EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-04622 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr10:6093880-6097260 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 4             
IDChromosomePositionGenome Version
rs61839660chr106094697hg19
rs2476491chr106095410hg19
rs12722497chr106095928hg19
rs10795763chr106096199hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr10:6095616-6095629AAATTAATTATCA+6.12
Sox3MA0514.1chr10:6094641-6094651CCTTTGTTTT+6.02
ZEB1MA0103.3chr10:6094817-6094828GGGCAGGTGCG-6.02
ZNF263MA0528.1chr10:6095995-6096016CCCTCCACCCGTTCCTCTTCC-6.17
ZNF263MA0528.1chr10:6095998-6096019TCCACCCGTTCCTCTTCCTCC-6.48
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
SE_11461chr10:6085497-6102623CD20
SE_18361chr10:6089836-6097608CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19212chr10:6089839-6097524CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_58346chr10:6078580-6152020Ly1
SE_63121chr10:6078375-6129661Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 7             
ChromosomeStartEnd
chr1060956726096560
chr1060954006095530
chr1060948006095400
chr1060964256096808
chr1060941266095537
chr1060956866096622
chr1060958226096104
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH10I006049chr1060912416096808
Enhancer Sequence
CTCCTTTCCT TGGAGAAGTC ACAGACTTTT AGGATTGGAG AACGGTTCAC ATGCATGTGT 60
GTGGGGCAGT TGGTCAGAGC TGTCCATTAT GAAAGGTGCT TCTAGAATAC TTGGGGAATG 120
TGGGAGCTAG AAAACAGGTT GTTATTAAAG GAATTGAAAT ACTCCCACTT GAAATGTTCC 180
CATTTTCTCT GTAAAGGAAT TTCTTGAGCA AAGGAAAACT CTACATCCTC TGTCTACCTG 240
AAGTTCAAAA TTAGTGGTGT TTGGTTTTAA TAATTTTAGT AGTTGATGAC AAAACAACGC 300
TCTCTGCTGT CCTCTCTGTC ACATCTAACA TGATGTGAAT GAGGCAGTCC CTGATGTGAG 360
ATGTGCTGGG TTTTGCAGGG GTAATGAACA TCGATCTGTG TGTTCCATCG ACTCCTTCTT 420
TAAACTTGTA TCTCAGCACT TAGCCTGTGT CATAATTGTC TGTGCAGAGG TCAAGGATGG 480
GCTCTTATTC ATCTCTGTGT CTCAAACCCT GTGCCTGACA CATAGCAGTT CCTCAATGAA 540
CATTTGCTGA ATGAATGAAT GAACAAAGGA ATGAACAAAC CAATAGCCGG AAGTCCTACC 600
ACACAAGAGG TTGTCTCCAA TCTCCCTGAC TTTCCCTCTT CCTCCTGTAC CCTCAACCCA 660
TCAGCTGCCT GTACTGCTGT AGCAACAACT TCTCTCTGAA AACCTTCCCA GGGGAGAAAA 720
CGCGCCCCCC CTCACGCCTC AGAGGCACAC ACCTATCCTA GCCTTTGTTT TTTTATTGCT 780
GAGAGTACAG AAAGCAGCGG CTTCTGAAGG AGGTATCTAT TTTGGTCCCA AACAGAAAAG 840
AGTGGGTGAT TCTGTGGGCA GAGGTGGCAA TTCCTGAATG TGGTATGGTG ACTCACGCCC 900
GGAGGTGCTC AGAATTTCCT CTGTTTTGTG GCTGCTGGGG CAGGTGCGAC ACTGCCGCTT 960
TCTCTAAAGA TGCCCCCAAG CTGCTCTGGG GGTAGAAGGA AGGCTGCAGG GAACAGCAGG 1020
ACCCGGAGAA CCCAGACCCC AAGGACCAGG TGGTCCTTAA GCCATCCTGC AGGAGGCCGG 1080
CTGCTCTAGC AGGTTGAGGA GTGCCACGCG GCTCTGTGGG TACCGCCTCA CTGCATGTAC 1140
