EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-29727 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr4:38685560-38689530 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs17428931chr438689042hg19
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Sox6MA0515.1chr4:38686480-38686490CCATTGTTTT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 27             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00335chr4:38682280-38690287Adipose_Nuclei
SE_04596chr4:38686444-38687402Brain_Anterior_Caudate
SE_05689chr4:38686183-38687565Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05689chr4:38687952-38689712Brain_Cingulate_Gyrus
SE_07401chr4:38686617-38687536Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08638chr4:38686151-38687631Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08638chr4:38687998-38690022Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_18991chr4:38683866-38687427CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18991chr4:38688060-38690623CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_20502chr4:38685656-38687011CD56
SE_23162chr4:38686260-38687043Colon_Crypt_1
SE_23162chr4:38688200-38688834Colon_Crypt_1
SE_23162chr4:38689087-38689960Colon_Crypt_1
SE_23890chr4:38686456-38687057Colon_Crypt_2
SE_25872chr4:38688065-38688952Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26762chr4:38686182-38687191Esophagus
SE_26762chr4:38687714-38688876Esophagus
SE_26762chr4:38688982-38690055Esophagus
SE_31613chr4:38686027-38687165Gastric
SE_38386chr4:38688203-38691769HUVEC
SE_41226chr4:38688082-38688852Left_Ventricle
SE_49111chr4:38686327-38687083Right_Atrium
SE_49111chr4:38689063-38689797Right_Atrium
SE_50241chr4:38689008-38689928Sigmoid_Colon
SE_52450chr4:38686292-38687242Small_Intestine
SE_52450chr4:38689085-38689939Small_Intestine
SE_53561chr4:38686149-38686866Spleen
Number: 4             
IDChromosomeStartEnd
GH04I038685chr43868602138686170
GH04I038684chr43868618338687565
GH04I038686chr43868771538688952
GH04I038687chr43868924138689390
Enhancer Sequence
GGGGTGCATG CCATTTGCTC TTCCCAGAGT GTGTGTTTAT ACACGCACCA TGCCTTCCTG 60
TGCCTGGAAC CCTCTCTTGG ATGAAGATTC TTTTGACTTG ACCTGTAATG GACATTCACT 120
TTTTTTCATG TTGAGGAATA GTGAAATAGA GATTTCATCC ATGTTTCCGT CATTCCGTCC 180
