EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-08059 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr11:65850350-65852250 
Target genes
Number: 61             
NameEnsembl ID
CDCA5ENSG00000146670
AP003068.6ENSG00000187066
AP003068.9ENSG00000254501
SYVN1ENSG00000162298
AP003068.23ENSG00000254614
SLC22A20ENSG00000197847
POLA2ENSG00000014138
DPF2ENSG00000133884
TIGD3ENSG00000173825
NEAT1ENSG00000245532
MALAT1ENSG00000251562
SCYL1ENSG00000142186
SSSCA1ENSG00000173465
FAM89BENSG00000176973
EHBP1L1ENSG00000173442
PCNXL3ENSG00000197136
SIPA1ENSG00000213445
RELAENSG00000173039
KAT5ENSG00000172977
RNASEH2CENSG00000172922
AP001266.1ENSG00000175827
AP5B1ENSG00000254470
OVOL1ENSG00000172818
RP11ENSG00000255120
SNX32ENSG00000172803
MUS81ENSG00000172732
CFL1ENSG00000172757
EFEMP2ENSG00000172638
CTSWENSG00000172543
FIBPENSG00000172500
CCDC85BENSG00000175602
FOSL1ENSG00000175592
C11orf68ENSG00000175573
DRAP1ENSG00000175550
SART1ENSG00000175467
BANF1ENSG00000175334
EIF1ADENSG00000175376
CST6ENSG00000175315
CATSPER1ENSG00000175294
SF3B2ENSG00000087365
PACS1ENSG00000175115
KLC2ENSG00000174996
RAB1BENSG00000174903
CNIH2ENSG00000174871
YIF1AENSG00000174851
TMEM151AENSG00000179292
RIN1ENSG00000174791
BRMS1ENSG00000174744
B3GNT1ENSG00000174684
SLC29A2ENSG00000174669
MRPL11ENSG00000174547
PELI3ENSG00000174516
DPP3ENSG00000254986
CTDENSG00000255517
BBS1ENSG00000174483
CCSENSG00000173992
RBM14ENSG00000239306
RBM4ENSG00000173933
SPTBN2ENSG00000173898
PCENSG00000173599
SYT12ENSG00000173227
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr11:65851052-65851068ATATGTTTACTTAGGC-6.64
FOXC1MA0032.2chr11:65851054-65851065ATGTTTACTTA-6.02
Foxa2MA0047.2chr11:65851055-65851067TGTTTACTTAGG+7.22
SOX10MA0442.2chr11:65850812-65850823TGCTTTGTTTT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00748chr11:65850189-65851647Adipose_Nuclei
SE_11071chr11:65842892-65857544CD20
SE_17686chr11:65843952-65853777CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_58381chr11:65834101-65902512Ly1
SE_59665chr11:65833534-65914414Ly4
SE_62408chr11:65835434-65906336Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr116585060065851684
chr116585188865851938
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH11I066078chr116584553465853027
Enhancer Sequence
AGCATCTATG TTCATAGAAA TCATGACCTT CACATCTTTG AGGAGTGTCA GTGAAACTAT 60
GAATATGATG GTATAATATT TATACTGCAG CAGCTCTCAT ATCAGCCACC TTTTACATTG 120
TCTTCACAAG CAGGTTTTTG TTTGGTACTT TAAATCACAG GCGATGGAAT GGGGCAGTGT 180
AATATGCCTT AAGTCTATTG TTTATGAAAT TATGTCCTCA GAGTTAAAAT ATGTAGAAAG 240
TAGTTGACAG CATTCTGTCA TCTCTCCCAT GCACTGCTTT TGCTGTGGAT GAAAATGAAT 300
AAGCAACTCT GGAAACCAAG GTCCTCTGGG AACATAAAAA CTCCTGTGGC TATTAATGGA 360
TTTAATTGTA TTTCCTCTCT GCCACCAAGA TATGCAATAA ATTGTTTATG CCCTTGCCGT 420
TAGTGGGGAG AATTGTTCAT TAAACGCATG TAATGTCATT ATTGCTTTGT TTTTATTACT 480
TGTAGGTAGT CCTATCTCTC CTTTTAAAAA AAGTATAAAA AGAATGGCCG TAATTATTAA 540
ACACTGGCCA TTAATCCCTT TGGTTGACTT TTTCCTCCAT GGAGAAAAAG GAAAGTATCA 600
TCTCACTGGG GAAGCAAGCT TGGGCTGGAA ATGGGTCATG GTCTCCCAAA TCTAAGATCT 660
GGCAGAAGGT TGGTTTTGTA TGCTTTGGAC TTGGGCCAAG TGATATGTTT ACTTAGGCTC 720
CAGAAGGGCC TGGTTCTAAG GCAGCCACAC TGATAAATGA ATGCCTTGTA TCAAGTGTGG 780
AGAGGCTTCA TTATATTTAA ATCCACTTAA GAGAACAGCT ATAGAAGAAT GACTGTTTAG 840
GACTGTGGCT CTGTTTTCTT GTTTGTCATT TAGATATTTC TGCCAATTAT AATAAATGTG 900
GAGGAAAAAA AAAGCCAGCA AATTGCTATA GTCTCTTTAA AACCATGTGC CAGAAATGCT 960
TTGACATTAA AGTTTGATTT CTCACTTGGC TTTACCCCAC CATGTGGGTT TGGATAAGTC 1020
TTTGTAACTC TTCCTGCACA TACCTTTACT GTTTCCTCAT TTAGTTGAAA GATACTTATT 1080
GAGCACACAT TACAGACCAG TCACTGCTTG GATACTGAGG AGAGAGCAGT GAACAAAACA 1140
GACAGAAATT CCAGCTCTTG CGGAGCTTAC CTTCTGGGGA CAGGGTGGGC AGCAGGCAGT 1200
AGTGAGTGAG TGAGCAAATA TTAGGGTGTG TTGGACGGGA AGAATAAAGC TGGATGGGGA 1260
TAAGTGGGCA GAGGAAAGAG GTCACGGTTT TAAACAAGGT GGTCTAGAAA GACCTCAGAA 1320
AGCGAGCCGG CCACATGGAA CACACATTTA GGTAAGCTGG GTGCATTTTA TGGGATGAGG 1380
CCCCCCAGTA GAGGGAACAA GAAGTACTGG CAGGTTCCAG AGCATCCAGG AGGCCAGTTT 1440
GGCTGGAGCC AGGTGAATTA AAGAGAGAGT AATGGATAAA GTCAGAGAGG TAAAACAGGT 1500
GATCTCACAG GCCATTGTGG GACTCTGGCT TTGATCTTGA GTGAGATGGG AAGTCACTGG 1560
GGCTTTTGAG CCAGCGAGGA GGCATGATGG TCACTTCCAC CCTAAAAGAA CCCCTGACCA 1620
CTGTGTGTGG AAGCAGGGAG TCCGGTCAGG GGGCTGCTGT GATGATCTAG GTGGGAGCTG 1680
ATGCTGGCTT GGACTAGGGT GGTGGAGGTG GAGATGAGAA AGTGGTGGGA GTCTGGGCAT 1740
ATTGTCAAGC CTGAAGGATT TGCCTATGGA TTGGATTTGA GGTGTGACAG AACAAAAGGA 1800
TTCAAGGATG ACACCAATAG TTCATTTAAC TTCTTTGTGT CAGTTTTCTG TTTGTTTTCT 1860
TTAAAAATAA TTATTGTCGT CTCTTTATCT TAGCGACTTT 1900