EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS098-38833 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HSMM 
Coordinate
chr3:58033240-58036050 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs11707429chr358033834hg19
rs12494328chr358035497hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESX1MA0644.1chr3:58033864-58033874ACCAATTAAC+6.02
NKX2-3MA0672.1chr3:58034318-58034328TTCAAGTGGT-6.02
NR2C2MA0504.1chr3:58033638-58033653TGACCCTTCACCCCC-6.01
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:58035975-58035990TGAGCTCTTGACCTC-7.23
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:58033509-58033524TGAACTATTGACCTC-7.41
RARAMA0729.1chr3:58033506-58033524TCGTGAACTATTGACCTC-6.16
ZfxMA0146.2chr3:58035998-58036012CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 18             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00762chr3:58032174-58039716Adipose_Nuclei
SE_01957chr3:58033868-58034414Aorta
SE_01957chr3:58034706-58035838Aorta
SE_23194chr3:58034815-58035733Colon_Crypt_1
SE_26498chr3:58033363-58039459Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27681chr3:58033703-58037597Fetal_Intestine
SE_29426chr3:58033550-58039244Fetal_Intestine_Large
SE_30574chr3:58034058-58035832Fetal_Muscle
SE_36024chr3:58033449-58039332HMEC
SE_37989chr3:58025669-58040227HUVEC
SE_41579chr3:58033874-58034394LNCaP
SE_41579chr3:58034780-58035730LNCaP
SE_45969chr3:58032377-58039419Osteoblasts
SE_47269chr3:58019885-58040171Panc1
SE_56289chr3:58032310-58039346u87
SE_64106chr3:58033450-58035902HSMM
SE_65730chr3:58034390-58037100Pancreatic_islets
SE_67942chr3:58032310-58039346u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr35803351558034395
chr35803500658035314
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I058046chr35803243758041425
Enhancer Sequence
GTTTTGCCAT ATTTGCTTGC TCTATCACTT GCTCTAAAGA TGCATATCAC ACACTTTTTT 60
TTTTTTTAAT TTATTTTTGA GACAGAGTCT GGCTCTGTCG CCCAGGCTGT AGTGCAGTGG 120
CATGATCTTG GCTTACTGCA TCCTCTGCCT CCTGGGTTCA AGCGATTCTC CTGCCTTAGT 180
CTCCTGAGTA GCTGGGATTA CAGGCACGGG CCACCATGCC CAGCTAATTT TTGTATTTTT 240
AGTAGAGATG GGGTTGGCCA AGCTGGTCGT GAACTATTGA CCTCAAGTGA TCCTCCTGCC 300
TCAGCCTCCC AAAGTGCTAG GATTACAGGA GTGAGCCACC ATGCCTGGCC ACATGCGTGT 360
TTTTTATTGA ATCATTTGAA AGTACTCAGC TCGTATCATG ACCCTTCACC CCCACATACT 420
CCAACAAGCA TCTCTAAGAA AAAGGACATT CTCCTAACCA CAGTGTCTCT GCATTCCCAG 480
GACATTCTTC TAACCACAGC GTCACTGCAT ACCCAAGAGG TTAGCACCGA TACAGTAATA 540
ACATCTTGTG TAAAACTTCC CAAAATGCTC CCAAGTGTCC TTTATGACAG TTTAAAAAAA 600
AATGGCATTT TTTGGGATCC AGGAACCAAT TAACGATTAC TCAATTGAAT TTGGTTTCAA 660
