EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
HS095-18413 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HMEC 
Coordinate
chr20:30282520-30289170 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs77962418chr2030283169hg19
rs6060796chr2030289039hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr20:30287836-30287857ACTCAGTTTCATTTTCTGTAC+6.55
JUN(var.2)MA0489.1chr20:30284057-30284071AGGAAATGACTCAG+6.73
Number of super-enhancer constituents: 113             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30281696-30285303Adipose_Nuclei
SE_00546chr20:30285914-30290417Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30281733-30283797Aorta
SE_01656chr20:30286536-30289005Aorta
SE_02627chr20:30286460-30288538Astrocytes
SE_03109chr20:30286419-30287781Bladder
SE_03156chr20:30286548-30288932Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30281567-30283497Brain_Anterior_Caudate
SE_03894chr20:30286146-30289176Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30281270-30284805Brain_Cingulate_Gyrus
SE_04818chr20:30285752-30290530Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30281178-30285014Brain_Hippocampus_Middle
SE_05813chr20:30285526-30290713Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30281314-30284637Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_06739chr20:30286157-30289233Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30281635-30284666Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_07749chr20:30285525-30290582Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08789chr20:30286618-30287903Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_13448chr20:30282048-30283284CD34_Primary_RO01536
SE_13448chr20:30286373-30288569CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30281409-30284791CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14426chr20:30285971-30289231CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30281400-30284483CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18483chr20:30286164-30289073CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30286373-30288645CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20456chr20:30281650-30283580CD56
SE_20456chr20:30286524-30287948CD56
SE_20764chr20:30281711-30283729CD8_Memory_7pool
SE_20764chr20:30286371-30287968CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30281489-30283485CD8_primiary
SE_22440chr20:30286355-30289018CD8_primiary
SE_23622chr20:30281755-30283243Colon_Crypt_1
SE_23622chr20:30286599-30287706Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30281085-30284597DND41
SE_25330chr20:30285768-30289021DND41
SE_25933chr20:30282095-30284805Duodenum_Smooth_Muscle
SE_25933chr20:30285935-30289194Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26879chr20:30285884-30288535Esophagus
