EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-01233 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr1:39580420-39583590 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr1:39583574-39583585AAGAGGATTAA+6.14
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:39582028-39582046AGGAGGAAGGAAAGAAGG+6.55
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:39581671-39581686TGACCTTTGGAACTT-6.23
ONECUT3MA0757.1chr1:39582255-39582269ATTATTGATTGTTT-6.04
RARAMA0729.1chr1:39581668-39581686CAGTGACCTTTGGAACTT-6.12
ZNF263MA0528.1chr1:39582029-39582050GGAGGAAGGAAAGAAGGGGTG+6.13
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00416chr1:39582226-39584408Adipose_Nuclei
SE_25799chr1:39580248-39583469Duodenum_Smooth_Muscle
SE_32006chr1:39582806-39583395Gastric
SE_35822chr1:39578065-39583403HMEC
SE_36947chr1:39579990-39583677HSMMtube
SE_37973chr1:39581967-39584097HUVEC
SE_42256chr1:39582891-39583417Lung
SE_45768chr1:39580081-39581943Osteoblasts
SE_45768chr1:39583174-39584474Osteoblasts
SE_47164chr1:39581638-39583573Panc1
SE_54583chr1:39582631-39584292Stomach_Smooth_Muscle
SE_64261chr1:39580108-39583689NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr13958058439581779
chr13958295939583226
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I039114chr13958035939584518
Enhancer Sequence
ACAGTTACTG TCTATTGTAG GGAGGGCTAT CATATAGATA AATGCTGATG CTGTGGTAGT 60
GAAGAGGAGT ACCCAGTATA GCCAGAGTGA GAAAGTGTCC AGGAAGGCAT CCAAGAGTAA 120
GTGAAACCTG AACTGTTACC TAAAGGATGT GGGACCCTGA GCAAAAAGTT TGGGGAAAGA 180
GCATTCTGGG CAGCATGAAC AGAAGTAAGG GGATGAGCAA GCTTGAGAGG GGGAATATTG 240
GGCATTGATA AGGTTGGAGC ATAGGATGTG AGGGAAGGAG AGATGAGATG AGATAGGGAG 300
AGTGGGCAGG ACAAAAATGT TGACTGGCTT TGTATGTCAT ATTGTATAGA GCTTGGACTT 360
TATCCTAAAG GCTTTTGGGA GCCATTGAAT AAAAGTAGGC AAGGAAGACT ATGCTTAGAT 420
TTACATTTTA GGAGTACTTT TCCTCTGGCA GCAGTGCCAA GGAAGGTAGG GGCGAGGAGG 480
AAAGACTAGT GGCAGACAAG TTAGGAAGCT GTCACAGGAA TTTAGGCAGG GAGTGAAACT 540
AAGGTTGTGA AAATAGTAAT GTAATAAAGC AGGCAAATCA AGAAATGTGA AGGGGTAACA 600
TCCATGTGTT TTGATGACTA ATTGTATGTG GTATATGAGG GGGAGAGGGA AGAACCTAGG 660
ATGACTTGGA GGTTTCTGGC TTGAGTATTT GTGTGGGTGG GTCGTGTCAT GAACTAAAAT 720
AGAGAATATA AGAGGAGGAA GGTTATTTTC TGTGAAGTGG TGGCAGTGAT GGTCCACGAG 780
AAGATACTGA GTTTAATTTA GGTTACATTG CGGTCGAGGC TTCTGAGGGA TGCTAGGTAG 840
AGATGTCCAG GAGGTAGTTG GTTGTAATGA ACATGAAACT TAGGAGAGTG ATAGGTGAGA 900
GGGTGAGAGA GTCATCAGCT TATCAAACCA CAGCCATAGG AGGGGAGAAG GAGCTGGCTT 960
TAGGAGTGTA TGTATATTGA GACAAAAACT CTGGGGAACT CCAACAGGAG AGTGGTGTCA 1020
