EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-29868 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr3:58023690-58028920 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs1623879chr358027197hg19
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:58023743-58023755GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:58023747-58023759GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:58023751-58023763GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:58023755-58023767GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:58023759-58023771GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:58028617-58028629GAATGTTTGTTT+7.22
IRF1MA0050.2chr3:58026946-58026967TTTTGCTTTCAGTATCACTTT+6.7
KLF4MA0039.3chr3:58025590-58025601GCAGGGTGTGG-6.62
Lhx3MA0135.1chr3:58024312-58024325AGTTAATTAATTT-6.74
MEOX2MA0706.1chr3:58025001-58025011GTTAATTACT-6.02
NFAT5MA0606.1chr3:58024970-58024980AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr3:58024970-58024980AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr3:58024970-58024980AATGGAAAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:58027242-58027262CTCCCCACCAACCACCACCA+6.33
RREB1MA0073.1chr3:58027246-58027266CCACCAACCACCACCACCAC+7.32
Number of super-enhancer constituents: 17             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00762chr3:58026357-58028180Adipose_Nuclei
SE_23194chr3:58026684-58027587Colon_Crypt_1
SE_27681chr3:58025564-58026354Fetal_Intestine
SE_27681chr3:58026398-58027802Fetal_Intestine
SE_29426chr3:58025684-58027847Fetal_Intestine_Large
SE_30574chr3:58026442-58027846Fetal_Muscle
SE_36024chr3:58026477-58028276HMEC
SE_37989chr3:58024154-58025648HUVEC
SE_37989chr3:58025669-58040227HUVEC
SE_41579chr3:58024365-58024891LNCaP
SE_41579chr3:58024913-58026383LNCaP
SE_41579chr3:58026680-58028166LNCaP
SE_45969chr3:58026358-58032250Osteoblasts
SE_47269chr3:58019885-58040171Panc1
SE_56289chr3:58026661-58028194u87
SE_64106chr3:58026703-58027892HSMM
SE_65730chr3:58025436-58027838Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr35802500058026400
chr35802660058028894
chr35802446758025000
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I058034chr35802017558032048
Enhancer Sequence
CTAAATTCTT GAAAAGTTTT TTGAAGACTT TGAGCCTGAG GCCTGTTCTT ATTGTTTGTT 60
TGTTTGTTTG TTTGTTTGTT TTTATGACAG AGTTTCGCTC TTGTTGCCCA GGCTAGAGTG 120
CAATGGCATG ATCTCGGCTC ATTGCAGCAT TTGCCTCCTG TGTTCAAGCG ATTCTCCTGC 180
CTCAGCCTCC CGAGTAGCTG GGATTACAGG TGCCCGCCAC CATGCCCAGC TAATTTTTGT 240
ATTTTAGTAG AGATGGGTTT TTGCCATGTT GGCCAGGCTG GTCTCGAACT CCTGACCTCA 300
GGTGATCCAC CTGCCTTGGC CTCCCAAAGT GTGGGGATTA CAGGCGTGAG CCACCATGCT 360
CGGCCTGTTC TTATTGTTAA AAAGAGAGAT TTGTGTGAAA GCTGCTGACG TCTTTTTGGC 420
ACCAAGTCAA GACTGAGTTA GTTCTTGTCA GAATCTGATT GTTTGTGAAT TGATGGCTTT 480
