EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS095-20400 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HMEC 
Coordinate
chr3:42065940-42068020 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:42067595-42067613CCCTCCATCCCTCCTTTC-6.17
MyogMA0500.1chr3:42067968-42067979CTGCAGCTGTT-6.02
Tcf12MA0521.1chr3:42067968-42067979CTGCAGCTGTT-6.62
ZNF263MA0528.1chr3:42067591-42067612CTCTCCCTCCATCCCTCCTTT-6.38
Number of super-enhancer constituents: 37             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00063chr3:42060660-42068971Adipose_Nuclei
SE_01171chr3:42066131-42066552Adrenal_Gland
SE_01171chr3:42066556-42067516Adrenal_Gland
SE_01171chr3:42067617-42068091Adrenal_Gland
SE_01796chr3:42066168-42066949Aorta
SE_02512chr3:42065459-42068129Astrocytes
SE_10226chr3:42065877-42068137CD19_Primary
SE_10922chr3:42060609-42068638CD20
SE_23272chr3:42066116-42066919Colon_Crypt_1
SE_23272chr3:42066976-42067316Colon_Crypt_1
SE_24262chr3:42066235-42066832Colon_Crypt_2
SE_24991chr3:42066143-42066941Colon_Crypt_3
SE_24991chr3:42067525-42067991Colon_Crypt_3
SE_25861chr3:42065366-42068715Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26989chr3:42066043-42067298Esophagus
SE_29565chr3:42065389-42069132Fetal_Muscle
SE_36966chr3:42065344-42069055HSMMtube
SE_38230chr3:42065373-42068528HUVEC
SE_40683chr3:42066021-42068361Left_Ventricle
SE_42248chr3:42066070-42068146Lung
SE_44658chr3:42065460-42068844NHDF-Ad
SE_44918chr3:42065870-42068385NHLF
SE_45733chr3:42065416-42068758Osteoblasts
SE_48185chr3:42066028-42068146Psoas_Muscle
SE_48670chr3:42066166-42067443Right_Atrium
SE_48670chr3:42067563-42068128Right_Atrium
SE_49555chr3:42066577-42066889Right_Ventricle
SE_50309chr3:42066089-42067441Sigmoid_Colon
SE_51166chr3:42060817-42068845Skeletal_Muscle
SE_51885chr3:42065989-42068136Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52625chr3:42066102-42067523Small_Intestine
SE_52625chr3:42067553-42068124Small_Intestine
SE_53513chr3:42066102-42068146Spleen
SE_54717chr3:42065389-42068637Stomach_Smooth_Muscle
SE_62800chr3:42053253-42125059Tonsil
SE_63663chr3:42065927-42068150HSMM
SE_65769chr3:42066166-42068375Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr34206596042068007
chr34206711042067525
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I042019chr34206049442069114
Enhancer Sequence
CCTTAAAATG CTGTAATTAT CTTTGAAGTT TTATAATTTT GCAGTGTTTA ACTTATGGCA 60
