EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS096-00054 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hNCC 
Coordinate
chr1:120555370-120564080 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs372562666chr1120561314hg19
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
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JUN(var.2)MA0489.1chr1:120561775-120561789ATGAGTCACTTTTT-6.86
MAFKMA0496.2chr1:120558607-120558626TATAGCTTACTCAGCAAGA+6.04
MAFKMA0496.2chr1:120558607-120558626TATAGCTTACTCAGCAAGA-6.31
Myod1MA0499.1chr1:120557817-120557830TGCAGCTGCTCCT+6.15
NKX2-3MA0672.1chr1:120556583-120556593ACCACTTGAA+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr1:120561555-120561568TCAACCACTTAAA+6.24
Nr5a2MA0505.1chr1:120561831-120561846AAATTCAAGGCCATG+6.18
ZNF263MA0528.1chr1:120562867-120562888CCCTTCCTCTCACCCTTCTCC-6.39
Number of super-enhancer constituents: 29             
IDCoordinateTissue/cell
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SE_03980chr1:120549079-120570221Brain_Anterior_Caudate
SE_07385chr1:120548934-120569847Brain_Hippocampus_Middle_150
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SE_08816chr1:120556940-120559534Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08816chr1:120560737-120563322Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09137chr1:120545789-120570232CD14
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SE_12867chr1:120560851-120563850CD34_Primary_RO01480
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SE_29608chr1:120554644-120561087Fetal_Muscle
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SE_36951chr1:120560204-120563380HSMMtube
SE_41312chr1:120555136-120563468Left_Ventricle
SE_42341chr1:120556611-120563456Lung
SE_43397chr1:120554561-120565886MCF-7
SE_45586chr1:120545832-120570231Osteoblasts
SE_46953chr1:120556751-120557698Ovary
SE_46953chr1:120558653-120559658Ovary
SE_46953chr1:120561329-120563259Ovary
SE_49875chr1:120554642-120565868RPMI-8402
SE_53396chr1:120556680-120563463Spleen
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1120557200120557502
