EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-29331 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr4:7822800-7826670 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6446626chr47823171hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr4:7824223-7824234CCCCATAAAAC+6.02
IRF1MA0050.2chr4:7824290-7824311GTCTTCTTTCTTTTTCTTTTT+6.59
IRF1MA0050.2chr4:7823625-7823646AGAAAGAAAATGAAAGAAGAA-6.95
MafbMA0117.2chr4:7823069-7823081TGTCAGCATTTT-6.62
Number of super-enhancer constituents: 18             
IDCoordinateTissue/cell
SE_26076chr4:7822797-7826794Duodenum_Smooth_Muscle
SE_29596chr4:7822735-7824416Fetal_Muscle
SE_29596chr4:7824491-7826917Fetal_Muscle
SE_36928chr4:7822873-7826757HSMMtube
SE_37967chr4:7824450-7827070HUVEC
SE_38878chr4:7824620-7825982IMR90
SE_44960chr4:7824462-7825968NHLF
SE_45546chr4:7812721-7824459Osteoblasts
SE_45546chr4:7824462-7834743Osteoblasts
SE_46790chr4:7824573-7825035Ovary
SE_46790chr4:7825064-7825788Ovary
SE_49435chr4:7822790-7824058Right_Atrium
SE_49435chr4:7824495-7825917Right_Atrium
SE_50973chr4:7822762-7824113Sigmoid_Colon
SE_50973chr4:7824514-7825941Sigmoid_Colon
SE_54555chr4:7811888-7826777Stomach_Smooth_Muscle
SE_55843chr4:7823091-7824453u87
SE_55843chr4:7824465-7825862u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr478231277823244
chr478236207823745
chr478250187825712
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH04I007821chr478228647827137
Enhancer Sequence
CACCACTGCA CTCCAGCCTG GGCGACAAGA GTGAAACTCC ATCTCCAAAA ATATATATAT 60
ACATATATCT GTTACCAGCT GTGTGGCCTT GGGGGAAAGT ATTTAATCTC TCAGAGCTTC 120
AGTTTCCTCC CCAGCGAGGG AATAAGTGTG AAGATTACCT GTCTTGCAGG ACTATGGTTA 180
AACTGAGACA GTGAGATCCG CTATGGAAGA AGTCTAAGCC AGCATGTGGC ACGTGTACAT 240
TCAAACCATG GAAGCAACAC CGTCATTACT GTCAGCATTT TGATGACCTA TGATAAGAGC 300
TCAGAAAATG ATTCTGGACT AGACTTCCAG ATGCAGGGAT GGTGAGCCTG CAGGACAGGA 360
TTCCGTGCAC GAGGGCTTTC CCAGCCGCCC CCTACATGCA GTCACCACAT GTTTCTCCAA 420
CCCCTACTGA GCTCATCAGC AACCAGGCCC ACTGTGATCA CGGGGGACGT GCAGCAAATA 480
AGACAGACAA GGTTCCAGCA CTTGCAAAAC TTACATTCTT AAAACTGAAA AGTTAGCAGG 540
CAAAATTTTC AAAATGTCTT CTATTCTTTT TAGGACTAAG CTGCAATTTC AGTTAAACTC 600
AAGCTTCTTC TGGGCAAAAA AGAAACACCA AAGTCCCAGA TATGTGTGTA GTAATTTTGC 660
AATTGGGCCT CCACAGACAG ATCCAAATTC CCTCAGCTTG TGCTGGTGCT GGGATTAAAT 720
CCAAGGCCTG ACAAGAGACC AGGATAGTGT TTCCAGCCAT TTTGCTCCTC AGCTGTTTTA 780
TGAAAAAACA ACAGAGTGAT GTCCACAGTT GAGACTACAA AAGAGAGAAA GAAAATGAAA 840
GAAGAAACCC AGAGAGCTCG CTGTCATATC TCCTCTTTGC TAATGCCGAG GTGTGGAAGC 900
ATGAGCAAAC CTGAACCTCA ATGCAGTGAT CTGTGTGTCT GATCTCTCTT GTTTCTCTCG 960
CTTTCATGCT AATTGCTTTT TTGGTCTTTA CTCCCTCACC TACCCTAAGG TGTTTATTAA 1020
GTCTCCAAAT GACAAGGCAA ATTTTTATTT GATTTGAGGA CAAGACTTTC TTTTCACTAG 1080
GGAAGGCATG TTCACGCAAT GGAAAACTCC TGAGCTTCTA CGTCAAACCC ACCTGGGTTT 1140
AAACCCCAGG TGGACCACTT GCTGTTTATG TGAAGCTGAG CAATTCTCAG AGCCTTGCTT 1200
CCTTCCTCAA TAACACGCAC AAAATAATAC CTCAGGGGGT CATTGTGAAA ACTAAACGTT 1260
AAAACAAATG TGAAGTATCC AGCCCAGTAT TTCTCCCCTA ACAGGCATTA AGGAAACCTG 1320
