EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-35582 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr5:130615990-130618850 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CEBPAMA0102.3chr5:130616314-130616325ATTGCACAATA+6.62
Foxq1MA0040.1chr5:130618042-130618053AATAAACAATA-6.62
Sox6MA0515.1chr5:130616219-130616229AAAACAATGG-6.02
Stat6MA0520.1chr5:130617919-130617934CATTTCCTGAGAAAT+9.03
Number of super-enhancer constituents: 21             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09774chr5:130616028-130618399CD14
SE_10907chr5:130605580-130619556CD20
SE_11934chr5:130615136-130618507CD3
SE_14764chr5:130616166-130618475CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15535chr5:130616363-130618583CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16387chr5:130617021-130618606CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16993chr5:130615878-130618458CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17464chr5:130612734-130622371CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17920chr5:130614934-130620122CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18240chr5:130612834-130622392CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19533chr5:130616286-130618352CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20276chr5:130613026-130618492CD56
SE_21079chr5:130616631-130618358CD8_Memory_7pool
SE_22038chr5:130614986-130618574CD8_Naive_8pool
SE_22359chr5:130612697-130618644CD8_primiary
SE_32702chr5:130614433-130618666GM12878
SE_53074chr5:130616664-130617774Small_Intestine
SE_53074chr5:130617913-130618450Small_Intestine
SE_59034chr5:130583453-130625223Ly3
SE_60881chr5:130587342-130617526DHL6
SE_62294chr5:130585648-130632637Tonsil
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH05I131283chr5130618751130619877
GH05I131277chr5130613181130618720
Enhancer Sequence
CACCCTAAAA TATAATAACT AGTCAGTGGT CATGTTTTGA TGAACATCCT TCCAGATACC 60
TCAATATGAA TATATGTTTT TTCACAAAAT CTTACATAGA CTCTGACATT TCACTTTAAC 120
GAATATTATC ATAAAAGTAT TACTTTTTAT TACTTCAGTT TGAAAGGGTC ATATTGGAAA 180
GTGAAAATTC TGTTTGACGA GGATAAAGCT GTAGGTAAAG TTGTGATTAA AAACAATGGT 240
GTTTATAGAG AGTAGAATGT GGTAAGTCAA CTGGAGAAAA GAATTACTTT CAGCAGTAAT 300
TTTTTTCTTA AGAGCCCTCT TACCATTGCA CAATAGCCTG ATTGTTTTAT ACTAGCTGAT 360
GAAAACCATT CAGGATTCTA TGTACAGCAG AATTATTTTA ATAATAGCCC TAGGGTAAAA 420
TATGAGCCTG TAGATAAGTT TATATTTTTT AGTCTGTCCA AGTCCGACTG ATCCTTTAAT 480
AGTAAAATAA TTTTGGAAGA AAACTGTGTT TTATTGAAGG CCTTCATCTA TCTGTAGTAT 540
GACAATTTTA TTAGATATTG CTACCCTTTT TATGTGTGAG AATGAGGAGT GAAATAGTTC 600
TTGGAAAAAT TTTAGCATGT AAGAATTCTT ATGTTAATGT TTCCTTTGAT TTTTGTTTTA 660
