EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-00618 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr1:20800400-20808880 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs75810319chr120807073hg19
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:20803829-20803840GATTTAATTAA+6.02
Lhx3MA0135.1chr1:20803837-20803850TAATTAATTAGTT+6.22
Lhx3MA0135.1chr1:20803833-20803846TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:20803834-20803847AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:20803830-20803843ATTTAATTAATTA-6
Nr2f6MA0677.1chr1:20801321-20801335TGACCTTTGAGCTC-6.6
POU4F2MA0683.1chr1:20806125-20806141GCCATTTATTATGCAC-6.27
POU6F1MA0628.1chr1:20803835-20803845ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:20803835-20803845ATTAATTAAT-6.02
RFX2MA0600.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC+6.02
RFX2MA0600.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC-6.29
RFX5MA0510.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC+6.07
RFX5MA0510.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC-6
RREB1MA0073.1chr1:20805934-20805954CCCCAAACCACTCCCCACCT+7.38
RREB1MA0073.1chr1:20808841-20808861CCCCACCCCACCCCCCCAGC+7.81
RxraMA0512.2chr1:20801321-20801335TGACCTTTGAGCTC-6.3
SP2MA0516.2chr1:20807018-20807035CCAAGCCCTGCCCCCCT+6.15
ZNF263MA0528.1chr1:20808093-20808114CCTCCTCCCAAACCCTCCTCC-6.1
mix-aMA0621.1chr1:20803838-20803849AATTAATTAGT+6.62
Number of super-enhancer constituents: 18             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03446chr1:20805352-20808699Brain_Angular_Gyrus
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SE_06168chr1:20800960-20809454Brain_Hippocampus_Middle
SE_06941chr1:20801073-20814394Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08044chr1:20802020-20815753Brain_Inferior_Temporal_Lobe
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SE_23263chr1:20802154-20804475Colon_Crypt_1
SE_23263chr1:20806149-20809183Colon_Crypt_1
SE_24162chr1:20803198-20804404Colon_Crypt_2
SE_24162chr1:20806799-20808760Colon_Crypt_2
SE_24976chr1:20802327-20803850Colon_Crypt_3
