EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-00641 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr1:21663510-21668250 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr1:21666141-21666152CTAATCCCCTT-6.32
LMX1BMA0703.2chr1:21667338-21667349TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr1:21667335-21667348AAATTAATTAAAT+6.07
Nr2f6MA0677.1chr1:21665975-21665989TGACCTTTGAGCCT-6.37
RxraMA0512.2chr1:21665975-21665989TGACCTTTGAGCCT-6.14
STAT3MA0144.2chr1:21666573-21666584CTTCTGGGAAG+6.14
ZNF263MA0528.1chr1:21664550-21664571CCCCTCTGCCCTCCCTCATCC-6.55
ZNF263MA0528.1chr1:21664532-21664553CCTTCCTTCCCCTTCTGCCCC-6.58
ZNF263MA0528.1chr1:21665441-21665462GGAGGAGGATGGGGAGAGGAG+8.11
Number of super-enhancer constituents: 44             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00105chr1:21656775-21671990Adipose_Nuclei
SE_00854chr1:21663168-21667245Adrenal_Gland
SE_00854chr1:21667352-21672486Adrenal_Gland
SE_01643chr1:21663301-21667219Aorta
SE_01643chr1:21667344-21672121Aorta
SE_02944chr1:21664000-21666080Bladder
SE_02944chr1:21666135-21667266Bladder
SE_02944chr1:21667360-21668291Bladder
SE_04518chr1:21663353-21665909Brain_Anterior_Caudate
SE_05710chr1:21664624-21665800Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05944chr1:21659989-21673592Brain_Hippocampus_Middle
SE_08398chr1:21663323-21665931Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08398chr1:21667381-21673694Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_26127chr1:21663680-21666771Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26127chr1:21667455-21671889Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26770chr1:21663415-21667226Esophagus
SE_26770chr1:21667319-21672743Esophagus
SE_28486chr1:21663392-21666819Fetal_Intestine
SE_28486chr1:21667334-21672947Fetal_Intestine
SE_29337chr1:21663370-21667087Fetal_Intestine_Large
SE_29337chr1:21667313-21673152Fetal_Intestine_Large
SE_31433chr1:21663236-21672659Gastric
SE_39164chr1:21663441-21666942IMR90
SE_39164chr1:21667486-21670213IMR90
SE_42174chr1:21663299-21667069Lung
SE_42174chr1:21667300-21672712Lung
SE_45045chr1:21663454-21666210NHLF
SE_46660chr1:21663525-21664021Ovary
