EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-30303 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr4:89729610-89731900 
Target genes
Number: 8             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs2167750chr489730074hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr4:89730677-89730698GGAGCAAAAGAGAAAGTGAGG-6.11
POU2F2MA0507.1chr4:89730495-89730508ATAATTTGCATAT+6.44
STAT1MA0137.3chr4:89731029-89731040TTTCCTGGAAA-6.62
Stat4MA0518.1chr4:89731026-89731040TTTTTTCCTGGAAA-6.02
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00440chr4:89721815-89732988Adipose_Nuclei
SE_28242chr4:89723730-89732989Fetal_Intestine
SE_29315chr4:89727317-89732670Fetal_Intestine_Large
SE_56409chr4:89729265-89732619u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr48973069889731274
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH04I088808chr48972958589732412
Enhancer Sequence
TCGTGTCAAT CTGTCATGTT CAATGATACT AAAGGATTTT GCCTAAACTC TAACTTGAGC 60
ATAATTTGTC ATAATTTTTT CCTAAAGATG AAATTGAGAA TTAATTCTGA TTCACTTTTA 120
ATTTTTAAAA ATAAGCACAT GTTCTGTGAA TGAAGAAGGA AGTGTGTGTC ATGAAATTAA 180
ACCAATGACA AATTGAAACA ACTTAGAATT CATTCGATTT CCTCCTTGGT TACCAGTAAA 240
AACTCCGTGT TTTAATTATT TCCTATTTGC TGACTCTCAA TAATGACCAA GCTTAAGCAG 300
CCAATTATAA GTAGTTTACT TAAAAAAAAA AATCAAACAT ACATTGAGAG ATTTGGGCAA 360
TCACCTCATT TATGTGATTA TGCTTAATGT TCTCAGATAC ATGGTACTAT ATTCTCAAAA 420
TAACTGCTTG TAGGAAGAAC ATTTATCATA TAGACCTAAA TAACAGTCTA AATCTAAGAA 480
GCTACAACTA AGAATGCCAA TAACTTAGAT ATTTTTATCT ACGTTTTAGC AGAGTCCTGT 540
CTAACTTATT TTTTATACAG CTTGACATTG GTTAATGCAC ATAAATAAAT GACACCTAGA 600
CTGATAATCT CTTCATGAGT TACCCTAATT TCTAAACTGA AGCCACAGAA TGCAGTGCAA 660
TGCCTATCAG TTTAATTATA CAGCAAGCTA AAGGAAATCA TGAAAGGCAT AGTGTTGTAT 720
ATGTCTAAGA AAAACCAAAT AATGTTGGGA GAATTCCCAG GGCAAGTACC CAGAATGGAT 780
CTTCAATTAC TCGATCAAAC CACCATTCCA TTCCATTCCC TTTTTAACTC TCCAATTACT 840
TCAACTTTCT AATTGGTTAA TGTGGCTGGC TACCAGAAAA TTAACATAAT TTGCATATTT 900
AGCCACACAC TTTAAATATA TTTCTAAGTG GTTTGAGACA GAAGAAATAG TTTGTAAGTG 960
TTCCTTGAAT ACTGAAAAGT ACAGAAAAAC AAGTAAATGC TAAGAATTCG GTCCCATTCA 1020
TTGAAGAAAC TAGAAAAACC ATCCATGAGG CTTAAAAAAC AAAACAAGGA GCAAAAGAGA 1080
AAGTGAGGGA CAAGTATAAA GAAACAAAAG AAAAGTATAA AGTAAACATT TTTTCAGGAA 1140
CTCAGGCATT TTCCACATGT GCTACAAATG TAAGGGGAGG AATTTTCTTA GAGAATGATA 1200
AGTGAAGTTA GCACATTTTC CTTTCCTTCC TTGTTCTCAA AACATAAAGT GCAACACATG 1260
TACTTGAGCA TTTTCAATTT ATCCACAGTC TCAGTCGTTA ACCATGCCCC TTGCCAACTG 1320
GGGAGGTACG TGGCAGCCAC TGTTCTGTTG CTTAGGTTTT TGGTTTGGTC CCAATCAAGA 1380
ACATTAAAAA AAAAAAAGTC CCGGTGGGCT TTTTTTTTTT TTCCTGGAAA ACAAATGTAA 1440
GAGTTTTCGG ATCAGTTCAT AACTGTTTGC AGCTGTAATT TGTTGCGGGT GGGGGATATT 1500
TTACAATTCT TTTTTGTAAA CCCAGGCAGC TTTGTTTATA GTTTTATTAT TTGCACTTTG 1560
TGCCTAAGAA CACAACTCTT AGCCAGTAGA AATACAAATT ATTGCAGTTC AAGGGCAAAT 1620
AGATTTTCCA GACCAAAGGT TAAATGCAAA GAGCTGAAGT TGTTAGTATT CACAGAACAG 1680
AAATTTTTAG CTAACAGTAA GAGGTATTAT TCTGAAGGCA AAACAAATAG ACAAAAAGAC 1740
TTCCAAAGAT TTAGATTTTA TTCCAATATG ATAGAAAAAT ATTTCTACCA ATTTTTGTCT 1800
GTTTAGTGGA AATTTGAAAT ATACTGTTAT CAGCTGAATT ATGTCACCCC AAAAATATAC 1860
ACTGAAACCA TAATCCCTCA TACTTTAGAA AGTTATCTTA TTTAGAAACA GGGTCTTGAC 1920
AGAGATGATC AAATTAAAAT AAAGTCATTA AGATGGGCCT GAATCTAATA TGACTAATGT 1980
CCTTATAAAA AGGGGAAATT TGGACACAGA GACAGATATG CACCCAGGCA GAATATCATG 2040
TGAAGATTGG AGTTATGCTG CCCCAAGCAA CGGAACTATT TGAAGCTAGG GAAGAGGCCT 2100
GGAACATATC AAATTCAGAT AGAAAAACAT GCCTAACAAA GGTGCTTCAA TCTTACTTAC 2160
ACAAAGGTTA TGCTCTGAAA GTTCATTTAC AGGAATGCTA AGACTATAAT CAATTTCCCA 2220
TACTGACATG GGGATTTGGT TTCCAGGCCT GTATTCAAAA GTCTATCTAA CCTCTCATTC 2280
AAGTGAACTA 2290