EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-23664 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr2:55325820-55330170 
Target genes
Number: 11             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr2:55328913-55328924AATAAACAATA-6.62
Lhx3MA0135.1chr2:55328927-55328940AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr2:55328928-55328941AATTAATTAATTT-6.92
POU6F1MA0628.1chr2:55328929-55328939ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:55328929-55328939ATTAATTAAT-6.02
Stat6MA0520.1chr2:55328536-55328551GCTTCTCAGGAAATT-6.03
Number of super-enhancer constituents: 23             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00239chr2:55322199-55331208Adipose_Nuclei
SE_13769chr2:55326770-55327737CD34_Primary_RO01536
SE_26467chr2:55323284-55330185Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27564chr2:55326380-55326953Esophagus
SE_27564chr2:55327101-55327953Esophagus
SE_27564chr2:55329296-55330050Esophagus
SE_30501chr2:55329026-55330125Fetal_Muscle
SE_33603chr2:55322403-55330113H2171
SE_37014chr2:55323361-55330554HSMMtube
SE_39299chr2:55326208-55330073IMR90
SE_39897chr2:55326352-55328017K562
SE_43033chr2:55326358-55328009Lung
SE_43033chr2:55329379-55330096Lung
SE_45296chr2:55326436-55330253NHLF
SE_46551chr2:55325577-55330859Osteoblasts
SE_49902chr2:55323425-55330072RPMI-8402
SE_51987chr2:55326302-55328231Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51987chr2:55328535-55330280Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_54907chr2:55325937-55328258Stomach_Smooth_Muscle
SE_54907chr2:55328958-55329959Stomach_Smooth_Muscle
SE_56652chr2:55326529-55329667u87
SE_63794chr2:55326302-55328306HSMM
SE_63794chr2:55328389-55330280HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr25532696555327954
chr25532634855328209
chr25532709555327368
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH02I055096chr25532388555325910
GH02I055098chr25532592855330735
Enhancer Sequence
GATCCAAATA AGGTCCACAT GTTGCAATTC ATCAATATGC CTTTTAAATC TCTTTTAATC 60
TATAGGTTTC CCCCTGAACC CCCTTTCTTG CGAATTATTT ATTGACGAAA TCAGGTCATT 120
TGTTCCGTAG AGTTTCTCAT AGTCTAGTTT TTTGCTGCCT TCATTCCCCC AATGTAGTGC 180
AACATGTTCC TCTGTCCTCT CTATTTTCTA AATTGGCATT TGGAACAAGA AACTTGGTAA 240
GATTTGAATT TGCCTTTTTG GCAAGACTTC TTCATGAATG GGTGTATTCT TCCTTCATCC 300
ATCAGGAGGT CCGTACTGTT TGGTTGTCTG TATTCTTGTT ACGTTAGCAA TCACTTCTCC 360
