EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS100-00239 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT1080 
Coordinate
chr3:71628570-71630690 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr3:71629666-71629677TTTGATACATT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 24             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02730chr3:71628265-71635399Astrocytes
SE_09191chr3:71624465-71636105CD14
SE_13022chr3:71626113-71635043CD34_Primary_RO01480
SE_13614chr3:71625219-71636259CD34_Primary_RO01536
SE_14189chr3:71626760-71635027CD34_Primary_RO01549
SE_23720chr3:71628890-71629422Colon_Crypt_1
SE_23720chr3:71629757-71634771Colon_Crypt_1
SE_24354chr3:71629003-71629303Colon_Crypt_2
SE_24354chr3:71630370-71634159Colon_Crypt_2
SE_25012chr3:71628798-71629477Colon_Crypt_3
SE_25012chr3:71629922-71634633Colon_Crypt_3
SE_27550chr3:71628786-71629534Esophagus
SE_27550chr3:71629673-71634771Esophagus
SE_28238chr3:71624284-71635371Fetal_Intestine
SE_29172chr3:71624193-71635215Fetal_Intestine_Large
SE_43216chr3:71628801-71629551Lung
SE_43216chr3:71629783-71634865Lung
SE_54447chr3:71628803-71629508Spleen
SE_54447chr3:71629726-71634889Spleen
SE_58320chr3:71535686-71635865Ly1
SE_59854chr3:71572180-71634756Ly4
SE_61196chr3:71611906-71636208HBL1
SE_61617chr3:71590206-71636416Toledo
SE_62842chr3:71612991-71635824Tonsil
Enhancer Sequence
AAATGTAAAG TAGTTAAATT TTCCTAGACA ACAAGCAAGG ACAAGTTACA GAGAACTTGA 60
ATAAAAGTAG CAACGTGGTC ATGTTGAATG TCAATCTAAA AAAAGAGGTT GTCTAATCTG 120
GAGACTGCTC TCTCTCGCCT TTTTAAATTC CAAGAGTGGG CTGACACAAA ACTTCATCAC 180
CAGAGATTTT TTTTTTCTTT TTTTTCTTTT TTCTTTTTTT TTTTTTTTTT GAGCTTCACA 240
TCAGATTTAA ACTCTCACAT ACAAAACCTT GGCTTCCCTG ACAAGGCAGA TCTTCTAAAC 300
TCAATGTGAG AAAACGTTAT CTAACTCTAG TGTAGGAGTC TAATGTTGGT AAAAAGAATT 360
CCATTGCACA GTTCTTGGTA GCAAGACAGT CTCTGGACGA CTTAATATTC CTTTAATACA 420
TTTTTGGGTA GCATTCTCCT CATAAAGAAG GATACATTAA AAAAAATAAC TTGTTTCGCG 480
ACTCGGCATC CATAAGGAAC TCAAATGCTG CCCAGAGAGG GGCTGAGTAT TTCCTTCCAA 540
GTGAGCCTTC GCTTGCACAA CAAAGATTAG CATCTGCAAT GGTCCATTTC TGCATAAGTG 600
AACATATAGC CTTGCTGCTT GATCGAATAG TCCAGGGTTC TCCGTGTAGC AGCTCCTGAC 660
AACCACCCAG CAGCAGTTCT GTTTGATCTC TCCTGCTTCC TTAATTTGGG TTGTCAAGGT 720
TCAGCAGTTG GAGGCTGTTT ACTTTACTTT TCCAAAAAAA AAAAAAAAGT GATTTTTTTT 780
TTCTCCCTCT CTCTCATACA ATGACTAATC CAAAGTCTAA GGGGGGTGGG GGATGCAGCC 840
AGTGGCAAGA TGTTAAACCT TTTTTTTTCC CTTTGCAGTG AGATTTTAGC TGACACCTTT 900
TGAATGGTAA CTAGTTGAGT TCCTTTTTTA TATTTTTCTT GCTCTTTAAT TGTGAGACGT 960
TTCAAATAGA AAGACAGAGG GGGGAAAAAA ACAGTCCAAA TTTCTGAAAC TGTGAGCTGA 1020
GTTTTCTTTT CCTGGACCCA AAGGGATGGG TATTTCCACT TTGAGAATCA AAACTCCAGT 1080
GGAATTCTAA AAAAGATTTG ATACATTTCT CTCTGGAACA GAAAAATAGC AGGAACTCCT 1140
CTTTCTCAAT TATGTAGGCT ATCCCTGGGT AGAAAACACC TGAAGTCTTA CTATTTCTTT 1200
AAAAATTCTA GTTTACACAT CTCCCTCCAA ATTGATTCTT GCTGTGGAAA ACGGGGGTGG 1260
GGGAAAGGGG ATGGAATGGA AAAATTTTGC AGCGATTCTT CAATATATTT TCAGTAGCAG 1320
AAAAATTCCT TTAAATATCC TTGAGGTCTT CTCAACTCAG CTATTGTCCA AGCCCTAAAC 1380
CCTTAAGTCT ACGTACAACC AATGGTGAAG TGTAGACGGT TTGAATGTAC AGATGCCTTT 1440
CAAAGGGAAT CCAGAATGCT CCTCCGGCAT TCCTGTTTAA AGAGCAGTGA CAAAAAAGAA 1500
AATGCTAACT TGGAAAATAC CTGTGAGCAG ACATGAGCGC AATTCCAGCC CCTCAGAAGT 1560
GGACTGCATA AGGTCAAATG CAACCAAATG AAATGTTTAT ATTAATTTCA TTATTCTGCC 1620
CAAGCCTCAC AGATGAGGGC TTGTGGGGTG GGGAGGTAGG GAAGAGGAAG AAATAAGTTT 1680
CATTTTGGGT CTTCTGGTAG AGCAAAAAGA AAATGAATTA AGACGAAAGC ATAGGATGAG 1740
CCCAGACTAA ATCAATACAC TTTGTAATCA GCCCAGCAAG GGTATTTGGA TACAATGACT 1800
TGGAAATAAT TAATAGTTAT AAGAGGGGAG TGGGGTGAGA AGGGGGGCGA GGATGTCACC 1860
ATATTTTATC GGAGCACTTT ACACTCCACG CTAAACTTTG ATCTCCAGAT TTTCAGATTT 1920
AGGAAAGAAA GAGGGGAAAA GGGTGGAGGG GAGGAAGTCC AGTATTTCGA AGCACCTACC 1980
GGCCTGAGGA TGGGCACATT CCTCGCTCCC GGTGCCTTAT CGCTAGGCTC GCGCCACCCC 2040
GGCTGGCTCT TTGGGGACGG AGAACCCCTA GTGCCGCCTG GGGCTCTCCG GTGTCCCTGG 2100
ACCCCGCGCC CGCGGCCGCC 2120