SE_24976chr1:20806647-20808745Colon_Crypt_3
SE_27987chr1:20800622-20814579Fetal_Intestine
SE_28809chr1:20799528-20814863Fetal_Intestine_Large
SE_41848chr1:20802447-20804302LNCaP
SE_65794chr1:20802035-20804918Pancreatic_islets
SE_65794chr1:20805486-20809200Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr12080148920801599
chr12080685920807349
Enhancer Sequence
TGTTTCCCTG CCTGTTAAAT GGAGATTATA ATAGTGCCTA CCTCATACAG TTGTTGTGAA 60
GATTAAATAA ATTAACATGT ATAAGAGCTT AGTGCAGCGC TGGGCGTGGT GGCTCACACC 120
TGTGCTCAGC ACTTGTGAGA GGTCATGCCA AGAGGACTGA TTGAGTCCAG GAGTTGGAGA 180
CCAGGCTGGG CAACATAGTG AGACCCCCAT CTCTACATAA AAATTTTAAA AATTAACTAG 240
GTGTGGTGGT GTGCACCTGT AGTCCCAGCT ACCTGGGAGG CTGAAGTGGA AGGATGGCTT 300
GAGCCTAGGA AGTTGAGGCT GCAGTGAACT GTGATCACGC CAGTACACTC CAGCCTGGAC 360
AACACAGCGA GACTGTGTCT CTCAAAACAA AAAATAAAAA CAAACAAAAA AAGAGCTTAG 420
TGCAGGGCCT GGCACTTCAT AAGTGCCCAC AGAGACTTGG TAGTGGTGTA GTAGTAGCAA 480
TCCTCAGTGG GCTATAAGGA CTGGATGAGA TAACACACAT AAAGAATTTA GGGTTGTAAC 540
TGGCACACAG TACTCATGAA ATATATGGCA GTGATTTCCT TAAATGCCGT TAGCTGTTAC 600
ATCAGCCCAT TTTAGAGAGA AGGGAACTGA GGAATGAGAA CTTAAGTGAC TTGCCCTAAA 660
TCTCACTTTA AAGGCTCTTA AGCAGGCTCT AAACTAGTAT TTCCTAACCT CAGCACATTG 720
CTGTTTGAGG CTGAATCATT CTTTGCAGTG GGGCTGTCCT GTGCACTCTA GGATGTTTAG 780
CAGTATCCCT GGCCTCCGCC CACCAGATGC CAGTAGCACT AGCCCTCTCC CCAGCATTTT 840
GACAACCAAA AATGTCTCCA GACATTGCCA AAGTCCCCTG GGGGGCCAAA TCAGCCCCAG 900
CTGAGAAGCA CTGCTCTAAA CTGACCTTTG AGCTCATATA TGAAAAACCT CCTGATCTAG 960
CCCTAACCTC CTTTCCCCCA GTCCCAACAC CACCACAAAT GCCTTGTTCC AACCAGCCCC 1020
TAAAGGACTG CCCTTTCTCA AGCAAACCCC AAACTTACCA ACATCTGTCC CTCTGCTCAA 1080
GAGTGACCTT GCCACCCCAT CCCCTTCTCC AAGGCCCCGC TGAAATCCCG CCCACTCATT 1140
AAATGGTCTC CTCACCCCCC AGAACACGTT GTTTGTCTGT GCCCAGCCTT CATCATGATG 1200
GGCATTTCAT TTTATATCGC ATCTGATCGT GAGCATATTC ATGCTTCCCT GTTCCCTGTC 1260
CCTCATACCC ACCCCCAACT CCAGGGGAGG GGCTGTGCCT GACTCACCCC TGTGTCCCCG 1320
GCACCCTGCA TGGGGCCAGG CACACAGGCC GGGTCATCAC TCTGTGCAGA TGGTTGTCAT 1380
AGATGAGACT GGTGCCCAAG CAGCCTCTTG GATGCTGGTG AAGGACCCCC AGGTTAGAAG 1440