SE_27731chr20:30281838-30288694Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30282053-30288849Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30280920-30284601Fetal_Thymus
SE_30903chr20:30286335-30288967Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30281639-30284593Gastric
SE_31430chr20:30286060-30288986Gastric
SE_33407chr20:30278956-30284610H2171
SE_33407chr20:30286348-30287887H2171
SE_34309chr20:30281429-30289008HCT-116
SE_34643chr20:30281430-30289269HeLa
SE_35852chr20:30283535-30284639HMEC
SE_35852chr20:30285817-30288911HMEC
SE_36989chr20:30277814-30290195HSMMtube
SE_38141chr20:30282089-30285312HUVEC
SE_38141chr20:30285416-30289224HUVEC
SE_39144chr20:30286359-30288952IMR90
SE_39853chr20:30282007-30284720K562
SE_39853chr20:30286529-30288860K562
SE_40644chr20:30281708-30285386Left_Ventricle
SE_40644chr20:30285851-30288970Left_Ventricle
SE_42121chr20:30281738-30285363Lung
SE_42121chr20:30285414-30289018Lung
SE_43515chr20:30277822-30284499MM1S
SE_43515chr20:30284537-30290340MM1S
SE_44365chr20:30281743-30284710NHDF-Ad
SE_44365chr20:30285831-30288996NHDF-Ad
SE_44995chr20:30282790-30284602NHLF
SE_44995chr20:30285926-30288667NHLF
SE_45708chr20:30282527-30285331Osteoblasts
SE_45708chr20:30285814-30288971Osteoblasts
SE_47264chr20:30281358-30285573Panc1
SE_47264chr20:30285629-30288991Panc1
SE_47861chr20:30286630-30287685Pancreas
SE_48182chr20:30282429-30283232Psoas_Muscle
SE_48182chr20:30285753-30288791Psoas_Muscle
SE_48890chr20:30282722-30283493Right_Atrium
SE_48890chr20:30283773-30284597Right_Atrium
SE_48890chr20:30286555-30288558Right_Atrium
SE_49684chr20:30286541-30287553Right_Ventricle
SE_49886chr20:30286550-30288884RPMI-8402
SE_50155chr20:30281748-30284675Sigmoid_Colon
SE_50155chr20:30285869-30288969Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30282135-30284696Skeletal_Muscle
SE_51509chr20:30285595-30290402Skeletal_Muscle
SE_51884chr20:30282308-30284717Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51884chr20:30286350-30288800Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52373chr20:30281728-30285346Small_Intestine
SE_52373chr20:30285428-30288947Small_Intestine
SE_53471chr20:30281646-30284749Spleen
SE_53471chr20:30285965-30288824Spleen
SE_55108chr20:30281743-30283556Thymus
SE_55108chr20:30286561-30288235Thymus
SE_55770chr20:30281854-30284727u87
SE_55770chr20:30285683-30288979u87
SE_56767chr20:30281105-30284651VACO_400
SE_56767chr20:30286579-30288939VACO_400
SE_57375chr20:30282804-30283747VACO_503
SE_57375chr20:30286582-30288547VACO_503
SE_57919chr20:30286762-30287447VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_63683chr20:30282201-30284731HSMM
SE_63683chr20:30286344-30288924HSMM
SE_64478chr20:30286331-30288179NHEK
SE_65412chr20:30285884-30289501Pancreatic_islets
