EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-01808 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr1:68278040-68286770 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr1:68279856-68279872CATAAAGTAAACAAAA+6.94
FOXH1MA0479.1chr1:68280799-68280810TGTGGATTGGA-6.62
FOXP2MA0593.1chr1:68279860-68279871AAGTAAACAAA+6.62
Gata1MA0035.3chr1:68278063-68278074ACAGATAAGGA-6.14
Gata1MA0035.3chr1:68283052-68283063ACAGATAAGGA-6.14
Gata4MA0482.1chr1:68278243-68278254AGGAGATAAGA-6.14
HNF4GMA0484.1chr1:68281995-68282010AGAGTGCAAAGGGCA+6.04
IRF1MA0050.2chr1:68283460-68283481TCTTTCTTTCTTTTTTTTTTT+6.25
IRF1MA0050.2chr1:68283792-68283813AAGGAAAAAATGAAACTATAC-6.3
LMX1BMA0703.2chr1:68278422-68278433TTAATTAAAAC-6.14
LMX1BMA0703.2chr1:68279515-68279526TTAATTAAAAT-6.62
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:68285855-68285870GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
Spz1MA0111.1chr1:68281220-68281231GCTGTTACCCT-6.62
TBX20MA0689.1chr1:68284459-68284470CTTCACACCTA-6.62
ZNF263MA0528.1chr1:68285137-68285158CTTTCCTCCTCCTCTTTCCCC-6.27
ZNF410MA0752.1chr1:68278740-68278757AACATCCCATAATTCTG+6.06
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00688chr1:68276814-68285074Adipose_Nuclei
SE_01639chr1:68280968-68282748Aorta
SE_27870chr1:68277074-68285791Fetal_Intestine
SE_28821chr1:68277189-68285946Fetal_Intestine_Large
SE_52846chr1:68277960-68279296Small_Intestine
SE_52846chr1:68279466-68285229Small_Intestine
SE_64727chr1:68279957-68282378NHEK
SE_64727chr1:68282470-68283449NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr16827870668278756
chr16828093968282649
chr16828307168283374
chr16828356968283619
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I067811chr16827721468285675
GH01I067820chr16828576868286070
Enhancer Sequence
AGAACGGGTG TTAATTTCAG CTGACAGATA AGGACACTGA GGTATGGGCA GACTATGTGC 60
CCTGCTAAAG GTCACTGATA ATCACTAGAG AGCCAGGTCT AAAGTCATAA TGCTTCAGAA 120
TGGAAGAGGC CTCAATGAGC CATCTACTCC ACTCATGTCA ATTTTACAGA GGAGCTAACT 180
TTCATCTTGA GAGGTAGGAG GGGAGGAGAT AAGACTTAGA GTGATTCTCT TGGTTTGGCA 240