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH01I120013chr1120555780120556587
GH01I120014chr1120556661120559639
GH01I120018chr1120560624120563022
Enhancer Sequence
CTTGCAATGA AATAGTACTT AACTGAAAGT GTATGACTAA GTCTTGCCCC AAGACTAGCA 60
CCTATTCAAT CAGCTCTAAC ATCCTAAATG GACCAGCATC CTATCCATAC CTCTCCTCTC 120
CCTAAGGACA GTCTGGAAAT TCCTTGCTGA ACCTAAGCAT ATGACTAAAA GAATAATCTT 180
TCCTAAGCAT AATTTTCATG TCATTCTTCT GCTCAGAAAC TAGCAACAGT ATTAATACCA 240
AGCCTTTCAA ATCCAAGTTC TTTACAATCT CTGATCTGCC TGTCTGTCCC ATTCCAATCA 300
TCTAACCATC TTACTCTTTA GTAATCCATA ACTCGAACAC TCCATATTAT TTCCACAATC 360
TTGTTTACTG TCCCCTATAT TAAAATCTTT TTAATTTCCA GTGAGAAACA TCATGCTTCC 420
CTTCTGGTAT ATCTCCAACT TAGGTTCCTT TCTTCCACCC TTTTTTCAAA AATCTGCTGT 480
AAACCTGTCC TATAGTAAGC CTTCTACAAA TCATCCCACC TATCTCTGAT CCTTCCAACA 540
GCAGATGTAG TGCCATGTCA TGCACTACAT TGTCTCCACT GGTATGGTTC TTCTTTATTT 600
AAGCCACTGT TATGTCTTTG CTGTACCTTT CTCAAACTCC CATCTAGATA GTTTTTGTGG 660
GGAAGAGCCT GTCTTGAACC CTTGGTGTAG GTTCCCTGAA TACCTGAGTA CCTAAACCCC 720
ACTAAGCAGC TGGTTCCAAA GCAGGCTAAA TTTCATGTGA TGGATAAAGT CAGTCTCTCA 780
ATCCAAATGT TCCACAAAAT CCATCTCTAC TCTGTGATCT GTCTGGTAGA ATAACAGGCC 840
AAATCAACCT AATAGTCATC CTGAGGTACA GAATTATCCT TCACACCCCA GGAAGCTAAG 900
CAGCATTATG GACATGGGAA GAAAGGGGAG TAATAGGTAA GACAGTCAGA AATAACAGAC 960
CCTTGTTTCC TAAGGCAGGA GATCTTTCAA CTTGCAAATC CCTGTTCAAC TGTGGTATAA 1020
GGAGAAAATA TACTCTGTTA GTCTTGGTGG AAAGTAAGGT TCTCTGCTTG AAAACAAGGG 1080
CTTAAATAGC TGTCTTCTTG AGATGGCTAA AGTTGAATTT GGTTAGAGAG TGAAAACATG 1140
GCTAAACACC CAACAACCCT TACATATCTA TAATTCCATT AAGCTACCCA GCACACATTT 1200
TGGAAAATAG TCTACCACTT GAACTAAAGG TGTATATTCT AAAAAATAAC CACAAAAATC 1260
TAACAGATGC CTTTCATCCG CAAAACTATA TGAATGTTTT CCTCCTGTAG GGAGTTTATT 1320
AATTATTTTC ATAACTGTCT CTTCAATGTC TCTCAGTGAC TTTTACTTAC TCTCTCTTCT 1380
CTAGCATTGA ACTCTGAAAG AACATACTTC ACAGATGAGG TTGTGAATAC AGAGAAAGGT 1440
TTGGGGAGCA TTTTTCCATT TTAAACTCCA TAAACTAATC TGAATACTTA CCAGGTCCAT 1500
AAAGATGTAT TTATGACTTT TTCTTTAAAA GTCTCAGCTG GGCACAGTGG CTCACACCTG 1560
TAATCCCAGC ACTGTGGGAG GCCAAGGCAA GCAGATTGCT AGAGCAGAAG TTCGAGACCT 1620
