EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-22431 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr2:178103850-178111670 
Target genes
Number: 12             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr2:178111496-178111517TTTTACTTTTTTTTTTTTTTT+6.16
IRF1MA0050.2chr2:178105846-178105867CAACAGAAAGCGAAACTGAGC-6.8
IRF1MA0050.2chr2:178109739-178109760AAAAAAAAAAAAAAAGTAAAT-6
IRF9MA0653.1chr2:178105848-178105863ACAGAAAGCGAAACT+6.15
Lhx3MA0135.1chr2:178105819-178105832AAATTAATTATAC+6.19
MEF2AMA0052.3chr2:178105784-178105796TCTAAAAATAAA+6.07
NR2C2MA0504.1chr2:178110064-178110079CAGGGTCAGAGGTCA+7.8
NR2F1MA0017.2chr2:178110070-178110083CAGAGGTCAAAGG+6.74
Nr2f6MA0677.1chr2:178110065-178110079AGGGTCAGAGGTCA+6.93
Nr5a2MA0505.1chr2:178110743-178110758TCTGACCTTGAGCCT-6.18
RxraMA0512.2chr2:178110065-178110079AGGGTCAGAGGTCA+6.73
ZfxMA0146.2chr2:178104164-178104178GAGGCCGAGGCGGG-6.01
ZfxMA0146.2chr2:178109494-178109508GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 43             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04365chr2:178102487-178108824Brain_Anterior_Caudate
SE_04365chr2:178108902-178109711Brain_Anterior_Caudate
SE_05456chr2:178102580-178108702Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06605chr2:178103329-178108687Brain_Hippocampus_Middle
SE_07153chr2:178102671-178108691Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08697chr2:178102435-178108704Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_11391chr2:178102484-178108874CD20
SE_12125chr2:178104718-178106259CD3
SE_13395chr2:178103653-178108665CD34_Primary_RO01536
SE_13395chr2:178110313-178111216CD34_Primary_RO01536
SE_14672chr2:178104109-178108948CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17501chr2:178102398-178108666CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18040chr2:178103612-178108386CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_20101chr2:178103064-178107859CD56
SE_20977chr2:178106043-178108703CD8_Memory_7pool
SE_21754chr2:178106523-178107702CD8_Naive_7pool
SE_24848chr2:178106656-178107661Colon_Crypt_3
SE_25905chr2:178103583-178111506Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26714chr2:178104696-178105921Esophagus
SE_26714chr2:178106782-178108838Esophagus
SE_27757chr2:178102324-178108497Fetal_Intestine
SE_28727chr2:178102213-178108544Fetal_Intestine_Large
SE_32276chr2:178107329-178108620Gastric