CAAAGCAGCT GCACAGGAGC CATTCGAAAA GAAGGCCTCT CACTTGGTGA GAATGAGGTA 300
GGAGATAAGG ATAAGGCCTT TCCTCCTCCT AAATGTCTAT AAAAGCTGAG CTACCCAAAA 360
TGGTAGCTAT ATATTAACAA GTTTAATTAA AACTAAATAA AGCAAAATTT AACTCCTAAG 420
TTACAGTAGT CATATTTCAT ATGCTCAAGA GGCACAAGTG GCTGGTGGCT ATGACACCAG 480
ACAGACTGAA CCTGTCCTTC ATTGCAGAAC GTTTTGCACA GAGATGCTCT TAAGTACACT 540
CTTCATGACA AGGATATAGT TGCTGGAATG GGCAGCTGGA ATCAGGAATC CTGGAGCTGC 600
CACCAATTAG CTATGTGAAC TTGGCAAATC TCTGGGCATC CATTTCTTCA TTTGTAAAAA 660
GAAGTTAGGC TCCATAATGA CGATGGCCCC TTTCTGTTGT AACATCCCAT AATTCTGTCC 720
CCAAAGCTCC AGATGGCAAG CTCCTGACTC TGGCCACTCT TCTTTCCAAA CTGGGCCCTT 780
TATCAAATTA GATCAAGAGA ACATGCTCTT GGACTTATTT CCCGTAGAAA TGCAGTTGCT 840
GAATACGAAT AGCATCCTCT AATTATTTCA AGGGTCATCA TAAGAAATAG CCACAAGAAA 900
AATTTCTCTA AATATTTACC AGGAAGAACC ACTTAAGATG GTGAAGAACC TATCCCCAAA 960
GCCCCTCTCG TAAGAACCTA CACCTACATG ATAAATCTGG TGCAGTTTAG GGCCAGAAAA 1020
AAAGTATATT TCTCCAGAAG AATTGGTATG CTTCCTTTTA ACCACAGAAT GAAAACAACA 1080
TTGTTCATTA TGATTTTTAG GCATCAGTTA GGGCCTAAGC ATGGGAGGCC CCTGTTCCAA 1140
GGAAACTGGA ACAATTCTGT CTCCAGCACA GAGCTCCTGT CTTCCTTGAC CCCACTGAAA 1200
GTACATTTTC AGCAGAGGCC ACATTTAACA CTTTTTAAAA GTAGAGTTAA AATGTTAAGT 1260
TTTTAAAAAT TAAATAGTTC ACTGATCCCG CTATACCATA CTGTAGAATA TAAACATGGA 1320
ATACGATGAG AATAAAAAAA AATGAACCTC AAATCACTGA GCTAAACAGA ATTAATTATA 1380
CTGGAAGAAT TTGCAGAAGG CTGAATTGTG GCAACTTTTG CATCTTTTCC TCCCCCATTA 1440
TCTCTATCAC CTCCTCCAAT TAAATTAAGT TCCAATTAAT TAAAATGGCA AGCATTTATT 1500
GAGTATCTAA TCTATTCAGT GTCAGGCATA GTTGTAAGTA TTCATATATA TATGTGTATA 1560
TATATATGTA TATAGTAGTA TATACACACA TATATATGTA ATTAAAACTT ATGCCTCACA 1620
GTAACCCCAG GAGGAAGATA AGGTAACTTG TTCAAGTTTA CATAGGTAGC AAGTGTCAGA 1680
GCTGGGATTT AAACCCTGCC AGTCAGGCTC CTGCTCTCTA ATACTACATG AGCCCCCTTT 1740
TTAATACTGA CAATGAACCT TTTCCCACCT TTAAAAGTAA AAATTTAAAA CATCATTAGA 1800
AAACATTACA GAAACACATA AAGTAAACAA AAAAAAATTG TGCTTGCTTA GCAAACAGCT 1860
TTCAGATTTG TCCCTTAGCA CTCTTCTACA CTGCCAGCCA TGAGCCCTTC CTGTTTAGAA 1920