GCCTAGACAA CACGGGCAAC ATGGTGAGAA CCCCATCTCA AAAAAAAAAA AGTGTCATTT 1680
CTGACATTGA GAGGTCCACA TTTCCATTGT TACTGTTCAA ACATACGCAT GGGGTTGGAT 1740
GTAGAAAAGC AAAGGAAGGA AGAAAACAGA GAAAAACAAG GGATTCCTCC TAATGGAACT 1800
AGAAAACATT CCATTTGAAG GATACCCCTA CAGTTTCCTC TCACTTAAGC AGATGAAAAC 1860
CAGACCCCAA CCCTCACATC TCACTAGCAG CCTGGATTAG TTTACATGTA GCCACTTTAC 1920
AGATTTCAAC GAAGCTGGGA TCTGAATAGC AATTCCAATC TATCTGGCAA TGGCTGCAGT 1980
TCAGGATCAG TCTCCCTAGT AATACAGGAC AGAAAAATTT GTTCTTTCAC GTTTCCTAAG 2040
TGAATAGCCA CTCGTCTACA GAAAAGCTTA AAACAGTGTA GCAGCTTGTG TCAGCTCCAA 2100
GATGACTGAA GTCTGAGCAG GAAATAAGCC CCTTTTCCAA ATAAAAGCCA GTGTTCTCTC 2160
CCCTTGTTTT CTCCACCGAA TGTTCTGTAT CAGCAGGGTG AGGCCAAATT GCATCCAGGG 2220
CTTTGCTGCA GCTCTGTCTT TAGCTTTTTT TTTTTTTTTT TTAAAAACGA GGATTTGGCC 2280
ATTCAAAAAA AAACAACAAC AACAACAAAG CAAAATCCCA CCACATACAA GAAGAAAAAG 2340
AGAGGCATGC TTTACAAAAC AGCTATTTCA AAATCATGAT TTTTAAAAAA ACTATACAGA 2400
ATGTGGAACG AAGGGGAAAA AAAGTCTCAT GTGGGTTGCG TCGGCACTGC AGCTGCTCCT 2460
CATTAAAGCT CCTCTTTACT CCCTCTGGGC TAGTTTCCAG CAGAAAATTC TTTGAACAGA 2520
ACTCTGCTTT CAACCCACTT TCTTCTTGCG CTGGGCCTCT TGGCCCCCCA ATCCGCAGTG 2580
GCAGCCTGCC CTAGCTGAGC TCTAGAGGGG GGAGCTGTCG TTAAGGTAAA TGAGGTAAGG 2640
GCAGGGGAAA AAACTAACAA AACCCAGAAA CCAAATTAAG CATCGGTCAG TAACAAAGGT 2700
CTGCAGTTTG AAAGGCTCCA AATCAGTCTG TTCTTTCCTG TGACCATAAT GCCAGCTTAG 2760
TTTCCTGCCC CCCTACTCTG TCCCCCCTGT TAAAGTAGAT AAAAATAATT GCTAACAGCC 2820
AAGGCTAGCT GGAACCAGTG AAAGTTCCTA TGTAACATTC AATTCCCAAG GCTCCGACTA 2880
CAAACTTGTA GGTACCCCAG AGCCTATAGA ATCAAGTCTA AACTTCTAGG CTGGCATTCA 2940
GGAGGCCTAA CCCACCTATT GGTCTAAACT CACTGGTCTC CCTCCTTTCA GTACCTCCTG 3000
GCTGAGGTCT GATGGGCTTG TCAACTTTTT AATTCTGTCA CTCTGTGTAA AGGTAACTAA 3060
CTAGGTTATG CTAATTACCA ACTTTGTTTT AAAAACATGC ATGAGGACTT CTAGTTAACT 3120
TCCTGGTAAA GAGGGGAAAA AAAGAGAAGA AGCTCTGTCA TACTACTTCT TGCCATTCCC 3180
ACTCTACTCT CAACCCCCCC TTCTCTCAAA AAAAAAAGAA AGAAAAAAAG GAAATACTAT 3240
AGCTTACTCA GCAAGAAGGA AAAACAAAAA GAACTTTAAA AAAAAGTATT TGTGTATAGA 3300
TTGGTGTCCA GAACTGGGAC GCTTGTGGTA AAACACACTT TCTAGTGTAG TTTTTCTAGG 3360
GCCTTACTAG TTGTATGTGA AGGAAACAAA GACAAGTATA CAATCTCTCA CTCTCACACA 3420