TGAATGTGAA AAATCCTTGT GGAAGAATTG CTCATATATA TTGGTATATT GCATTCTTTG 720
GAAATCACCA GTTCCAAATT TGTCAAGTGG TTGTTTGGGT CGTTAAATAG CAATTGTAAA 780
AGCAAATCAA AGATCCTTTA AGGATTTTTC CTTGATCACA GTGATATCCA TTACCTGGGG 840
TAGAGTAGAC CGCTGATGTC TTGCCTTCAT TTTTATTGTT CTTAACCTCG TCCTTTCTGT 900
GTTGTATCAC TGCTTGCTCA CAAGCTCCTC CAGTCTTTTT CTCTTCAGTA GCTTTTTCTC 960
TTACCCCCTT GTGCTACTTC CTGAATGGTG TATATGTTGC TGAAAACATT TCTCATGTGG 1020
TAAAGAAGAG TAAAGAGCAA TGTAGTTGAT GTGGCCTTTT CTACTGAGAA ATGATGCATT 1080
TGTGGTCTAC AGAAGAGACT TGACAGCCCC TAAAGAAGTG TTTTTTATCT ACATTACATG 1140
TTTGTGAGTG GATATGCAAG TGCCTCTGTT GGAAGGTAAA GTGAATCTTG AAACAAATTC 1200
TAGAAAAGTG TTTAGAATTA TTCCATACAT TTTGCTGTTG AAAAAATAGT ATTTAAAGAA 1260
AGTTTCATCT CACAGTGAAT TTTTAGCCTC CTCTTTTAAG ATTTATTTTG TGAACAGTGA 1320
CCTTGTTTTT GTAAACTCTA CTCTGAAGAA GTTTAGAAAT TAGTCACACA GTAAGTGGCA 1380
GAACAAGTAT TCAAAGTCTT GCCTGATTTT CCATAGTCAT TTAGCTTGGA AAGCATTGTA 1440
AAGTGGCAGA AAGAATATGG ACTTTGAAAT TTAGACACAC CTCGATTTGA TCTCTAACTT 1500
TGCTGCATAT TTGCTGCGTG GCAAGTTCTT ACCGTTGGTG ATTTTCATTT TCCTTTTCAG 1560
TTAAGTGAGA GTAATACATT TGTTAGGATT AAATGAAGTA ATGCACATAA AGCATTTGGC 1620
TTGTAGAATA AGATGTTAAT AAATGTTTAA TTTCCTTTCA ACAATACCAT ATCGTTTTAA 1680
AATGTCTTGG GAGCCACTTG GACATTTCAC TTGAAAGTTA AGTGCCATCA GGAAACTAGA 1740
AACATGTATA ACCCAGGTAG TGATCTTTCA GGGAAATTTT AATTTCCCTG TCTAAGGAGG 1800
AGAGTAGTTT TTCGGACTGT TTTAAAAATA TGTGACTTAA AGGAAAGTTT TAAGGTTAAA 1860
AGCTGAAATA GAACTGAGTT AGGATGAGTT AATTATTGCT GACCAAAATT GTAAGAAAGT 1920
CCATTTCTAC ATTTCCTGAG AAATCGAAAC ATTTGTGTTA TATACATAGA GAAGTCACTT 1980
TTAAAGGCTA AGAACTGACC ATTTGAAAAG TTTATGATTA AGATATGGGG AGAAAGTGTT 2040
CATTTTTAAA GTAATAAACA ATAGCAAGTT TCTCTTATCA GATTTAAGGT TTAAGGAATG 2100
GTGCTTGTTC AGACCTGAGT ACAGTGATGA CACAGGTACT AAATATGTTG TTGGAGGTAG 2160
TATAAATCTG GAACCTGTTT CAAAAGCGCT TTGGCATATT TGTGTGTATT TCCACTTCTG 2220
AGAGATTATT CTAAGGAAGT AACCTTTTTT TTTCTTCTTT GGGGGGAGAG GAGGTTATTT 2280
TCCTTCCTTA ATGACACCCT AATTGAGATA ATTCACATAA AAAATCACCT TTTTAAAATT 2340
ATTATTATTG AGATGGAATC TTGCTCTGTC ACCTAGGCTG GAGTGCAGTG GCGCGATCTC 2400
GGCTCACTGC AAGCTCCGCC TCCCGGGTTC ATGCCATTCT CCTGCCTCAG CCTCCCGAGT 2460
AGCTGGGACT ACAGGTGCCC GCCACCATGC CTGGCTAATG TTTTTGTATT TTTAGTAGAG 2520
ACGGGGTTTC ACCATATTAG CCAGGATGGT CTTGATCTCC TGACCTCGTG ATGCGCCTGC 2580
CTTGGCCTCC CAAAGTCCTG GGATTACAAG TGTGAGCCAC TGCACCTGGC CCTTTTTTTT 2640
TTTTTTTAAG ATGGAGGTTC ACTCTTGTTG CCCAGGCTGG AGTGCAGTGG TGCAGTCTCG 2700
GCTCACCGCA GCCTCCACCT CCCGGGTTCA AGCGATTCTC CTGCCTCAGC CTCCCGAGTA 2760
GATGGGATTA CAGGCATGTG CCACCATGCC TGGCTAATTT TGTATTTTTA GTAGAGATGG 2820
GGTTTCTCCA TGTTGTTCAG GCTGGTCTCG AACTCCTGAC 2860