EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS095-18414 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HMEC 
Coordinate
chr20:30291330-30294970 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6060821chr2030294034hg19
rs80054178chr2030294682hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
TFAP4MA0691.1chr20:30293234-30293244AACAGCTGAT+6.02
ZNF143MA0088.2chr20:30294777-30294793TTCCCACAATGCCATG+7.06
Number of super-enhancer constituents: 77             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30292383-30293830Adipose_Nuclei
SE_00546chr20:30293974-30296822Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30293288-30294321Aorta
SE_02627chr20:30291813-30293615Astrocytes
SE_03156chr20:30292475-30293118Brain_Angular_Gyrus
SE_03156chr20:30293152-30295232Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30293076-30297376Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30291888-30312530Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30291812-30312465Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30292005-30297574Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30292115-30312408Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_13448chr20:30294062-30295511CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30292092-30297225CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30292973-30294930CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_20764chr20:30292149-30295366CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30294469-30295251CD8_primiary
SE_23622chr20:30291926-30293145Colon_Crypt_1
SE_23622chr20:30293276-30294340Colon_Crypt_1
SE_23622chr20:30294588-30295088Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30291945-30297378DND41
SE_25933chr20:30291811-30295349Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26879chr20:30291662-30293146Esophagus
SE_26879chr20:30293157-30294278Esophagus
SE_27731chr20:30291257-30297421Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30291565-30297515Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30292078-30302768Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30291980-30293111Gastric
SE_31430chr20:30293220-30295196Gastric
SE_33407chr20:30292055-30302718H2171
SE_34309chr20:30291576-30306320HCT-116
SE_34643chr20:30291507-30295446HeLa
SE_35852chr20:30291735-30295247HMEC
SE_36989chr20:30291921-30294611HSMMtube
SE_38141chr20:30291885-30293880HUVEC
SE_39443chr20:30294186-30295416Jurkat
SE_39853chr20:30292057-30293062K562
SE_39853chr20:30293169-30295459K562
SE_40644chr20:30291815-30295345Left_Ventricle
SE_42121chr20:30291801-30295313Lung
SE_43515chr20:30291879-30312193MM1S
SE_45708chr20:30291884-30293174Osteoblasts
SE_47264chr20:30291858-30294978Panc1
SE_47861chr20:30291945-30292571Pancreas
SE_47861chr20:30293292-30293942Pancreas
SE_48182chr20:30293240-30294390Psoas_Muscle