GCAATGTGGC ATGGAATTTA GGAGTGGTTA AGAGTTCAGA GTGGGGGCCG GGCGTGGTGG 1500
TTCACGCCTG TAATCCTAGC ACTTTGGGAG GCCAAGGCGG GCGGATCACC TGAGGTCAGG 1560
AGTTCGAGAC CAGCCTTGCC AACATGGTGA AATTCCCGTC TCTACTAAAA ATACAAAAAT 1620
TAGTCAGGCA TGGTGGCAGT CGCCTGTAAT CCCAGCTACT CGGGAGGCTG AGGCAGGAGA 1680
ATCACTTGAA CTCGTGAGGC GGAGGTTGCA GTGAGCCAAG ATCGTGCCAT TGCGCTCCAG 1740
CCTGGGGCAC AAGAGCGAGA CTTCGTCTCA AAAAAAAAAA AAAAAAAGAG TTCAGAGTGG 1800
AAGCCAGACT CAGACTCAGT TTCCACTCCT GGCTCCTTCC TGACTGAGGA CAGGTTACTC 1860
AGAACCTCTG GGCCTCGGTT TCTTTGTATG TGAAATGGGC ATGATATATA GTTGTAACTG 1920
GCACACACCA TAAACATGAT TCCTAGGGCT GCTGTGAGAA TTAAATAAGA AAATGTACAC 1980
GGAACACTTA GCACTGTGGC ACATGACAAG AAGGCTATTA AGAAAATTTA AATAATGGAA 2040
AAAAAATAGA ATACCGATAG TGATAACTGC GCACTCATAC AATGCCTTGG TTGCAGAGGT 2100
CATTCCCCCA CATTACCTTG TGGGGTTTGA TCAGCAGTTC TGGAAGCACC TAGGGCAGGA 2160
ATCACCACCC CAGGGTCACA GATGAGACTG CTGAGGTTCC CAGAGGACCC AAGCAGGGCT 2220
GCAGGTGCCC TGGCTCCCAA CTCAGTCAGT GCTCTCTGGT TCCGGAAAAG AATTCTGGGT 2280
GAAAGCGGGA GGGGGTGGGA AGCTCCTTCC CCCCAGGTAC CCCTGAGGTC TAACTCTGGA 2340
ACTCCTTGGA TAATGAGAAA AGGGGGGCTT CGGAACCCAG GACGTGGGTT CCACATCCTG 2400
CGGGGGCAGG GAGGCCGCGC GGGAGGCCGC CAGACGCAGT AAATAATTCA CACAGATGAA 2460
CTGGAGATAA GGGCGGCTTC GTGGAGGATC GAGTTCAGGT CGGAGGAGGC TCAGACGGCT 2520
GGGGGGACTT GTGGTCTCCC CGGTCTGAGA GGGGAAAATT CCTGGGACTC TGGCTGCCAG 2580
GAAAACACAG TCCCCAGGTG CCGGCTTGGT GCCACTCCCT GCCATTGGCG GGAGGGAGCT 2640
CCCCGGAACT GCCCCGCGGG GCAACAGGCC TGGCCAGCCG CCTCCGCCCA GCCGTCCCCA 2700
TGGCAACCGG CTGGCCTGGT CCAGGGTTCA CGGACAACCG GATCCTCTGT CTCCCCTCCC 2760
CCACGGGAGG CTGGGCGTCT TAGACTCCCA ACTGTGTTCT CTGGGAGCTT CCAGCTGCAG 2820
GAACCTACAG AATCATCCTG TCTGACCCCC TCGTTTTATG GGAGTAGTTG AGACCACGGA 2880
CTCTGGGGAC CTGCCCGTCC TGGTTGCAAG CCCCGCTCCA CCATTTCCTG CTGTAGGATC 2940
CTAGGCAGGG GACTTGGCCA CCCTGTGCCT CGGTGTTCAT TATCTGTAAA ATGGGGATGA 3000
TAATAAGTGA CTGTCTTATA GGGTTGTGAA AATTGAATGG ACTAAATGCA AAGAGGGCAG 3060
AGTGGTTACT GGTCTGTAGC CAGCACTGAG GAAGCATTAT TTTCCATGTT GGGAAGGTGA 3120
CGGTCACACA GCATGCTATT AGCAGATTTG GGATTGGAAT GCAGTTGCCA ATTCTTCCTA 3180
AAACACCCAG GGTGGCCACA TTGGGATTCT CCAAGGGTTA CCTGTGCTTC CTGCGGGCCC 3240
