EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-34536 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr5:52104570-52107960 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr5:52104970-52104988TCTTCCTGCCTTTCTTCT-6.37
IRF1MA0050.2chr5:52105330-52105351CTTTACTTTTTTTTTTTTTTT+6.01
MEF2CMA0497.1chr5:52106183-52106198TTCTATTTTTATATT-6.58
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00277chr5:52105540-52107075Adipose_Nuclei
SE_25796chr5:52092176-52108174Duodenum_Smooth_Muscle
SE_39238chr5:52105493-52106729IMR90
SE_45492chr5:52105662-52106662NHLF
SE_53714chr5:52104987-52106665Spleen
SE_53714chr5:52106966-52107749Spleen
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 7             
ChromosomeStartEnd
chr55210527052105316
chr55210589752106086
chr55210695252107234
chr55210697152107441
chr55210486252104922
chr55210561152106109
chr55210632952106582
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH05I052809chr55210503652107833
Enhancer Sequence
GTACATGGCT CTGAATCACT TAAAATCATA AGAGGTTAAA GCTGTAAGGA ACTTTATATA 60
TCATCGGACC TAGTTCCTTC ATGTTACAGA TTTAAGCCAG CCCAGAGAGG GTTGGTAACT 120
TGCTCAAACA CAATAGGAGT TTTTCACAGG GTCCACATTC CTGTTTGATA TATCTGATTC 180
CAATGTCACC TACTTTTTGT CACCTATTCA TATTGAGTCA TTTGGGGTAG AGGAACAAGG 240
AACAATGCAG GATTCAAAAA TGCCTTAAAC CCTCCTTATT TATCAAATTA TCATCTTGTG 300
GCAAGGCAGT TTTTCTCTGA GCAGCATTGC TGAGACTCAA ACTCAGTTTT GAAGTCTTGT 360
TCATTCCTTG GAGGAGTATT TATATTTCCC TATAGGGAAC TCTTCCTGCC TTTCTTCTTC 420
TGAGAACCAT TTCATTTTTC TGAAAATCAT GTACTAAGTA CCTACTATGT GACAGGGACT 480
CTAATAGCCC CCAGTGATCA GAAGTAAAGA AAGATCACAG TCTCTTCCTT GCAAAAAAAC 540
ACAGTCTACA ATGGGGAACG AATGGTAAAG CAGTAGTAAT AGCAGTGCAA TCTGGCACAG 600
GAACATGGGA GCTCAGAGGG CTAACTCAGC CTGGCTTTAG TGAGGAGGTA TTCCCAGAGT 660
TTAAACTGGC AAGTTCCAGA AGCCCACACT GATCTTCCAT TAGTTTCTAG AGAGATCAGG 720
TGAAGGGACC TGAGATTATT CCTCTTTTAA GGCCTCTCAA CTTTACTTTT TTTTTTTTTT 780
TTTTTGGAGA CAAGAGTCTT GCTCTATACC CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC CTGATCTTGG 840
CTCACTGCCC CTCTGCCTCC TGGGTTCAAG CAATTCTCGT GCCTCACCCT CCCCAGTAGC 900
TGGGGATTAC AGGTGCGTGC CACCACACCC AGCTAATTGT CATATTTTTA GTAGAGACGG 960
GGTTTCACCA TGTTGGCCAG GTTGGTCTCA AACTCCTGAC CTCAAGTGAT CTGCCCATCT 1020
TGTCCTCCCC AAGTGGGATT ACAGGCGTGA GTCACTGCAC CTGGCCTCAA CTTCACTTTG 1080
GTAATATTTT TCTTCTACAG AGTGGTCTCT GTAATCCCTG ATCTCTCTAA ATGTTAAATA 1140
TTTACTGTGG AGTCAACAAA CCTGAGAGGA GACATCATGG AGAAGGAGAT TCCATTACCT 1200
CCTACCCTCA TAAGAAAATG AAAATCAAAT ACAGACCAGG GACCATGACT GAAAGGACTC 1260