SE_35032chr2:178104215-178108759HeLa
SE_35032chr2:178108911-178111380HeLa
SE_36337chr2:178104559-178108570HMEC
SE_37359chr2:178103331-178111569HSMMtube
SE_38389chr2:178104200-178111484HUVEC
SE_40102chr2:178106196-178108470K562
SE_40102chr2:178109627-178110433K562
SE_42450chr2:178104558-178105511Lung
SE_42450chr2:178106091-178108759Lung
SE_42450chr2:178109058-178110480Lung
SE_44916chr2:178104393-178108865NHLF
SE_44916chr2:178108939-178111219NHLF
SE_45949chr2:178103517-178113015Osteoblasts
SE_49035chr2:178107206-178108449Right_Atrium
SE_50467chr2:178104588-178105422Sigmoid_Colon
SE_50467chr2:178106148-178108768Sigmoid_Colon
SE_51368chr2:178103240-178111482Skeletal_Muscle
SE_62773chr2:178104117-178132097Tonsil
SE_64314chr2:178104318-178108889NHEK
SE_64314chr2:178109604-178111402NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr2178104199178108800
chr2178104644178105169
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH02I177237chr2178102546178111927
Enhancer Sequence
CCTTATCAAC AAACAGGAAA AATAAGACAT GAAGCATTAT TTAGACTAGC TCTTGAGCAT 60
CCTGTTCACG TTACCTGAAA CAATGCTGGA CCCTGGGAGA CTAAGCAGCT CCTGCGGCCC 120
TAGCTTACTG TCTCCACCAA GAATGCCACC AAATGACATC TAATTGCTCT TCATTAGGCT 180
GGGGGACATT CAGTGCAATC GTAATAGGAC CAAAATAGGT TTCAAAGTGT TCTGAAAGGT 240
TTTCCTGTGT ATTTTTAAGT TTATATTTAT GTGGCCAGGC ATGGTGGCTC ACGCCTATAA 300
TCTTAGCACT TTGGGAGGCC GAGGCGGGCA GATCGCTTGT GCTCAGGAGT TCGAGACCAG 360
CCTGGGCAAC ATGGTGAAAC CCTGTCTCTA CTAAAAATAC AAAAATTAGC CGGGCGTGGT 420
GGCATGTGCC TGTAGTCCCA GCTACGTGGG GGACTAAGGT GGGAGGACTG CTTGAGCCCA 480
GGAGGTCGAG GCTGCAGTGA GCCAAGATCG TGCCACTGCA CTCCAGCCTG GGTAACAAAG 540
TGAGACCTTG TCTCAAAAAA AAGTTTATGT AATGTTTTTT CTTGCTATGA GAGGTCTCAA 600
AACAAAACAA AACAAAACTG CTTCATAAAA GAAAAAAGCT AAATTTGAAG CAACTATTTT 660
GGATTCCCAA AAACAGACAT CTTGATCAAA TTTAGAATGC AGCAACAATA GGTTTATTGT 720
TATGGCCTTA ATGTCATACT CTGTGCTACT CAGATTTTCA CATCTGTTTC AGCAGGCAAA 780
ATCCTGCAGA GATTTGATAC TGTATGAAAC ATTCAAAGCT TTATGTTAAA AAAAAAAAAA 840
AAAAAACAGC AGAAGTTAAC TGAAGACTCA CTGTTGGGGA CCACAAGCTC ACTACTGTAT 900
TTTGTGCTAA GCTAATATGC ACCAACCATT TCCTGTAAGG AGCCGTGTGA CTGGGCACAT 960
GATTTATTCC ACAAATGACC CAGCTCTCTG CAAGGCTCAC ACATCATCTA AGAGGAAATA 1020
ATCGTCTGGG TGGAGCCCAT AACAAACAAG AACATGACAC TGGACAGGAG GAAAGGGAAG 1080
TGCCTAAGGA AGAACTAAAA CTGCTCTTCT GCACAGAAAT CCAGGGCTTT GAGGAAGTGC 1140
AAGTCCCCCA TGGAGGAAGG CCACAGTACA AAGTGTTAGA TAAGTAGGGT TTGGGTAGAG 1200