SE_66898chr20:30278956-30284610H2171
SE_66898chr20:30286348-30287887H2171
SE_67146chr20:30277822-30284499MM1S
SE_67146chr20:30284537-30290340MM1S
SE_67821chr20:30281854-30284727u87
SE_67821chr20:30285683-30288979u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr203028658330287977
chr203028617630286226
chr203028869330288840
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I031693chr203028097730290157
Enhancer Sequence
CTATCATCTA GACAGTAGGC TTACATTGAA GGAAACTAAG GCTTGGCAAA GTCAAACACT 60
TGCTCAAAGT CAAACAGTAA GCAGGGCCTG GTGGCGTACC TATAATCCCA GGAAGATAGA 120
GGCGGGAGGA TCACTTGAGC CCAGGAGTTC GAGACAAGCA CAGGCAACAT AGTGAGACCT 180
CATCTCAAAA CAACAACAAA AACAAAACAG TAAGCAAACT AGGACTTGAA TGCAGGCAGT 240
TCAACTCCAC AGCCCTAGCA GGAAATCACT ATCAGCCAAG GCATCTTCCC CTTATTAAAT 300
GGCAGTAAGG ACTTTCCAGT TTCTTAAGCC AAAAACCTGG ACTCCTTTCT CTCTCACCTC 360
TTATCCAGCA AACATCAGCA AATCCAGTTG GTCCAACCTT CAAATTGTAT TGAAGCTCTG 420
ACCACTGCTC GCCACTTCCA CCACCCATCC ACCCTGGTAT AAACTGCTGT TATCACCCAC 480
CTGGCTTCTC ACTGGTCTCC TGCTCCCGCT CTTACCCATA GAGTTTGTTC TCCACATCAG 540
AGAGATCCTT CTAAAACCTG TCACTTCTTT GCTTAAAAAT CCTCCATGCC TTTCCACTGC 600
CCTTAAAGCA AGGTCCCATG TGGCCCTACA AGACCTGGCC CCTGGTGACG TCTCAGACCT 660
GATTCCTACC ACTGGCTTAC TCTACTCTGG CCATACTGGC CAACTTGCTG TACTTTAAAT 720
ATGTTGGAGA GTCTTTTTTT GTACTTGCTT TATTTTTTAA TTTTTTTGAA ACAAGGTCTT 780
GCTCTGTCAG CCAGACTAGA GTGGAGGGAC AGGATCATAG CTCACTGCAG CCTCAAACTC 840
CTGGATTTAA GCCATCTTCC TGCCTCAGTG TCCCGAGTAG CTAGCTAGGA CTACAGACAT 900
GCACCACTAT GCCCAACTAA ACTCTGGCTT TGTCGCTCTG GCTGATCTCA AACTCTCAGC 960
ATCAAGTGAT CCTCCTGCCT TGGCCTCCCA AAGTGTTGGG ATTATAGGCG TGAGCCACTG 1020
CATCTGGCTT TTTTTTGTTT TACGGCTTGC TGTTCTCTAT GCCTACAACA CTATTCCCCC 1080
ATATATCCGC ACAGCTCATG CCCTCACTGC ATTCAGATCC AATGTCACTT TATCAGAGAG 1140
GCCTTCCTAA CTACCCTACC CTTCCTTTTC CCATCCCTAA TCCCTTTTCT CTGCTTTATT 1200
TTTCCCTATA TCACTAAATA CTACCTCACA TGTTATTTAT TTTTTAGAGG TGGGTTGTCA 1260
CTATGTTGCC CAGGTTGGTC TCGAACTCCT GGGCTCAAGC AATACTCCCA CTTCAGCTTC 1320
CCAAAGTGCT AGAATTAAAG GCGAGAGCCA CCATGCCTAG CCCTGACATG TTAATTTACT 1380
TAAAATCTGT CACCCACCTT GGAATGTCCA CTGGGTGAGA ATAGGGACTT TGGTTCGTTC 1440
AGACTGTATG TCCAACCTTT AGCTCAGTCC CTGATATATG ACAGGAATGC AATAAATACT 1500
TGTTAATGAA CAAATGAATG AATGACCAAT ATCCCTCAGG AAATGACTCA GACTCAAAGG 1560
GGAGTAAGGC TGCCTGAGTG TCCTTGGCTT TCACAGCCCT GATGACCTTT GGTACCCCAT 1620
GGCAGCGGTC AACGTCCTTC CCTATTATGA AATGTCCTGG GTGCATAGCA TCACCACTGT 1680
GTCATCTACT TGTGCCTGCA CCCATGCAAA CACACAGGGA CACAAAGCTG GAAAAGGGCT 1740
GGTTTTGAGA AGGAGTAAGC CTGGGCAGTT GAAACCCAGG TTCGGTGTAC TCTAGGGCAC 1800
TTACTTCTAG GTGACTGTCC TTGCCACTGC TGGCGTACCA AGGTCTCCCA GTCATATGCC 1860
CATGCACTGT ATACATTTTG GCATTTATTC TCATGAATAA AGTGTCATTA GAGGCCAGAC 1920
ACTGCTGGCT AACGCCTGTA ATCGCAGCAC TTTGGGACGT CAAGGTGGGA GGACTGCTTG 1980