ATTTTAGAGA ATGCCAACTC TTTAATTCTG TCATTTTTCC AACATTCACT CTGAACTTCT 1980
TCCGCATTGT TTTCTGGTGA AATAACTAAA AATCCTGCAT GTAGTGTAAC AGTCAACTAA 2040
AGGCATAATA ACCATTAGCA AAACTGTTCC TACCTATTAA TTCCTTGCTT AACAAGGGTG 2100
GGTCACAATA ATAAAAAGAC AATGAAGCTG GGAACTGACA ATTCCAGTCT TTGCAGCTGT 2160
CATGAGACAG TTTAAAAATG AATTTACATA AGTGATTGCT GGGCTTTTTA TAAACATGGT 2220
ACCTGCCAGG AAACAGTTCC ACTTTCTCTT CCCTGGACTT TCTGTCCTCT TGTAGATTCT 2280
GATTCTCGAG CTTTACAATG CTTTATATGC TTTCATGTTT TATATGCTTA TCAGGACAAT 2340
CTTCTGTGGA CAGTAAAAGG AAACACGTCT CTTAAAGCTA TTAGAAAATT AACACTTGAG 2400
TTATGTGTTT CTTTAGTCCT AGGGGTAGTG TACTCAAACA GGCACAGGTT TCAATTCTGG 2460
CTCTGCAGCC TTGTACAAGT TACTGAAGCT CTCTTGAGTT GTACTGTCTT CTGTAAAATG 2520
AACTAATTAT ATTGCCCTAA TGGAGTTGTA ATGCCAGGTC AACAACAGAC ACACAACAAA 2580
GTTACTTCCC ATAATCAAAG TTGTAAAAAG TTAGTTTCAA AACCAAGCTG CACTTTTGAG 2640
ATTCCATTTT TCATTTTTAT CCAGTTTGTG GCCATTCCCA AAGGACTCCT TTCAGGTGCT 2700
TCTGGAAAGT GTTACCATAC AAAAGACTTC TAGTTCTCAA GGGGGAATGG AGAAATACAT 2760
GTGGATTGGA AATTCAATCC AAACAAAACC TCTCTAAAAA TTTTTTAAAT GGTATTTGTA 2820
TCCAGGAAAT CAAGGCCACA AATCGTTTCT ATGAATGAGA ACTTTACAGG TTGCCTTCCC 2880
TCACAATTTT TCCTTCACTT ATATCCCTGA TAAAAATAAG AAATGCTGCT GGATATAAAG 2940
CAAAATTAAT GTTGACCACT AAAGCCATTT CTAGTCAAAA TTCAATAGCC TACATACACC 3000
TCTTGAAAAA ACAATTTGCT CCCAGGCTCC GTATGATGAC GCTGGCCATG AGTAACACTC 3060
ATGTCCCAGA ATCCTCAGAT TTAGCTTTCT CAAGAAAACT TTCCATGAAA CACGACTTGC 3120
CAGGACAAGG CCTTGCGGAG GCTCCTTGTG TACCTGTGGC CCTCATCCCC AGAGTGCTGT 3180
GCTGTTACCC TGTGGGTTAC TGTGTCGAAA TGGAAGCGGT GACGTTCTTC CTTCAGGGAC 3240
ATTCCTTTTG TTTTTACCTA GCAGCATACA CCAATAATTT GTAAGTAGGA AGAGTTTTCT 3300
GTTCATTTTT TTCTTAATGG ACAGATTTAG ACAGCCCAAA GGTAGGGCTC GGTATGTGCT 3360
GCGGGGAGGG GCTCAGAGGG CCGGCATGAG GGAGGATTTG TGCCCAAAGG CTTCTCACAG 3420
ACTCCGTAAC TAGATGAGGA AATGAGCCAG GATCCACAAG ACTCCTCAGC GGCCAAATCC 3480
CGAGTTCTCC TTCTGTCAAT CATCTGCACT GCAGAGACTT AGAGTACACT CCGGCAGCAA 3540
GAAGGCTGCT CTCCCAGTGC TCCTGCCTTG ACCATGCCCT GGAGTTACCT GGAAGCTTTA 3600
TTAGAGACTG TACCCTCTGG GCCCCATGCC AGGGCTGGGT GCGGCCGGGG CTCCATGATT 3660
