EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS100-00228 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT1080 
Coordinate
chr3:15677200-15680760 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC1MA0032.2chr3:15680382-15680393TATGTAAACAT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:15679525-15679537GTTTGTTTGTTT+6.32
RREB1MA0073.1chr3:15678284-15678304GGGTGGGGGGGTGTTTGGGG-6.21
RREB1MA0073.1chr3:15678285-15678305GGTGGGGGGGTGTTTGGGGG-9.74
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00674chr3:15671117-15680751Adipose_Nuclei
SE_02404chr3:15675530-15678996Astrocytes
SE_30777chr3:15674765-15679025Fetal_Muscle
SE_34855chr3:15671286-15680476HeLa
SE_37315chr3:15674556-15681131HSMMtube
SE_37991chr3:15670990-15681194HUVEC
SE_44420chr3:15674765-15679663NHDF-Ad
SE_45314chr3:15675439-15678511NHLF
SE_45947chr3:15674663-15681448Osteoblasts
SE_51797chr3:15674790-15680179Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_56316chr3:15674985-15680844u87
SE_63585chr3:15674657-15680179HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr31567784815678314
chr31567730515678225
Enhancer Sequence
AATGCTCCTC GGAACCTGAG TTTCTCTCAT ACAGAGCAGA TTGCTCTTTA CCCCTTGATC 60
AGTGGTTGGG TAATCCCAGG CTTCCTACCA CCCTCTGAAA AAGCATCCAG GTAGTTAACC 120
TGAGTTGAGT TAGTCAGTTG AATTAGGAGC CTTACCCCTC AGAGAGTGGT CCGTGGACCG 180
GCATCCCCTG GGAGCTTGTT AGAAATACAA AATCTTGGGC GGCACCCCAG ACCTACTGAA 240
TCAGAATGTG CATTGCAGCA GGATCCCCAG GTGATGCTTT CACATGGCAA GTATGAGAAG 300
CCCAGGACTA GATCCCCAGT TCTCAAGTGT GGTTGTACAT AAGAATCACG AGGTAAGTGG 360
TAAACACTAT GGCTGCCCGG GTCCTGGAGA GTCCGTTGTA ATTGGTGTGG AAGGGGTGTG 420
GACTGGCACT GGGATTGTTT TAAGGCTCCC CAGTGCAGTC TAATGTGCAG AAAAATTTGA 480
AGATGACTGG GCGTGATGAC CTCTCTGAGT CATTCGAAGC TTCACTGAAG TAGTAAGCAT 540
CTGCAAGAAT GCCGTTTGCT CCCTTCAGAC TGTTTGAGGC TCGTTTCCGG TCTCTATGTC 600
GGACTACGAT CAGTCTGAGA CCTTCGCCCA GATAGAACTG ACCCCAAACT GACAAAGGGA 660
AGGTCAGTGC CAGCCTTTGT GAAGGCTTCC TGGTTGGCCT GAATTTCCTG CTCCCTTCAG 720
GAAGGGTGGG GACAAAGGAG AGGCCCCCCT GGGGGCAAAG AGGGAAATAT CAGAGGTTGC 780
CTAAGAAAAT GCCCTGCTGG AAAACACAAA CCCGAAGGGA AGTTTGGGCT GTAACTCTGG 840
TGGCAGGGTG ACCAAGCGCA GCTGCTTGAG GAAGCCCTGC TGTGCCTCAA CAGGATGTAA 900
ACTCATTGTG AGCAACACTT TCCTGCTCTC TGTGAACTTA AAGGGCAGAA CCAGCAGGTC 960
CTGCCCCAAA CAGTCCCTGC CTTAGAGCAG GGTGGTCGGG ATGGCCTGGA CAGCCACAGC 1020
AATTAAAAAA TTGCAACATT TTAAAATTTT AGTCTATAAT ATATATACAA AGGCTATGTG 1080
TATGGGGTGG GGGGGTGTTT GGGGGCAGGG GGTGTGTATG TGTGTATAAC ATGATGTTGA 1140
AAGGGAACTT GAAGACTTGG TCCAGCTTCT TTTTTTTCAA CCAAGACAAC TTTTGCAAGG 1200
GTGACACTTT TCTTTAGTCC CAACCTGACA TACGGTTTCT CCTTGAACAC CTTCAGTGGC 1260
TCAGACTCAC AGGTCCGTTT GTTCCAATGG TGGGAACTTC TGAACAGGTC TTCCTTTCAA 1320
