640200
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH06I109316chr6109637782109641789
Enhancer Sequence
AAAAACCAAA ACATCGGTGC GATGCCCGGA AAATGATATA AAAATGACCT TTTACCCTTG 60
ACCCTGTGCA ATGAAAGGGC AAGCCTCTCC CCAGCTGGGT GTCTCTAAAT GCCACCAGAG 120
AGCTGAGTGT GGTTGAGCTC TAGTTACAGA ACCTGCAACA AGACACAAAG CCCTTTGGTA 180
TATTTCTTTC CCTGTACAAA GGCTTTTTTA AACAAATGGA AAACATAGTT TCACTTCAGT 240
TTCAACTCTA CTGATTAACT CATAACTGAA ATAAAGTTGA AATGAAGGGA AACCTAAAGC 300
CTTTCTTATT TGTAACATAT ATAAGTTATG ATATGTCAAA TTTGTATATT TAGGGTATGA 360
AGGCAATCAG AATGGTTCCT TCCATCTGAG GTCCAAACTT GGGGCCACTT CACGGGCATG 420
TGACACACAG GATGCAGAGG GGCACTTGAG ATTTCATGTT CTGTGATCAC CATCCTGAAA 480
CTTTTAATGG TTTACCTTTG AATTTGTTCA AAGTTACAAT TCTAGGTACC TAAAGTGGGC 540
AGGAGGCTTA CCCTTCCTGA GCTACCCATT GAACGCATGG TGTTGCTGCC AGCCTGGGAC 600
CCCTGAGATG CTGCCGGGTG CACACGTCTG ACCTTGACCC TCCCTGTACC CAGAGGGGAC 660
GGGGACCTTG GCACAGGGAG GGTCAAGGTC AGGCGTGTGC ACCTGGCAGC ATCTCAGGGG 720
TCTTAGGCTG GCAGCACCAC CATGTGTTCA ATGGGTAGCT CAGTGAGGGC AAGCCTCCTG 780
CCCACCTTGG GTACCTAGAG TCTCTCAGGA CAGAGGTTGC AGTACTCTTG GGGGTTGCCT 840
TTCCACAGTG GATTGGGGTG GTGGGAAGGG GAGATGCCTG ACTCAACTTC TCATCCCCAG 900
GCAGGGCCCG GTGCCTCAGT CTGGTAGCTG GCGGGTCATG CGTATTCATG CACTGAGACA 960
CAGGCAGGGC CACTGGGTGC TTATGGGGGT CTCACTTCCC CTGCACATAT TCCCATGACC 1020
AAGAGAGCGC AACGTTAAAA GCAAATTAAA AACACCATGA CAGGTCAAGG GAGAGACTGC 1080
AGAAGAAAGG GAAAAGGTTT ATCTCTTAAT GTCGGTGTGA CACTTTTTCC TGCTTTTTAA 1140
ACAAGAGGTC CTACATTTTT ATCTTGCGCC AGGCCCCTGC GTTATGTAGC TAGTCCTGTC 1200
TGAACTATAA TATCTATTCC TAACTTTGAA TATTCTGTAG GAAATTCATA ACCTTTGAGC 1260
TAGGGAGGAG TTGTCTGACT ACGAACTTAA ATTAGGTTTT GCTTTTGAGA CAAAGTCCAC 1320
AGACATTGTA GTGTTAATTA ATAACCTCTG TCCTCACCTA AGACATAGTC GTTTTATTAG 1380
TGCTTCGAGT AACCGAATTC TGTAAACAGG GCCCTGTGCA ATGAAAGCGC GAGCCTCTCC 1440
CCAGCTGGGC GTCTCTAATG CCACCAGAGA GCTGAGTGTG GTTGAGCTCT AGTTACAGAA 1500
CATTCAACAA GACACAAAGC GCCTGTTGTT TGTGCTGTGT TTGCTGCATC CAGGCGGCTC 1560
CCTTCCGAGT CCTTGGAGAA AATCCACAAG CCTGCATCAG GTGCAGCCAT CTGCACATGT 1620
TGGGGCCGTG GTTCCTATGA GACACCTGGG GTGAGGGGCT GTGGGGAAGC ATCTTTGCTC 1680
