EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-28721 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr22:29217420-29219980 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr22:29218261-29218273GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr22:29218265-29218277GTTTGTTTGTTT+6.32
GFI1MA0038.2chr22:29218614-29218626TGCAGTGATTTT-6.11
ZNF263MA0528.1chr22:29218582-29218603TTTTCCTTCTCCTTCTCCTCT-7.15
Number of super-enhancer constituents: 27             
IDCoordinateTissue/cell
SE_13369chr22:29218532-29220102CD34_Primary_RO01536
SE_14087chr22:29218571-29219697CD34_Primary_RO01549
SE_14873chr22:29218340-29220196CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18901chr22:29218464-29220036CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19461chr22:29218813-29219666CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_21193chr22:29218725-29219761CD8_Memory_7pool
SE_23503chr22:29216824-29217924Colon_Crypt_1
SE_23503chr22:29218482-29218939Colon_Crypt_1
SE_23503chr22:29219047-29219903Colon_Crypt_1
SE_25378chr22:29203596-29221521DND41
SE_28436chr22:29218500-29219878Fetal_Intestine
SE_29251chr22:29218848-29219910Fetal_Intestine_Large
SE_31018chr22:29216756-29221331Fetal_Thymus
SE_31638chr22:29213521-29220117Gastric
SE_33938chr22:29217571-29220537HCC1954
SE_35317chr22:29218400-29219910HepG2
SE_43412chr22:29216782-29219958MCF-7
SE_43527chr22:29212224-29222080MM1S
SE_50644chr22:29216767-29219958Sigmoid_Colon
SE_52811chr22:29216768-29218293Small_Intestine
SE_52811chr22:29218440-29219724Small_Intestine
SE_55644chr22:29217457-29218303Thymus
SE_55644chr22:29218481-29220015Thymus
SE_62966chr22:29186510-29220159Tonsil
SE_66754chr22:29218445-29218868Jurkat
SE_66754chr22:29219009-29219860Jurkat
SE_67157chr22:29212224-29222080MM1S
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr222921888529219640
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH22I028807chr222920322129221297
Enhancer Sequence
TGTGATCATG GCTCACTGCA GCCTCCACCT CTCAGGCTCA TATGATCCTC CTGCCTCAGC 60
CTCCCAAGTA GCTGGGACAA CAGACATGTA CCACCATGCC CAGCTAATAG GGACTGTATC 120
TTATGTATGA ACCTTTGTAA CTCTCAAGCC ACTTGATAGC CCTCAGTAAC TATTATTGGC 180
CAAATTTGTC CTTTTTGGCA GAGCACCTGG CAGGGACTCA GTACATCCCT AATCAGTTGC 240
TCATCTGAGG CACAGAAAGG TTAAAAGTGA TGCAGCCAGG ACCTGCTGGC AAATCCCCAT 300
GGCTCCAGCA CCAGGCCTGT CTGGCTCCTG AACCTCTGAC CTACTGCTGC TCATCCATAT 360
CTATCTCCTG AGACCTCGAG ACATGAATCC ACCTTGGGTA ACCTGTAAAG ACTTATTTGC 420
CTAAAACCTG CCCAGGAGTC TTAATGTCCC CATCCCGTTT TAATAGATGA ACACTTTGCT 480
