EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-10721 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr12:65048680-65051120 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GFI1MA0038.2chr12:65048768-65048780TGCTGTGATTTA-6.27
Gfi1bMA0483.1chr12:65048768-65048779TGCTGTGATTT-6.62
IRF1MA0050.2chr12:65050781-65050802GTATAGTTTCTTTTTTTTTTT+6.19
ZfxMA0146.2chr12:65049566-65049580GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_11789chr12:65048359-65079116CD20
SE_20172chr12:65050065-65053505CD56
SE_22370chr12:65048627-65049450CD8_primiary
SE_22370chr12:65049645-65053513CD8_primiary
SE_26327chr12:65049875-65050721Duodenum_Smooth_Muscle
SE_32113chr12:65050664-65051206Gastric
SE_41405chr12:65048992-65049546Left_Ventricle
SE_41405chr12:65050174-65050681Left_Ventricle
SE_54802chr12:65050043-65052685Stomach_Smooth_Muscle
SE_59758chr12:65002038-65072203Ly4
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH12I064655chr126504886765053480
Enhancer Sequence
AAATAAAATA GAATGAATTC ACTGATAAAG TTGACTTCTC TCATCTCCAA GTAAATGATT 60
TCATTTTCTC CTTTGTTCCT TGCATGTATG CTGTGATTTA CTGACTATCA AGAACTCATT 120
ACACCAGTAC GTATCCCAAG ACAAATCAGC TCCAAAGTGG AGTGAGTGCA AGGGGAGAGC 180
TTTAATTCAA AACTGCTTTA TGGAGGAAGT ACAGGTTTTC CTCTAAGCTG CACTGTTATA 240
GATCTGTAGA AGTTTTAAAT CCATGTAATG CTCATCAGTT TTTAGTTTAG TATTTAGCTG 300
TCTGTGATGA TAAGTAAATA ATTTACCTTT TTGAAGGCCT GTGATATACT GTGTCTTCAT 360
TGCTTCATTT AAGAGGATGC AACATCAGGA TTTTCAAAAA TACACATAAC GAAGTGTTGT 420
GTAATCGTCT GTACATGGTT TCTTTGATAA GAGAGAGGCA GGAATCTGCG TAAAGCAGGT 480
GTACAGACAT AGTTTGCCCA TGAGACAGCA AGAAGAGCCC TGATGTCCTA AAGGAGAGCC 540
CTCTCCTGAA ATGCATAACA TACATATATA TTTTTTTTTC CTTTTTTTCA AAAAATAGAG 600
ACAGGGTCTC AGTATGTTGC CCAGGCTGTC TCAAACTCCT GGCCTTAAGT GATCCTCCTG 660
CCTCGGCCTC CCAAATTATT GGGATTACAG GTGTGAACCA CCATGCCTGG TCTTGAAATG 720
CATATCTTAG TCACTGTTAC TTCTTTTAAA TTGTTTTAAT TGTATAAGAT AAAAACCAAA 780
ACAAACAAAA AAAATGCTAC CATTTCAGGA GCATACATCT AGTCTTAAAA ATATCATAAA 840
TTTGGGCCGG GTGCAGTAGC TCACGCCTGT AATTCCAGCA CTTTGGGAGG CCGAGGCGGG 900
CGGATCACGT GAGGTCAGGA GTTCGAGACC AGCCTGGCTA ACATGGTGAA ACCCTGTCTC 960
TACTAAAAAT ATGAAAATTA GCCGGGCGTG ATTGTGGGTG CCTGTAATCC TGGCTACTTG 1020
GGAGGCTAAG GCAGGAAAAT TGCTTAAACC CAGGAGATGG AGGTTGCAGT GAGCTGACAC 1080
AGTGCCACTG TACTCCAGCT TGGGCAACAG AGTGAGACTT TGTCTCAGAA AAAAAAAAAA 1140
AAAAAATTAT AAATCCTTTT TATTCCCCTA ACTTGGATCT CAGGTTAATT GGGATATGCC 1200
TAATAACAAA ATTTCTGAAC ATGAGGTTTA CTAGAAAGAA TTATTTTTTA GATTATTTGT 1260
GATATATGTA TATATGCATT TGATAGTAGT GGATGTGTTT ATTGGACTCT TAAGTACTTG 1320
CTATGTACTG TGGGACATGT AGGAGTATAT GAATATTTGT CAGCTAGATT ATAAAGCTTA 1380
AAAACATATT ATTGGGCAGG AGTGGGCTAT GGGGCTGTGA CTACTAGTGG GCCTGGGGTT 1440
TCTTTGTGGG TTGATGAAAA TAGAGATGGT TGTGCAACTT TGTGAATATA GTAAAACCAT 1500
TTAATTGTAT ACTTATGGGT GAATTTTATG TTATGTGAGT TATATCTCAG TGATGCTTAA 1560
AAAATGCTGT TAATGAATTT GCAGTGCTGA AAAGATTCCA AAGTTGTGAT TCTCTACCTT 1620
TTTCTGTTCT CCAGATCTCC CAAAGCAGTT GCAGTGAAAG ATAAAGAACA TCAAACACTC 1680
TTATCTTCTG GTGGTGGGGA AATGCTGAGT GGCCCTGACT TTGTGCAGTG AAAGTTGTTT 1740
ACACAAGCCT GAGTCTATAA ACTCAGAGAT AAAAAAAATC ACACCAGGCT GAAGCCCCAT 1800
CAGGCAAAAA CCTACCAGAG AAATGGGCCT GCCCGTCTGA TGGAATATCT GGGATTTCCT 1860
GATGTTGGTC CCTTAATTTG TGGACCATTT TAGGCTGTCA TTAAAGTAGC AGTCTAAAGT 1920
AAGAGAAAAA TTCTGACATG GAATAATGTG GATGAATCTT GAGGACATTA CATGAAATAA 1980
GCCAGTCACT AAAAGGACAA ATACTGTATG ATTACAATTG CATGAAGTGC CTAGAGTAGC 2040
CACATTCATA GAGACAAAGT AGAATGGTAG TCACAGGGAA ATAGGGAGTC AGTGTTTAAT 2100
AGTATAGTTT CTTTTTTTTT TTTTTTTCAG ACAGAGTCTT ACTCTGTCGC CCAGGCTGGA 2160
GTGCAATGGT GCTATCTTGG CTCACTACAG CCTCCATCAA CCAGGTTCAA GCGATTTTCT 2220
CCTGCCTCAA CCTCCCTTGT AGCTGGGACT ACAGGCCCAC GCCACCACGT CTGGCTAATT 2280
TTTGTATTTT TAGTAGAGTT GGGGTTTCGC CACGTGGGCC AGGATGGTCT CGAACTCCTG 2340
ACCTCAAGTG ATCTGCCCAC CCGCAAAGTG CTGGGATTAC AGGGGTGAGC CACCACGCTG 2400
GGCGATACAG AGTTTCAGCT GGGGAAGGTG AAAAAGTTCT 2440