EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-03775 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr1:206886490-206889370 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr1:206888182-206888198TTTTGTTTACATATTG-6.2
FOXP2MA0593.1chr1:206888183-206888194TTTGTTTACAT-6.14
IRF1MA0050.2chr1:206888964-206888985TCTTTCTTTCTTTTTTTTTTT+6.25
ZNF143MA0088.2chr1:206888259-206888275TGGAGCATTGTGGGTA-6.51
Number of super-enhancer constituents: 20             
IDCoordinateTissue/cell
SE_18978chr1:206886129-206891443CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_26063chr1:206886354-206889074Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27575chr1:206887443-206888941Esophagus
SE_31968chr1:206886257-206887065Gastric
SE_31968chr1:206887150-206889403Gastric
SE_40628chr1:206886209-206888054Left_Ventricle
SE_40628chr1:206888111-206891316Left_Ventricle
SE_42239chr1:206886370-206889066Lung
SE_45992chr1:206886188-206891212Osteoblasts
SE_48186chr1:206886265-206888115Psoas_Muscle
SE_48186chr1:206888149-206888979Psoas_Muscle
SE_48619chr1:206886260-206887062Right_Atrium
SE_48619chr1:206887101-206888007Right_Atrium
SE_48619chr1:206889007-206891195Right_Atrium
SE_50514chr1:206886245-206889409Sigmoid_Colon
SE_51178chr1:206886185-206891206Skeletal_Muscle
SE_52589chr1:206885539-206891265Small_Intestine
SE_54245chr1:206887278-206888715Spleen
SE_54245chr1:206888868-206891242Spleen
SE_59174chr1:206876376-206918919Ly3
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1206887200206889030
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I206712chr1206885617206891363
Enhancer Sequence
CATGGTCCAC AGTGAAAAGA GAAACCGTTT TATAAATCCC ACTGGTGAGT GCTGAAGTAG 60
GAGTTTAGCA AGAGTCTGTG GGCACAGAGA GGCAGAGGGG CTGACTCTGC CTGGAAGTGG 120
TCAGAGAGGC TTCACAGAGG AGGTGACATT GCCATGGTTC TTACAGACGT GAAGTCATGA 180
CAAGGCCTGG CTTGCCTGAG GTCAGGAAGT GCATTGTAGC TTCAATATAG GGGATGTGTT 240
GGGAGGTTAG GGTAGCGATG ATGTGGATAG GAGCTAGGGA AGACTAAGTT AGGGAATTTG 300
GATTTTATCA TGTCAGCCAG TGGAGATGTT TAAGGAGGAA AATGTCCTGC TCAGCTTTGC 360
CTTTCAGCAT GTGACCCAAG ATGTACTGGG ATGGAGTACG TCTCCCTTCT AGAAACCAGT 420
TAGAAAACAC AGAAGAGTAG GCCAGGCATG GTGGCTCATG CCTGTAATCC TAGTACTTTC 480
GGAGGCCGAG GTGGACAGAT CACTTGAGGT CAGGAGATTG AGACCAGCCT GGCCAACATG 540
TGAAACCCCG TTTCTACCAA AAAATAAAAA GTTAGCCAGG CGTGGTGGTG TATGTCTGTA 600
GTCCCAGCTA GTCAGGTGCT TGAGGTGGGA GAATTGCTTG AACCCAAGAG GCGGAGTTTG 660
CAGTGAGCTG AAATCATGCC ACTGCACTCC AGCCTGGGGG ACAGAATGAG ACCCTGTCTC 720
AAAAAGAGAA AGCACACAAG AGAAAAGGGG CTGCAACCCA GTAAGCGATA GCAGGACTGG 780