SE_48182chr20:30294514-30295218Psoas_Muscle
SE_50155chr20:30291979-30293164Sigmoid_Colon
SE_50155chr20:30293172-30295195Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30293396-30302434Skeletal_Muscle
SE_52373chr20:30291702-30295310Small_Intestine
SE_53471chr20:30292078-30292710Spleen
SE_53471chr20:30294485-30295159Spleen
SE_55108chr20:30292167-30292585Thymus
SE_55108chr20:30293280-30294299Thymus
SE_55108chr20:30294451-30295219Thymus
SE_55770chr20:30292264-30294885u87
SE_56767chr20:30292026-30292562VACO_400
SE_56767chr20:30292607-30295221VACO_400
SE_57375chr20:30291974-30292464VACO_503
SE_57375chr20:30292729-30294334VACO_503
SE_57919chr20:30292049-30292581VACO_9m
SE_57919chr20:30292673-30293103VACO_9m
SE_57919chr20:30293234-30294355VACO_9m
SE_57919chr20:30294417-30294881VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_64478chr20:30291827-30294478NHEK
SE_65412chr20:30291566-30292774Pancreatic_islets
SE_65412chr20:30293264-30294304Pancreatic_islets
SE_66334chr20:30294186-30295416Jurkat
SE_66898chr20:30292055-30302718H2171
SE_67146chr20:30291879-30312193MM1S
SE_67821chr20:30292264-30294885u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr203029218730293046
chr203029349330294957
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I031702chr203029062130297397
Enhancer Sequence
GTTGCCCAGG CTGGCGTGCA GTGGTGCAAT CTCGGCTCAC TGCAACCTCC GCCTCCTGGG 60
TTCAAGTGAT TCTCCTGCCT CAGCCTCCCG AGTAGCTGAG AATACAGTCA TGCACCACCA 120
CACCCGGCTA ATTTTTTTAT TTTCAGTAGA GATGGGGTTT CACTGTGTTG GCCAGGCTGG 180
TCTGGAACTC CTGATCTCAG GTGATTCGCC TGTCTTGGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAT 240
AGGCATGAGC CACTGAGCCC AGCCCTGAAC TTGTTTTTTT TTTTTTTTTG AGACGAGTAT 300
TGCTCTGTCA CCCAGGCTGG AGTGCAGTGG TGCGATCTTG GCTCATTGCA ACCTCTGCCT 360
CCCAGGTTCA AGCGATTCTC CTGCCTCAGC CTCCCAAGTA GCCGGGACTA TAGGCCCACG 420
CCACCACACC TGGCTAATTT TTGTAATTTT AGTAGAGACG GGGTTTCGCC ATATTGGTCA 480
GGCTGGTATC GAACTCCTGA CCTTAGTTGA TCCACTCGGC TTGGCCTCCC AAAGTGCTGG 540
GATTACAGGC ATGAGCCACT GCACCCGGCC CTAAACCTTT TTTTTTTTTT TTTTGAGACG 600
GAGTCTCTCC CTGTCACCTA GGCTGGAGTG CAGTGGCGCG ATCTCAGCTC ACTGCAACCT 660
ATGCCTCCCA GGTTCAAGCG ATTCTTCTGC CTCAGCCTCC TGAGTAGCTG GGATTACAGG 720
CGTGCACCAC ACCCGGCTAA TTTTTGTATT TTTAGCAGAG ACGGGGTTTC CACCACCTTA 780
GCCAGGCTGG TCTTGAACTC CCGACCTGAT GATCCACCCA CCTCGGCCTC CCAAAGTGCT 840
GAGATTACAG GCATGAGCCA CCGCGCCCAG CCTGAACTTG GTTTTTAAAA GACCACTTTG 900
GCTGGAGTAT TGGGCAAGAG TGATTTTCTA AGGTCCCTTC CCAGCTTTTT CCCTGTCATT 960
CTAGGCTGCC ATGAACTGGT TGCCTGAGCC ATAAAGACAC AGTTTCTGGA TTAGAGTGAC 1020
TGAAGAGCTT AGAGTGGTTC CTTGCCCTTG GCCGGAGTAG GGAATCTGTG TCACCTTGTT 1080
CTGCAGGAGA TGGAGGAAGT GACTCCCTCA GGGAGGGGTG GGAATCCCAT CTTGGAAAAC 1140
ATCCTCAAAC CACCTGTATT GTTTCTGCCT CCTGTGTGGA AGTTTCTGCC AATGACACAG 1200
TGCTCTCTGG AATGCACCCC CCCAACGCAC ACACCCAATC TTCCGTTTAC ACAGGCATAG 1260