AGAGGAAAGC AGGTAGATGG GTTGCACAGC ACTGCACAGA TACTTTCTTA CAACGGGTGA 1260
GAAAGCTTCC CAAGGGCCAT GCGAGCACTG GCCAGGAGCC TTTGCATGGC ATATGGAGCA 1320
AATGCCGTCT GCCACTTGGT GTCTGAATTT TTTTTGCTCT TGTCCTTTAG TGATTCCTGA 1380
GTGTGTTCCA AATTATGTTG CTAGCTTGGC TTAGACAAAA GAAGACAATT TGATAAGAAA 1440
CACAAATGTT GGACAATTCA TGTTAAATCA CCATCTGGCC TAACAGAAAT ATTCATGTTT 1500
AAAAAATATA TATCATCATT TGCCAACTGG GTAATCTGTT ACACATTTTA GGGAAATCTG 1560
AAGTTGGACA ATTAACTCAT ACCACTTTAA AACAAACATC TTTGTACCAG GATAAACAAA 1620
GAAGAAAGGA CTTGAACACA GAATCCATAT TAAATATGTC TTTTGCAAGT CAATTTTAGT 1680
GCCTTGAATA AACCAGCATC TATCATGCTT AGATGATCCA AAATATTGGA AAAGATAAAG 1740
CAAAGATAAT ACAATCCCTG TCCTAAATTA AAGCTATTCA GTAAACTGAG ACAAAGTATT 1800
TGAAATGAAA AGTAATCTTT TAGACACTCA AATGTCTAAT TAAGGCTTGC ACCTCCCATT 1860
CCCCCGAGTC TCCCTTCCCT CTCCTACCCT CTATCTTGCC CTGAGAATGA CAGGAAGGTG 1920
GTGGGAGATT TCCTTCTAAA AATAAATTTC ATCAATAAAC TGTTAAAAAA AATTAATTAT 1980
ACACACTACT AACTCTCAAC AGAAAGCGAA ACTGAGCCTT GCTCCAAAGA GAAAACTGAT 2040
CCTTGATCTT TTTACTTTCA TGTAGTATAA AGTTGGAATG TCTTAAGTTA TTCCTTCTTA 2100
AAATCATGTA TTTCCATTTA AAAAAAATCT TATTTTAATG TTATTCCCCT GAGATCCTTC 2160
CTTCATCCAA ATCTTAGTTA CCAGCATTCA GAGTCTAAGT TACACTTGAT TATATTTTTC 2220
TTTCTTTCAT TTCATTCTTC ATATTATTCC CAGGTGATTA TATTATTTAC CTAAAAGCTA 2280
AATCTGGTTC AATGTTTTTT TCCATAGACA CTGTCTAAGT ATTTCTGAAG AAAACCAGGT 2340
GGAACATGAA TCATATCCTA CCATCTGGAT GAATATAAAC CAAATTAAGA GCTATATGAG 2400
GCTGCAAAAA TATTTGAGGG CATGCTTGAA TTTTGAGGAA TTGATAAAAT AACAGCCAGG 2460
CACGGTGGCT CACACCTGTA ATCCCAGCTC TTTGGGAGGC TGAGGTGTGA GAATCACTTG 2520
AGCCCAGGAG TTTGAGACCA GCCTGGGCAA CACAGGCCTC AACTCTACAA AAAAATTTAA 2580
AAATTAGCCA GACATGGTGA GACACTGCTG TAGTCCCAGC TACTTGGGAA ACTGATGTGG 2640
GAGGATCACT TGAGCCCAGG AGATGAAGGT TGCAGTGAGC CATGATCATG TACTGCCCTC 2700
CAGCCCTGTC TTAAAACAAA ACAAAAGCAA AAACAAAACA AAAACAACAG AGATCTCCTT 2760
CATTTACAAA TCTCTGCCTT GCAGTCGTAA TCCTTATTAG ATAAAGCAAA ATGACACCAA 2820
GCAGATGTGT TTTTAAAATA CATCTTGCTG ATGACTAATT ACATTTCATA GATATGTATC 2880
TGCCTATTTA CTTCTCTGGC TTCTCTCACA CTGCATTACA AGAATATAGC AATACCAATT 2940
GTTTTCTCAG CAAGAATTCT AGGTCATTCT TTCTATTTCC CACATTCCAG TACTTTTGGT 3000
TTTATTAGAC TGATTTGCTA TCTTGATTGT GTTGCTACAG TAAGTGTAAA GTAGGTGATT 3060
AAAATACAGA AACACAGAAT ACTGGAGACA AAAGGGGCCT TACAGCCTAT CGAGGCCAAG 3120
TGTAAATGTT GCCAGGTTTA TTTCTATGTA ACTACAGTGC CTTAAAAAAA ATAACTGGCC 3180