GCAATAGCAT TGGTATTTTA AATCAAAACA GAACACTGTC AAGGGTTACA TAACTTATTC 120
ATGATATTAA CAAGATATAA AGCACCATGT TTTTGTGTGT AACTGTTTAA CAGTAGATGA 180
AGTTAATGAT TGCCCACTTT CAGCTAATCA TATGATTGCT ATTGAAATAA GTACTTGCTA 240
GACAGGGATA GAATCTAGTA ATTTGTTAGC TTCAGTACTT CATGCTTGCA TACACACCCA 300
TGCTATTGTG TTACCAAGCC TGAGTTTTGA AATGTGGCGT TCTTTGTCTT TTTCTGGTGA 360
ATAAACCCCA TACGTCTTAC CATAGCCATT TGACTCTTCC TGGCTGTCAG GATGTGTTGC 420
CCTGGACTGA GAGTGAGAGA TCCCAGATTT TTCAGCTTCT CTTCCAATTG CTAGGGATAC 480
CACATCAGTG CCAACGTGAG TCTCCTCTTG TCACTTTCTG CTAGGCTTCC CCTTAGAAGC 540
TGAAATTCTT TCCCTTCCTG ATGCTAAGTT GCAGTTTCTT AAAATGCTAG AGAGCTTTTA 600
AAAGCATACC GTGATGGGAA TTAGTTTCAA AAGATTATAC CAGAGGGGGT TAAAACTTGC 660
CAACCTTGTA AAAACCTAAC TTCTTTGTTT ACGTCCTCCC TGCCCCGCTT TCTGCTGTGC 720
TTGGTTTCCT CCTAGCAATA TGCCTTGGTC AGGGGGAGAG TCTTCCTGTC AGACATAACT 780
TCCCAGACCA GCACTCCTGG AGGGGCCTGT ACCTCAGACC CTGGCAACGA GGCACGCTGG 840
GGCACGCTGG CCTTTCGTTG TGGTGTAGAA AATTTTTCAT TTGGAATTCC ATTTTAAAAA 900
TAAGTATAGG GTTATTTATA TCTTCTTACA TTAATTTTGA TAAGTTGTGT ATTTTAAGGG 960
CTTTATCCAC TTTATCTAAG CTACTGAATT AATTGGCACA ATTATTACTC TTTCAATGTC 1020
CATAAGACCT GTAGTGATGT CCCCATATTT TATTTCTGGT ATTTGCCTTT CATGTTAAGA 1080
ATGTGTCTGT TCAAAGGGAG AGGGGAAGGA GAAAAGAAGA ATGTGTCTGT TCAAAGGACT 1140
GCTGGATCAG GGTAACTTAG CTCAAGAAAA TGAGAAGGGG TGGTTTCTGG AAGGGGAGAA 1200
TGAAAGCCGT GGAGGAAATA AAGCATGAAT GTGGGGGAGG GCGGGGGCGG GGACTGCTTC 1260
TCTTGCTGGC TGCCTTCTCT CTCTGGAGAA TCTGCTGGAG AAGGAGCAGT CACGTGGGTG 1320
GTGAGCTCAT TAGGCTGGGG ACACCAGCTG TGCTATTATT AGGGCTTTTA AAGTCCGTGG 1380
CAGATGTTCT TAGGCGGTGT TCCAGCCTTG TTCACTTCCC ACATATGGCA TGATACTGTA 1440
CACAGAAAAA AGAGGGACTC TTTAACAAAT AGCTTTTCCA TGAAATGCAT CACTATTTTT 1500
TTCCCATGAA CTTTTTTCTT TTCTTTCTTC CTCTGTCTCT GTTTCTTTGT TTCTCTCTCT 1560
GCTGTTTGTT CTTTCTTCTT TCTCCGTTTA TCTTTCTCCC TCTGTCTCTT TCTTGCTTTC 1620
CTCTATTTTT CTGTATTCTC ATTCTCCCTG TCTCTCCCTC CATCCCTCCT TTCTATACTT 1680
CCTTCTTTTG TCCTTTGAGG CCCTTTTTAT TTAATCCTTT GTGAAACTAG AAGAGGACTC 1740
AGAGGCACAT GAAGAAAGTT TGTCTATTTT AGATTAAAAG TGAGCCTTAG CATTTCATAG 1800
AAAGTATAAG AAATGTGGGT AAGTCTCAGG GTGATCATAT ACTAGAGAAT TTTTTTGACA 1860
AGAGCCTGTT TTGAATTGCG TGGTTAGCTT GCTGCCTCTT CACTCCTCTG GCACAGTGGT 1920
AGTTTTTGTA CAGGATCGCT TTTACCTCAA TGGACTGATA AGCTAGCCAG GGCACCGATT 1980
ATTTTTACAT ACCAATTTGT GTGTTGTTTG TTTGGCTAAT CACCTCTTCT GCAGCTGTTA 2040
TCCTGGATCT CAGTGATCAA AGAGATCAGT GATCTCTTTT 2080