SE_46660chr1:21664031-21667287Ovary
SE_46660chr1:21667360-21668323Ovary
SE_47592chr1:21663572-21665292Pancreas
SE_47592chr1:21665303-21666898Pancreas
SE_47592chr1:21667472-21668246Pancreas
SE_48583chr1:21663300-21667219Right_Atrium
SE_48583chr1:21667258-21672989Right_Atrium
SE_50108chr1:21663357-21673470Sigmoid_Colon
SE_52633chr1:21663378-21667298Small_Intestine
SE_52633chr1:21667302-21672599Small_Intestine
SE_53334chr1:21663536-21666469Spleen
SE_53334chr1:21667327-21672651Spleen
SE_54639chr1:21663094-21674002Stomach_Smooth_Muscle
SE_56171chr1:21663474-21665484u87
SE_65263chr1:21660486-21671744Pancreatic_islets
SE_67931chr1:21663474-21665484u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 8             
ChromosomeStartEnd
chr12166399121664182
chr12166440021664833
chr12166494721665143
chr12166700021667175
chr12166425521666064
chr12166736221667447
chr12166760721668150
chr12166360021667000
Enhancer Sequence
CAAGAGTGAA AGTCCATCTC AAAAAAACAA CAACAAAAAA AGAAAGTTAA ACACACATTG 60
CCCCTCTGAC CCAGGAGTTG CACTCCTAAG TATGTGCCCC AAAGAAATGA GTGCTGAGGT 120
CTGCAAAGAG TTACATACGA GAATGTCACA GCAGCCTCAA GCTGGAATCA ACCCAAATGT 180
CAGCCACGGA CATTTACACG TACATCCACC CAATGCGGCA CGACTCAGCC TAAAAAGGAG 240
CAGATGCTGG TACAGGCGAC ACGGACAAAC CTCAAACATT CCTTGCTGTC CAAAGCTGAA 300
GAAAACCAGG CACAAAAGAG CACACATGAA TGAATCCACA CAGAGAAAGC TCAAAACCAG 360
GCCAAACTAG AGGGCCAGTG GCCACCTGCT GCAGGGGACT GATGGAGGAG GCACACGGGA 420
ACTGTGGGAA TGGTTCACAC TTTGGTCCAG GTAGTATGCA GGTGTGTGCA TTTGTAAAAC 480
GTGAGCTGTA CAAGATATGC ATACATTACT TAAGTAAATT ATACTATACC ACAATTTTTA 540
GAAACGTACA ATCTCTGCCC TCATGAGGTC CAGTCTGGCA TCCTGTGTCA TCATCGTAAC 600
AGTCATGACA ATAACAGCAG GTGACACCGA CTGAGTCCTC TGTATGTGCC AGCCCTCAGC 660
TGGGCTACTC TGAAACAGGA TCTGATTGAG CGTTTCTAAC TACTGGGCAA AATACTGCCC 720
CAGGAGCTCC ATATTAGAGA CAGGAGAATA AAGCTTAGAG AGGTGACACG CTGTCCAAGG 780
TGACAATGCA AAAAGTGAGG ATGCCAGGTT TGAACCTGGG CCCATCAGTC TCCAAGGCCC 840
ACTCCTGCTG CACGGGCAGA TCCCGCCTCC CTGCCCTCTC CTCCCCACAC TGCCTGCTCA 900
GATGTGGCAC CTGGAGGCAG CCAGTCCTCG CCCCTCGCCC CCTCCTCTCC AGTGCTGGAA 960
GGAACAGCTC ATGTGTGTAA TGGACTCGAA GCTTCTGTGA AAGAGCTGCT GAGGAAATGA 1020
GTCCTTCCTT CCCCTTCTGC CCCCTCTGCC CTCCCTCATC CCTCTCATGG CCACATAGCT 1080