TTTGGAAACT TTCTGTTCCT TGGATATTGA TGGTCATATT GCTTCTGGAA TCATTACAGT 540
GTGCCTTCAG CCAAAAGCAG AACTGGAAAC ATCCTAAGTG GGCCGGTAAC GAGGCTAGCT 600
CTGTCGACTA GTTCAAGACC CCTGAGCGCT TTGGGCCTGA GGTTCCTCAG CTTCCAAGTG 660
AAAGGCTTCG ACTTGGCATT CTAAGAGACA ATCTCTGTGA CCATCAGTTT CCTCATCTGT 720
AAAACTGGCA TCATGATAAC TTTGAAGGTA ATTGTGAAGA TTAAAGGGAG TCATGCATGT 780
AAACCACCTT GCATAGTCCC TTGTGGGAGT TCTTGGTTTT TTGTTTTTTT GGGGTTTTTT 840
GGTTTGTTTG TTTGTTTTGA AACAGAGTCT TGCTCTGTCG CCCAGACTGG AGTGCAGTGG 900
TGCAATCTCG GCTCACTGCA GCCTCCACCT CCCTGATTCA AATGATTCTT GCACCTCAGC 960
CTCCCGAGTA GCTGGGATTA CAGGCGCCTG CCACCATGCC CAGCTAATTT TTGTATTTTT 1020
AGTAGAGACA GAGTTTCGCC CTGTTGGCCA GGCTGGTCTC AAACTCCTGG CCTCAAGTGA 1080
TCCACCTGCC TCGGCCTCAC AAAGTGCTAG GATTACAGGT GTAAGTCACC TTGCCCGCCC 1140
GGGAGTTCAT TTATTAGCTT GTTTTTCCTT CTCCTTCTCC TCTTAAGTCT AAACTGCAGT 1200
GATTTTATGA TTCCACTTTT CGAGTCAGTG CCCCAGATGG TTTGCTCATT CATTCATTCA 1260
CCCCAAAAAA TGTTTATTGT TCACCTACTA TGTGGCAAGC ATCACACTAG GTACTGGGTG 1320
CTAAGCATAT GGTGGTGGGC AAGAACCTCT CTAGAAAACA TCAGAAATTG TCCAGCAATC 1380
CCCAGCAATG CAAAGAAAGA CACAGCAAAA AAATGCATGA TCAAATGCAT CCAGAAGTCT 1440
GAAATTATAA CTTTTATAAT TGTTTCAAGT GAATTCTGAG TAGATGCTAC TTAGCAGGTG 1500
GCCACAGTTC TCCCCAGTAG CTGCTGTTCC ACTTAAGACA CCTGCTGCTG TTTCCAGGAT 1560
GCTAACATTT ACTTTGGTCT TTATGTCAAT GTCATTTGCA GAGAGAGCCA GCTGTGTGGC 1620
TTTTTCTCTT TCAACATTGC CACTGAATTG TGCTTTGTTG ACAGAAATTA AACACTGCTC 1680
ACGTAGATAG CATCAGGGCA GCCTTCAAGA CTGGTTTGAA CAGGAACCTT CTGCCCAAGA 1740
TGAAGAGTAG ACTCTATCTT GGGGTTAGGA ATGTTTTCCT TCTTTGTGGC TTGATCATCT 1800
GGCCAAATTT TACTTTACCT AGTGCTGCTT TTGTTCCCCT GGCTTTCCTT CCTTGGAGCC 1860
CTTTTAAAAT AATCCTTCTC TGCTTGTGGG ATTTTACCAG ACAGTAAAGA ACTGATGAAC 1920
CATAAAAAGA AAAGGTTAGA CAGACAGCAG ATTAGTGGTT GCCAGGTGCT GGGGGTGGGG 1980
AGAATGCTGA GTGCTTCACA GGAATGAGGA CTCCTTTGCG GGTAATGAAA ATGTTTTGGA 2040
ACTAGACAGA AGTGGTGGTT GTGCCGAATT GCAAATGTAC TAAATGCCAC CGAATTTTTC 2100
ACTTTACAAC AATTTCTTTT ATGTTACATG CATTTCCCCT TAGTTACACA CACACACACA 2160
CACACACACA CACTCACACA AACTAAACTA AACTAAACTA ATTATATTAA ATGAGAGAAG 2220
CCAGGTACAA GAGTACAATC TATAAGCCTA GGTATATGAG GTTTGAGAAC AGGCTAGAGT 2280
ACACTATGGT GATAGAAATT AGAACAGTGG GACGGGTGTA GTGGCTCACA CCTGTAATCC 2340
CAGCACTTTG GGAGGCCAAG GCGGGTGGAT AACCTGAGGT CAAGAGTTTG ACACTAGCCT 2400
GGCCAACACA GTGAAACAGT GTTCTCTACT AAAAATAACA AAAATTAGCT GGGCGTGGTG 2460
GTGTGCGCCT ATAGTCCCAG CTACTCAGGG GGCTGAGGCA GGAGAATCAC TTGAACCCGG 2520
GAGACAGAGG TTGCAGTGAC CCGAGATCAC ATCACTGTAC 2560