TGAAAGATTG TGGAACCTTT GTATAATAGT ATCCATGTTT TTGTTGTCTC CTCTGCATTT 1320
CTTACATGAC TAAGCACTGA CTGGTTAAAC CAGAAAAGGA AGCTTAGCTT CTTTCGTTTT 1380
TAGGACAGCA AAGATGGGGA TGGTGACAGG GGAGTTTGAG ACATTCTGTC CCTTTCCATA 1440
GCCATTCCTG GAAGAAAGAA TGTCCAGGAT TAACTGGTTG GTGGCACAGC CACCTCAGGG 1500
AAAGGGAAAC TGACCCCTGG GGACTGAAGT CAGGAATAAA GAAGTGACAA GGAGCTAGCT 1560
GGGGCCTGGG GAAGGCCCTG GGGCTGGACA CTAGAAAGAC CCACCGGGGT CTTTTCTATT 1620
TTTATATTCA ACATTTTATC TTTCGTTGTA AAACTCAGGA AAACACCTTT AACAAACAAA 1680
AATAACTTCT CTCTTAAGTT GTTCATTTTA CTAAATGGCC AACATGGATT GGATATGGTA 1740
GAAGGAAAGA ACATTTTCTG CAGAAGGGAG AAAAAAACCA CAATCTATTT TATGAGGAGG 1800
AATGAACTCT GGGAATAGTT CTCTGACCCT TTGTGTGTCA GTGTGTTCTC AGCCTGAACT 1860
GGAAGAAAAT GGGATAGCAT GTGGAATGTG GGAAAGTGCG AAGACTGATG CAAAATTCAC 1920
TATCTGCCTC ATTAAATACA CTAGTAGGTT TTCAAGAGAA TGAGTCTGTT ATCACCACAG 1980
TAAATTTCTC ACTCTGGGCC TAACTCCTTA TCTAAAACTT AATAGAGCTT AATAAGTTCA 2040
AATTTTTCCT GTCTTTCTGG GAATCATTTT CACCTTTATC TCTGATCCTG TACTTTCCCT 2100
AGGTCAGAGT AAAATATAAT GGGAAACGGG CAAGTAGGTA GGAAATGTGG AGAAGGTCAA 2160
GGCCTTTTTA TAATGGTTCA TTGTAAATTT AAAATTCTTA GATATGTATT TCATACAGAT 2220
TCACATATGT TCTTCTGGAT GAATTAGAAA TTTTAATTGT GAGGATCAAT AAAGTAGCGC 2280
AACCAGCTTT CACATCTGTA TGAAATTTAG GACTTTGCAA AGGATGTTGC ACACCAAAAA 2340
TTACAAAATA ATTCAACGAT TATTTGCTAC AGTTACCAAA GATTATAATA TTAACATTTG 2400
CAAGAACATT GCATTTGTGA ATAACCAAGT ATGATACAAG GAAGAAATCA TCCATGTCAT 2460
TCTCAGAGGA TATGGTGTAA GAACTGGCCC ATGACTCATG ACACCAGGCC CTGCCACTAG 2520
GTTGTGTGAC TTGAGGAAAT AATTTCATCT TTTTGAGAGT TGGTTTCTTC ATCTGCAGAA 2580
TGAGCAAAGA AGGGTGGCTC TTGACTTCAT AATCTCTCTT GCAGATATCT GATTCTACTT 2640
GGTGCAGTAA CAATAATTGC TTGTTATTTT TGCGATCATG TCTTTCCAGT AAAATAAATC 2700
TTTAGTGACT CTCAGGTTTA AAAAGAATCT TTTTTGCACC CTATTTTAAA AGCTGCCAGA 2760
TTTGGGGTTT GGCTGACTAC TAAGGAGAGC AGCCTGCTAG AAGGAGCAAA TTCCAGAGCT 2820
GAGGGTCATT TATTTGGAAT GCTTTGCCAA ACACTCCCCT ATTTTTAAAG TTGTTGGGGG 2880
ACTTTAAACT TGAATATAGG GTGGTAGGAC AATTGTTTGA ACCACTCTGT AAATACGTGC 2940
ATGAAAATCT TGAGGTTTAC AAATATTTTT TAATAGTTTG CCACATTTCA ATGGCATGTC 3000
AAGTTGCAGG GTCCTGCCAC TTTTCTTCTT GTTATTTTCC TCTTCTATCA ACTTTGCTCA 3060
CTCTCCCAAA GAAATAGGCA ATGAGAAAAA ACAGGTCTTA ATTTTTACTG GAATGCTCTT 3120
TCCATTTGGC TAGAGGTTTC TCAAACCAGG CGGCACCAAT CACCTAGGGA GTTTTAAAAT 3180
CATGGTGATG CCTGAGCCCT ACCTCAACTA AGTCAGAATA TTTGGGAAAG GAGCCCAGGC 3240
ATCTGTACAT TTTAAAAGCT CCTCAGGTGC TTCTTATCTG CAGCCAGGTT AAACCAGGAG 3300
TGTCATCACT GAGTAGGACT ATTAGCTTTA ATGTGTCCTG TGACCACAAT ACCAATCAGC 3360
TCTCTGGTTA AGAAAAGAGA TGAACATAGA 3390