AACTCTCCCC ACGATTATAT TTAATAGTGT TAAATAAATG AAAATGTGCT TCCATTATAC 1380
AAACGCACCT GACATGCTCT TCATTTTACA CTAAAAGGCT GTACCCCATA AAACATAACC 1440
TGCCAAAACC CATGATCTCT GGCAAATGTT TTTATTCAAA AAAAACGGTT GTCTTCTTTC 1500
TTTTTCTTTT TTCTTTTTTT TTTTTTTTTG AGACAGAGTC TCGCTCTGTC GCCCAGGCTG 1560
GAGTGCAGTG GCACGATCTC GGCTCACTGC AAGCTCCGCC TCCTGGGTTC ATGCCATTCT 1620
CCTGCCTCAG CCTCCTGAGT AGCTGGGACT ATAGGCGCCC GCCACTGCGC CCGGCTAATT 1680
TTTTTTTTTT TTTGTATTTT TAGTAGAGAC GGGGTTTCAC CGTGTTAGCC AGGATGGTCT 1740
TGAACTCCGG ACCTTGTGAT CCGCCCGCAT CGGCCTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGGCG 1800
TGAGCCACTG CGCCCGGCCC CTCTTTCTTT TTTTTTTTCA ACAGGGGAAC TTCTTTGGCA 1860
GCACTACTCC AATTATTCCC AGCAGCCTCT TGGGTAGGGT GGAGGGGCTG GCTGTGTGAA 1920
TGGTGTCTTC TGGAGGAGCT GTGCTTTTTT TTATATAGCT AAATAGAACT CATCTTTCAA 1980
GATTCAGCTG AGGTCTCCCA TCTTCAGGAA GCCTGCTCTG GCCCTTCTGT GTGGTCCATA 2040
AGGCAGGGCT CCCCCTCCAC ACATGCCCAC AGAGGCCTGT GTCTCCTACT AAGTTGTGCT 2100
CGTGTTCATG GGAGGGGCTG GGCCTTGCTT TTGTCACTGT TCCCAATGTC TACTTCGAAA 2160
CAGCAACCAA AAGTTTGATT AAAGGGAAAA CAATGAGGGA ATGAGGAAAG AAACTGGAAT 2220
TAAGATTTCT ATGAAGAAAA AAAAGAAGGA AAGAAAAACA GAAGGAAAGA AACGTAGGCC 2280
ATCACTAAAA TAAGAAGAGC CTCATGACCA AGCTTCCCCA GTCCTCGGCA CTGGTTTCTA 2340
AAATCCTCAA GAGGAAAAAG TGTTGTTTTG TGTGTTTTTT AAAGGAAAGT AGATAAAAGC 2400
CATCTGGCAC ATACGCACTT CCCCACTCAG CCCTACCCTA ACACACACAC CCTGGCTAAG 2460
CTCCTGGCAG ACTCGCCTGG TCCCTGGAGT GTCCCCATCC CTCTCCTGTT CCCATCAGCT 2520
CCGACTTTCT AGCAGACAGA CGACGCTGCC CAGCATCAAA GCACCTCACG TAATCGCCTT 2580
TCCAAGAAGC TTTCCTGGTA CACCCAACCA TGTAATCTGA ATGCTTAGAA TGGGGAACAC 2640
AGACAAGCCA GCCACGTTTG CTCTCTAATC ATTAACTTCT CTCCCAGCTA GAACTCACAT 2700
TGCCCCAGGA AAATAACAGC ATCTCCAACA GTGCTTGGGA GGATCGCATT CAGCAACCCA 2760
GAGCAGGCCC AGGATCAACC TGGTGCCCAG CAAGGGGGTG GCTCATGGCA TCCCAGCTTC 2820
GTGGGACTCT CTTCCCCCAG GCATAATAAC TATGTCCAAG GTACGAAGAA AGGCATTGCT 2880
AAAAACATGC ATCAGCATAA ACCAGTCTTT ATTCCCACAA AGTTTTTCAA CCAGTCGGAG 2940
AGGTCAGGTT ATTTTCATGA AACTGTCTTT CTACTTTGGA TCTCTGTTGA TTGCCAAGCT 3000
GCACCTGCAG AGTTTAGTCA GAAGTAATAA GTAAAGCACT GATCACTCCA ATTCTTTGAA 3060
CAGCTATAAA TGAGGCTTCT ATTAATACAT TTCTACTTGA AGAGCCATGT CCTATGAGGT 3120
TCAATGTGTA TTTAAGAGAA CTGGATCCAA ATTCAGAATC GCAAATCCTC CAAAAAAACA 3180
AATTGTTATA TATTTTGTGG TATTTTGTTT GCTTTTAACT TGAGCCCTCG ACTCCAGAAA 3240
CACAATCTCT GCACATTTTT TAAGGAAATC TGACCACTCC GTTTCTGGGA ATATTGGCTC 3300
TTGTCTTCTG TTTGACCCCT ACACAAAGGC TCATGTTTTC AGCATTTGTG TACACACACA 3360
CACACACACA GAGACAGTCA GTTAATTCTG TCAAGAACCA CTAGTAATGG AAATTGGAGA 3420
CAGAGAGCAG AAACAAATTT GGCAGTAATT CTTGCACGAG TATGTGCAAA GTCAAGCACT 3480
GGTTAAACAC AGTTCTCATG GTTTTTTTAG ACTTGACAAA GGGCGTGTGC AACTTCATTA 3540
AAGATTTTTA ATGGTTACAT TAAAATTACG TTTCACAGAA AGTCAAATCT CACATGTTCT 3600
CACTCATGTG GGTGCTAAAT AATGCCTACA CGTGAATGGA GAGTGGAGAA TGACAGCAAT 3660
GGAGGCCGGG AAGGCTGAGG GAACGGGAGG AAGGGGGATG GCGAGAAATT GGTTAATGGG 3720
CACTGAGGGA ATGGGAGGAA GGATGGTGAG GAACTGGTGA AGGGTACAGT GTACATTATT 3780
TGGGTGATGG ATACCCTGAA ATCTCTGATT TGACCACTAT GCAATCTATG AATATAAATT 3840
TATACAGATC TTTTCCAAAG CTGTGTTTCA 3870