EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-11272 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr12:104709680-104712690 
Target genes
Number: 10             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr12:104710690-104710701AATTGTTTATT+6.02
NEUROD2MA0668.1chr12:104712111-104712121GCCATATGGT+6.02
NEUROG1MA0623.2chr12:104710548-104710558GACATATGTC+6.02
NEUROG1MA0623.2chr12:104710548-104710558GACATATGTC-6.02
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr12:104712613-104712624CTTGAGTGGTT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr12:104711978-104711989TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr12:104711978-104711989TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr12:104711978-104711989TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr12:104711978-104711989TAATTTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr12:104709843-104709859AGTTGTTATGGTAACA+6.18
RFX1MA0509.2chr12:104709843-104709859AGTTGTTATGGTAACA-6.18
RFX2MA0600.2chr12:104709843-104709859AGTTGTTATGGTAACA+6.06
RFX2MA0600.2chr12:104709843-104709859AGTTGTTATGGTAACA-6.13
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
SE_46200chr12:104709002-104709983Osteoblasts
SE_47243chr12:104710439-104711880Panc1
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH12I104315chr12104709003104709983
GH12I104316chr12104710440104711880
Enhancer Sequence
GAGGGAAAAG CTACTCTTCT GTTTGTGCTT TTGGGGGTTT GAGCTGCAAT TTTTGTGATG 60
CGTCGTCCAT TTTCATGAAG ATAGCAAATA GCCTAGTTGT TTTTATTGTT TACATTTTTG 120
ATGGATATAA TCACTGGAGT TATCCTTTGT CAAGTATTTA CATAGTTGTT ATGGTAACAA 180
CAGATACTGC ATTTGGACTA TGGTATTTCT GTAATATAAA ATTAGAGTTC TTTTGAATAT 240
ATTGTCATGT AGTATTTGTG AGAAATCATA CAATGTTTAT AATTTGTAAG GAAGTACTAA 300
TTGCATTTGC TTTCTTTCAT GTTGCATTTT TCTCCCTCCA AAGAAGTCTG TTTCATGAGC 360
TGATGTTTGT GGGGGGTGGG GGTTGTTTGT TCAGGAGGGG GTGGTTAGGC TTTGTTGGAT 420
TAAAACTATT TAGAGTACCC TAGAAACCCT AGATGAGTTT AAGAGATTGG AATTGTTAAT 480
TTTATTTTTA TTTATTTATT TATTTGAGAC GGAGTCTCAC TCTGTCGCCC AGGCTGGAGT 540
GCAGTGGCAC GATCTCAGCT CACTGCAAGC TCCGCCTCCC GGGTTCACAC CATTCTCCTG 600
CCTCAGCCTC CCGAGTAGCT GGGATTACGG GCGCCTGCCA CCACGCCTGG CTAATTTTTT 660
GCATTTTTAG TAGAGGTGGG GTTTTACCAT GTTAGCCAGG ATGGTCTCGA TCTCCTGACC 720
TCATGATCCA CCTGCCTCAG CCTCCCAAAG TGCTGGGATT ACAGGTGTGA GCCACCGTGC 780
CTGGTGGAAT TGTTAATTTT AGAAAGTAGA TTGCATTATT TAGTAGAAGA ATAAAATGAG 840
ATCTGGCATA GCTTCCTGGC TAATTTATGA CATATGTCAC TCTGTTGTGA AGAGTGAAAC 900
TCCAACCCCT ATGTGATTTG AGGTTTGAGA CCTATGCATT ATGGAGCATT TGAGGGAAAA 960
