EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-23622 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr2:238217230-238221150 
Target genes
Number: 9             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs2029999chr2238218583hg19
rs4496284chr2238220230hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr2:238219982-238219993TAATTCAATCA+6.14
Foxd3MA0041.1chr2:238220607-238220619GTTTGTTTGTTT+6.32
IRF1MA0050.2chr2:238220337-238220358AAAGAAAAAGAAAAAGAAAAG-6.02
IRF1MA0050.2chr2:238220331-238220352AAAAAAAAAGAAAAAGAAAAA-6.09
MEF2BMA0660.1chr2:238218722-238218734ACTATTTATAGC-6.18
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_25904chr2:238216860-238218544Duodenum_Smooth_Muscle
SE_25904chr2:238218908-238219935Duodenum_Smooth_Muscle
SE_30045chr2:238217204-238218631Fetal_Muscle
SE_45533chr2:238217379-238220014Osteoblasts
SE_45533chr2:238220275-238222082Osteoblasts
SE_54504chr2:238216339-238218867Stomach_Smooth_Muscle
SE_54504chr2:238218872-238245659Stomach_Smooth_Muscle
SE_55650chr2:238212893-238220197u87
SE_67448chr2:238212893-238220197u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr2238220834238220979
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH02I237308chr2238217176238218417
GH02I237310chr2238219244238219443
Enhancer Sequence
GCGTGTGTGT TGGCGGGGGT TGCAGGGGTG AAGATCTTAA CTCGAAGTGC CCAGTTCAGT 60
GGCATTAAGT ACATTTACAC ATTCACATTG CTGTGTAACC GCCACCTTCA TCCATTCCCA 120
GAAGTTTGTT CATCTCCCCA GACTGAAACT TCATGACCAT TAAACACGAA CTCCCCATTA 180
ACCCTTTATT TTCAGCCCTT GGAAACCACC ATTCTATTTC CTATCCCTAT GAATTGGACT 240
ATTTCAGGTT GCTCCCATAA GAGGAATAGT GCGGTATTTG TCCCTTTCTG ACCGGCTTAT 300
TTTGCTTTCT TCTCTTCAAC GTTCAGCCAG GTTGTAGGTA ACATGGGTCA GAATCCCCTA 360
CTTTTTTAAG GCTGAATAAT ACTCCACCGT GTGGATAGAC CACATTTTGT TTATCCATTC 420
ATCTATTAAT ATTCAGCGTC CTTCTTAGCA TAGTGGTGTT TCTCCTGGTC TCTCCTTGTA 480
TAAATATTTA TACCAATTGC TACCGAAAAA CACACAATTC CCTCCTCATT TCTGAGTGAA 540
CTCTAAGTAT CAGAGTGTTC TCAGCAAGCA GTTGGCAGGG GGAAGCAAAA ATTGTTCTCA 600
ACCAGAAAAC ATTCACTGAA GAGCTGACCA CTTGCCAAAT TAGCCTCCAT GCCTTCCCCT 660
CTCCCTGCTT AACACTGCAG CTGCCATAAC ACAGTCAAAC CATGTCAGGC GCAGCCATTC 720
TCTTCCTGAT TGGAGGAGGC TATTAATACA ACAGAAATAC AATGCAAATT AACTGCAAAC 780
TTCTTCAAAG AATGTAAGAT TTTGTGTAGC AGGTGACAGT CATACTAGAG GACTTCTGGA 840
ATCACAAAGT CTGGTAGAAC AGTTATCACT GAAAAGGGAA AAGTTAACAA AATTGGTGAC 900
ATTATCAGTG ACTCGCAACA AGACTTAATC CCAAAACATC TAAGGGATTA AGAGAGGCCT 960
TGGAAAGATG ATTAAATCCC TGGAGCATTT TGACAAGTGT GACTCTCTTC ACGAACTTGC 1020
CAGAAAGTCA AATGAGAGAA TGTTTCATAC TTATCATGCA ATATCGTGGT CTCACGTGAA 1080
GTGTAGCCTT AGCCTGACCC ACTAGATATT TCAAAACAAT AATTGCACAG CAGGATTGTT 1140
CTGCCTTGAG GAGAAGTTAG GAACAGGTTA GAATAAATTG TCAAAGAAAT AAAGAAGAAC 1200
ATTTCTGAAC TTCTAATCTA AAAAAAATAC TTTTGACAAA ATTCAACATT TATTCCTAAT 1260
TGTAAAAAAC AATACATTAA AAGAGAAAAA TATTTAACAT AAATATATAT AACATAGTAT 1320
ATAACATGAT TGCTTAACGT CTAAATTCAG AACCTAATAC CAGAAAACAA TGAATGAGAC 1380
ATTCTCAGTG AAGATAGAAA TGCTTAATAC CACACCATGA TGTGTAAGTA CTAGGAAGTT 1440