TTCAGTCACT CCTCAGCTGA TCCTAACATG CACATAAGTT TATGAACCGC TGCCCTGGTC 3720
CCTTCTGCCT TCAGTGAGGC TGCGGAAGCT GCTAGAGCCT ATTATCTTGA GACTTTTTTT 3780
TCTTTTCTTC TAATGAAAGA AAAAGATAAT GTACGAAATC ATACATTTTG AGCTTTCCTC 3840
AAGTCAAGAA AGTTTAGGTC AGAGTCCTTA GTGTGAGTTT ATCCCTTTGC CCCACCCACC 3900
CTAATGAAGA TTACAGCCGA CCGTAGTAAC TGGAGCATAG AGCGTGCTCC TGGGCAGAGT 3960
GCAAAGGGCA CCCTTTCAAA GAAGGTGGAA GGGAAATGTA TTGGGAAGTT TATGAAGGGG 4020
AGTAAAGAAA TTTAAGAAAC AGATTCACTG CTCTTTGGAT ATGCGTGCAA GGGCTTTCAC 4080
GACTTTCCAA GCCCCTGCCT TCATCTGGAC TCCTGTTCCT CCTGGACACA CTCACCCTCC 4140
AGTCTAGTTA CAAATTATTC ACTCTTAGGA CAGGGCCCTC TGCCTCCAGC TCAAGCCAGC 4200
TGGAGACCTC TGCCCTCATC CCCACCCCAG GTTTCCAGGT GGGCCCTGCC ACTTACGGTG 4260
TGACTCCTAA ATACCTGTGG GGCAGCAGTG AGCCAGAGGG GTGGGGAAGA GTATAGATGG 4320
GGCTCTCTCC AGGACTGACT CCTGCGTACT CAGCCGTCCT CCCAGGACAG GTAGGGCCCG 4380
GTGACAAGAC GTCCTGAGCC TGGCCAGCAC CCGACAACTC CCAGCTCACT AGATTTAATG 4440
AGGCAGCACA AAAGCAGGAG AACAAGAGGT GTGGGGCTCT AACTCCACCT TTGCCCTCTG 4500
CTAGCCCATG ACCTTGTGCA AGTAACAGAA GCTTTCTAGA AAGTGCCTCA GTGTCCCCAT 4560
CTGTAAAGTG GAAATTAATG TTTGACTAGA CTCCTCAGAA AGCTTTTTGA AAAGTGCAAA 4620
GTGCTTTAAG TTATTTTGAT ACAATACAAC TTCTCTAGAC ATTAATTGAA TCTTCTATGC 4680
ATGGGACACT GCCTATCACT GACAATATAA AGATGAAAAA AAGGCCACTG AATTCAACGG 4740
GTACAATATA TTCCACAGAG CAAACAGAAA TGTGGTAGAT AAAGCTACAT AATTCAATGT 4800
AATAATTAGT ATGATGGCTG AATAGCATGC TACTGGGAAC CCAGACAGCA GAAAATTTAC 4860
ATATGTCCAG AGATGGGGGA GAGAAGAGGA CAAGAAGGTG ACATCAGGTA AACACTGATG 4920
GTCAGGTACT CATCTGAGCA CTTTATGTAT ACAATCTCAA GTGAGCCTCA AAACAACCTT 4980
GTGAAGTAGG TAAGTACTGC TTTCCCCATT TTACAGATAA GGAAAGCAAT ACCTACCTAC 5040
CTGGCAAGTT CAGAGAGGCA GTCTCTCAAA GTCACATGGC TAGTGAATGG CAGAGCTGGG 5100
CTTTGGCTGT GGGCCCAAAA CCTGGATCAT AATCTTTCCA CACACTGTCT CCACCCTAAC 5160
TATGACCCCA TTCCTGATCT CCCCAGTGCC TTGCCCTGGC TCAGGCATAG CCCGGCACAC 5220
CCCTCCTCTG TGCTTCCATA CTTCTGTATT CACACTGCCA TATAACATGC CTATTATTCT 5280
GTCATTATTT GTTTTTGTGT CTGTCTTCCT CATTAGCTTA CTGGTCCTTA GGGAAGAAAG 5340
