EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-27107 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr20:33898610-33902490 
Target genes
Number: 38             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs4911486chr2033901449hg19
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF5MA0599.1chr20:33899414-33899424GCCCCGCCCC+6.02
Lhx3MA0135.1chr20:33899281-33899294ATTTAATTAATTT-6.07
MAFKMA0496.2chr20:33899426-33899445ACTTGCTGAGTCAGAATCT-6.02
MAFKMA0496.2chr20:33899426-33899445ACTTGCTGAGTCAGAATCT+6.4
NFAT5MA0606.1chr20:33899269-33899279ATTTTCCATT+6.02
NFATC1MA0624.1chr20:33899269-33899279ATTTTCCATT+6.02
NFATC3MA0625.1chr20:33899269-33899279ATTTTCCATT+6.02
YY1MA0095.2chr20:33899362-33899374CAAAATGGCTGC+6.52
ZfxMA0146.2chr20:33900939-33900953GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02275chr20:33898668-33901023Astrocytes
SE_36174chr20:33898711-33901136HMEC
SE_44275chr20:33899328-33901022NHDF-Ad
SE_44275chr20:33901927-33903499NHDF-Ad
SE_44962chr20:33898643-33901548NHLF
SE_45807chr20:33898571-33901706Osteoblasts
SE_45807chr20:33901892-33904692Osteoblasts
SE_51781chr20:33898758-33900913Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_55706chr20:33898658-33904602u87
SE_63567chr20:33898744-33900927HSMM
SE_64842chr20:33898710-33901046NHEK
SE_67595chr20:33898658-33904602u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr203389936133899545
chr203390017733900484
chr203389933933899479
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I035310chr203389870833901718
Enhancer Sequence
TCAGCCTCCC GAGTAGCTGG GACTACAGGC GCCCACCACC ATGCCGGGCT AATTTTTTTT 60
TTTTTTTTTT TCAGTAGAGA CGGGGTTTCA CCATGTTGGT CAGGCTGGTC TCGAACTCTT 120
GGCCTCGTGA TCTATCCACC TCGGCCTCCC AAAGTGCTGG GATTACAGGC GTGAGCCACT 180
GTGCCTGGCC AGCTGCAGAT TATTCTAAGC AAGAGAAAAT ATTCAAAATA TTTACAGAGG 240
GAGTGCCTAC AAGGTACACC AGGCCCTGAA CCAGACCCTA AAGCTGACCA AGACTCAGCT 300
ACTGCCCTCA ACCCCTCATT GTTAGGTAGA GTCTCAGTCA GGCACAGCAT GTCTATAGGG 360
CAGTAAGGCA AACGGCCTAA GAGAGAGCAC AAGAAATATA AAGGCAGATA GGGCACATAG 420
CAATGGCAAC AGTTCACAGA AGGCCTGGAA GTTCAGGGAG CAATTTGGAC CTAATGTCAC 480
AGAAAACAGG GAGGTTCCCA AAGCGTCCAG GGAGGGGGAA CAATCCAAGC AAGATTCTAG 540
GAAAAGGTTG CTGTAGAACA GCGCTGTCCA ATAGAACTTT TTGTGACTAT GGAACTGTTC 600
TGTATCTGCA CTGTCCAAGA TGGTAGTCAC ATATAGTAAC TGAGTACCTG AGGATCTGAA 660
TTTTCCATTT TATTTAATTA ATTTAAATTA AAATAGCTGC ATGTGTTTAG TATCAAATAG 720
CTCTAGCACC TTGTGACTCC AAGTGTGGTC TGCAAAATGG CTGCACCCCC ATCACGTGCA 780
GCTGTTAGCA ATGCAGAATC TCAGGCCCCG CCCCAGACTT GCTGAGTCAG AATCTGAATT 840
GTACCTAGGT CCTCTAGGTG ACTCACATGC ACATTAAAAT ACAGGAAAAA CTTCTAGAAT 900
TGCACATTAA AATCACCTGG GAACTTTTAC AACTACAGAT GTCCACCTCC ACCAATTAAA 960
TCAGAATCTT TGGGGGACAG GGCCCAGACA CTGATATTTC TAAAAAGTGT CCCAGGTAAT 1020
TAGTATATTT CCCCAAAATT TCCTGCTCTT AAAAGTCACC TTCGGGTGAC TTGTTGAACC 1080
ACCAGGCAGC ACTCCTACTG AATTGTAATC TTCAGAGAGG TGATAAAGAT TTAGATTTTA 1140
AAAGCACCCC AGGTGACTCC TGTGGTCAGG CACAGTTGGG TAAAATGGCT CTGCCAGAAT 1200
GGACTGGATG GGGGACCGGA AACAAACACA ATTCGGTACA TTTTTATTAA TACTGATGAA 1260
AGGATCGACT GAGCCAATAG AGCCACCTGC AATAAAGACC ATAAACAAAG GCTCACAGAG 1320