ACCCAACCCC CCTCTCTAAC CTCTTGACAG TCACAGTCAT TGAATTGTCT TTGACCAGGC 3300
AGTAAAATCC CTGAACCAGA AAAGGTCTTG CTCTAGCCAG CCCGGTCTCC CCAGTGCCAA 3360
GCACAAACCC GTTTCCTGCA CCTCCACTTT CCACCCCATG CCTGGTAGAG GAGTTGTTGA 3420
ATGAATATAG ATTTAATTAA TTAATTAGTT CATCTCCTCT ACCCAAACAC CCTCCCAGAG 3480
CAAGCTCCTG AAGCCCCTGG CCACCCAGCT CTCTCTCTTA CAGGACACCC CTTACGCTGA 3540
CCACTTCCTG CCATCAGCCC CCACCCCACC CCACTGCCAT CACCATGCTG TTCACAGTTC 3600
CCATGGCACA TTGCCTGGGT CCTCCTCCTC CCTTCAGCCT GCCCTCCCTC ACTTCCCTCC 3660
CCGGTTAGTG ACCCTTTGTC CTCAAAATGG CTGTTTTGGG GTCAAGGACC CTCCTCCAGG 3720
TCCAGAGGTG TACATTTCCC CTGGGTTAAG GAAAAACCCT CCAATGTGAG AGGCAACAAA 3780
GTAAACCGTC CTCATCCCCC ATCCTGGGGG AGACAAATGG GGGCCTGGTA CTGCCACGAT 3840
GGGTGTAGGG GTAATCCAGC GGCTTTCTGG GACTCTCCAT CCCACTAGGG AGGTGGCAGG 3900
GGCTTTTGGA CGCAGAATCT CTGCCCTTAG GGGCCACCCC ACAAGCTCCA GCCCAGCTGC 3960
CAGGTTTCCT CGGATACGGC CCAGTCGCCT CTGATTTATT TTTGCATGTG GTTTGGGAGA 4020
ATCTCTGTTG CTGGAATAAC GACAACCTTT TTTTTTCTCT CTCTCTTTTC CTTCCCTCCA 4080
ATAGGCAGAC TTTATAAACC AGAGCAGCTG CCTGAAGGTT TCCAAGAAAA AAATTCTGCA 4140
CAGTTTCTAA CCAGGGTGAC AGTTCCCCTC CACAGGAAGT TACTTTTATT AATTTTTTTA 4200
TCTCTTCTTT TGTAAGACTA TATACTGGTC ATCAGGCAGC ACCTGTGGGC ATTTTCTTAT 4260
TTCCCCCCAC TGCTCCCATT TGCCTGGAAT TCATTATTAA ATCTAACTCA TAGTGGCCTT 4320
GCCCAACACA GGGGCGAAGT TCAAACTACT GAAAAATGGG TCACTCAAAT CGCCTGTGCA 4380
GAAGAATCCC AAATAATTTA TGGAGATACT CCTCCCTCAA GGCGGTGAAA CATAAATCCC 4440
TGTCCCTGAA GTGTGGGCTG TGCATAATGA TTTCCTTCTA TGGAGTATAG TATGGAAAGC 4500
AGGGGGAAAG AGTAATCTTG CAGGAGAGAA ACCTGACAAG CACTAGCTCA GCCAGATGGC 4560
CAAGGTCAAC ATCAGCAGCG ATCAGTCGTG TCTATAGCAT GGACACTTGA TATGATGTGA 4620
TGGAAACAGC ACATCACCCC CAAACCCATA ACCACAGTTG AACCATGAGA AAAACAGCAG 4680
ACAGACCCCA CCTGAGGGAC AGTCTACAAA TTACCTGACC AACAGTCCAT CAAAAGCAAG 4740
GAAAGTCTGA GAAACTACCA CAGCCAAGAG CAGCCTAGGG AAATAAGATG GCTGCATACA 4800
ATGTGAGAGA CCCTGTGGAA CAGAGAAAGG ATGGTGGGTA AAAACTAATA AAATCCAAAT 4860
AAACTACAGA GTTTAGTTAA CAATAACATA CCAGTGTTGT GGAAAATGTA CCGCAGCAAT 4920
GTCAGGTGTT AACAATAGGA GAAACTGGGT TGGGGTATAT GGCAATTCTG TACTATCTGC 4980