AGCCCAGGAG TTAGAGACCA GTCTGGACAA CACAGTGAGA CCTTGTCTCT ACTAAAAATT 2040
TAAAAATAAG CTAGTCGGCC GGGTGTGGTG GCTCACACCT GTAATCCTAG CACTTTGGGA 2100
AGCCGAGGCG GGTGGATCAT CTGAGGTCAG GAGTTCGAGA CGAGCCTGGC CAACGTGGTC 2160
AAACTCTGTC TCTACCAAAA ATACAAAAAT TAGCTGGGCA TGGTGGTGGG TGACTGTAAT 2220
CCCAGCTACT CGGGAGGCTG AGGCAGGAGA ATCACTTGAA TCCAGGAGGC GGAGGCTGCA 2280
GTGAGCCGAG ATCAAGCCAC TCCAGCCTGG GCAACAGAGC AAGACTCTAT CTCAAAAAAA 2340
AAAAAAAAAA AAAAATTAGC TAGGCATGAT GGCATGTGCC TATATTTTAG CTTCACTATT 2400
TTCACATGTA AAATGGATGT CACAGGGCAT ATGGCTCCTT GGAATATTAC ATGAGATAAC 2460
ATATTTAAAT CATTCAGCAG TATACTTAGC ACCCATGGAG TGCTCAATGG ATGGTAGCTC 2520
TGTAGATCAG CTCTCAATAG AGGGACAGGC CATTAGATAA GCTTGGGGAA GGCTTCCTGG 2580
AAAAGACTGG CTTGGTACTG GACTTTGGAG CCTGGATAGA ATATACATGA ATGTTGGCTG 2640
GAAGGAGCCT ATTCAAATGG AAGAGGGAAG AGGACAGGCT TTGGATGCTG GCAGTTTGCT 2700
GTGTAATCTT TAACAGGTGA CTTTCTTTTT TTTTTTTTTA GACGGAGTCT CGCTCTGTCA 2760
CCCAGGCTGG AGTGCAGTGG CACGATCTTG ACTCACTGCA ACCTCCACCT CCCGGGTTCA 2820
TGCCATTCTC CTGCCTTAGC CTCCCAAGTA GCTGGGACTG CAGGTGCCCG CCACCACGCC 2880
CGGCTAATTT TTTGTATTTT TAGTAGAGAC GGGGTTTCAC CGTGTTAGCC AGGATGGTCT 2940
CAAACTCCTG ACCTCATGAT CTGCCCACCT CATCCTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGGCG 3000
TGAGCCACTG TGCCCGGCCT AACAGGTGAC TTTACCTCTC AAAGTCTCAG TTTTCTTCTC 3060
TGTAGAATGT GGATACCACT AGAGCATACC TCATAAAACT GTTGGGAGGA TTAATGAGGT 3120
GCTATACTGA TAAGTGGAAA CCACTGAACA GAATCCTCAG CATGTGCTGT TGCTGTTTTT 3180
TTTTTTTTGA GACGGAGTCT CGCTTTGTTG CCCAGGCTGG AGTGCAGTGG CACAATCTCA 3240
GCTCACTGCA ATCTCCACCT CCCGGGCTCA AGCAGTTTTC CTGCCTCAGC CTCCTGAGTA 3300
ACTGGGATGA TAGGCACACG CCATCATGCC TGGCTAATTT TTGTATTTTT AGTAGAGATG 3360
GGGTTTCACC ATGTTGGCCA GGCTAGTCTT AAACTTCTGA CCTCAAGTGA TCTGCCTGCC 3420
TCGGCCTCCC AAAGTGCTGG GATGACAGGC GTGAACCATC GTGCCCAGCC TGGTGATCCT 3480
TTAAAAATGT ATGTCGGACT GTCATTTCTT GGTTCAAAAC CCTCCAATGA CTCTTTTTTC 3540
TGAGACAGGA TTTTGCTCTG TCGCCCAGGT TGGAGTTCTG TGAGATGTGT TCATAGCTCA 3600
CTGCAGCCAT GAACTCCCAG GCTCAAGTGA TCCTCCCACC TTAGCCTCCT GAGTAGCCAA 3660
GATTATTGGC ATGTGCCACC ATGCCTGACA AATTTTTTGT AGAGATGGAG GTCTCACTGT 3720
ACTGCTCAGG CTGATGTTGA ATTCCTGGGC TCAAGTGATC CTCCCACCTC AGACTCCCAA 3780
AGTTTTGGGA TTACAGGCAT GAGCTACTGG ACCCAGTCGA TTTTCCTTCT TTTTTTTTTT 3840
GGAGACGGTC TCGCTTTGTC ACCTAGGCTG GGGTATAGTG GTGTGAACAT GGCTCACTGC 3900
AACCTTGACC TCCTGGACTC AAGTGTTTCT CCCATCTCAG CCTCCCGAGT AGCTGGGAAT 3960
ACAGGTGCGA AACACCACAC CCGGCTAATT TTTGTATTTT TTTGTAGAGA CAGAGTTTCG 4020
CCATGTTGCC CAGGCTGGTC TCAAACTCCT AAGCTCAAGC AATCTGCCTG CCTCAGCCTC 4080
CTAAAGTGCT CAGATTACAG GCATGAGCCA CCACACCTGC CCTTTTTTGC TTTTCAATTA 4140
GTGAGTCAAG GGGAGATCTC CAATATATCT CCAATAGTGT GGTGGCTGGT CTGCTCTGAA 4200
ATGTAAGCAG TTTTTTTTTG TCCCCTTGAC CAGACTCTAA AAGTCTTAAG GTCAAAAAGT 4260
CCACAAATAA CGTTTTGTTT ACCCATCCTA CAGTGCTAGG CCTAAGCCTC GGACTTAGGC 4320