TAATAAAATA AGAAAAATAA GAGCTACAAA TGTTGGAAAT TAATATCAAA ATACTATTTA 1500
TAGCAAAATG ATATGATAGT ATACCAACAG ATGGTGCTGG GACAATTGAT TGATAATTTG 1560
GAAAAAAAAT AAAATTCCTA CATTAAACCT CCCTCCAAAA AAATCCACAT CTCAGATATT 1620
TAAATTTAAA ATTAAATAAA ATTTAAATTT AAAAATACTA GGAGAAAATA TGGGTGACAA 1680
TTTCTTATGG TTTACTATGT GGTTATAAGT AACAGAAAAG GTTTCAACCT AAATGATGTA 1740
GAAAGTGAAT TCATTATAAT TTATGATATA CTATCATTGC TCTTTCTACT AAAGGCCCGC 1800
ATGGGACTGA ATAAGACCTG GAGTGTTTTG GGAAATGAAG ATGGCTTTGC TCTCGCTTCC 1860
CCTTCCCTTT TCATCAACCT CACAGTAAGT CCAGGACTTC TGCTGCACAG CTTCTGGGCT 1920
GCTTGTATAA CTCACAAGCA GCCTTATTAG ATCTCCTAGT CCCTGCATGT TTCAACCAAA 1980
TAAGGCACTC TTCGAGACCC TAACAAAAAG AAAAGAAGCC TAAACTCTTG GGTGGACACC 2040
AATGGCCACT TCTCCCACGC CCCTCACAAG GTAAGAGGGG CAAACGCTCC TGTCTGGGCA 2100
TCCCGCCGTG AGGGGCGCTG TTACGCCATG GTGGTGCTGC GCCCTGATGT TTGGGATATT 2160
TGGCAGCCTC TCTTTTTCTC CTTGGCAGGC CACTTAGAGC TGCGGTTGGC CCACTGGTTT 2220
TTGAACCCAA GGATGACCTG AGTGCTGAGA GCCCTGGGTC CTCAGCTCCC CACCTGAGGT 2280
TTCCCTGGCA GCGGAACCCT GGTGAGCTGC CTCTCAATTT CAGGTTGTGA TATCCATGTA 2340
TGAGTCACAG CCTGACATCT CTGAGCGTCA GCCACTCCTA AGCCCGACTG CCTAATATAA 2400
CTATTGAGAT TCAGTTTGCT CCTAGAAAGC AGAGTTAACC CTCGGATGTT GTCCTCTGCT 2460
GTGGTTCATT GAGCAAAACC TGGCTCCTGG AGCCCACATT ATTAGGGAAG TGGGGCGGGA 2520
TGTCAGGGGG CCATTCTCAG AGAAGGGGAA CCAGGGGCTG AGCAGACGCC CAAACCGCAT 2580
TCACTCTAGT GTTTTTTAAC CTGGAATTAA AGATGGCATT TATAAGCACA GCAGCAGAGA 2640
TGAACTTTGT AAGGAAAAAA AAAAATTAAA AGGTATGAGT TCAGAAAAAT TTAAAACCAT 2700
ATAAATAAAA AGAAAATGAT AAATACTTTA AAATTAGCAA TATTTGTGAA AGTAATTCAA 2760
TCAGTAAAGA AATATTTAAA GTAGAACAAT AAATAGGCCA AAAGAAAAAC AGTCTGGGCA 2820
CGGTGGCTCA CACCTGTAAT CCCAGCACTT TGGGAGGCCG AGGCTGGTGG ATCACCTGAG 2880
GTCAGGAGTT CCAGACCAGC CTAGCCAGCA TGATGAAACC TCGTCTCTAC TAAAAATACA 2940
AAAATTAGCT AGGCATGGTG GCAGGTGACT GTAATCCCAG CTACTCGGGA GGCTGAGGCG 3000
GGAGAATTGC TTGAACCCGG GAGGAGGGGT TGTGGTGAGC CTAGATTGCG CCACTGTACT 3060
CCAGCCTGGG TGACAGAGTG GGACTCCATC TCAAAAAAAA AAAAAAAAAA GAAAAAGAAA 3120
AAGAAAAGAC AAAAAAAAAG AGGGGGCCCA AGCTCTTTGT CTGACTTTCA GACTGGGTTG 3180
AATTCAAAAG CAGCTGTGTG ACTAAGAGCA ATTACAAAAC CTCTCTGAGC CTCTGTTGCC 3240
CATCTACAAA ATGCAAAGCT CCCATCAATG TGGGAATAAT TAAACGTGAC ACTGTGAGCC 3300
AGGCATGGAG CTCAATCCCT CAATCCCCTC CATCCCAGAG GAGCTATTGT TTCTGTTGCT 3360
GTTAGTTTGG TTGGTTGGTT TGTTTGTTTT CACTGTTGTT GTTTAGAATA AATTGTTTAA 3420
AATTTTAACT TCACTAGTAA TTTTAACCAA TCAAAATAAT GCAACATCAA TTTCACAAAT 3480
CAAATTAGCA ACAAAGATTT AGTAAAAATG AACATATTTT TAGATGAGAG ATGAGACATT 3540
TAAAAGACCA TTAGTGGGTT GGGTGCATTG GCTCACGGCT GTATTCCCAG CACTTTGGGA 3600
AGCTAAGGTG GGTGGATCAC CTGAGGCCAG GAGTTCCAGA CCGACCAGCC TGGCCAATAT 3660
GGCAAAACCC TGTCTCTACT AAAAATACAA AAAATTAGCC GGGCATGCTG GTGGGCATCT 3720
GTAATCTCAG CTACTCGGGA ATCTGAGGCA CGAGAATCAC TTGAACCTGG GAGGCAGAGG 3780
TTGCAGTGAG CTGAGATCAC ACCACTGCAC TCTAGCCTGG ATGGCAGGGT GAGACTCTGT 3840
TTCAAAAACA AAAACAAAAT ATAAAATACA ATACAATACA ATAAAAGACC ATTAGTGGGC 3900
GTATAAGTTG GTGTAGCTTC 3920