TTAAGGCCTA GATCTATTAG TTCTTTAGAG GCCATAGAAA GGGGACTCTA TTACTCCTTT 420
GTTGTTTAGT GGCTGAATTA GTTCTTTAAA CAAGAACTTC ACCTCATGCA CTATTTAGTT 480
ACTGGGGCAT ACAGTTCATA TAAGGAAGGC AGAAAAAAAT GGTAGAATTT ATTTACCGGT 540
TATCAGTTCA ATAATGAGTT GCCTCCCAAT CATCTTCTAA ACATGACCAG TTTTTTGAGC 600
ATCATTATGG ACTCATAGAT TTAAACATAT TTGAGATGTT TCAATCTATT GCTGGTATTA 660
TCCCTACTGA TGTCAAAACT GTGACACCTT TGGCCATTGG GAGCCTCTTT AAGTTGGTTC 720
TGCTGTCCTT TTGAGAATGA CCCTGTAGTC CTCAATAGCT TCCTCACTAC CTATATGACA 780
AAGTGCTTCA GGGATCCCTT GTTCATTTCC TGCCCTAGAC CTTGACTCAG CCATTTCTTC 840
AAGGAGCCTG GCTCTTTGAC ATGGGAAATG GTATTTCAGG ACATCAATCA GGGATTTGGG 900
GGTGCTCTTT GCACCTGGGT TGGCTAGAGA CTGACTTTAA ATTTTTGAAT TTCTCAGACA 960
TACTAGTGGC TAAAAGTGCA GGTGCCAGAG GTAGACTGTC TGGGTTTGAA TCACCACTCT 1020
GCCACATATT ATGTATGTGA CACGGTGCCA GTTTACCAAC TTATCTGTGC TTCAGTTTTT 1080
CTCAATTGTG AAAAGAGAAT AATAACAGTA GCTAAATATG TAGAATCCTG TAAAGTTTAA 1140
ATGAAGCGAT TCATGTAAAA TGCTTAGAAT AGGGCCTGGC ACATAGGGCT GTGTAAGCAT 1200
TGACTATTAT TATTCTTATT ACTAGTCTCT TTCCAGCCTC ATCATTGTTG CCTGCTTACA 1260
CTGTGGGTCA ACTGATATGC AACATGGACT TACATTTTAT TCATATCTAG TGACATGCTG 1320
ACTTATTTTA GAGAACTAGT CTAAGTTACA TCTGCAACAT TTGTCCTACT AATCTGCTAC 1380
TTTAAATGAT GCAATACTTG CACATATTAG AACATTTCCT GTAAAGGAAT CCAAATTCAA 1440
CAAAACAAAT GGCATTCATA AGGTCACCAA GCACCAGTGT ACTTTCTGCT TTTTATACTT 1500
GTCTGGAAAG GGGTAAATTA GCAGAAGCCT GGCTAGGAGT GACCCCACTA CGGAGTTAAG 1560
GTCTTACTTT GCACTGGGGG CTTGGACAAG CCACATTCGT CTTGTCTTTC CTAGTTGAAC 1620
ACAGGGAGCT ATTGGGGTGG CATTCCCCAA GCCCTCCAGA TCCCTTTCTA ATCAAACTGG 1680
TAGAATTACA AGACATATCC CAGATCACAT AAATCTTAAT GCTGGTTCTG TCTGGAAGCC 1740
CATTCATATT ATGAAATCTT GATCTATTCA GCCATTTGCC ATAATTCTTT CGTCAGGTTC 1800
GAGGAGTTAA GATCTCAGCA CTGCTGCAAC TGAAGACAGT GAAAGGGAAG CAGCAGACCT 1860
GTGGGCTGTT TCCTTGGTGG TCCATTAGAC CCCAACAAAG CCTCAAGGTA CATCTTCTCT 1920
AAACCTAAAA ACCCTACGGA GCTCTAACAA GAACAGTCTC TAAAGTAGTT AAATCAAAGT 1980
TTATTTAAAG CAAAGGCATT TGTTTATCTG CAATTTTATA TACTTGCATT ACTGACATAT 2040
AATTGTGCTA TCATTGCATC AGCCATGCCA AGTTTTCCAC AGCTCACTGG CTAGAAATTC 2100
TCAGGATGCA CTAGGGTTCA TTTGTGCTTA AACAAAAATT TACTTGCTTG TTTTATTCTT 2160
TTCTTTCTTT TTTCTCTTGA CAGCACTCTT AGCATTTTTT TTTTTTACTC TTACCATTTT 2220
ATAAAAATAG CTGTCATTAG ATTACTTGAC ACTTAAAACA CTTTGGATTA AAATGTAATT 2280
TTAATCACAT ATTTGTCAAG AGGAAAGTGT GAATAAATAA TGGTAAATTT ATGTAATAGA 2340