AAAGGAGATC AGAAGGGTCA TATGGCTAAA TGTAGGTGGA CAAGAGGGAG TCGGGGAGGG 4380
CCTTCCTGTG AATCCTCCTG CCTCTCAAGG ACGCTCTGTT CCCTTAGCTT GAGAAGCCTT 4440
GAGGAAAGCT TTTTCCATGA ACAAGCTTTT AAAAACCTTT TAGCTCTTTA AAAGCAGCAA 4500
GTACCATTCC AGTCATGACC CTGCAGACAG GTGGAACACC CATACTCCAG CCTCATTCTG 4560
AAGAGACTTG CAGAGCAGGA AGGAAGGGGT AATGACTTTC AGTTCCAGTA ATGTATCTAG 4620
AAGCAGCAGC TGATTCAGCT AGATGATGTC ACCTTCCCAA ACCTCCTGAC CAGCAGCTGA 4680
GATGGTAAAA GCAGGAAACA GGGGATACTC AGCTGGCTAA GTCCGAACAT GCCTCTGGCA 4740
AAGGCCTACA GTAACCCCAG GCTCTGGAGG CATCCTCCTG AAGATGAGGA GAAAGAGTCC 4800
TCTCAGCTGG GAGTACAGTA GGTGTCCTTC AAGACCCTCA AACCAAGATG CTTCTCCAAC 4860
TCTCCTTTTG CTAAGCAGCT TTCTGCATAT CCTGAACCAA CAATCCTTCA TTTATTCCAA 4920
GAGTGGAGCA GGGGAAAGAA GCCTGGCTTT AGAGCCAGCC CAATCTAGGT CCAAATCCAG 4980
GATTCACCAC GTAAAGCTGC AGGACCCTGG CATGCAACTT CACTTATCCA AACCTTAGTT 5040
TCTTTACTGG AAAAGAAAGT AGGGCTAATG GACCATTTAG CACACAGTCT AGGTGAGGGA 5100
ATTAAATGAG AAAATGCATG TAGAGTACCT GACATGGGCT AGGTGCTCAA TAAATGGTAG 5160
TCAACCATTA TCCCATTGGA TCTCTGCAGA GGAGATTTGA AAGATCACCT CCATCTATAA 5220
CACAAAAGGA AACAAAGGTA CCAACTAGAC CCAACAGTGT CAAAGCTGAG TAACTGAGTT 5280
GGCCCATGCA TATAGTTGCT TCCTAGATAT TCCATTACTC AGTTTCATTT TCTGTACAGC 5340
ATTTAACCCA ATCCCTGAAA TAATCTTGTT TGTTTCTCGG GCTAGCTGTC TCTCCCATTA 5400
AAGTAAGAGT TCTACAAGAG CAATGTCCTT GACCTTATCT TGTTTATCTT AGCATCTTCA 5460
GCATGTAGCA CAGGGCCTGG CACATAGTTG GTGCTCAATA AACATTTGCC GAATCGCCAA 5520
ATGAATAGCA CCTGGGATGG CCAAAAGCTA AACTGACAAT GGCCCCACAC TTAACTCCTC 5580
CCCTCACTAT TAGTTGAAGG CTCTGGCTCC CATTTCAGAA GCTGCCATTG CCACCTGGGA 5640
ATCAGCAGCC CAACCAGTGG CCAGCATGGG CATTAGTCCC TGGGCACGAC CTATCTATTG 5700
GGATACCAGG GCTGCCAAGG AGGGCCTTGG AATCCTCCCC CTGGCACTTG AAGATCCTAC 5760
AAACCTGGTT CTAGCTGACC TTTTTGGCTT TATTACCTAA TGAAAGAGAC CCCTCCACAT 5820
ATGCCTAAAA TTTGACTGCC ACTGCCCACG GGTCTCTTCT TGAGAGTTGG TCTCAGCCTG 5880
CAAATCTTAA CCCACATTGA CTCTCCTACT GGGAGCTACA GCCCCTCTTT TCTCCGCTTT 5940
GTGGTAAGGC TCGGTGTAAA CCTCACCTCT TCTGTGAAGT CCTTCCCTCA TTTGGCATTT 6000
AGCATTTATT GTTGGCTTTT ACAAGATCTC CTTTCATGTA TATTATGTCT TTTCTCTCTA 6060
ATTCAACTGG AAGTATCTTG AGAGCAGAAC TGGGTTTCCA ATGGCAATAT CTCAATTAAT 6120
AAACCTTCTA CAGAAAAGAC TCCTTGAAAC AAAGTTAGCT AGGTCCAGAG AGGACTGGAG 6180
AGGGGTCTAG GCTCCTCCCT GCTGGACCAG CCCCTTTGGC AAAAAGAGGA GATCGTGTTG 6240
CCTCAATCCA GGAGCCCAGC TGATGAGGCA GGAAGGGAGC CAGCAAATCC TAGACTATTA 6300
GGTGCAGTCT GGGACAATCC CAAGGTCATC TATGTAATTA GATTTTTTTT TTTTGGAGAC 6360
GGAGTCTTGC TCTGTCGCCA GGCCGGAGTG CAGTGGTGTG ATCTCAGCTC ACTGCAACCT 6420
CCGCCTCCTG GGTTCAAGCG ATTCTCCTGC CTCAGCCTCC TGAGTAGCTG GGATTACAGG 6480
CACGCGCCAC CACACCTGGC TAATTTTTTG TATTTTAGCA GAGACAGGGT TTCACCATGT 6540
TGGCCAAGAC GGTCTTGATC TCCTGACCTC ATGATCTGCC CACCTTGCCC TCCCAAAGTG 6600
CTGGGATTAC AGGCGTGAGC CACCACGCCC GGCCTGTAGT TAGATTTTTA 6650