CGTACACACA CACATACACA CTTTTATCAC AACTAATACA CAAAGACTAC CAAATACTGC 3480
AGGGCAGCTC ATTTTTCTAC TATGTAAATT CAGCTTCCTG GACAGACCAT TTCTGCTTTT 3540
CTTGTAGAAG TATTTCAGAA AATGTTAATC TTGGTTCCCA CATTAGGTTG CATGCTTCCA 3600
AATTAAAAGT TTCCCACAGG AAAAGAACTT CACGAGGAAT TGTGAGGCTG GGAATTATCT 3660
CTGAAACCCC ACCTCACTTA GTTTACATGT GTTAGGTTTT TCACCCCCTC ATCTGAATAA 3720
AGCATTAAAT ACACACTGAT TTTAAGAAAC CTAAACCAAA AAGAAGCTGA AGTGATACGG 3780
ACTTTAAAGC TGTTGATTCA CAGCATCATT CATCTTCACT CAGACTATGA AATCAGTAAC 3840
CACTGCAATG AGAAACCATG CTTTATTTAT ACAAGAACTT TACAAACATC CTTATCTTCC 3900
AGTTTACAGT CTGGGCTCAT TTATCAGAAC TCAAAGGCTG AGCTGAGCAC CTAGTCTCTT 3960
CAATCATCAC TTGAAAGATT GGGAAGGGGC ACACAGTGTT AAAAGACTTG TGTTGTTGCT 4020
ATAACAGAAG GTGGTCTTTC CTCTGTGTTC CAGAACACAA TCAGGATCTT ACCATACTTC 4080
ACTGCACTGG ACCCTGAGAA AATATCTACT TGTGATTAAA ACATGGCAAA CACATTCTAG 4140
ACATATGAGT TTACAAAAAA CACCCTTCGA TGTAATGGAC AAAACTGAAT GAGTTAGCTC 4200
AGTTGTTCCC AAGGTATGGG CTGTGGAGTT ATTGCAAGGG ATTGCAATCC TTATAAATCA 4260
CTTTCTAAAC TACTAAACAG TATCTTGTCC ATATTTAAAT ATATGTATAT GCTTTTATGA 4320
CTAGTAAAAC ATAAAGATAT ATTAAATGAT TCTTGAATTC TTAGATTTTG ACAGTATACA 4380
TTGTATTCAA ACAACACACT GAGAAATTGT TTCATCTCAA GCTCTCTCCT TTATGCACTA 4440
TACTCTTGCT AAACGCCTTT CAGCTCCTAG AAAATGCTAT AGTACACTAC TTCTCACTTC 4500
CAGACCTCTG TACACGCTGT TCAGTCAGCC CAAAATGCTT TTCCCCACTT TCTCATGGCT 4560
AAGCCCTAAA ATTTCATTAA GTCTCAACTT AAATGTTATT TCCTGTGAAA AACAGCCTTG 4620
ATACCCCCTC TGTTCTTATA ACCCTGAGCC TGTGTTACTC ATTAGCCCTT ATTATGATTA 4680
TCTGTCAACA GACTAAAATT ATTAATTCTC ATACTCCCAG TGCCTAACAC AATGACTGGC 4740
ATATAGAAGG CATTCAACTA TTCAGTGCAG AAGCACAAGG TCAAAATGAA GGGCTCTGTG 4800
GAATCTTTAC CCCTTAAAAA GACCCTATAA ATACACTTGA AGTTTGGGAA CAACTGGGTT 4860
GAGCTATTTA CCTAAAGGAT TTTCAAAACT AATTAAGATT CCTGATATAT AGACTACTTC 4920
TTAACCCCCA CTCACCCCTA TATCAGTCAA ATTGGGCCAA CTCCATGCAA AGTAGATTAT 4980
TTTTTAATCA CCTTCCCTCC CACCTACCAA ATATGAAGTT AACCAACACA CACAGAGAGG 5040
CATGTGTGCA TGTGCAGACA TACACACACA CAGTCCTCAT TCCCTCTTGC ACTTTTATTA 5100
GTCTTTCATC GGTTGTTGAT AAAAGACTGA CTACATAAAC CACCAGGGAC CTGGAGCCCT 5160