GGAAGGCAGC AGGTGCTTAG TAAACAGTTG GTGTTTGGTG TCTGGTGTTT AATAAATGTT 5400
AATAAATGTT TTCTTTTGTT TCTTTCTTTC TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT GCGATGTCTC 5460
ATTCTGCTGC CCAGGCTGGA GTGCAGTGGT GCAATCATGG CTCACTGCAG CCTCAAACTC 5520
CTGGGCCCAG AAAATCCTCC CACCTCAGCC TCCTGAGTAG CTAGGACTAC AGGCACATAC 5580
CACTGCACCC AGCTAATTTT TAAAATTTTT GTAGCGATAG GGTTTCACTA GGTTGCCCAG 5640
GCTAGTCTCA AACTCCTGGG CTCAAGCAAT CCTCTTACCT CAGCCTCCCA AAGTGCTGGG 5700
ATTACAGGTG TGAGCCACTG CACCTGGTCA ATAAATGTTT TCTCAATGGA TGAAGGAAAA 5760
AATGAAACTA TACTAGGCTT CGACAGACTG GTAGGAATTT ACTAGGTGGT TTGAAGGAAA 5820
CATTTTCAAA AGCAAAGGCA GACCCTTATT CATCCTTATG TCCCCAGAGT CTTGTACTTA 5880
TTACAGGTAC TTAATAAATG TCTAACAAAT TCTAGGCAGA GGAAACAGTG TGAGGAAATC 5940
CAGAGAGATT TAAGGTTACA CAGTGAGTTT GGACAACTTG GCCAATGTGA ATCACATAGT 6000
GGGTGTGTGG GGACACAGAA GTGCTTCTCA AATTATTCAT GGGGAAAGAC CAGGGGTTTT 6060
TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTACTTCC AATTCAATAT GGACCAATTC TTTCATAAAA 6120
ATTCAGCGAA AAGGAACTGC CAAAAATGGG ACAAAATACA AGTCCAGTTC CTAATCAGAT 6180
TCAACAGATG TAAAATGATG GTCAAATTGC TATAAAAATT ACCAAATATG GACTTATCTA 6240
GCTGCAGATT GCTAACAAAG AGGTCTGTCT GCTGATCAAG CTTTGCCTGG CACTGAGAAA 6300
GGTGGAGGTA GGAGCTATTG TGGAGAGCCA CAAGAAAGAT GAGCTTGTTC TACAAAGGAA 6360
AGAGAGATCA AGAATAATGT TCACTGAGGA TTTCTGTGTG GCCGGCATGG TTATGAGTGC 6420
TTCACACCTA TTAACTCATT TACATTTCAT AACTTATCTG TGAGGTAAGT GCTATTATCA 6480
CACCCGTTTC AGAGATGAGT AAACTGAGAC ACAGCCGTTA AAAACATTCC CAAGCCAGAG 6540
GTGGTAAGAA GCATCACGAG GCCTTGAACC TGGGCAGTGT GAATCTTCAT TACTAGACTG 6600
CGATGCCTTT GGGGAACTCA TAGACAATTT TCTATTGTCT ATGAGTTCAG GAAGTGACCC 6660
ACTGAAATTT ATGTTTTCAA GAAATCATGC TGGTGGCAGT GTGCAGGGTA AAGGTCAGTT 6720
AGGAAGCCAC AACAACAATC CAGGTGAGAG GCATGGGGGT AGGGAGAAGC AGACATGCGG 6780
GCGCTTTAGG AGGTGGACCC AGGCTTTAGT TGGGGGCAGG GTGTCCAAGC TAGGGAGAGA 6840
TGAAGGGGAG GGAGGCGTTC CTGATGACTC AAGGGTTCAG AGCTTAGCAA CCTGGGTGGA 6900
TGGAAATGTC TTACAGAAAA CAGGCAGGAA AGCAGGTTTT AAGGGGACGA TGATGAGATC 6960
AGTTTTCAGC AAATGTCTAT CTGAATTTGA AGAGCCTGAG ACAATCTACA GTTGTGTCTT 7020