TTTTTTTTTC CTGAGTTGGG GGTCTCGCTC TGTTGCCCAG GCTGGAGTAC GACCACTATA 540
ACCTCAAATT GCTGGGCTCA AGCAATCCTT CCGCCTCAGC TGCCCAAGTA GCTGGGACTA 600
CTAGGCATGC TCCACCATGC CCAGTTAATT AATTTTTTTT TTTTTTTGAG AGACAGGGTC 660
TCACTATGTT CCCCAGGCTG GTCTCAAATT CCTGGCCTCA AGTGATCTCC TGCCTCAGCC 720
TCCCAAAGCT CTGGGATTAC AGGAGCGAGC CACTGTGCCT GGCCGGATTT TAAAGTTCTG 780
CCCATGCACC TCCTTAGCTC TGGCAGTTAC TACTTGCAGG CATCTCCTTT GTCTGCCCTG 840
CCCCTTGTTA GGAAAGGCTG TGCTGACTGT CAGCTGGCAC CCAGTGCATA GAAGAGATAG 900
TTCTCTGTAG ATGATGTTGA ACAATGTGGT ACTATAATCC CAACCTGTTG TATCTTTGTT 960
TACTCTCAAA AGCAACAATT GGGCTGGGCA TGGTGGCTCA TGCCTGTAAT CGCAGCACTT 1020
TGGGAGGCTA AGGTGGGAGG GTTGCTTGAA GTTAGTTCCT TTTTTTTTTT TTTTTTAAAA 1080
AAAAGACAAG ATCTCGCTCT GTCACCCCGG CTGGAATGCA GTGGCATGAT CATAGCTCAC 1140
TGCAGCCTTG ACCACGTGGG CTCAAGGAAT GAACCATTGT GCCAGGAGTT CAACACCAGC 1200
CTGGATAACA TAGCGAGACC CTGTCTCTAC AGGAAAAAAA AAAAAAAAGA AGAATTGCAT 1260
AAGTATCATC AGAACTGTTG AATGGAAAAT CAGACTTTGT GGGTTTGGTT TGTTAATTAC 1320
TTCTCGTTGG ATTAGAATTT GATAGGTAAA AAAAAAAAAA AAGGTGTAGA AAAGTGATTC 1380
CAGTCTTGAG CAAATTTTTA ATGGAAAACG GTGTCTTGGT TCTCTGTTCA CTACAACTTG 1440
TATCTAAGGG AAAGCCTAGT GATGCAGACA TTTCATTTCG TGATGGGAAA ACTGATGCCC 1500
AGAGGTTCAC AGCTGACCAG GGGCTAGTCT GACTGGGGGG ATCTAGGTCA CCACCCCCCT 1560
TGCCTTGTTT TCCCAGCTAG TGCATTTCCT ACTAGACTTG ACTCTACTGT AATTCAAGTT 1620
GCTGAGTAGC AAACAAGAAC TACAATGACT AGAAGGAACA GAACTAGCTT TTTTGTGCTC 1680
TGAAAGTGGA AACTTATTGA GGGTTCTTTT CCTCCCAGAG AATGCAGAAG TGCCCTGATT 1740
TGCTTTTGGA AGGACACCAT TCACTTTATT GCCTCTTTTC ATTGTTGCCC AGAATATCAC 1800
CATGATTTAT TCATGGGTGG TGGGGAGGGT AGCACTAGTG TATGCTCCCA GCAAAGAGGA 1860
ACATCTCACG TTGTGAAGAG ATGCGCAAAA CTAAGCCAGG GCAGGGTGTG GTGGCTCATG 1920
CCTGTAATCC CAGCACTTTG GGAAGCTGAG GTGGGCAGAT CACCTGAGGT CAAGAGTTGA 1980
AGACCACCCT GGCCAACATG GTGAAACTCT GTCTGTACTA AAAATACAAA AATTAGCTGG 2040
GTCTGATTGC AGGTGCCTCT AATTGCAGCT ACTTGGGAGG CTGAGGCAGG AGAATTTCTT 2100
GAACCTGGGA GGCAGAGGTT GCAGTGAGCT GAGACTGTGC CGTTGTACTC TAGCCTGGGC 2160
AACAAGAGCC ATCTCAAAAA AAGAAGCAAG CCAGATCTTT GGGGTGCTGT GACGGCAAAT 2220
CCCCCAGCGC TGGCCTCTCA GGTTCTCTTG CGGGATTAGT GTTTGTTGAA TAATAAGCAA 2280
TACACCCTGA CCCAGCGAGC CAAAGCAAAC AGGACAGTAA CTGAAACTGC AGGGGAGTGT 2340
GAGTAAACAG TTACCTTCTA CCCTCATGGA GCTGGCCTCT GGCCAGCAAC ATGATAGCTG 2400
TTTGCATCTT ACTCTTATGG AGCCATTGGC CCTCTCATTA AGGTGGGGGC AGCTTCTGGT 2460
CCATGCCTGC AAGTCCTCAT GGGAGTGGGT ACCTGACAGG GTGTAAAGGG TAGGTCTGAG 2520
GACATGGTTT CTTTTTTTTA TTGTTGTTGA GATGGAATCC TGCTCTTGTC ACACAGTCTG 2580
GAGTGCAGTG GCCTGATCTC GGCTCACTGC AACCTCCGTC TCACTGGTTC AAGCGATTCT 2640
CCTGCCTAAG CCTCCTGAGT AGCTGGGACT ATAGGCGCAT CCTGCCATGC CTGGCTAAGT 2700
TTTGTATTTT TAGTAGAGAC GGGGTTTCAC CACGTTGGCC AGGCTGGTCT CGAACTCCTG 2760
ACCTCAGGTG ATCCACCCAC CTCAGCCTCC CAAAGTGCTG GGATTACAGG CGTGAGCCAC 2820
CGTCCCCAGC CAACATGGTT TCTTTAAAAT ATACTCCCCG CTCCATCCCA TTCATGTGTG 2880
