EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-01273 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr1:41173990-41176080 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr1:41174599-41174610GGCCAATCAGA+6.02
Pou2f3MA0627.1chr1:41174024-41174040TTTTATGCAAATACTA+6.36
SOX10MA0442.2chr1:41175298-41175309TTCTTTGTTTT-6.62
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09912chr1:41173992-41180691CD14
SE_11310chr1:41173187-41180749CD20
SE_15194chr1:41173670-41178324CD4_Memory_Primary_7pool
SE_22820chr1:41173545-41180177CD8_primiary
SE_26108chr1:41173936-41180309Duodenum_Smooth_Muscle
SE_35491chr1:41173792-41178431HepG2
SE_59908chr1:41156532-41180069Ly4
SE_63017chr1:41156198-41179996Tonsil
Enhancer Sequence
CTTAAAAACA AGTATACATG GGAATGTGCA AGTGTTTTAT GCAAATACTA TACCATTTTA 60
TATTAGGGAC ATGAGCACCC AAGGATTTTG GTATCCATGA GAGGGTTGGC TGGGGAGTAT 120
CCTGGAACCA GTCTCCCATG GATACCAGGG GATGATTGTA TTCACTAATG TTCTAGCTTT 180
TTTGTCATTC CCCCCAACCC CTTATCATTA TATTTCCTTC TTAGGTTCCT GGTTGACTTT 240
CTAGAAATGC CACTTCCATT GTCCCTGCCG CTAACTTCAT ACATTACCTT AAAATTTTCC 300
TATTTAAATT AGTTTGTGTT TTAAAATAAA GTGCTTTGCC TTGATACCAG TCTGTGCCTT 360
TAAAGTGCCA CTAACATAAT GACAGATGCC TTTTAGAAAT CATGCAAACT ATTGTATGGC 420
CATTGGCATC ACTCTGTTAG TGTTAAAGAA GCTGTATTTT CTTTGGATTA GCCCTACCCA 480
GTTTTGTTTT TCTTCTGTTA ATGCTCAACA GAAAACTGAA GATGGTCACA ACTTTCCGAC 540
CTTGTGCACA TTGCTTCTCT GGTCTATTGC CATAGGATAC CGTAGCAGTA TCTTACAGAC 600
ATCTTTGATG GCCAATCAGA AGCAGTTAAA TTACCTTAAA TTTTTTAAAT GGAACTCTGA 660
CAGCCAATAA GAAATCCCGT GGGTGGGAAC ACTAACAACC CTTTGGCTTG TTTTTAAGAA 720
CAATTCTAAA TTTTCAATAT TCTGTTTTAG AAGCACATGA TGCCCTAGTG CAGCTGCTAT 780
GTGCATTTGC CAGACATTTC CACGCCTTAG AGTTCCCCAT AGTTTGAAGT CTGAATCTGA 840
CCCCTGTTCT GCTTCTCAAG GTAACTTTAA AACAGGAAGT GTACAAAAGA GGTAACTGAT 900
GACGTGAACA GCCAATCGTG GCTTTGTGTT CTTAGCCGAT AAAGCAGTTC AGCCAATGGG 960
ACCACTGTGG AGGCAAGGTT TGGTGTCAAA TAGCATGCTA GATTGAATGC CTTTGACTGT 1020
TAAAGTGGAA GGAGGCTGCA GGGCTTCATT GGAGCCTCGG AGTTTTTCAC TGAGGCAGGG 1080
GTCAGCTGAA AGACAAAGAA AAATGGCGAA TAGTTTGTTG GGGGGTGGGA GGACAGCTGT 1140
TCGGGTTTTC AGTGGAGTGG ACATTCCAGA CTCATGTTTC TGCATCTCCT GCTGCCTTTT 1200
GTTTCCTCCG TCCTTTGGGG GGTAGGGATA GGAGTGACTT AAATTCTCCC AGTCGGTGGA 1260
GGTATAAATA ACTACATGTA AAATTAATGC AGTTCCCGGT AAGTTTAATT CTTTGTTTTG 1320
TGTTGAAATG ATAGAAACTG TTTAGCTTCA GAGAGTGTAG ACAAGTTGCA CTGTTCAGAA 1380
AATGGCCACT TTACATTCCA TGCATACCTT TTGGTGCACC TAGAATACCT TGCTGTGTTT 1440
AGATTTTGCA TGTCCTTCAA CTAGGATTTC TTTCCTAGTT GGGTATCGAC AAGATCAGGT 1500
ACATGGAGAA AGGCTAATCA TTTTTCAGGG GCACACAGAA GCAAAACACT TTTCTCTTTG 1560
CATTGGGTAA ACTTAACTGT TTTCCAAATA ATTTTCCTTT GTTCAAGTGC CCTGAAGCTT 1620
TCCTACGGAA TAAGCTGGGT TGTTGTGAGA GTTTTTCTAT TTCCATGCAC TTTGTTGACA 1680
TCTGTGTTTT CAGATATGGA AGCAACACTG TTGCTGTTAG AAATTTGTGT GAAAATACGA 1740
TTTGCACTGC TGCAGGTTCT AATGGTGAAG GCCCACATGC CAGTGTGAAA TTTTCCCATA 1800
ACTTTCTTGA TTTACCAGTC TACCTCTAGA TTCTAATAAG TAGTAGTTAA TGTAGTAACA 1860
ATCTTTGTTT TTAATGCACA TTTTAGCTTA GAATGCTGGT TAGAAATATC TTCACTTATA 1920
TTGACAGTGA TGAGCAAATA TTTTTCCACA GATTTCACAC ATTTTGTCAG GTGTTGATTT 1980
AGTTCTTTAA AATGATGTGA GCAAAGTGCT TTCCATTTTT CCGTATTAAA TATTTAAAAT 2040
CCTGCAGTTT GTGAATAGGA AAGTTAAGAG TATAGGCACC CTATCTTTTG 2090