EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-30129 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr3:99724560-99727840 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr3:99726034-99726045TTTTATTGCTT-6.32
EsrraMA0592.2chr3:99726489-99726500TTCAAGGTCAA+6.14
FOXA1MA0148.4chr3:99725643-99725659GCCAAAGTAAACAAGC+6
Foxa2MA0047.2chr3:99725644-99725656CCAAAGTAAACA-6.74
POU6F1MA0628.1chr3:99727725-99727735ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:99727725-99727735ATTAATTAAT-6.02
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr39972544099725726
chr39972457099724720
chr39972465399725165
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH03I100005chr39972444599725044
GH03I100006chr39972544499726045
GH03I100007chr39972680799727073
Enhancer Sequence
TTAGCAGTCA TAATAAACAC ACTTGGTTAT GAGGAAGAGT GTTGTGAATT CAGAAAGTTT 60
GTGTGTTTTG TGGAATTTCT ATTATTGCCC AAGAGAGGAA AGAACTGAAA GGAGAGAACT 120
TGGAAGAAGC TTTCTTTGGC TTCCAAGATC CTAATCCTCC AAAATGCAGC TGCTTGCTAC 180
CCACCATCTC TTTGCCACAG ACCAGCTGTG TCCCCATTCA TTCCCACCTC CGCTATTGCT 240
TTTTCAATCC ACACATGCCA GAACCAGAAT GGAGAATGGT AGAGAAGGGA AAGGTAGTTT 300
GATAGGAAGT GGGATAGAAG TTTTATAGAA AAGAGGTTTC TGGAAAGCCC TAAAGCATTA 360
GACCAGAAAG CCCTTAGCCG TAGACCTCTG GGTAAAATTT GTTGCAGTTA TAAAACTCTG 420
TGGGATGCAG GTAGGTATAC TGGTGGTTTC TGGGGGCTGG GGCAGTAAGA CAGGCTGACC 480
CCATTAAGAT AACCTCAGAA ACTAACCCAA ACTGTTTTCC CCAGCCCTCA ACTGATCTTT 540
GGCTCTTATT TAAATTTTGT TTTTGTTGTC TTTGAATTGT TTCCTTTGTA CAAGTCATTT 600
CCCTAAATAA TCTCCAGATT TCTTCATGAG TGGAATAGTT AGGTACTTCC TTTGAATACC 660
TTTGCCAACA GCCTTTTTTC CTCCTTCCCC ATAATTATCA TAACTATTAC CCACAAATGG 720
ATAAATTTGG TTCCTATCTT TCAGTGCTTT TCATGAGGTT ATCATCTATA ATTTTCTGCC 780
CCAAAGTCTC CTTTTAAAAA AAGTATTTTT TCTATATAGT CATGAAGGCT ATCATTCAAA 840
TCCCAGAAGT TGTAGTTTTA CCCTTTTTGT TTAGTACTGT TAAAACTCAG CTTTGGAATG 900
ATGAGAATTC AGCTCATTTA TCTTACATCT TTTCTTTCCA AAAAAAAAAA AAAATTCCAG 960
CTTGGGTTGC ACTCAGCCCT TAGCATAGTG ACTCCCAGAG TTTGCTAGTT AAGTTAGGAA 1020
ATTAAAAGTA AGAGCTTACT CTGTTTTGAA TCAGATAAGT AAATTAATAA TTGCGGCATG 1080
TCAGCCAAAG TAAACAAGCA TTCTTGATGG GTAGAACTGT GCATTGTCTT AAGCTATTTG 1140
ATTACTAAAC CACTGCAAGC TTTTAAAATT GAACTATCTC TAATATGCAT TGAGAAGGAT 1200
AAAAAATAAC TTGTTTTAAA AAGTGTTTTT GTTTGGTTTT GTTCTGTATA TTCTTTGTCC 1260
AAAACTTGAG CATATTCATC TTTATAAATC TTTCATTACT TACTGGCTTT CTTAGTGCCT 1320