GGAGTTGAGC TGCATCTGGG TTTTTCTTTT CTCTTTTTCT GTAAATCTTT ATTGTATTTT 2940
TTTTGGATCA TAGAATGGAT ACATGTTTCT TAAAGTTTGA TCATTATAGA AACTTAATTA 3000
GACTATTATT TGAGTGCTAA CCATAGTGAG TGAGTGCTTA CTGTGTGCTA GGTGGCTTTT 3060
TATGCCTCAT GTCACTTACA TGAGGTCTGA GGAACGGTGT TAATCCCGTT TTGCAGCTGA 3120
GGAAACTGAG GCTACATTTA CGGTCACCTA GCTGGCAAGC AAGTGGCTGA GCCTGGAGCA 3180
GCAGCAGATC TGGGGAACTC CACAAACCAG ATTTCTGTGT GGTATCCCTG TGGACACAAG 3240
GATTTAACTT GATTCTTTTT GCTTTCAGTA TCACTTTATG ATATTACAAT GAGCTTGCAG 3300
TATTTATTTT CAGAAGAAAA GCCAGATTAT TCCCATTTAT GAGAGAAGCA GCCAGGTGGG 3360
CAGGGATTTC CAGCGCTGAA CCAGCCAGTG TGTGCATTGT CTCTTCCCGC TGAGCGGCCC 3420
TGGTGTGCTG GGTTAGTCTG TGAGCCACAG GAAATGTTGT CAGGGCCTCT GGGCTTTTGG 3480
ATGTCAGCAG GCCTTCAGTG GTGAGGAGGT TGTGGCTGGA CTCAGAGGAC TCCTTGCTTT 3540
TGCTGAACGA CCCTCCCCAC CAACCACCAC CACCACCACC AGTGGGACTA GCCCATGAGC 3600
TGTAAGCCAA CCTTTTCCTT CCTAACTTAA TTTTCCAAAG AATAGTAACT TACCCACCAC 3660
CACTGCAGTC ACTGGGCCGG GAAGACAAGC ACTCTTGCCT TGAATCCATG CCTTGAGCCA 3720
GTAGCCTTGA CCCAGGGTAA AGCAGTTATG TGCTTGGGTC ACCTGGGTCA TGTTTTTGAA 3780
ATTGCCTCAA GCCTACCTTA CAAATCCTTC CTGGAACCCT GCTTGGCTTT TCTTTGTGGG 3840
CTTCCCTTAG GAGGGAAGCT TCCCGAGCAG CTTGTCTTGA CTGTAGCCAG CTGGGTGGTC 3900
CCAGCCACAG AATTTAACTG TCAAACAGCA CCAGAAGGGT TCCTCATCCA GCTGTCTTGC 3960
CCCAAGTGCC CTCTTTGCTT TCTTTTTAGA GAGTTCTGAG ACTCATTAGA GAGTTTAGAG 4020
ATTTTAGCAT TCTTGAAGTT CTTTCTGTGG TCAGTTTGGT GAACCACTTC ATTTCTAAAG 4080
TTTCTCAGTT GACCCCATTC TTCCCCAGCT TTGCATTCTC CATGAAGCCA CCTGTGTTTG 4140
GTGTGTATGG GTTTTCTGCA ACCTAGGTTG AACAAGTCCT CTAGAATCCT GAACAATTGG 4200
TGATTCATGC TGGCCTGGTT TTTCTAATTG GCCTGGAAAT GTGGCTGTAG TGGACACAAG 4260
TGGACTTGGC CTCCTCTTTG ATGCGGGTAA ACTTTAGATT TGCATTAGCT CTGTTTGATT 4320
AGAGGATCTT ACTGGTTTTT GTTGTTATTT ATTTACCTTT TAGGAGCTTT AGTCTCTGTA 4380
GGTTTTTTTT TTTTTTTTTT TAAAGTCCGG GTCTTACTCT GTCACCCAGG CTAGGGTGCA 4440
GTGGCATGAT CACAGCTCAC TGCAGCCCCC ACCTTCCTGG GCTCAGGTGA TCCTGCCACC 4500
TTAGTTTCCT GAGTAGCTGG GACTACAGGC ATGTGCCACC ATGCCCAGCA AATTTATTTC 4560
TACTTTTTGA AAACAGGGTC TCACTTTGTC ACCCAGGCCA GAATGCAGTA GCACGATCAT 4620
GGCTCACTGC AGTCTCAACC TCCCAGGCTT AAGGGATTCT CCCACCTCAG CCTCCCAAGT 4680
AGCTGGGAGG CTACTTGGCA TGCATCACAA GGCCCAGCTA ATTTGTGTTT TTTCTTGTAG 4740
AGGCGGGGTT TTGCCATGTT GCCCAGGCTG GTCTCGAACT CCTGGGGTCA AGTTATACTC 4800
TCTCCTTTGC CTCCAGCCAT GAGCCGTTCG TTGCGCCTGG GCTAGTCATT ATAGATTTAT 4860
CCCTTCTTTC ATCTCATGCT ACAAAAGCAG TTCTTGTATT TTTACCCGAC TTGTGATTTT 4920
CTACTGGGAA TGTTTGTTTG TGATGGTTAG CAGGGTGCTG AGAGGGAATT AATCCCAGGA 4980
GGCCCAATAT TGGGCCATGT CGTGCTGTTG AGCACAGTCA TTTGACACCT ATAACTTCTC 5040
ATCAATTCTT CTGATAGACT GAGGAGGAAT TGGGAAATTT CCTAGAGTTT TGTCTGCATT 5100
ATTGGGTTGT TTTGAGAACA TAAACCTTAA ACTCTAGCTA TGTAAACTGG ATAAGTCATT 5160
TTGGTAATTT GGCATTCCTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TGAGACAGAG TTTCACTCTG 5220
TTGCCCGGGG 5230