TGAGCAGCAG TCAGCCTCCC CGTAACTGCC ACCACGATTC TATCGTCAGA GCTAAAGGGA 1380
GCAGGACCGT GTCCCTTATC ACGGCATGCC ATCTTCTCCA CCTTTGAGGA CAGCTGTCAT 1440
GATCCCCCTG GCATCTGTCC CCCAGGCTGT ATCCTCAGTC CCTTCCACAG TTCCTTAGGA 1500
GACTCAGTTT CCAAACCTTC TACTGAAGAC TTCCATGTTT TCTCTGTGCT CAGAACTGTA 1560
TGCAGCTATC CCGATTCTGT CTAATAAGGG CAGGGTAGAG AACTCTCACC TGTCGCATTC 1620
TAGATGTTGT CCCCAGAAAA CTGCTGGCAG CCACATGTCT CATTATGGGT GTATAAGGCA 1680
CTTGCTGTCA ACTAAAACAC CTTTTCACAT GAGCAGACAC ACATGCTGCC ATTGCCATCC 1740
TGTACTTATA AATTATAAAG GTGATTGATT TAAGCTGAGG GCAAGACTTC ACATTTATGC 1800
TGTTAAATTT CATCATTCCA GCCTGTTGGG CTATTTAGGG ATCTTTACTG ACATCCCAAG 1860
TATCAGTTAC CTTTACGTCA TTCACACATA TGATACACAC CTCATTTATG TCTATGCTGA 1920
AGTCAGTGTA AAAAAACCCC AGGCTGTGCC CTCAGACCTC CTGATGACAC TGATCTCCTA 1980
GAGGGCAGGC ATTCTCTTGA TAGAGATGTT TGCCTGCATG GCACTGAGTC CAGCACCTGA 2040
AATGTCATCT GCCTCTTGCT TCCCTCCCCT ATCCACCGGA CCATTCTGAG ACATTTGGCA 2100
AATGACACAC TGAAACCCAG ACTGTGGCTG TAGAATTCTC CTGCATTCAC CTTTCAATAA 2160
TCTGCCCCCA GAGGAAACAC TTAACACGGT TTTGTTGAAA CCACGCCAGC TGCACAGCAT 2220
CACTCCGTCT CTATTTGTTT TCCAGGGGCC AGGATTAAGC TGTTGATATG ATCACTTTTA 2280
GAATTTACAG ATATCTCAGC TCCCATACGT GGTTATATGT TTTTTGTTTG TTTGTTTTCC 2340
AGCAGCACTT TTATTTTTCC TTACACGATG ACATGTTGCT GGGGCCTATT GTTCTCACAT 2400
AACAGTAGAA AACCAAAATT TGTTGTCATC TCTTCAAAGA ATCGAGAATT GCATACAGAA 2460
AAACCTTACA TAAATTAAAA GGATGAATAC ATTTACAGGT GTAAATGCAA ACCACTTTCA 2520
ACTCAGACAA GTAACAGCCC ATGGTGTTCT GGCAGAAAAC ATCAGCTAAG AAAGGAAACT 2580
GGGTCCTAAG TCTTGGACTT TCCAACCCTT ACAGACCGGC AGAACAGAAA CAACTGGTTC 2640
AGGAGCCCTT GCCAGCCTCC AGAGAAATCC CAGAACACGC AGCCCTGACG TATTAATACC 2700
CTGCACAGAT CAGAGACTGC TGGCCACGCA GACTCACCAA GCCACAGACT TGTCTTCCAC 2760
AAGCACTTTC TTATCTTAGC CACAAAGTGA CCAAGCCACA TGTACTAAGG GTTGAAATCA 2820
AAGATATGTA CAGGGTATTA AGCAAATCTG GTTATATGTT TTAAAACAAC TTCTAAGACA 2880
AATTGATGGC AAGTTTGTGT GAAAGTTTTA TATCAAAGTT GTTATAAGAG GTTCCTGAGC 2940
AAACCAATTG AAATACAGTC ATGCATTGCT TAATGACAGG GATATGTTCT GAAAGGATGC 3000
ATCATTAGGC CATTGTGTCA TTGTGCATGC ATCATAGCAT GTACTTACAC AAACCTACAT 3060
GGTACGGCCT ACTATGCGCC TAGGCTATAT GGTATGGCCC ATTGTTCCTA GGCTATAAAC 3120
CTTTACAGCA TATTACTGTA CTGAACACTG TAGGCAGTTG TAACAAGTGG TAAGCATTTG 3180
TATATGTAAA CATAGAAAAG GTACAATAAA AATTCAGTAT TATAATCTTA TGGGACCACC 3240
ATCACATATG TGGTCTGTCA TTGACCAAAA TGTCATCATG CAGTGCATGA CTATATTTCT 3300
GTCTCAGTAG GGGCATTCAT AGGGGAAAAA CGGAGTCTAG TTTCAAGATG ATTAGGCTGG 3360
GCAGTCACTT GGGATTGTAA CCTTCATTCC TCAGAAGGAA GGGGTTCTTG ATCTCATTGA 3420
GATCTACCAG AAAATTGCTG AAGCCATTTA TCAAGAATGC AACTTACTTC CTAGATAGGA 3480
TTACTCATCA CATCAGACCC AAAATTTTGC CCAGCTCAGG TTTGGTTCCT CTCCTCATTC 3540
CTGGTTGATA ATAATCTAGT 3560