CTGGGGCTGA AGGAGCAGTG GGCATTACTC ACAGCCTATT ACTTCACCTT TGTAAAAAAC 1200
AAAAATAACT TCCCTGCTCA CATGGCACCT TTGTCTTTGA CCTTTAGCAG CAGTTTAGAC 1260
AGGAGGAAAA AAGGCAGGTT CTGGAATGAG AGCGCCTGCT TCCTATCCTA GCCCCTTCCT 1320
CGTTGGGCTA CATCAGGCAA CCCATTTAAT CTCTGTAAGC CCATTTAACC ACAGTTCACC 1380
AGGCAGAAAA TGGGGATAAT CATATGACCT ACTTTATTTT GAGAATTAAC CAAAGTAATA 1440
CTATGTCTGA ACATAATACC TGAAAGATAG CATTTAGGCA ATGGATATTC ACTGTGGTGG 1500
TTCTAGCTAG TGTTCAAATG TTTTCTGGAA CAAAGCTTGA AGCAAATAAG AACGAAAGGA 1560
AACATAACTA TCAGTATCGG AGTTGGTGCA TGGGCCGGCT TTAACCAGTC ATGTTTCCTA 1620
GTCTATAGCT TTGCTCATTT TCTTACCAAA GGAAATCAGG GCCTGTTGGA GACTGTCCTA 1680
TTTTCCACGC TCTTTAGAAT AAAGAAACCA ATGGCTTTCA CAAACTTCCT TATTTAAAAT 1740
TAATTATCAT TTTAAAAAAT AGAGGTGGGG TCTCACTATG TTGCCCAGGC TGGTCTCAAA 1800
CTCCTGGGCT CCAGGGATCC TCCCCTCTTG GCCCCCCAAA GTGCTGGGAT TACAGGAATG 1860
AGCCACTGCA CCTGGCTGCA GCTTCCTTTT TATTCTTTTG AAACATTGCT CTTTCTTCTT 1920
CTTTTGGGTA AAAGGACTCA ATTGCTGCTA GTCCAATTGC ACCAGCTTGT TCTTGCACTG 1980
CATACAGCGT GGGAGGAAAA AGCCTGGGAA ACGGGGGGAC ATGGGCCAGC GAGCTCATCC 2040
GGCCACACCT TCCACCATGG GGCAGGCCCC TCTACTGGCA CAGGATGTCA ATACTCCTGA 2100
TCCGTATCTT GCCTTCCCTC CACCCGTTCC TCTTCCTCCC AGCACAGTGA CCTTCCGGTC 2160
AACCCCACCC ATGCCACCCA CACTTTGTTG CCCTGGAGTT TCCTGCCACC TGAACCCCTC 2220
CTTAAGCAGG ATGCCTGGAT CCGGGTCGAG GGCTGCAGGC GGAGCTGCTG GTCAAAAACC 2280
CCCCGGGGAA CTGGTTGGGT GTGGGAGTGG GAGAATGGGC TGTCAGGACA AAAGCACTGG 2340
GACTCCAGCC CTGTGGTGTG CACGTGGCTC GGGCTGGGTC AGGAAAAAAA TGTGGAGGTA 2400
GGGAAACAAG ACCCAGGAAC TCTTTGGCTG CCATCCAGGG TCATGTGGTG CTGGTGATAA 2460
GTGATCAGTG ACCCATTGAA CCGAGGACGT CTACCGGGGA CCAATGACAC CTGTAGACAC 2520
TGCAGGGTTG AAGCTGGGGG AGAAGCACTC ACATGCTGTC TGTCTGAGCA AAAGTATTCG 2580
TTTTTGTCCG AGAATCTGAG ACTCATTTGC TTGGCACACA CACACAAAAC TTCATGTATG 2640
TTGAAATATG GCTCATTATG TAGTTGTCCT GGCAAACCCC TCATCTCTCT AATTGGTCAG 2700
CTCACTACTC ATGGAACACG GTCCATGTAC ACGACTCCAG CAGCATCACT AGAAAACACC 2760
ATTCTCCAGC CCCTCTCCTG ATATTCAGAA CCACCATTCA GAGCCAGGAG GTCCCAGGGC 2820
CACCTTCTCT GAGAATTTTT TTTCTAGTTC TCCAGGTAGC ATGTTACTCT CCCTATTCTG 2880
ATCATTTATG GCATTATTTG CAATGTTTGA TCAATATTTG ATCTTTCCCA GATTGGTTTT 2940
CCCTTTTTCT AATTTTTTTT TAAGAGGCAG AGTCTCACTA TGTTGCCCAG GCTGGTTTTG 3000
AACTCCTGGG CTCATGGGAT CCTCCTGCCT TGGCCTCCCA AAGTGCAGGT ATTACAGGCA 3060
TGAGCTATCA CACTCAGCCT ATTTTCTCAT TTCAGTCGCA AGTTCTGTGT GGGTAAAAGC 3120
AATGCGTATT TATTCTCTGA CTTGATAGCC TTGTTACTCA AAATGGGGTT CATGCACCCA 3180
CAACATAGGC CTCCTGTGGA ACCTGTTTGC ACCAGAATCT TAGGCGGTAA CCCCTGACCT 3240
CCCGAGTCAG AATTTGCTCC GTGACAAGAT CCCTGGATGA TTTCTAAATG CATTAAAGGT 3300
TGAGAAGTAC TGCTTGAGCA TACCTGTTCC TAGTGAATCA GACCAACCAT GGAAATCATT 3360
ATTCCATCTC TCTAATTTGG 3380