TGTGGTTGTG CTGCCTTGCA TAGGGTGCCT GTCAGCTGTG CTTGCAAAGG GCCTTCAATG 1740
CAGTGGGGGG CAGGCAGAGG GGAGGGGTAG AGTTATTTTT AACAGTGGCT AGGTTGATAT 1800
TACCAAGCCT CACTTTGGCT GGAGTGTGCT GGCCAGTTCT AAACTCTTGT TTGATTCTAT 1860
ACTTATAAGA CTTTTAAACT CCATGCCAAT GTCAAAGGGG AAGGGTTGTT GTTTCTGGTT 1920
CTATTTTGTT TTGTTCTTTG GTCTGTCAGG CATGACTCAG TGTGGAGACC TGGATCTCCA 1980
CCTCTACTGA GTTCTCCTAA TTCAAGCGAT TGAGTCCTTA CTGTGTGCCA AGGTGCTTTG 2040
GTATACATTT ATTCAGTGTC ATCTTCCTGA GACCTCTGTG GGCTTGGTAC CTTCAAAGAA 2100
GGCAATAACA TATTGGAATC CCCACCTACC TACTATTTAT CTTGGCAGCA AGAAGTAGCC 2160
ATAGTGGCCA GGGCTTCCAA GCAAGGGCTG CCTCTTCATG CAGAGATCAC CCTTTGTAGT 2220
CAAGATTAGC TTGGGGCTGG AGGTTTTTCC AGAGGAAGTT AGGAATGGAG AGTATTGAGA 2280
ACCAGGGGGA CAGCAAAAGC CCTTATCCTT TTCCTCAGGG TCTTCTCCTT CCCTATGGGC 2340
TGACTGACTC TGGTGTTTAC ATTTACAACT GCCAAAAAGA AACCCTGAGC CAGGTATGGT 2400
GGCTCACTCC TGGAGCCCAA AGGCACTCTG GGAGGCCGAG GCAGGCGGAT CACTTGAGCT 2460
CAGGAATTTG AGACCAGCCT GAGCAACATG GTAAAACCCC AACTCTACAA AAAATGGAAA 2520
AAAAATTAGC TGGGTGTGGC GGTGCACACC TGTAGTCCCA GCTACTCAGG ATGCTGAGGT 2580
GGGAGGATCG CTTACGCCTA GGATGTCGAG GCTGCAGTGA GCCAAGATCG TGCCACTGCA 2640
CTCCAGCCTG AGTGACAGAG TGAGACTCTG TATCAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAGGAACC 2700
CTGGAATACT TCTCTCCCTC TCCCTCCTTC ATTCCCCCTC ACCTTGTCTT GGAGCTTGAT 2760
CATACAGCTT CTGAATGAGT TTCCGGTTTG TCATTGAGCC TCTGAGGATG TGGCATCCAG 2820
ACCTGGCCCT TGTATTAGGT CTCGGTAGCT GAACTAGTAG TCCCCTGAAA ACTATCTAAA 2880
GTTGATCCAG ACATCTTTGT TCAGCCCCGG GGCTTATCTT AGCAGAAATG GCCCCGTTGG 2940
TTCACAAAGA TTCTGCCATC CCTCATCTTT GATGTTTTGG CATTGAAGTG ATTTTTAATT 3000
GATTTTCTAA TTTTCTCTGG GTAGTTATAA GGCCAACAGT CTCCAAAGTG GAATGCATAT 3060
ATCCCAGGGG TGTGGGAAGA AAATATGAGA ACTTCTAAAT AGATTAGAGC CATATGTAAG 3120
GAGTCACATG CCACACTCTA CACTGAGGTG TCCTGAAGTG ACCATGGGCA GGCAATCCAC 3180
AAGTAATGAG AAAATAGTCG AGGTGACACT GTAATCCTAG TGCATGCTTA TCCTCAGCCA 3240
CATTCTGAGG TCATAAAAGA TAATCTAATC ATGTCTGATA AGAAGACAGA CAATAAATTT 3300
TTCTTTTTTT CTTTTTTTTT TTAAAGATAC GATCTCATGC TGCCACCCAG GCTGGAGTTC 3360