CTGTACTTTG CATTCCTCCT AGGATTTAGT TCAAAGCTAG CCTACAGGAA CTGGTCGATA 1320
AAGAGTTACT GATTGATTAC TAAAGAAAGA GAATATTCTC AGCCATTAAG CAAATATTAA 1380
TGAGTTTTAT GAGTATTATG TTGGTCTCTG GGGGTGCAAG GTGATTAAAT GGGTTTCTAG 1440
TCTTCACTGA GCTCAGAATT CAGTGGATAG ACCAAAAACT ACAGACAACT ACAATGCTGG 1500
ATACAATAGT TATAACAGCA ACATTTACTA GGGCCTTCCT TATCCAGGTA GGACAAGTTG 1560
GCTTTGGAGC CAGACTACCT GGGTTCAAAT CATGGTTTTA CCACTTACTC GCTGTGCATC 1620
TTTGAACAAC TTTCTTAACT TCTCTATAGG AATAATAAGA GAACCTACCT GAGTGGTACT 1680
ATTTTGAGAA TTCAATGAAC TATCTCATAT AAAACACTTA AGTGCAAGTG CTCATTGTTA 1740
AATATTACTA AAATTACCTT AATACCTGCA CCATATGATC TTACATACAT TCTTACAAAA 1800
GGCTCTTAAA TCCTTACAAA AACCCTATGA AGTATTATTA TTATCCCCAT TTTTCAGATA 1860
GGGGGACTGA GGCTCAGAAA TGGAAAGGAA TGCACCCAAA ATCTAACAGC TGATATGTAA 1920
TAGAGACCAG ATTCAAACTC AACTCTGTCT GATTCCAGAG CCCATACTTC CAATTAACAA 1980
AATGATCCCC TTTTCATAAA GAGCCCCAGC ACAGTGCCTA ACACACAGCA GAGACTTTAT 2040
AAAGGGAGCT ATGGTTATTA TGTCATTGTC CCTGGAGTTT CCAGCTGTAG ATGCTGTAGA 2100
ACCCAGAGGA GGGGGCCTCT CTTTCACCCT AAAGGGATCT GAGAAGGGTT TAAAGGTGCT 2160
GGGTGCCAAC TACAGGCTTT GCTTGGGAGT CCCAAAGGTT TCCCTCACTG GGGCTTGGGA 2220
TACTAATATG GAACCTACAC TAGCACCACT AAATCAGACC CAGAAAGTTC CCCCAGGTGT 2280
CCAAACACCT GCATGAACAA GCAGGCAGTT TCCTCTAGGT TGACTTCTTG TCTGGCCCTA 2340
CACATCTCTC AGTTTCATCA CTCAGCCACC AGCCCTGGGT CTCATGTATG CACCTGCTGC 2400
TTGACCCAGT CCCAGGAGAC ACTGAGCCTT AGAATTGGGC TCCTTCTCTG GACCTTGCCC 2460
CAAAGGCTAT TTCTGAGTGA CTCCCTGGGA CTTCCCTGAC ATGGTAACCC CTAGGGCTCC 2520
AACTGAACAT GGGTGCTGTG AGCAAGGGGA AATTCTTCTG AGTAGCAGAT GGAGAGTGGG 2580
TAGAACAAGA GGCAGTTGTT CTGGATCAGA GATAAGCATG GGGTGAGAAC CATAGTACAC 2640
TGGATTTTAT GTTTAAGCAG CACTGATCCT CGATAGTTCA GAACTCCCGC ACTGAAGTCC 2700
AGCGTAGGCA GGTAAGGACA ACCTGGAGCC AGGCATTAAT ACTCACTTCT ACTTCCCATC 2760
TGAGTCATAT TCAGAGTCTG GCCTTGCCTG GTACTTTGAC TGCAGAAGGC AACCCATGGC 2820
TAAATCAAGG CACCTCAAGC CTCATAGAGA AAAGGGAAAG ACTCAGCATT TGCTGAGCTT 2880
TTACTCTGCA CTAGGCAATG TGTAAGTGCA CTTTACATGT ACCATTAATT ATTAGGAATG 2940
TTTGTTAATC CAGTCACTAA ACACTCAGCC ACCAAGTACT AGGCCCAGCA GTAGCTGTTA 3000
AGAGTGAATA AGACATAGTT TTTATCCTCA GTAAGCTCAG AGCACCTCGT TTAGTCTTTC 3060
TCCCAACAAC CCTCTGAAAT GAGTATTACT TCCACTTTAT AGATCTTCAG GTTTACAGAG 3120
GGAAGTAACT TGTCCAAATT CATGAAGCCA GTTAAGTGAT AAGATATTGC TTCTACTCAA 3180
AAAATGCTTG TTGACTGAAT GAATGAATGA ATGACACAGC TATGGCTGTG ACTTTAGTCA 3240
AGGAGTAGCA ACAAGACCAA ATATTTATAG TTCTCAAAGT GCTTTTTCAT CTATCATCTC 3300
TTTGGGCCTC CCTGCTAGCC CATGAGGGAG GCAAGGCGGG TGTTATCTTT CTTCAACATA 3360
TGAGGCAACA GGCAGAGCTT GGGCAAGAGG CTTGAGGCCA CAGAGCAAAC AAGGAGTGAG 3420
TGGGGCCATC CTGGAAAAAC TCCAGAGTTC CCACAATGCC ATGTTTAATC ATTCAAACCC 3480
ATGTCAAGCA CCTACTGTGT GCCAGGCATG CTCCTACCCA CTTTAAATAC TTAACTCATT 3540
AAGTCTTCCA CTCAGTCAAC AAACAAGGAG GACCCTGGGA AGATAAAACA AAATATGCCC 3600
CATTGCCAAA CGCCTAGTCA ACAACACTGG CCAAACCTCT 3640