EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-15973 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr15:93387650-93389810 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFICMA0161.2chr15:93389348-93389359TCTGCCAAGAA-6.02
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr15:93389676-93389691TGAACTCCTGACCTC-6.22
SOX10MA0442.2chr15:93388246-93388257TTCTTTGTTTT-6.62
Number of super-enhancer constituents: 46             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09652chr15:93386552-93389375CD14
SE_10533chr15:93387702-93388887CD19_Primary
SE_11607chr15:93387458-93394413CD20
SE_12070chr15:93387907-93388924CD3
SE_13564chr15:93387971-93388967CD34_Primary_RO01536
SE_14477chr15:93387687-93389155CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15588chr15:93387938-93389031CD4_Memory_Primary_8pool
SE_17069chr15:93388065-93388858CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17547chr15:93386041-93393382CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18103chr15:93386611-93389484CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18547chr15:93387686-93393671CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19553chr15:93387892-93388873CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20693chr15:93387915-93388933CD56
SE_20859chr15:93387861-93388974CD8_Memory_7pool
SE_22279chr15:93387698-93389076CD8_Naive_8pool
SE_22966chr15:93387902-93389145CD8_primiary
SE_23716chr15:93387700-93388711Colon_Crypt_1
SE_24264chr15:93387947-93388581Colon_Crypt_2
SE_26010chr15:93387716-93389311Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26840chr15:93387753-93388696Esophagus
SE_27996chr15:93387746-93389226Fetal_Intestine
SE_28970chr15:93387747-93389279Fetal_Intestine_Large
SE_29703chr15:93387990-93388810Fetal_Muscle
SE_30995chr15:93387748-93389098Fetal_Thymus
SE_31921chr15:93387749-93388464Gastric
SE_31921chr15:93389114-93389514Gastric
SE_33848chr15:93387725-93389099HCC1954
SE_34564chr15:93387948-93388792HCT-116
SE_34679chr15:93387951-93388921HeLa
SE_42600chr15:93387839-93388444Lung
SE_43659chr15:93387730-93389342MM1S
SE_47960chr15:93387891-93388184Pancreas
SE_47960chr15:93389190-93389476Pancreas
SE_50492chr15:93387722-93388702Sigmoid_Colon
SE_52822chr15:93387746-93388708Small_Intestine
SE_53626chr15:93387719-93388711Spleen
SE_53626chr15:93389129-93389626Spleen
SE_55179chr15:93387795-93388649Thymus
SE_58414chr15:93350819-93397613Ly1
SE_59292chr15:93350909-93397284Ly3
SE_59816chr15:93351073-93397403Ly4
SE_60705chr15:93340495-93393151DHL6
SE_61142chr15:93340330-93400291HBL1
SE_61602chr15:93347024-93408751Toledo
SE_62387chr15:93344538-93393491Tonsil
SE_67338chr15:93387730-93389342MM1S
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr159338793093388929