AGGTGTAGTT CTTCACTCCT AAGCCTCATC CTTTTCTATA TTGTAAGGCT TCTACAATTA 1380
CAATTCGTCC ACTTTTATAA TTGATATGTA CACTTGAGCA ATAATTCTCA ATTCCCAACC 1440
CATAACCCCC GAAAGCTCAT GTTAAGTTAA TGATGTGTAT AGTATGCAAT GTAAATGCTC 1500
CCTTGTAATT CAGGATATCC AGTAGAATAG GAATCAGGAG ACCCTATTTT AACAAAAGTT 1560
AAGAAACTGA ACTCCAGTTT CTTAACTTTT GTCCTTTTAT GCATTTCTCA CTCTTTGACT 1620
ACCACATGCC AAGCACTATG CCAGGCCACA GAAATGCAAA CACAGTAGGC ATTGCACTAC 1680
CCAAAAAGAA ATCCCCACCC AGCCAAGGTG ACAGATAATG TGAATGTAGT AAGCACTGTG 1740
AGAGTGCAGG GAGGATGGAA TGAGCTGAGT CACAGGAAGT TCAGGAACCG CTTCCCAGGA 1800
GGGGTCATGC TTGCATTAAA TCTGGAGGTA ACCACAAAAT CAGTATAAAA GCATATGGTT 1860
AGTTTAAAAT ATCAGGTGTT CATTACACCA TTCTTTCTAC ATGCTTGAAA TCTCCACAAT 1920
AAATGTTGGG GAGAAAAAAG ATGAGATAGA TGAACCTCGA GGGCATTATG TTAAGTGAAA 1980
TAAGTCAGTC ACAAAAGGTC AAAAATTGTG TGATTCTACT TATATGAATT ATCTACAGTA 2040
GTCAAATTCA TAGAGACATA AAGTCAAATG AATGGTGGTT GCTAGGGGAT ATGAGGGAAG 2100
GAGGGAATAA TTATTGTTCA ATAGGGACAG AGTTTCAGTT TGGAAGATGG AAAAGCTCTG 2160
GAGATGAATG GTGGTGACGG TGCAAAGCAA TGGGAATGTA CTTTATGCTA CTAAACTGTA 2220
CACTTAAAAA TAGTTAAAAT GGTACATTTT ATGATATGTA TATTTTACAA TTTTTTTAAA 2280
AAGATGAGGC CAGGCGTGGT GGCTCACGCC TGTAATCCCA GCACTTTGGG AGGCCGAGGC 2340
GGGCAGATCA CAAGGTCAGG AGATCGAGAC CATCCTGGCT AACACGGTGA AACCCTGTCT 2400
CTACTAAAAA TACAAAAAAT TAGCCGGGTG TGGTGGCAGG CGCCTGTAGT CCCAGCTACT 2460
CAGGAGGCTG AGGCAGAAGA ATGGCGTGAA CCTGGGAGGT GGAGCTTGTG GTAAGTAGAG 2520
ATCGCGCCAC TGCACTCCAG CCTGGGTGAC AGAGCAAGAC TCTGTCTAAA AAAAAAAAAA 2580
AAAAAAAAAA AAGATGAGAT AGATCCAAAT GTCCTGATGT GGAAGGACAC CCAAGATACA 2640
TACTTCAGTG AAAAAAGCAA GTTGCAGAAT CATGTGTCTA GTGTAACTCC AGTTGCATAA 2700
AGAAGGAAAA GACAAAGGTG CTTGTCTATG CACAGACAAC ATTCGGAAGG ACATCCAATA 2760
AACTAGAAAT TAAGTTTTCG TCTGGAGCAG GGTAGGAAAT AGGTCTTCTA ATTTCATTTT 2820
TTTTGAGACC AAGTCTCATT CTGTTGCCCA GGCTGGAGTG CAGTGGCGCA ATCTCAGCTC 2880
ACTGCAGTCT CCGCCTCCCA GGTTCAAGAG ACTCCGCCTC TCATGCCTCA CCTTCCCAAG 2940
CAGGTGGGAT TACAGGCACA TGCCACCATG CCTGGCTAAT TTTTGTATCT GTAGTAGAGA 3000
CGGGGTTTCA GGCTGATCTC AAACTCCTGA CCTCAGCTGA TCCACCCACC TCGGCCTCCC 3060
AAGGTGCTGG GATTACAGGC GTGAGCCACT ATGCCTGGCC AGGTCTTCTG ATTTCTATTT 3120
CAACCACTTA TGTACAGCTT TACAAACTTT TATTTTTATT TATTTATCTT TTTTTGAGAC 3180
GGAGTCTCAC TCTGTCACCC AGGCTAGAGT GCAGAGGCAT GATCTCGGCT CACTGCAACC 3240
TCCGTCTCCC AGGTTCAAGC GATTCACCTG CCTCAGCCTC TAGAGTAGCT GGGATTACAG 3300
GCACCCACCA CCATACCCGG CTAAGTTTTG CATTTTTAGT GACACGGGGT TTCACCATGT 3360
TGGCCAGGCT GGTCTCGAAC TCCTGACCTC AAGTGATCTG CCCACCTCAG CCTCCCAAAG 3420
TGCTGGGAGC CACTGCGCCC AGCCAGTTTT ACAAACTTTC AAAATGAATA TGTATTGCTT 3480
TCATAATTAA AGCAAAAAAA AAAAAAAGTG TATACTTTGC CTGGCAGACC ATGCTGTTTA 3540
CGTGAATATC CTCCTCTCTC TGGGAGCACA TGGGGCTAAG ACAGTGTCTC ATTTGCCTCT 3600
GTCCCTCCAT CCAGCACCCA GCAGCCACTC AACAAATGCT GACTAGTTGA ATGGTTTGAC 3660
CATATTATAT ACTGCTTTCT TTCCCAAACA TGTGGCATGT TTCCCAAACA TGCTCAGCAC 3720
ATTCATTCTC GCTGCCCAGT TGATGAATAT GAAGAAATAA ATACTACGCC ATGGTGGTAG 3780
CCAGTAACAA TGGTCCCTGT GGCTTCCCTC AGAGGCTCTC ATCAAAAGCC TTTGCTGGGG 3840
GAGGCCACCG TCCTGCCTAA GCCTTGGCAA ACAATCTTAC 3880