GAAGCAGAGA AAGAGGATCT CCTGAAGGAA ATTGTCCACA GAAAGGGAGT GGCCAGAAAG 1080
GTAAGAGGAA CAGGAGAGAA GTGAGTTTCA AGGAGAGTGT GACACACATT GTAGATTATG 1140
CAGAGGTCAA ATAAGGCAAA GACTACAGAT GTCCAAAATA AAGGTTACTG CTACTGGAAC 1200
ATTTTCAGTG GAGTTGTGGG AAGTGAATGG AAAGTGCAGA AGAGGAGTCA GTGACCTTTG 1260
GAACTTGGAC TTTGAAGGAA GAGAGAGGAG GAAGACAGGT GAAGAAGGGT GGGGAGAGTT 1320
TTGTTTATGT ATTGTAACAC AGGAGAGACT TGAGCATGTT TATTTTAAGT GCTGTTTTGA 1380
AAGAGCCAGT AGAGAAGGAA GATATAATAC AATTCAAAGA CGGGGAGAAA AATTGATGGA 1440
GCATGGGCTC TAGAGTCAAA AGTTGTGTCT TTTAGAAAGA TCAGAGGGTT AAAAATAAGA 1500
ATGCAGGTGA TTAAGTTGGT TGGTTAGAGG TGTAGGAACT TGAGGGAATT TCTCCTGATG 1560
CTCATACTCT CTCTATGAAG TAGGAGGTGA AGTTATTTGC TGAGAGTCAG GAGGAAGGAA 1620
AGAAGGGGTG AGTGTGTATG TGTGTGTGTG TGTGTGCACG TGTGTGTGTG TATGTGTGTG 1680
TGTTTTCCCT CTAGCCCTAG AAGCACTCAA CAACCTGATT GTAATAGATT CCAAGGCAGA 1740
CAGGTAGATT GATCTAGGAT CAGAATTTTC CAGCATAGTT TTGACGGAAG AATATGGGGT 1800
CCTTGTAGTT TGTCTTAAAA TGTAGCATCA GTTTGATTAT TGATTGTTTG TACTGTTGTT 1860
CTCTGGCTGG CTTGTATTTT GGCTCCCCAG TGAAATTGTC TACTCCTCTG GGAAGAAGCA 1920
TATATGTAAC TTTTGCATTC CTGCCTGTCA TTTAGCTAAA TACTATGCAG AAATTAATTC 1980
TTAAGTTTTT GTTGAGATAA TTTGACTTTT GGACAGGACA TCTTGACTCT TGACATAGAG 2040
AGAGGCTTTC CTCACTTGTG GTCTTTAATC CCCATCTCAT TATCTGACAT GGATAGTGGA 2100
GGATTCACTC ACTCTCCATG AGTGAACTCC AGGCCTAGCT TCTTCATTAG TCTTAACAGG 2160
TTAGCTTTAC TACTCTCCCC AGGGCAGTTG AGCTTTGCTT TCCATGAAGG TTATGTAGTT 2220
AATTTGTACT AGGCTTGTGA AGACCTGGGT GTTTACAAGA CTGGACAGAG AGGCTGTTGT 2280
GGAAAATGCA GCCTCCTTCT TGTTTATTTT GGCAGGCAGG CAATGAAGGA GATAGATTTG 2340
TTCTCATGAC TCAGAGCCCT ACCTGCTTTA CCTTAACAGG TTCAATATAA CCACCACCTT 2400
TCAGATGTGA TAGTGTCCTT CAGAGTTTAT CTGACCTTTA TATCTAAAAA GAGTATTAGT 2460
TACCCTTTGC CCTCTACTTG CTTGGTTTTT TTTCACTTTT ATTCCAGTGT AGAGGATATT 2520
TCCTAATGTG TTAGGGCCAG CTCAGAATTG ATGTAGTTCT TTCCCATTGG CACATTCCGC 2580
ATCTTTGTTT GTTTATTGCC ATGTTCGCCA CAGTGTGCCT TGTTTTGCGC TCCTTGTTTT 2640
GTGAAGCTGG ACTCTTATCA GATAAACTTG CCATGAGTCA CACTGGGGAG TGGAAGTATG 2700
TCTCCACTAA TTTGGAGAAT CTTTGATCTT GTTTCACTCC CTGGTTTGGC TTGTCCAGTG 2760
CAATTTGTCT CTCAACCTGC AAGAGGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTA 2820
CTTGGGTGTC CCTTGCCTGT GGCTTCACCT GTTGCCATGA ATGGTTGACT TCAGGGCATG 2880
CCCCTTTGTG TATACAGACT TCCTCTACTA TTGTTATCAC CATCAGCAAA AATGTCTCTG 2940
TTAAGAGCCT CTTTGAATGT AGAATATAGT ATATAACACT GAGAGTTCAT AAACCCTCTG 3000
TCCTCTAGGG ATTTACAGTA TATAATACAC ATTACAAATG ACAAAAGACA ATAAAGAATG 3060
TGTAAGCGGT TGAACAAATA ATGGATTATT GCTCCTCATT TAGCTATCAT ATTCACAGTA 3120
GAAGATATCC TAAAAAGACA TGTAGTCAGT GAGGAAGAGG ATTAACAGAG 3170