AGTCACATAC CTCAACTTTT CCTTTAATCA AGAACAGCCC CCCTGCCTTT TACACATTTT 720
TTTGTCTTTC GTGACCGTGT CATTTTTGAA GAAATCAGGC CCGTTGTCTT GTAGAACTGG 780
TGTTTCTCAA GTGTGCTTGG GAGGGTCTTG GTAAAATGCA CATTCTGATT CTGGAGAACA 840
GGGTGGAGCC TGGGAATCTG CATTTCCAGC CAGCATCCCG GTGATGCCAG TGCAGCTGGT 900
CTTCGGCTGT AGAATGTTCC ACATTCTAGG TCTGTCTGTT TCCTTGTGAT TAAATTCAAG 960
TTGAATATTT TTGGCTAGGG CACTTCCTGA GGTCATAGGT ACTTCCCACT GCCTCACAGC 1020
ACAGGCTCAC AATCTCAGTT TGTCCTGTTA CTTCGTGGTG CTAAGTGTGG TCACCTGCTT 1080
CAAGTGGTGT CCGCCTGCTC TCTGTTGAAA CAATACCTTT CTCCTAGTAT AATGATTAGG 1140
TAACCTGTGA TTGTAATTGG TAAGTAATCT TTGAGACTAC ATGAATATCC TGTTCCCCAG 1200
CAGTTTTCAC TCATTGGTGA ACTGTTTTGG GAAAAATAAT AGCATCTTAC AGTTATAATA 1260
CCCTGCTGGT AACACATGGC TCTTACATAA TCAGCAGTTA ATTGTTTGTA TGTGTGTTAA 1320
TTTTTATTTT TAAAATGTAA CTAGTGACTG GTAACTCTCA TTTGTATTTT AAACATTGGC 1380
TTTTACAGCT TCTCAGTACA TTTCACTCTG TGTATGTTTT TGGTAGAGCA TTTGTTGTCC 1440
TGTATAATGG TTTAGGAAAT CCTATAGGCC AAATGAAGGG CTGGAGACTC ACCTGTGTTC 1500
CCACCACTGT GTTTCACTGT GTATTGCCAG AGAAAATACA GTTAAATTTG AATTTCAGAT 1560
AGACAATGAA TAACTTTTTA GTATAAGTAT GTTCCAAGTG TGGCAGACAG CTCTCACAAG 1620
TTACAAGTCG TTGCGTAGGA CATACCTATG CTAAACGATT TGATGTTTAT CTAAATTAAT 1680
ATGTAACTGA TATCTTGTAT TTTTATTTGT ACGATCTTCC AAGCCCACGT CCCACCGCCT 1740
TCTCGGGGAT GGCCACCATT TGTGTTTGCT GCCTGGTGGT GTTTGCAGCT GCGAGAAGGG 1800
CCTTGGAGGA GGAGCAAAGT GTAGTGGTAT CTCCGTGCTG TGGCCTTGGG CACTGGGGTG 1860
GGGGTTAGAT GAGTAATTAG CTGAATATGA CCTCACCCAT GAAGAATGTG CCCTTGCTAG 1920
GTATTAGCAG AGGTTTAGGC TCCAGGGAGC CATTGTCAGA AGCTTGTCAG TGATGTCATC 1980
AGCTGGAAGG GCCAGCTTTC AGGCCTCAGG AAAAAGCTTG AAAGTCAGGG CTCCAGTTTT 2040
GGTAATAAAT GGGAATGGAG TTTCACAGGT AGGGTGTGGA GGAATTTATT GTGACAGGAA 2100
GCCTGATGGA GCCTCTTGCC TGTGTGCAGC CCCCAGCCAG GTTTCTGAGT TCTGATGAAC 2160
TACCAGAAAC TTCCACCACG GCCTGTGATT ACACTGTTGG CCCAATGCCC TGGAAAAATT 2220
GGCTTGCTCT CGGGGAACAC TCCAGGAGCT GCAAAGGGGG TGTCAGGACT GTTGTGCAGC 2280
TCCCCTTAAA TTGGGGAGGA GGGGTGGCTG ATGTGGAAAC TGTTCATTAG ACTGCTCAGG 2340
GTAGTGTGAG AAAACGTGTA ATCTGTGGGC ATCTACCCCT AGCTGCCCCT CTGATCTCAC 2400
CCACTACTGT GGGAGGACCC CGTGGATGGG GGCAGAGGAG GGTCTTCTGG ATTTAGACAC 2460
TCACAAAACT TCCTTTTACC TTGTTCATTG GAAGAAATAG AAAATGCCTT TTTTTTTTTT 2520
TTTTTCTTTT TTTTTGAGAC AGAGTCTCGC TCTGTTGACA GGCTGGAGTG CAGTGGCATG 2580
ATCTTGGCTC ACCGCAACCT CTGCCTCCCG GGTTCTAACA ATTCTCCTGC CTCAGCCTCT 2640
GGAGTAGCTG GGACTACAGC CACGTGCCAC CACACCCAGC TAATTTTTGT ATTTTTAGTA 2700
CAGACGGGGT TTCACCATGT TGGCCAGGAC GGTCTTGAGC TCTTGACCTC GTTATCCACC 2760
CGCCTCGGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC AGGCGTGAGC CACCATGCCT 2810