AAAACTTTTC TGTAAGTCTA AAACTATTCT AAAAGTTTAC ATTTTAAACA GTGAGTCATC 5040
TGTCTGGGCT TTAGGTAATC CTCAAAACCT AGCTATCTTT GATTCCCCTT TTTTGCCATT 5100
TATGAAGGAT TTGAGCTTCT GATGTGGGGG GTATCCAAGC CCCTAGATCC CAACCTCATT 5160
TCCATAGGAA GAATCATCAT TTTCAAGCTC AGGAAAAACA TCCATTTTGT TCACCATGGT 5220
ATACCCAGAT AGCCTAGCAC AGTACCAGGC ACATAGTAGG TGCTAAATTG ATATTTGTCC 5280
AATGAAAGAA ACTTGAGGAG GTCTTCTTGA AGGAAGTGAT CCAAGCAGAA AGCCAAGATC 5340
TTCCCTTCCC AGGGCGAGAA GTAAGTACCT CTTAGTCTCC ATCCAGAAAA GGAAGACTTC 5400
TGGCAATCTG ATTAGAAGCG GGTAGAGACT CCTCTTGACT CTGCCTTTGG AAGGCAAGCA 5460
TGTGGATTTA CTTAGGATTG TATTTATTAG GACATTTTGG GAGCTGATGG AGATCATGAG 5520
AGGCAGGCTG ATCCCCCCAA ACCACTCCCC ACCTCCTCAC CCAAGACCCC ACCCTTCAAA 5580
CCCCCAAGAT GCCTCCACTG ACCCTCAGGG CAACTGCCAA AACTATACGC AAAGAAGCTT 5640
CATGCAACAA AAACAGTTGG CTAGATCTTA AAAGTGCATT TCCTGGCACA TGGTAGTCAC 5700
TTCATATATG TTAATATTGA TGGATGCCAT TTATTATGCA CCAGGCCCTG TGCAGGGAGA 5760
AGGGAGGAGT TTCCATCTAA TGATGTGTGA GAATTGTCAT TATCCCTATT TTATAGAAGA 5820
CAAAACAGAG GCCCAAAGAA CTTGAGAAAT GCCCAAGTCA CAGCTAGAAA GTATAGGAGA 5880
TTTCAAATCC AAAACATCTG TGTCCCAAAC CCATGTACCA GCCACCCTAA TGTCTGACCC 5940
CTCCCTCTAG GCCAGAGCTT CCCACCAGGC CCCCAGACCC TGGGAGTCCC CTCCCTGCTC 6000
TCTGCAGAGG CACCCCTTAC TCATCCCTTC ATCTGTCTCC TCCAGACAGC AGTGATTTTC 6060
AAGTCTCTCT CTTTTAAAAC TTAATTTGCC AATTTCCCCC TTAGAGGTGC TTTTTGATAT 6120
TCCTTCAGGC TGTCAGCCTG GACAGGCCAC GCAAGCAGAA TCCAGGGAGA TGGATGCTTA 6180
TTACAACCAT TCAATTAATT AAGTTTGAAT AATGCAGCGC TGGCATGCTC CCATCGATCA 6240
GTGGAGGCCT ATAGACCTCC CCCACCTTGG ACTTTTAATA GCCTTTTCCA TATTTATTGC 6300
TACCTAACCG GACACTTCAA GCATATCCTG CACTTGGTAT AATTTGATAT CTGCCCGGTC 6360
CCCAAAGTGC CCTCTCAACA AATGTTTACC TGATGCTATA GTGTATTTAA AAGATTTATA 6420
TTCCTTTTTG CTGAATGGAG TCCTTCGGAA AGGAGGACTG TCTTCCCAAG CAGAGGATCC 6480
GGCATTCGCT GGCGGGGTGG CCTCCAGCAG GAATGTTTTA ATACATCACT TATTAAAATG 6540
GACCTGGAGC CTTGGCCGAG GGCTCCCATA CTCCCTGCTT CCCAACAGAG GACAGCCTTA 6600
GGCCTTAGCT GACCACTTCC AAGCCCTGCC CCCCTTCTAA ACCCTTACAC AATGACTATC 6660
AGAGCCGACA GGGCCTCAAA CCAACAAACC AACAAAGGAC CTTTAAGGCT GAAGGACAGT 6720