AACTATTAAG CCACTAAAAT TATAAAATGT ATTTTGAAAT CTTGACATAG AAACATGAGA 2400
GAACAAAAAC AAGCTCCAAA CAGTTTGTAT AGTAGGATTA TATTTTAGTA AAATAATAAT 2460
TATTTTACAT GTTGGCATAT GCATAGAAAA AAATCTGAAC AAACAAGTTG TTAATAGGGA 2520
TTATCTCCAG GGGTGAGATT ATCATTGTCT TTTCCTACAT ATTCCTATAG TTTCTGAATT 2580
TCTTATGAAT ACTTATTACT TTTCCAATCA GAAAATGTTT ATTTTTTTGA AAATCAATGT 2640
TGTTGTAACT TGTTCAGAAG AGTGAAATAA TACATTATCC ATTGTAATAA TAATTTTAGT 2700
GAGATTTCTC ATGGTAGCTT CTCAGGAAAT TCTATAATAC TAATAAGTTT CTGTAAAAAT 2760
TGAAGTTATT AATACAATAA CTGAAGTATT GAAAAACAGT ATACTTAGTC TTCTCAGAAT 2820
CCAAAATGAT TTGGTGTATA TTTTTATATA TATGCAAAAC CAAATGGAAT TTAAAACTTT 2880
GAAATCTTTA GAACAATCAA CAAACCACTT TCATTCATTA AGCATGCATT TCTGCTACAT 2940
AGTCTGTGCC AGGCAATGTG CTAGGTATGC AAGTACCAGC TACACAGAGA TGAAAAAGAT 3000
CAACCCAATT TCTGTCCTCA TATGATGGTA TGAACCAGCC CTGTGGATAT CCTGGAGCAT 3060
AGGAATTATT AATTAGAAGA ACTGCTGCAT GTGAATAAAC AATAAGCAAA TTAATTAATT 3120
TTGTATGTTA AAGTGAATTT TTCACTACAT AAGAGCTAAG TGACTGGAAA GATTGTATAT 3180
TTCATCAGCA CATTCAAATT TCACAAAATC ATCACACACT GTAGGATATA TGTTCAAATA 3240
TATTCACACC TCCAAATCAA ATATAAAAGA AAAGGAAAAA TAGAGTGAAA TCTTATTATT 3300
GTTTTCTACT GATATTTCAC TTTTAGATGT GACATCTGAA ATCTAAGACA AAAAAAGGCT 3360
TCTGCTTTTA TTTTGAATCA TAAAGTTAAC AAGTCCATTT TTAAAAATCA TGAGCACCAA 3420
ATTCCTTAAA GATGAGATAT TGTTATTTCA TAACTTTCCA TCCAAATCAT GCCTAAATCA 3480
TTTTTCAGTT CTTTGGAGCA GATGACGATT AAGGGGGAAA GGGAAGGAGG GATCAAAATG 3540
TTCACTTAAA TGGAATTTAG TTTGTTTTTG TAAGGCTGAA ATCCCTTGAA GATGGTATAT 3600
AAACTACTAC TTTAGGCCAG GGGGTAGCAA ACCTTTTCTG TGAAGGGCCA GATAGTAAAT 3660
CTTTTAGGAT TTGTGGACCA TGGACCATGC TGTCTCTGCC AAAATGGCTC AACTCTGTTG 3720
TTTTACGGCA AAACAGCCAT AAACTACACA TAAACAAAGG GACATAGCTG TGTTTCAATA 3780
AAACTTTATT TGTGGACGCT AAAAATTTTA ATGTTATATA ATTTTCACAT GTCATTTTTC 3840
TTTTGATTTT TTTTTAATCA TTTAAGATGT GAAATTCGTC CTTAGTTGGC AGACCTCACA 3900
AGAATCTGGT GGCTGATTGG ACTTGACACA TGGCCAACTG CCAGTCCCTG CTAATAGGCC 3960
AGTGCATGGT GCTTGGGATC TGCTGCTTCT CTTTGGTCCT GGTATTGAAG GGTAGGAGGT 4020
AGGAGAGGAG AATCCAAGAG ATTTATAAAA CAAAACTCTA TAGATTTTCT AAAAACAATT 4080
TGTAAGACAA AACTCTATTG TTTTTCTAAA GACAATTCAA ATCTCTTTAT TAATCTAAGA 4140
AGTTACTATC GTGGCCGGGT GCGGTGGCTC ACGCCTGTAA TCCCAGCACT TTGGGAGGCT 4200
GAGGCGGGCG GATCACCTGA GGTCGGGAGT TTGAGACCAG CCTGACCAAT GTGGAGAAAC 4260
CCCGTCTCTA CTAAAATTAC AAAATAAGCC GGGCATGGTG ACACATGCCT GTAATCCCAG 4320
CTACTAGGGA GGCTGAGGCA GGAGAATCAC 4350