CTGAGGACAT TTCAGCCCTG GACCTCCGCC CAATAAGAAG GGACTCCAAT GGCCAGGCAG 1140
CTGGGGGTGT GTGTGGTATT GACCAAGGAG CTTTCTCAAC CCCTGGACAC CCCAGCCCAG 1200
CCTGTGGCCT CTCAGAGGAC CAGGAGGACA TGAGGTTAGA GTCCCCACCC TTGGCTCCAG 1260
TTTCCAAGTG ACGCAACCAA GTGTCTGGAT TCAGAGAATC GCAAAATGTT TATCTGGAAT 1320
CACAACCACC ACCATGACCA TTTAATCAAA CCTTATCCTG TGCCAAGTGC TACAAACATA 1380
GCTCATGAAT CCTCACCAGC AAACAAAATG GGTACTGCTA GGCTCTCATT TTACAGAGGA 1440
AGAAAGTGGA GCTCAAAGGG GTTAGGTGCC TTGCCCCAAG TCTCACAGTG AGGAAGTGGT 1500
GGGGCTGGAA TTCAAACCCA GATTTGCACA ACTTCGAGTC TATCCTCTGA ATGAGAGTAT 1560
TATACTTGTC ATCCTGCATG TCATTACTGA AGACGGCCCT GGAGTCAGTC TGCTCCAGCC 1620
ATGTCATTTC ACAGATGGGA AGACTGAGGC CCACGAAGGA AGACCGTGGT TCAGGAGGAC 1680
AAGGATTAGT GGCAGAGCCT GGGCTGGAAG CCACCCTGGC CTTGCTTTCA ATGACCAGAT 1740
CAGAGCCTGG GAGCGGGCCA TGTGCAGCTG GATGGGCAGC TGGAGGGAGT CAGGCAGGGA 1800
GGTGGGAGGC TCTGCTTCCA GGCAGAGGTA AATATTGACA TGACTGTGTT TACGCTGTAA 1860
CCTAACTCTG CCTGGCTGCT GCCCCAGGCC CACCCTCCTG CCTTCCCAGC CAAGGAGGGA 1920
AGGGAGCTGT GGGAGGAGGA TGGGGAGAGG AGGCTTCTGG GCCAGGGGCT GCTCCTCCTG 1980
CTTAGAGGGC TATGTGGTCA GAAAGGCTGG GACATCAGGT GTTAGGGGTG GGGGTTAGTG 2040
GAGACCCAGG CCAGGGGACC AGGTGGTGCC AGACAGGGAG GGGCTGTTAT CTGAGCTGGG 2100
GAGCTGGGGA TCTCAGGGCG GGGGACTGGG CTGGGAGTCA CAAGGCCTGA GTTCAAGTTC 2160
TAGTTCTGCT ACTGATTGGC AGTGGGAATC CAAGAACAGT CGGTGAATGG GGAAGAAAAG 2220
GTCTAACTGT CAAGTGCGGT GCAAAGGTGA ACAATAAATA ACCAGCATTT GAGCCTGGCC 2280
AGTGTCCAGC CCCAGTGAGC TCTCAACGCC TCTGGCTACC GGCTCAACAG TCCTATCCCT 2340
GTCCCAGTGG GCTTTCCCAG GAAGGCCAAG TTTCTGCCAA ACTGAGTGGC AGCTTGGGAC 2400
TGAAGCCATA ATAATCTAGA GGAATCGGGG AGCCACTGTC TAGCTCCCGT CCCTAATTCC 2460
CTAAGTGACC TTTGAGCCTC AGCTTTTACA ACTCTGAAAT AAGGCTCACC CTCCTCCCTG 2520
GGGTTGGTGT GAAGAGCAGA GATTACATTT AAGTGCCAGG CACATAGTAG ATGCTCATTT 2580
TGTCTCTCAG TCTTCCCACT TGTCAAACAG GGGCCTCGAA GTTGGTGGTT CCTAATCCCC 2640
TTTTCATACA AGCGCTCTAG CGTCTTTAGA AGGCCCAGAA GCCAGGCCCA CCTCCCTGAT 2700
GTTAGATCCC CACCTAGCCG ATTTCCTGAA TGCTCTCTAG AAACTTGCTC CCCTGTTTAC 2760
ACCTCCCCCC AGGAAGTCCA AAGGGGCCCT GTTGGGAGGA GGGAGCCATT CCTAGGCTTG 2820
TCAGCCCACC AAGACAGGCC TGGGGCATCC CAGCCACTCT GCCCTCAGGG GCCCAAGGAA 2880
