EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS098-38832 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HSMM 
Coordinate
chr3:58025820-58028550 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs1623879chr358027197hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr3:58026946-58026967TTTTGCTTTCAGTATCACTTT+6.7
RREB1MA0073.1chr3:58027242-58027262CTCCCCACCAACCACCACCA+6.33
RREB1MA0073.1chr3:58027246-58027266CCACCAACCACCACCACCAC+7.32
Number of super-enhancer constituents: 15             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00762chr3:58026357-58028180Adipose_Nuclei
SE_23194chr3:58026684-58027587Colon_Crypt_1
SE_27681chr3:58025564-58026354Fetal_Intestine
SE_27681chr3:58026398-58027802Fetal_Intestine
SE_29426chr3:58025684-58027847Fetal_Intestine_Large
SE_30574chr3:58026442-58027846Fetal_Muscle
SE_36024chr3:58026477-58028276HMEC
SE_37989chr3:58025669-58040227HUVEC
SE_41579chr3:58024913-58026383LNCaP
SE_41579chr3:58026680-58028166LNCaP
SE_45969chr3:58026358-58032250Osteoblasts
SE_47269chr3:58019885-58040171Panc1
SE_56289chr3:58026661-58028194u87
SE_64106chr3:58026703-58027892HSMM
SE_65730chr3:58025436-58027838Pancreatic_islets
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I058034chr35802017558032048
Enhancer Sequence
GAGACTGTGC CGTTGTACTC TAGCCTGGGC AACAAGAGCC ATCTCAAAAA AAGAAGCAAG 60
CCAGATCTTT GGGGTGCTGT GACGGCAAAT CCCCCAGCGC TGGCCTCTCA GGTTCTCTTG 120
CGGGATTAGT GTTTGTTGAA TAATAAGCAA TACACCCTGA CCCAGCGAGC CAAAGCAAAC 180
AGGACAGTAA CTGAAACTGC AGGGGAGTGT GAGTAAACAG TTACCTTCTA CCCTCATGGA 240
GCTGGCCTCT GGCCAGCAAC ATGATAGCTG TTTGCATCTT ACTCTTATGG AGCCATTGGC 300
CCTCTCATTA AGGTGGGGGC AGCTTCTGGT CCATGCCTGC AAGTCCTCAT GGGAGTGGGT 360
ACCTGACAGG GTGTAAAGGG TAGGTCTGAG GACATGGTTT CTTTTTTTTA TTGTTGTTGA 420
GATGGAATCC TGCTCTTGTC ACACAGTCTG GAGTGCAGTG GCCTGATCTC GGCTCACTGC 480
AACCTCCGTC TCACTGGTTC AAGCGATTCT CCTGCCTAAG CCTCCTGAGT AGCTGGGACT 540
ATAGGCGCAT CCTGCCATGC CTGGCTAAGT TTTGTATTTT TAGTAGAGAC GGGGTTTCAC 600
CACGTTGGCC AGGCTGGTCT CGAACTCCTG ACCTCAGGTG ATCCACCCAC CTCAGCCTCC 660
CAAAGTGCTG GGATTACAGG CGTGAGCCAC CGTCCCCAGC CAACATGGTT TCTTTAAAAT 720
ATACTCCCCG CTCCATCCCA TTCATGTGTG GGAGTTGAGC TGCATCTGGG TTTTTCTTTT 780
CTCTTTTTCT GTAAATCTTT ATTGTATTTT TTTTGGATCA TAGAATGGAT ACATGTTTCT 840