AGGAAAATTC TACAGACTGT GATCTTCGTT TACTGAATTC AGGTAGTCAC TATTTTTACC 7080
CTAGTTCTGC CAAACCACTT TCCTCCTCCT CTTTCCCCTT TGCACTGGTT ACACTTAAAA 7140
TAGTTTAAAA AGCAGCAGTT CCAAAACCCT AAACTTTCCT CCCTTCAAAA ATAACACAGT 7200
GTGTATGCAA AATGCCACAC TCATTACAGC TTATTTCTGA ACAAAAAGCA GATTTCCCTG 7260
CAAATTCTTA TTTGCATTTT CATTAAATTC AGATTCTTTA TAATGGCTTA TGTGATCTGT 7320
TCTCTGTCTA CTTCTCCAAA CTTATCTCCT ACCATGCATT CACTCATTCA TTGTTCTTTA 7380
CACTCCTACC ACAGGAGCCT TCTTTTTGTG CTCAAACATG CGAAGCTTAT TCCCAGCTCA 7440
GTGCCTTTGC ACTGGCTGTT CCCTCTACCT GGAATGCTCT TCTCCAGATT TAACCTGGCT 7500
GCCTCCTGCT CATTCAGCTC TCAGCTCAAA TGTCCCCTCC AAAGAGTGGT CTTTCCTGGT 7560
CACCTCCATC CCCAGTCCAT CTCTCTGTCT CAGTCCCCTG CTTTGCTACC TTCACAGCAC 7620
TTACCCCTTT CTGAATTGAC CTCGTCATGT GATTTTTACT CAAGGAATTT TGTGTATCTT 7680
GTTCACAGTT GTATCCCCCA AGTAGACAAT CAATAAACAT TTGCTGAATT AAAAAAAAAA 7740
AAAAAGATCA GCCAGGCACA GCGGCTCACG CCTGTAATCC CAGCACTTTG GGAGGCCGAG 7800
GTGGGCGGAT CATCTGAGGT CAGGAGTTCA AGACCAGCCT GACCAATATG GTGAAACTCT 7860
GTCTCTACTA AAAATACAAA AATTAGCTGG GTGTGGTGGC ATATGCCTAT AGTCCCAGTT 7920
ACTCAGGAGG CTGAGACAGG AGAATTGCTT GAACCCGGAT GGCGGAGGTT GCCAAGATTG 7980
TGCCATTATA CTCCAGCCTG GATGACAGAG TGAGACTCCA TCTCAAAAAA AAAAAAAAGA 8040
TCAACTTGGA GCTTATTAAC AACTGAAAAA CAGATGAAGA GACAGGGCCT TTGTCCACAA 8100
AAAATAGCAA AGAAACATCC AAGTACGAGA GAGACAACAC AGGGCAGTGT CTCCTCCCTG 8160
TGTCCCTTCC ACTCCCAGAA GCCCATTCCT CCAGACCACC TGGCGGATGC CTCACCTGTC 8220
ACACTTTTCA ATGTGGTATT ACCAGAGGCT GTTGGACAGC AAAACGGTGC CATGAAAAGA 8280
GTACTGATTT CAGAGTCAGA CCACTCACTA CTGTGCCTAT AACCTTCCAA GCACAGTATT 8340
CAACCTCTCA GAACCTGCTT CCTCACTTGT AAATGGAGCC AGTATTCCCT AGCTCAGCTA 8400
CTATAAGGAG TGAGAAAGTG TATGTGAAGT TCCTAGCATA TGCTGATACT CAAAGGGTAA 8460
CTATCATCAG CTTCATCCAG TTTACTGCCG GGACACTATA CTCTCTCAAT TAGGGTTTAA 8520
TAAATGCATT TAACTGTAGA AATAAGTTTA ATTGATATTA AAGATGATGG ATATTACGTG 8580
ACCACTATGA TAATGATGTC AATTATAACA ACAGTTAACA TCTGAGCACT TACTAGTAAC 8640
ACCCTAAGTA CTTTAAATAT ATCAGTAGCT GTTTTATTCC TAAGCCAAAT ATGGTGTTTC 8700
ATCAATTCTA AGAAGCATAT TTTGTTCACA 8730