GACTGCAGCT GGGACTGAGC CTGGTCCTGG GGTCAGATGA CCCTGCATCC CCCTCCTGAA 6780
GGGTGGACCC TGGGTTTCAG TCCTGGCTCA GTGACTTACT AGCTGAGTCA CCTTATACAA 6840
GTTACTTCAC CCTTCTGAGC CCCGGTTTCT CCTGTACAAT CAGGATAATA ATAGTGCCTA 6900
TTTCACAGGG TTTTGTGAGC CTGGTATACA GTAAGAGCTC AATTAATGCA GAGGCTGTGC 6960
GATCCTTTTG GCCTCTCTGG GGCCTCGATT TCCTTACCTA CTGAAGAGAG CAACTCATGG 7020
GTTTCTAGGG GTGCTGGGAT GATTGCATAG GAAAACAGGA GAGAAAACAC CTTGTAATTA 7080
CACAGTGCTT TGATCACGTC AGTGGCAATT ACTCCTGGGT GTGGACACAA ATCGTGTCTT 7140
CTGAAAGAAT CTTTTCACAT GGCTTCTGCC CCTCGGCAGA TTGATGCCTT GTCCCCCTCA 7200
GCCTATCAGC GGGAATGCCA GGGGATGGCT GAGCTCCATG GTGCCCATCA GCTCCCAGGT 7260
GCTGGGAGTC CCCGGGTAAG CAGGGAGGAG AGCAGGTTCT GGAGGAGGGT CAGGTGCCTG 7320
GGAAAATCAA TCTGGCATTC CCACTCCTGT TGGCCCCGCC AGCCCCAGCT TGCTCACCAT 7380
TCCCAATAAT AACTGCTTGC ATGGAGAGCT CTCTGCTGGG ACCTCCTGAG CCCTTGGGCC 7440
TCCACTGCCT GGGAAGGAGG TTGAGACATC ACCCACTCTG GGCCCTCTGG AGCCCCTCTT 7500
CCTCCTGCCT GCCCCCCTCC CCTAGCCTCT CACCTGAAGT CTGAGTCACT CTTAGGCTCC 7560
TGTCACTGTG AGCTGTGTTG TGACGCCTGG CTGACAGCTT TACCACAAAC ACATTAAAAG 7620
CTCCCAGCAC TTCTGGGTGT GTAATAGCCC AGGAGAAAAA AAAAAACTCT CCCAGTCTTT 7680
CTTCAGCCAA AATCCTCCTC CCAAACCCTC CTCCCCCAGG GGCCTGCTCC ACGACCTTTG 7740
ACTGCCCCAA GCCTAACAAG GGGCTAAGAT TTGTCTTCCT ATCAAGCCCT TCTAACTGAT 7800
GATTAGAGAA AGGCTGATAA GTGCAGGTGC CTGAGACCTC TCAGGCCGTG CACCCCCAGG 7860
AGCAGCGCAT CCCTTGACCT GTGAGCCCCG GAAGGTGAAG ATGAAGACAG AATGCAACTC 7920
ATCTGCAGCC CCGCCTCTGA GGACAGGGGG CCCCTGGCGA AGTATGAAAG GTGCGTAGAG 7980
TGGCCTGATA CTGAGTGTTC CCATGTGCTG GCACTGTGTT CATCCTCCTA ATAACCCTAT 8040
GAGGCAGGGG CTGAGTTATC CTCACTTTAC AGATTAGGAA ATTGAGGCAC TTGCTCAAGT 8100
CTAAAGACCT AGGAAGTCGG GTAGCTGGGA CTCGCATCCA ACTCTGCCAG CCTGCAAAGT 8160
CACTCTTAAC AAGACTGCCT GCTTCCCTGC ACAGTATCCC TCTTTCTCCC CTCACCCCAC 8220
CAGAGATGGC AGAAACCTCA GGGATGCAGT GAGAGCTCAA CCTGCAAATC CAAAATGGAA 8280
TAAATTCACC TTAGGGGGAT GGCCTTGCCA GTCCAGTCCA TCTTTCCTCT CATCTGAGCC 8340
CACCCATAGG GGACCCCAAC ATTGCCTTTT TGCCTCGCAG ACCAAAGCCA CCATCCCTCC 8400
TTCCTGTCTG CAGCCAGCCC ACAAACAGCA AGTCATGTCC CCCCCACCCC ACCCCCCCAG 8460
CCAAAGCAGA GAAAAGAGAG 8480