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH15I092843chr159338663293389629
Enhancer Sequence
GTCTTGATCT CCTGACCTCG TGATCCGCCT GCTTCGGCCT CCCAAAGTGC TGGGATTACA 60
GGCGTGAGCC ACCAGGCCTG GCCTTTTTTT TTTTTTTTCC AGAATGGAGT CTTGCTCTGT 120
CGCCCAGGCT GGAGTCCAGT GGTGCAATCT TGGCTCACTG CAAACTCCGC CTCCCGGGTT 180
CAAGTGATTC TCCTGCCTCA GCCTCCCAAA CTCCACCTCC CGGGTTCAAG TGATTCTCCT 240
GCCTCAGCCT CCCAAGTAGC TGGAATTACA CGCATGCACC ACCACACTGG ACTAATTTTT 300
GTATTTTTAA TAGAGATAGG GTTTCACCAT GTTGGCCAGG CTGGTGTCAA ACTCCTGAAT 360
GAAAGTGATC CACCTGCCTC GGCCTCCCAA AGTGCTGGTA TTACAGGAGC GAGCCACCGC 420
GCCCAGCCTA GCCTCACTTC TTTCCAGCAA GTCTGTGGGA TTCCTTTCAT TAAGGAATTT 480
CACAGCAAAG TCCCCTTCAC CTGATTGGGA CATCTTTGAT TGCTCACTAT GTTTTCACGG 540
AACCTGGTCC TTTTCATTCC TTCATTCATA GACCTTATTT ATACTTCTGC CTTCAATTCT 600
TTGTTTTCAT AACGCACCAG CCTTTCTCCA GTAGTACCTG GTACTTCACT GAACATCAAA 660
CTAATTCCTG TGAATTTCAA CAACAAAAAC AGACCCTTTC TTCAAATTTC CCTCATTCTT 720
TCCTCAACCT CTCCCCTTAC TCCTGCTTTG TACTTTGTAT CTAACAGTGG CTGTACCTTT 780
TGGAACAGTT CTGAACTGTT TTATGCTATG CAGTGCAGAG AATGCACTTT CTTATAGTCT 840
GAAGTTGCTG GCAGAGCAAA AAGAAACAAG AAACAAAAGC AGCAATTCAG GAACTTCATT 900
TAGTGAGATA CACTTCCTCT TGGTAGTTTG CCAGCTAGTT TCTTTAGTGG GAAATGATAT 960
TTTGAAAGTA AATGACTACC AGTCAGAGGG GAGGGGTTGG TAAAGGGAAT CAGTATATTA 1020
AACCAGATGC CTGTTTCAAC TGATGTTGTC ATTCATTATT AAACCATAGA AAAGAGATAC 1080
ATTCACTGGT AAATGCAACT TATTATTATT ACAACTTTGT TGCCTGTTTT TCATGTAGAG 1140
GAGAATTAAA AAAAACTGTG TTTGATGATG AATTGCTGTA GATTACAAAA GCCTCATAAA 1200
GTACATTAAA ACAAATCTAA TCATTTACAA GTGCACAAAA TAGATCACAT ATTAAAACTT 1260
TTGTTTTCTT GAGAATTAAA ACCTTGAAGT TATCTGTATG TTTCCTTACT TTATATTAAG 1320
GGATCTATTT TTTTTTTTTA AACAGAGTCT CGCTCCGTCA CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC 1380
GTGATCTCAG CTCACTGCAA CCTCCACCTC CTGGGTTCAA GCGATTCTCC TGCCTTAGCC 1440
TCCTGAGTAG CTGGGACTAC AGGGGTGCAC CACCACACCC AGCTAATTTT TGTATTTTTA 1500
GTAGAGATAG GGTTTCACCA TGTTGGCCAG GATGGTCTCA ATCTCTTGAC CTCGTGATCA 1560
GCCTGCCTCG GACTTTCAAA GTGCTGGGAT TACAGATGTG AGCCACCGCG CCCGGTAATT 1620
TTTTTCCTTT TAATGTACTC CTTATGTTGC CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC TATTCACAGG 1680
TTGGGATCAT AGCTCATTTC TGCCAAGAAC TCCTGACCCC AAGAGATCCT CATGCCTCAG 1740
CCTCCAGAGT AGCTGGGACT ACAGGCATGT ACCACTGCAT ATGGCTATTA AGTGGTCTTT 1800
AAATCAGGTT TTTTGTTCCT TTTTTGAGAT GGAGTCTTGC TCTGTCATTC AGGCTGGAGT 1860
GCAGTGGTAC GATCTTGGCT CACTGCAACC TCTGTCTCCT GGGTTCAAGC CATTGTCCTG 1920
CCTCAGCCTC TTGAGTACCT GAGATTACAG GCGCCTGCCA CCACGTCCAA CTAATGTTTG 1980
TATTTTTAGT AGAGACGAGG TTTCACCATA TTGGCCAGGC TGGTCTTGAA CTCCTGACCT 2040
CAAGTGATTC ACCCACTTTG GCCTCCCAAA ATGCTGGGAT TACAGGCGTG AGCCAAAGCG 2100
CACAGCCTAA GGTATCTTTA AATCAATTTA ACTATTAAGG TTATGGGTGG ATATATATGC 2160