TATTCCAGCC AGTAGCCAGG ATAAACATTT TGTGGCTTTT TTGGGGTTTT AATTGTTTAT 1020
TAAATGTAAA GATAAGGCAT AAATGTATAC TTGGAAAAAT TTTGCTCTCA CTCAAACTAG 1080
TTATGCTTCT CTTGTTGATG CTTTTACTTC CTACTTAAAA TAATAGTACC TTTTCCAAGT 1140
CTGGAATCTT AGAAAATCAC TAACTTTTAA AGTTTTATAA TGTTGGGGTC ACATTGTTTG 1200
CTCAGACCCT TAAGAGAGAG AGGGATATAG GAGGAAATTT TGTAAAACAT TGATAATTAC 1260
TGCAGCTTAG ATGATTAGCA CATGTGGGTG AGCTATATAC TATTCTATTC CACTCCTAGC 1320
AGAGAAACAG CAAGTCCTGA GCCTTTTGTA GTGGTGGTAG ACAGAGGCCA GGCAGGGAGG 1380
TTAGTCCAAG CTTCCTGCAG CCTTCCCTAC CCACAAGCTA CCTGGTCCTC TAGAACCATA 1440
ACCGCAGTGG CATCTGCAGT TACTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTCAGTTG AACCAATTTC 1500
TTAAGGTTTG CTCTAATTCT AACATTATGA TCATATGAAT TCAATATCCA TGATCTATCT 1560
GTTCTCTTAG AGGCTATAAA TCAATTTTTT GTGCTGTCAT TCCCACTTCC AGAGGCTGGC 1620
CAGTAAGTGT TATAAGCCTA TTTTCAAAAC TTACTGTATA GCCAGCCAGG ATCATGCCTG 1680
TAATCCCAAC AGTTTAGGAG GCCAAGGGGA AAGGATCAGT TTGAGACCAG AAGTTCGAGA 1740
CTACCTTGGA CAACAAAGCA AGAGCCTGTC TCTACAAAGA ATAATTAGTC GGGCCTGGAA 1800
GCCCTCTCCT ATAGTCCCAG CTTCTCAGGA GGCTGAAGCA GGGGGATAAT TTGAGCCCAG 1860
GAGTTCAAGG CTGCAGTGAG CTGTGATTGA TTGCACCACT GCACTCCAGC CTGGGCAACA 1920
GAGTGAGACC CTGTCTCTAA AGAAGAGATT ATTGAGGCTG GGTGCAATGA CTCATGCCTG 1980
TAATCCCAGC ACTTTGGGAG GCTGAAGTCG GCAGAGCACT TGAGGTCGGG AGTTTGAGAC 2040
CAGCCTGGCC AACATGGCAA AACTGCGTCT CTACTAAAAA TATAAACAAT TAGCTGGGCA 2100
TGATGGCCCA CACTTGTAGT CCCAGCTACT CTTGAGGCTG AGGCACGAGA ATAGCTTGAA 2160
CCCTGGGTTG AGGGGTACGG AGGTTGCAGT GAGCCCAGAT TGAGCCACTG CATTCCAGTC 2220
TGGGCAGTCT GGGCAACCAA AGGGTTGATT TTTATCCTTT GAAATTTAAT ATTACTTTAG 2280
TGTCCTGACT TAAAGGATTA ATTTAATTAT GACAGAATCA AAAAGAATAA AAAAGTTTTC 2340
TCTTTGATAA GATATGGGAG TTTGGAGGAA ATGTGATAAG ACTCTTAAAA TCCTGTCTAA 2400
ATGAATAGTC AGTGAATTTT TTCCGTAAAA GGCCATATGG TAAATATTTT AGGATTCTTG 2460
GGGCATAGGG TCTCTAGTAG CTACTTAACT CTGCTTATGT AGTGTGAAAG TAGCACTAGA 2520
AAATATCGAA ATAAATAAGC ATGGCTGTAT TTTAATAAAG CTTTATTTAC AAAAAGCTGA 2580
TGGGCTGGAT TGGCCCATGG TGCAGTTTGC CAGCCCCTGA CATAAACACT GTTACTAGTG 2640
TAGTAACTCC ATACTCGGCT ACATCAGAAT CTCTTGGATT TTCTTACAAA CACAGAATCC 2700
TAAGCCTTAA TATATCCCAG AAATCAGTAA AATTCAAGTT CGTTTCTAGA TAAAGAAGGA 2760
AAAAGTTTGT GTATTGTTAT TTTAGTTTAA AATTGTCAGG GGATCTGTCT TGTATTATTT 2820
AATTGTATTA GTCTTATAAG AGAATACTTG AAGATGAAAA AGTGGCATAT GTGCTCAAAA 2880
TGGAGGATTT GCCCTTTCAG ATTGCCTTTT AGAGCTCTGC TCCCTGTATT TCACTTGAGT 2940
GGTTATTGAG AAATGATCTT TGCCAGCAGT TGAAAAGCCA AACAAGATTT TGTTTTATTT 3000
TCTTATACAG 3010