AAAAGGAAAG ATGGATTTGG GAGATCTTCC CAGAGACAAA ATTGGATTGC TTCTGTGGGT 840
GACGGAGGGA GAGAGTCTGA GGATGAGTAC TCAAGATTTA TATCTGGGAG CCTGGCTAGA 900
TAGTGATGTC ATTGCCGTTT ACTGAGATCC GGGAGCAAAT TCAAAGGGGC CGTGAGTTCA 960
GTTTGGTGCC TGTTCAGCAG CCTGTCCTAG ATCCACCAAA CAGCACTTTA TTACTGGCCA 1020
TTTATAACAA CTGCAAATAT TATCTAAATG CTTTGTCATC TCACTGCCTC CTCCTTTGTC 1080
ATCCCTAAGG TCTGGGCAGG AGACTGTGTT CATATACTTC ATAGAGGTCC AGACCCCTTG 1140
CGTCTGGCAT TCCTTTGGTC TATAATTCAG TAAACTCTGC TAAAAAGGAA ACGAGACTAG 1200
CTTGCTGTGG CCTCTTAAGC GACCCAGGGT AGCTTGTGAT GGTTCAGATT ATGATTTGTT 1260
CTAGAGCTTT TCCAGAGGCA GATGTTGAGG AGTTTATCCT ATTTGTCCCC TTCCCTTTAA 1320
ACAAACAAAA GTGCCGGCTG GACGCAGTGG CTCATGCTGG TAATCCCAGC ATTTTGAGAG 1380
GCTGAGGCAG GCGGATCACC TGAGGTCAGG AGTTCGAAAC TAAGCCTGGC CAGCATGGTG 1440
AAACCCTGTC TCTACTTAAA AAAAAAAAAA TTAGTTGGGT GTGGTGGTGG GAGCCTATAA 1500
TCCCAGCCAC TCGGGAGGCT GAGGTGGGAG AATTGCTTGA ATCTGGGAGG TGGAGGTTGC 1560
AGTGAGCTGA GATCACACCA TTGCACTCCA GCCTGGGTAG CAGAGTGAAA CTCGGTCACA 1620
AAAAAAAAAA AAAAAAGAAG TCCCAACCCC CCAGTTTTTT ATATCCTCTT AGTCATCATA 1680
GTTTATTAAC AGTTTTGTTT ACATATTGCT TCTTTTTCCC TCTTGGCTAG ACTGTGAACC 1740
TTGAAGCCCT GTGAGCTTGG TCTAGTGCCT GGAGCATTGT GGGTACCAGG TTTCGAGAGA 1800
ATGTGTGCTG CCAGAAAGCA GATCTTTGCC ACCTCCTCTC CCCTCAGCTC CTGAACCACT 1860
GCCAGCAGTG GTTCTGGAAT CAACCTGTAC TTTCCTTCTG CATCCTGGGA TGTAATTCTG 1920
GGTGATTGTA AGTTGGTTTA TGGTCTAGCT TAGAATTGAG GCTTCTCTTG AGAGAGAGCA 1980
TGTGTGTAAA TGTTTAGCTT GTTCTAGTCT GTGGAGCATT CTCCTTCATA GAAAAGATGG 2040
GAAATACTGG AGATGAAAAT TCTCCATTCT CTGTCATTTT GTGTGTTAGA GTCTCTGTCC 2100
CCATCCCAGG GCCACTTCCT CCCTGGTTCT TCTTATGGCT TTGGATGTAG CTTGAAGACA 2160
TGCTCCTAGC ATTTTCACAA GCTCTGCTTG TTGTGTTTAG TGAGCGCAGA CTACTCCCTT 2220
CGGGCCTGTC CTGGCTCATG GGCAGTTGCT CGTGTCTTTG CACACATCCT TTACTGTCTC 2280
AGCTCTTCAC TTCTCCCTGA CATTTGTGGC TGCCTCCTCC TGGTTTCTTC TTTAAGCGAT 2340
TATTGTGTTT TAGATGATCA GAATTCACTT TTTAGAGACT TGGACCTTGT CTTTCAAAAT 2400
GCATTCCCTT TTGGGATCTC TGCCCATCAT ACTCCTTGGT CTCAACATCT AAATATTGGT 2460
TTTTTTTTTC TTTTTCTTTC TTTCTTTTTT TTTTTTTTTG AGATAGGGTC TCACTCTGTT 2520
GCCCAGGCTG AAGTGCAGTG GTACGATCAT TGGCTCACTG CAGCCTTGAC CTCCTGGGCT 2580
CAGTGATCTT CCTGCCTCAG CCTCCTGAGT AGCTGGGGCC ACAGGCTAGT GCCACCATGC 2640
CCTGCTAATT TTTTAAATTA TTCATAGAGA CGGGGTCTCC CTGTGTTGCC CAGGCTGGTC 2700
TTGAACTCCT CCTTCTCCTT TTTGTATCCT CTTAGTCATC AAGCCATCCT CCTGCCTCAG 2760
CCTCCCAAAG TGCTGGGATT TCAGTGTGAT CCACTGCGCC TGACCTGAAT ATTGGTTTTT 2820
TTGAAGTCTA GGCTAAACAA CTGTTTTTGT CTCAGTTTTT TTTTTTTTAA TTTCCCTCCT 2880