EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-01804 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr1:68210760-68212370 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC1MA0032.2chr1:68210795-68210806ATATTTACTTA-6.14
HNF4GMA0484.1chr1:68211714-68211729AAAGTCCAAAGTCCT+6.12
RREB1MA0073.1chr1:68211797-68211817TTTGGGGAGGTGGTTTGGGT-6.51
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01639chr1:68210838-68211486Aorta
SE_26044chr1:68211437-68216835Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27725chr1:68210914-68212669Fetal_Intestine
SE_28951chr1:68210853-68212754Fetal_Intestine_Large
SE_37082chr1:68210007-68218576HSMMtube
SE_45739chr1:68211192-68219124Osteoblasts
SE_51814chr1:68211613-68216689Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_58705chr1:68176128-68226756Ly1
SE_60335chr1:68196375-68216708Ly4
SE_63615chr1:68211392-68216703HSMM
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I067742chr16820827368210792
GH01I067745chr16821105468221574
Enhancer Sequence
GTAAAGTGTT TAGCACAGTG CTTGGCACAT GGTAAATATT TACTTAAGTG TGTGAAATAA 60
ATAAAAATGT AAAACTTTCT CTTGTATGGG TACTTATACA CAGACGACAA ATAAACCAGG 120
GTAATAGATG TGTCATCACA GAAAATTTAT ATAAATCAAC TTTCACAGTT GCCAATGTAG 180
CAAGCCCACC ACAAACACTG TTGTGGGACC TGATAGCTTT CCATCTGAAT TGTTGATGTG 240
AAGAATACAT TTGGAAGAGT CCTGGGCTTT AGTCTCAGAT CTGACATGAA TTACTGCGTG 300
ACTTGGAGAA GGCATTTCAC TCTTCTGGGC CCTGCTTCTT CCCAGGTGGA AAGCTGCCCC 360
GGTGACCAGG CAGCATGGCA TTGGGAAGGA AAGTGCCCAG AAATGGCATC CAAGCCCCAC 420
AGGGTCTGGT TCTCCCACAT ACGAATTTTA TAACTTTGGA CAAAACTGCT TTATTTCTTT 480
GCATCTCTAT TTCTTCTCTC TAAAATGGAG AAAATGGTGT CCGTCCCCTT ATTTCACAGG 540
GTTGGGGGCA AGTAAGAAAG GGAACATTAG AGCCCCTTTG CAAACAGGGC TCTCCACAGG 600
CATCTCCTTT GCTGGGTAAC AGGTGGATAC TTAGTAAGTA TTTGTGGTTT CCAAGTCAGT 660
GTAAAAATCT AAAAAATAAA TAAATACATA AATAGATGTT TGTGGAAATG ACGTGTAGCA 720
CCTATCATTG TCTGATGTAG TTTTCCTTGT TTGTTACTTG TTTCTCCATC CCCCTAGAAG 780
CTAAGGTTTC TGAAAGCAAG GACATCTCTG TCTATATCCC TGCAACTGTT AAAGAGTCAG 840
TACTTAATAA ATACTTATTG ACCGAATTTG TGGAAAGTAT GAATACATGA ACCAATGAAT 900
AAATGACTCT GAAGTTACAT GAGAAGCAAA CAAACTTACC TAAAGATATT AATGAAAGTC 960
CAAAGTCCTA AGAAACAAGG TATGCAGGAC TAAAGCTCTT GGTGTATTGT ATCATCTGAC 1020
TCCTCTAAAT TCTTTTCTTT GGGGAGGTGG TTTGGGTGGA GAAATGGCAG AGTTAAGATA 1080
CTATAAAGTT GTTAAATTAA CATACTCAGC AGGTCCACAG ACTTTCTAAA GCTGAATACC 1140
AACTGGGATA ATTAAAGGCC AGAGCCTTCT TTTTTAATTG ACTCTCCAAT AAACTACCTG 1200
CTGACAAAGG CATAGTTAAG TTGATTCCTG CAAGAATAAA GAAACGTTTC TCTTCCATTC 1260
TTAATTTTTT AAAAAGTCCC CACTTTCCCC TCTAGCTCGA TGAGCACTTA AATTCACCAG 1320
AATTAAAAAG AAAGTTACCA AATACTTTTT TTTTTAAACT AAGCAAGCCT GTAACATCCC 1380
TTCTTCTCAG CAATCAACTC ATGAAGGCAC GGAAGTGGCT TGTGCTGAGG AAGGCATTCG 1440
GAGGGAGCTA TGGGGGCGGG GGAGGTGGTC ACACCAGCTC TTCACCAAGG GATGGAGAAG 1500
TGCCCAGGAG CCTCCCTCAT TCCTCTCCAT CCCTGTGGTC TAAAATAAAA TCTACCATCT 1560
AAAAAATACT GTTCTAAAAA TAGGGAGTTT GGCTTAAATC CACCAGTTGG 1610