ACTGAAACTG TCTTATAATG GAAAGCTCGC CAAAACTATT CCTCATAAAA TGAGAAACTA 240
TTGCAATTAT CACCTTAGCA TAAAGTGATA GAGCTTTGGG AAATTATCCA AACATGGTAC 300
CTCTTTCCCT GTTGCAATTA AAATCATTTT TTCAAAGTTC AAAATAATTA GTATATTATT 360
CTTCACCTTA TCAGTAATAA AAACCTGCTA AGAGAGTGTG TCAATTTACT ACACATTCAT 420
CAAGTATTAA TTGAGCACCT ATTGCAGGCC CTCATCACCT CACAGTGCAG TGAGAAGCAG 480
CAGTCAATAA GTAAATGCAC ACTGTGCAGG GGTGTGAACA TCTGAGTACA TGTTACAGAC 540
GGAAATAACT CTTATAGCAG ATCAGTGGTT TTGTGGAGGT TTTTTTGTTT TGGTTTTTTG 600
TGTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTGGTTTGGT TTTGGTTTTG AGACAAGGTA TTGCCCTGTT 660
GCCCAGGCTG GAATGCAGTA GCAAGATCAC TGCAACCTCA AACGCCTGGG TTCAAGCAAT 720
CCTCCTCCCT CAGCCTCCCC AGTAGCTGGG ACTACAAGCA AGCACCACCA TGCCCCGCTA 780
CATTTTTGTT TTTTTCTGTA GAGACAGGAT CTCATTATGT TGCCCAGGCT GGTCTCAAAC 840
TCTCGGCCTT AAGATATCCT CCTGCCTCAG CCTCTCCAAG TGCTGGAGTT AAAAGTGTGA 900
GCCACCATGC CTGGCCCAGC CCATTGTTTT AAGCCCTTAA GATCCCTAGT GGGGGCCAGA 960
GGCAGAAGCG GGAAAGACCC ATGTCTGTGT CTTGTCTTTG GACTGCTCTG TTCCAGGACA 1020
CAGGGTCTCT TGGACTAAGC AGCATGCACA GAGGGCACTG GAGGTCCATC CGTGGCCAGA 1080
GGCACATTTT TTGCTTCATC AACATTTGTC TCTGATTTGG ATATGGGGCC AGTACAGCCG 1140
TGCTTGTATG CATTGCTTTG ATAGAACATA GGAACTGTCT GGAACAGAGC GGGGAAGACT 1200
GTTACCAGGT TGTACCTGCC CAGAGCACAC ACCCTGCCGT GTCAGTCCCT ACACGGCACC 1260
AGATTGTTGG AAGCTGATTG CAAAAGCTTG TGTGTGCCAC CCAAATAAAG TGAACCAGCT 1320
TGAGGGACCA CATGTCTTCA CCCTTTTGTG AGGCAGTTGG GCTGGAAACA GTTAATTATC 1380
TGCCCAGAGT TGGGTGTCTG TGTCCAAATG TGTCTCTCCC CACAGTTAGT CTTGTACCTT 1440
ACAATAATCG CACATCCAAT AGAGGGAATG AGGGCATTCA TTTGAGAACA GACTTATCAG 1500
CAAACTGCAT AATGTTGATA AAGCTTAGCT TTATGTGTGG CTTTTTCTGT CTTAATGGCT 1560
TGAGAAACCT GAGAATATTA TTAGATTTGC AAATCTGGAG GTTCTAAATT CCTACTCTCC 1620
CAAAACTCAC CCCATGCATA GAAAAATCCA GCAATGACAG CAATAAAACT GTGTCCTCAT 1680
TTTGCTTCCC ATTTAGCTGC CAATAACTAT TGGCATTAAA ATCTAGGTCA TAGGGAGGTC 1740
TTGGAAGAAC AGGGCTGAAA ATAAGGGAGA AGCTACATTT TCGTCAATAG AAACAATGCT 1800
GCCTCCCATT TCCTAAAGTT TTTTCCTAGT ACCAGAACCA TTGCCCTTTG GAGAATTATA 1860
TAAAGCACAT TAGACTTTAG GACTAGGCGA AATCATTCTC CTTCCTATAT TTAATTACTC 1920
CCTGAAACCC TCCAGTGTAC ATGATTTATA ATGGATTTAT TTTGTTGTGT TGTTAATGAA 1980
CCTTGTGCCT CTTTTAATAA TACCCATCTT AATATTTAAA TTTAAATCTA TTTAATACTT 2040