GACTAAGAAA AAAAAAAATC CTACAAAGTG GCCTCAATAG CATGAACTGC TAGATTCTGT 5220
AGTGACTGCC ATTGAAAATT AAAGAAGATC TCTAGAAAGA AAAGTGTTGG AGCCTTCTTT 5280
CCATTCCCCA ATGTTGGTGG ATGACCACCT TCAAAGTTCT GAAGTCCAAA AAATATCTAA 5340
AAGCAGAGTA ATTTAAAAAG CTTACTGTTT AGTCTAAAAG GATTTTCCTA GATCAAAAAC 5400
AACTGTACCT ATTTGGATAC CAAAAATGAA AAAGAAATAG TGCAGAATCT TTAGATTGCC 5460
TAATGGGATC TGGAGAAACA GCTCTTAGTC CCAGTCTACA TTCTAATGAG TTATGTAATA 5520
AAGGCTAATT CGCTTAGCTG TATTACACCT CAGCCGCCTC ACTTATAAAA CAAAATGAGT 5580
GACAAAGGTG CTTTCCAAAG TCCCTTTGAC CTCCTAAGTG TGATGACTCT ATAATCTTGG 5640
CCTTTGAAGT CCCTTGGCAA TACCACCCAA GGATGTAATG ATGCTTGCTG ATGTTAATGT 5700
TTGGGTGTTT GTGGTTGTAT ATGTCTTGAC CACTGTCCCA CTCCAAGCAG GGGATCCTAG 5760
GGTAAGAACT GTACTGTGTC TCTTTTTTAA TATCCCTCAC AGTGCCCATC ACCCTCTAGG 5820
TGCACAGATA ATTCAATATA CACTTATGTA AATGAATTGT TCCACAACTC ACACTTTCAG 5880
CTAGCCCCTC ACAGATGCAT AAGAAAGCAA AGAACAACCA AACAGAAGGA ACAATATATT 5940
TAAATAAGAT AAGGGGAATG AAAAAGAATC TTGTGTTTAA AAGGGATAGA AAGGTCTAAC 6000
CATCTTCTAT CCCAAACAAC TGGCCAACAT GAGAGCCTGT TTTCTTGAGC ATAGAATGGT 6060
GGTAGGTATT TCAGCCTCTA TGGAATCTGA CCTGCTGATT AGTTATACAA GGCTAAAACT 6120
GACTGAAGTG TGTATGTAAG ACAACGGTCT GGGAAGAGAA GCACTAAATT TAAGCTCACA 6180
GGGAATCAAC CACTTAAAAT GGTAAATTCA GATAGAACTT TATCCAGATT TCATTTTTAT 6240
GCATCCTCTC TACAAGCATA AACGCTTATC TTACTCACTT CCCATCTCAT GATGCTATCA 6300
TCAATTCTTA TAAAATTTAG AAAAGAATAG GTGATGTCTC CTAATTAGAG AGTTTGCTTC 6360
TGTCACAAAC TGTGACAGTC AGTGTCAGCC TTTGCCTGGA AGAAAATGAG TCACTTTTTC 6420
ATTAGTAATC AAGTTATGTC TATTTTTTAA GAGTGACCCA GAAATTCAAG GCCATGAGTT 6480
TCAGCAATAC GAGACAGAGA ATCAGACACC ACAAACATTG TATACAAATA GAATTAAGAC 6540
AGAAAAATTA AAGTCAAGGA GGTACAGAGT TACTTTTCAG GATGACTGAG GTTTCAGAAA 6600
GGGCAAGTTG CCCCGTAAAA TATTCTCAAG ATGTGTCTGG CTTACACAAC GAGAACCAGT 6660
ATTTCAAAAT CTTAAAGTGA CAGGCAGTTA AACGACTAAG GCACTACCAT CGTCTAGGCA 6720
AGAGAATCTT AACCACCATC AAATGTTTTC CACACAGAAT AGGCAGACCT AGTTTATTCT 6780
GGAAAATTGA GGGTTTGGAT ATGTACTATA TAATCAGAGG AAACAAGCAG TAAAGGACCT 6840
GAGCTAATTT GGGGTAACCA AAGACTTGGC TAACAGATGC TTCCTTACTC TGGATCCCTC 6900
ATATGAATCA GATCTGGCCA GCGATATGCT GGACAGAAGA TATCTGAGGT TGAGATACCT 6960