TAGCTGGTAT TTTCCACATG AGGTTTACAC CATCTTGTGG CCTACAGTTT TCTGACTCGC 1380
TTTTTCTTGC ATCCTTGGCA TTCATTAGCC TATTGGTAAA TGTTTGAAAT GGGAAGAAAA 1440
GGAGAAATCA CCTGTCATTT TCTGCTCTTA AGGCTTTTAT TGCTTTTTCT ATTTTCTCTT 1500
CATGACCATG AAAGTAAATG GTTTGAGTCT CTCAGACATA CTCTTTTTAG CTTTTATTTT 1560
TTGAGATGAA AATATCTTAT TTCCTGAAAT TTTTATTTGA CTAGAAAACT AGTCCATGTA 1620
GAGGAGAGCT TTGATGATGT GTCTGCCCAC AAAACAGATT TTTGCCATGG CTCGCTAATG 1680
CATTTTGTGT GAAATATCAA ATTTTGGAAA CCTTGCTTGT ATATCTCCCA CCACAGAAAA 1740
AAATGAGAAG ATGAAATGAG AGAAATCAAA TCATGAAAGA TGCAAAAGTC TAGTCAGCAG 1800
AAACAGTAAG AGATCCGTTA TGTAATGAAG AAGAGAGTCA GGGACAAAAC CAACTCTCAG 1860
TTATGTGACT GAGGCACAGA GAGGCCCAGA ATTGGCCCAG AAAGTGTACA GATTTTGCTC 1920
TAATTGCATT TCAAGGTCAA CCTTTAAATT GCCTTAAACC AAAAAAGTGT GTCACTGATG 1980
GAAGCTACAG TATCGTGTAG GCAAAATGGG CCTTGTTGCT TTGACTGCCA CTGTTACCAA 2040
TTGTGATATA GTACTGATAG AAAAAATATA TTAGTTATCT AGTGGTAACA GGGAATTGGC 2100
CACTGCCAGC CACTGAGGGA GTACAGACAG GTGTCTATTG GTGTCTGTTA GTGAACAGAT 2160
TCTTATAGTC TCTCACCCAC TGGGTAATGC ATTGCATATA GTTACTAGTT TTTAAAATAG 2220
TTAACTCCTA ATTTTCTTGC AAATTTGGAA ACTGAGGGCT CCCTGGGAAT TATAGGTTAT 2280
GGTTGTTTTC CCCAGCACAA CCTTGCCTGG GACCTGTACA CAAAGTGTTT CCCTCCTCCA 2340
AGTTGACATA ACATTTTCCA CCTTCCTAAT GTTTTTACTA ACATAATTAC AATAAATTGC 2400
TGCTGCTGTT GGAGACATTC TCTTTTCTCA CATCTGGGTT TAAAGCTTTC AGTAAGGCTA 2460
CTAAGCAGTG GGAAGGAAGG AGCCTTTCCA TAACTTTAAG GTCATTCCTG ATAAAGGTAA 2520
CTACTCCACC CCTGCTTCCC AATTAGATTC CCTGCCAGCA ATAGCATAGA CTTGAACCAG 2580
TGCCAAATGT TTTAATACCA TAAGGACTTG CTTGATAAAG GCTATGCAAG GCAAAGAAAA 2640
AAAGCAGCCA AAGTTCCCCA AACTAAAATT TTCCAAGATT TTCATATGAG TTGCAGCCAG 2700
GGTACCCTTC ATATAAGTGT TACCATGTGT TTGCTGTAGT CATTGGTATC CTGCAATTCT 2760
CATTCTCCAG GACTTCTAGA GATTAGAATT TAGAGGAAGT GCTGGTGATG TCAAGATGGA 2820
AATCTACTCT AGCTGCAAAG AATATAGTCT TTGACAAAAA GAAGGACAAT AGCAAAGACA 2880
GGGAACAATG GTGGGGTTAA TACTATGATC TTTCCAAATA ATTATTAAGT AATTATAAGT 2940
CTATTGCACA GCAACATTCA GCATTGTACT TCATTGTACC ATTAATGTTT GCATATGTTT 3000
GCTAGCCTTG CTTCTCTTAC TGTTATAAAC TCTAGACTAG GAGGAGTATT GTCTTGCTCT 3060
GGCCCTTGTA TTTTGCGTGC AGAAATAGCA TAATGTCATC AATAAACAGT TGTTGGTCAT 3120
CTGACTAGAT GCAGCAAAGT GATTTTATTC CTGGGCATGG GTGGGATTAA TTAATAATTA 3180
CAAAGTGCCT ACATAGTTCA GAAACTTGGA ACACCTATAA ATATAGGAAA GAAACTTTTT 3240
TCTGTTTGAC ATTGATTTTC AGATTTCATA TGCAACGATA 3280