AATGTTGCTA TCTTTTGGAT CTCTTGCGTT GGTACTGTGC GTGCCTGGCT TTAAAGAAAG 2100
GTAGAGAATC TTTTCTTCAT TTGATCCTTG ATCTATAACT CAAAGCTGTT TTTATGCATT 2160
TTGTGTTTTC TGATTTTATA TCCTTCATGT TCTTGTTTTT AAGCAGTATT AGTAGTGAAA 2220
ACTGGCTGCG CGTGGTGGCT CATGTCTGTA ATCCTAGAAC TTTGGGAGGT TGAGGCAGGC 2280
AGATCACTTG AGCCCAAGAG TACGAGACCA GCCTGGACAA CATGACAAAA CCCAGTCTCT 2340
ACAAAAAAAT ACAAAAATTA GCGAGGCGTG GTGTCATGTG CCTGTAGTTC CACTTCCTCT 2400
GGAGGCTGAG TTGGGAGAAT CATATGAGCC CAGGAGGTCG AGGCTGCAGT GAGCTATGAT 2460
CATACCACTG CACTCCAGCC TGAGTAACAG TGAGACCCTA TCTCAAAAAA AAAAAAAAAA 2520
AAAAGAAAAG AAAATTCTTT TTCCCTCCTT TAAATAGACC TTTAGTATCT TTATTTTTTA 2580
TCTCTGTCAT TTAGAGCATT GCTATTCAAA AGGTAGCCTA AGTTCCCTTG GTCCACTCCC 2640
CGGTAATTCA AAATTTGCAT TTTAACGAGT GCTCCAGGGA GATGGATGTG CACAGTAAAG 2700
TTTGAGAAAC TCTGGTTGGG AGCAGTAGAG CCCGTGACAG TGAGCATCTC TTGTATAAGC 2760
AGGGACAAGA AGGGATTTCC AGGATGGCAT GTGTATAAGC TCGTTGTGTA GGTTATCCCA 2820
TAACCTTGAT CTTAACCATG AGGACCTGAC ATCCAAACCA GATAAAGATA AACACAGTTA 2880
TGTGATAAAG TTTCACTGAC TGACTCCTCC CTAACAGGCT GCTCTGCAGG CCTGGAGCAG 2940
GGACTGGGCA TCTGGAATTT TAAAAACAAC ACAGATGATT CCAATGCATA ACCAGCCGAG 3000
GATTCGCCCA GACCAAGCCC AGAGAGGAAA GAGGGTGATC TCAGTAGGAA TCCCTATCAA 3060
AACCACTGCT GCCCCACAGT CATAACTCAC AATAGTGGCC ACCAGAGGGG CCAAGGAGAC 3120
CCAGAAATTA ATAGTGCATT TACGCTGTTT AATTACAAGG CACCATTGGG TTTTCTTGGT 3180
TGCATCCCAA GTTAGTATTG CCTCTAACTC TTAAACACAT AGGGTTTTAG AGCTGGAAGA 3240
GAAGCACAAT ATGTTGTTTA TCACTGTCAC TGTCAGACAT TCAAGTACAA AGAATTTTCT 3300
GCAGGTAAGC AGGCTTGACA TGCAAAATTT CAGTTTCCCT AAAATGCCTA GTAAAGATGA 3360
TGGTTTATGT TGAGTTTAAT TTTTTTAAAT TAAAAATTAG GTTGCATTCT ACAAAGAAAA 3420
TTTACAACAA AATGTTAGTT AAGGAATAGA AGTAATTTAG GTGAACTCCA TGGTCAAGGA 3480
TAGTGCCCAT TGTGTGAAAT TATGATGACT GGTTTGTATT TAAAGCTGGC AGATGAAAGT 3540
TAGGTTATCC TGATATTTAA AGAGAGAAAG GTGTTTGAAG ATAAATGAGG TCAGTTGTGG 3600
ACCAGATCTT GGGAAGGAAA CAGACTCTTC TGTCTCTTCT GCACTCCCTT GTTTGTGCCC 3660
CAGCCTCATT TGATGAGTGG GTAGCAGGGT ATAGAGGAGA GAACACAGGG CCTCAGCTTG 3720
TGTGAATGAC TTTGAGCTCC ACATTTCCTT ATGTGAGTCA TATCACGTTA GCTGTTTCTT 3780
ATAGTTCCGT GTCATCCACA GACTTGCCAT TCAAGTCTAC AGCTTCATTC AGATTCTGAA 3840
TAAGAACACT GAGCAAGTTA GGGCCAGGGA CATCATTGCC GCAGTGAGGG TGGCCTTCAG 3900
TACAAAGGTG TGTATGGTGA CTGACCCCCT CCTGGTTTGC CTGAGACTGT AGAGTTTCAT 3960
GGGATGTGGG 3970