GATTTCTCAA CTAAGGGAAT GAACTATGCA GTACATGAAA ACCAACCCTC TTCTTAGTGC 7020
CTCTGTTTTC CTATCACTTT CCCTATCCCA ATCCATTCTT GCTCTTGCCT TAGAGATTCT 7080
TAGATTCTGA TTTTCCTCGC AAAACATGGC CACAAGCCTA CCGCCTCTCT GTCTGGTAGA 7140
AGTACAAGAA TCAAGAGTCA AGGCCAAAAA GGTCTGAGGG AAGGAGCATA ATTGCTCCCA 7200
GCTGCCCTCT CTTCCTGTCC CCAGGTCCTC TCCTTCACCC TCACTCTAGG CATTCTACCT 7260
CCAAACGTTC AAGTTAACAT GTGCTAAAGG AAGGATTTTC TAAATCACTT ACCTGTCACT 7320
GTGAAACTAG ATTAATCCAC ATACTGGTTT AGTAAAACCT CACACAAACC AGCATATACA 7380
CAGAAGACAG CAATCAAGAT GAAGAAAACG TTTGAAACTG TGTCATTAAG AAAATGTGAT 7440
GAAGAAATTG GTAATGATTA TTCCAGGAAA TAACAGTCCC TTCTAGTCTC CTCAGCTCCC 7500
TTCCTCTCAC CCTTCTCCTA CCTATCCGTC TTCTAAGGCA CCACTAATAT TCAAAGATTT 7560
AGGATCTAAG CAGTGCACCA AAAGTCCTCT GATTTTACTC TTTTGTCCCA CAGTACTTGT 7620
TCCTTTGTCT GAGTGTCCAT AGTTATTATC TGTGCCCCTA CACTGGGATA TTACAAACTG 7680
TTTTATTTTA CACATCTCTG TATGCTTCAT CTCCCCAGCA AGACTTCAGA AGACTGCCAC 7740
CATGTCTTAT GCAGGAGAAA CTGCATTCAC TGTCAGACAG TCTCTGGGTA CGTATACTTG 7800
TGAATAAGGA AGTCAGGTAA CACAGGCCTC TTGGGCTTTT CTGGGTATTC ACAATACCCA 7860
GTACAGTGAT CAGTTATAGT AGCCTGCTCA ATAAATACTA GTGTGATAAA AATTAAACTT 7920
TTGTTTGAAA AGTGAGGATT CTATAGTGCT TCAGAGTCCA TCTAACTTTC AGTGTTCAGC 7980
ACACAGGATT ATAGACAGTG ACTGCAGGAA AATGACCTGA ATCTATACAG ATTTAATAGT 8040
CTAAATGCTA CCATTCTACA TAAATCCTAA TCAGATTATT TTCTTATTAA CACCTACCTT 8100
TCTCCTCATA TTTACGTGAA GGCAAAAAAC TGGATAGAAT GCTCTAGTTG AATGTGTTCG 8160
CTGAATAATA TCACCCATCA CTTAAATAAT GCCTTTCTTA GTCTTTATTT TCACTTTTCT 8220
TTCATAAAAC TCTTTTCATA AAGATCAAGT AGAAGACTGT TTAGGAGAAG AGCATTTCGA 8280
GCAGAAATTA ACTGCATTAC TTTTTCATAG GAGAAGGCTG ATGGAGTCTA AGAATTGGCA 8340
ATACATTTTT GGACACAGAG GACTAAGTGC TAGTGAAGGT CACTGACAGT GAATAAATAG 8400
GATCTAGAAA ATGTGCGGAA ATCCAATAGA AAGTTTAATT TACCTTACGT TGGGTTGTAA 8460
GGTAAAACTC AACTAAAAGA AATATGAAAA CAAAATGCAT AACACAGTCG CATGTGCACA 8520
CATGTGTGCA TACACACATA TGACAGGAGG ACGGAGAGAC ACTAAACTTC ATTCCTAACT 8580
ACTGTATGTT GAGAGGAGGC CTAATGAAAA CCTCTATCAC ACCCACATAT TTATGCTAGC 8640
TTAACAAATT TTAAAGTGCT TGGAAATTTT TAGATGATTA CTTTTTCTCA TATTCTGATA 8700
TCCCCCATTC 8710