TAAAGTTTGA TCATTATAGA AACTTAATTA GACTATTATT TGAGTGCTAA CCATAGTGAG 900
TGAGTGCTTA CTGTGTGCTA GGTGGCTTTT TATGCCTCAT GTCACTTACA TGAGGTCTGA 960
GGAACGGTGT TAATCCCGTT TTGCAGCTGA GGAAACTGAG GCTACATTTA CGGTCACCTA 1020
GCTGGCAAGC AAGTGGCTGA GCCTGGAGCA GCAGCAGATC TGGGGAACTC CACAAACCAG 1080
ATTTCTGTGT GGTATCCCTG TGGACACAAG GATTTAACTT GATTCTTTTT GCTTTCAGTA 1140
TCACTTTATG ATATTACAAT GAGCTTGCAG TATTTATTTT CAGAAGAAAA GCCAGATTAT 1200
TCCCATTTAT GAGAGAAGCA GCCAGGTGGG CAGGGATTTC CAGCGCTGAA CCAGCCAGTG 1260
TGTGCATTGT CTCTTCCCGC TGAGCGGCCC TGGTGTGCTG GGTTAGTCTG TGAGCCACAG 1320
GAAATGTTGT CAGGGCCTCT GGGCTTTTGG ATGTCAGCAG GCCTTCAGTG GTGAGGAGGT 1380
TGTGGCTGGA CTCAGAGGAC TCCTTGCTTT TGCTGAACGA CCCTCCCCAC CAACCACCAC 1440
CACCACCACC AGTGGGACTA GCCCATGAGC TGTAAGCCAA CCTTTTCCTT CCTAACTTAA 1500
TTTTCCAAAG AATAGTAACT TACCCACCAC CACTGCAGTC ACTGGGCCGG GAAGACAAGC 1560
ACTCTTGCCT TGAATCCATG CCTTGAGCCA GTAGCCTTGA CCCAGGGTAA AGCAGTTATG 1620
TGCTTGGGTC ACCTGGGTCA TGTTTTTGAA ATTGCCTCAA GCCTACCTTA CAAATCCTTC 1680
CTGGAACCCT GCTTGGCTTT TCTTTGTGGG CTTCCCTTAG GAGGGAAGCT TCCCGAGCAG 1740
CTTGTCTTGA CTGTAGCCAG CTGGGTGGTC CCAGCCACAG AATTTAACTG TCAAACAGCA 1800
CCAGAAGGGT TCCTCATCCA GCTGTCTTGC CCCAAGTGCC CTCTTTGCTT TCTTTTTAGA 1860
GAGTTCTGAG ACTCATTAGA GAGTTTAGAG ATTTTAGCAT TCTTGAAGTT CTTTCTGTGG 1920
TCAGTTTGGT GAACCACTTC ATTTCTAAAG TTTCTCAGTT GACCCCATTC TTCCCCAGCT 1980
TTGCATTCTC CATGAAGCCA CCTGTGTTTG GTGTGTATGG GTTTTCTGCA ACCTAGGTTG 2040
AACAAGTCCT CTAGAATCCT GAACAATTGG TGATTCATGC TGGCCTGGTT TTTCTAATTG 2100
GCCTGGAAAT GTGGCTGTAG TGGACACAAG TGGACTTGGC CTCCTCTTTG ATGCGGGTAA 2160
ACTTTAGATT TGCATTAGCT CTGTTTGATT AGAGGATCTT ACTGGTTTTT GTTGTTATTT 2220
ATTTACCTTT TAGGAGCTTT AGTCTCTGTA GGTTTTTTTT TTTTTTTTTT TAAAGTCCGG 2280
GTCTTACTCT GTCACCCAGG CTAGGGTGCA GTGGCATGAT CACAGCTCAC TGCAGCCCCC 2340
ACCTTCCTGG GCTCAGGTGA TCCTGCCACC TTAGTTTCCT GAGTAGCTGG GACTACAGGC 2400
ATGTGCCACC ATGCCCAGCA AATTTATTTC TACTTTTTGA AAACAGGGTC TCACTTTGTC 2460
ACCCAGGCCA GAATGCAGTA GCACGATCAT GGCTCACTGC AGTCTCAACC TCCCAGGCTT 2520
AAGGGATTCT CCCACCTCAG CCTCCCAAGT AGCTGGGAGG CTACTTGGCA TGCATCACAA 2580
GGCCCAGCTA ATTTGTGTTT TTTCTTGTAG AGGCGGGGTT TTGCCATGTT GCCCAGGCTG 2640
GTCTCGAACT CCTGGGGTCA AGTTATACTC TCTCCTTTGC CTCCAGCCAT GAGCCGTTCG 2700
TTGCGCCTGG GCTAGTCATT ATAGATTTAT 2730