AGGGCAGGCC CCAGGTCCTG GACTCCAGTG CCACCCTGAC AGTGGGGTTC CGCCAGCACT 2940
GGTTGTTCAT TAAACTGTGC CCCTCAGACT ATTAACTCTT CAAGGACAAG TGAACCCCCC 3000
TCCTAATTTT TTATGTGTCC AAAACTTGGC GTCTAGGAAG CATTCCACCA AGTGTTAACA 3060
CCTCTTCTGG GAAGGCTTCC CTGATACACA CCTATGGGCA GGATGACTCT GGAGCTGCAT 3120
CCCCAGGTTG GCACATAGCA TTTTCTACCT TATTTCAGAG CGATCTGGGA ACTTGTTCTT 3180
TCTCCTCTAT TAAAGGCTCT GGAGACCAGG GCCCTCGGCT GGTTATCTGC CTGAAAGGAT 3240
GAGGGGAAGG GTCAATACAT TCAGGAGAAG GGGCTGTCTG GGACCTCTGT CTGGGGCCAC 3300
AGCCTCCTTC TGTCTTCACT GACTGCTCTG GGCAGCATGC CAGGGGCGTG GTTTGGGCTA 3360
GAGGAGGACT GGATGGTGCC TGCAGCACCA CCTTTCTCCC AGGGCCACTT CAGGTGCCTC 3420
CTCACTGGTT TCCCAGCCTT CGGCCTCACT CCTTCTACTC AATCACCACA AAGCAGCCTG 3480
TGACCATCTC AGAATGCAAA TCCGACCGTG TCACTCCCCT GACTCTAAAC TCCTCAGTAG 3540
GCTGGGTGCG GTGGCTCACA CCTGTAATCC CAGCACTGTG GGAGGCTGAG GCGGGTGGAT 3600
CACTTGAGGT CAGCAGTCCA AGACCAGCCT GGGCAACATG GCGAAACCCG GTGTCTACTA 3660
AAAAAATACA GAAGTTAGTC GCATGGTGGC ACGCCTGTAA TCCCAGCTAC TCGGGAGACT 3720
GAGGAGAATC ACTTGAACCA GGGAGGCTGA GGCTGCAGTG AGCTGAGATT GCACCACTGC 3780
ACTCAGCCTG GGTGACAGAG CAAGACTATG TCTCAATAAA TAAGTAAATT AATTAAATTT 3840
AAAAAATAAA CTCCTGAGTG GCTCCCCACT GCCCTAAGGA TTGAGCCCCA GGTCCTTCAT 3900
ATGACCATCC CTGAGTGCAC CCTCCGGGCC ACCTCCTAAG CACAGTCCTC CGTGCCTCCA 3960
GATGAACCAT CCCTGAAGGC ACAGCGGTCT GTACTCTTGC ACATTCTGCT CCCTCCACCC 4020
CCCGCCCCCC AACACTCTTC CCAGTCCCAC TCGCTCTTTA GGTTATGATT TTAATGCCAT 4080
GTGCTCAGGG AGCCTTTTCT GATCCTCAGG TCAGGTTCCC GGTCCAATCC CACAGCCCCC 4140
CGCGTGTCTC CCTGACAACA GTAATTGCGC TTGTAATTTC CTGCTCTGTA TCTGTCTGCC 4200
TGCCTGTCCA TCAGACTGTG GGAGAGAGAG ACCTATCAGT CTCACTCACA CTGACCACGG 4260
CCCCCATGCC TCGTGTTGTG CCAGACAGAC TTGTTTGGTG AGTGAGTGAA TGAACAAATG 4320
AATGAAGCCC TTTGACTATG GCAGGAGGCT TACCCAGTCA ATTGGAGAGA AAAAAATTGA 4380
GCAGAAGCAC AAAAAATTGT AAACATTTGC TCATGGTTCC TCTCTCACCG TAGACATGAA 4440
AGTGTGGACT TGGCCAAGCT GGTTTTCTGG GCTAACGCCC AGAACATTCT GCCAAGCCCA 4500
CCTTGTAGCC CTCTCATGCC TCAAATCCTG TTCTTCCCCT GGCCTCCCCA ACTCTGCAGG 4560
GAAAACAATG TATTTATTCT TTAACAAAAG GTAACAACAT CCTTGTTTAC CAAAAGAGTG 4620
TAGCAATGTA AGGAGGCCTC AGTAGCCCAG TCACCAGCAG GGGCACAGGC TGCCCAGGGT 4680
GAAGTACGCA CTGTGCTCTG GGAGCCCCAT CTGGAGTGGC TGAGAGGCAC CAGAGTGACG 4740