TAGCAACATG TTGTATACAT CAGCAGAGAC ATTTAAGAGG TAGCAACAGT TACCACGAAT 3240
CCAAGTTTTC CTTTCCCTTA TCTTGAATAA CTAGAGACTT TTAACAGCAT AAAAAAGCCC 3300
AAATACACAC AAAGACGTAT TATTCAACAA GTTAAAACCC TAGTTCACAA ATTTACCATT 3360
CCCTGAGTTA TAGAACCATT TTTCTGCCCT TTTATCTTTC CACTAGAAAG TGGTCCGGTT 3420
TCTTCAATCT GGCAGGTTAC TATGTGCAGC CATTTTCATG GGCTGCTTCC TGTTCCCAAA 3480
CAAGTTCCTC AGTCATGACT CAATCTAAGA AATATGATCC AGCCAATTTA CTGGAACTCT 3540
CACCCATTAT GCTTGTCTGT AAACTGCAGA GCATGATGCA AAGATAAAGC AAAACTGGAA 3600
AGTGAAGAAA GCAAGAATTT GGATTATTTT CTCAAGAGGC ACATGCAGAG TTCGGTCAAA 3660
AAGATGTCAG AAAAAAAGTT AATTTCCAAA ACAGCAGGTG ATCCTACCTG CTACAAAAAG 3720
CACATGGTAC TGAATTTTCC ATGAGAGGTT CACATCTGAG TCCCCAAGGA GGTTTTGTTT 3780
TTTTTTTGTT TTTTTTTTGG TGGTTTGTGT TTGAGTAGGA TACTGCTGCT AGGCTTCAAA 3840
GGACTTATGT AAGGGTTTCA CTACTTTGCT GAGAGAATGG CTTGGTTTGA CAAGCAAACA 3900
TTAGGATAAA TTTTTCTAAT CTCTTCCCCA TTTTTGAACA AGCCATGTAT GTATTGAGTT 3960
CTAAATGCTG TCCTCCACAG AGAGGAACTT CTCACCTTTG GGATTAGGTC TTGTACTGCC 4020
CTTAGAATGA TCCAACCCTC CCCACACCCG ACCCGACCCC TGCCATATTA CCAACAGAAA 4080
CTTCAGGAAC ATTGGATCCA ACTCCCTAAC CTACTTTACC AAACCTCCAT AGAAATTAAC 4140
TGGGCATGGA CTGACCAGGT GGCTCAGATC TCCACCTTGA GGTCAAACAG CTTTGCTGCC 4200
CATGCTGGTG TACCCTCATC CTCCAAGGAA GTCCCCCATG AGGGTGGGCA CACACAATCC 4260
AGCACATTCA CACCGTAAGG CTTCTACAGA TACTTCTGCC ACTTCTAAAC TCCCCAAGTG 4320
ATCCTTTACC CTCTCTTTTG ATCCTGGATT TGTAAAGATA AATGTAAAGA TAAAGTTCAA 4380
TCCTTGGGGT CCTTTTCAGA TTTTTTTTTT AAAAGAGATT AAGAGTCTTG CTCTGTTGCC 4440
CAGGCTGGAG TGCAGTGGCA CCTTCCTAGC TCACTGCAGC TTCTAATTCC CAGGCTCAAG 4500
TGATCCTCCC ACCTTGGCCT CCCAAGTAGC ATGCATCACC ATGCCTGGTT AATTTTTATT 4560
TTTTGTAGAG ATGGTTCTTG CTATGTTACT CATGCTGGTC TCAAATTCTT GGCCCCAACT 4620
GATCCTCCTG CCTTGGTCTC CCAAAGTGCT GAGATTACAG GCATGAACCA CTGTGCCTGG 4680
TCAATTTTCA GATGTAACTA CCTACAAATA GCTAAAAGTA ATAATAAGTC AGTATAGTCA 4740
GTCATCCAGG CTTGGGGGCT AAGTAAGTAC TAAATGCCAT TTACTGCTGC TAGCCGGAGA 4800
CCTTGTGTGC TGGTGGTATG AATTTTAGAT ACATTTTATT AACAATATTA TTATATGTAT 4860
AAAACACTTA GCTTTAAAAA AAAAAAAAAA GATCCTTGCT GGGTGCGGTG GCTCACGCCT 4920
GTAATCCCAG CACTTTAGGA GGCTGAGGTA GGTGGATCAC AGGATCAGGA GATTGAGACC 4980
ATCCTGGCTA ACACGGTGAA ACCCCGTCTC TACTAAAAAT ACAAAAAAAT TAGCCAGGCA 5040
TGGTGGCGGG TGCCTGTAGT CCCAGCTACT CGGGAGGCTG AGGCAGGAGA ATCGCTTGAA 5100
CCCGGGGAGG CAGAGGTTGC AGTGAGCCAA GATCGCGCCA TTGCACTCCA GCCTGGGTGA 5160
CAAGAGCAAA ACTCTGTCTC AAAAAAAAAA AAAAGTTAAA ACTTGTAGAA TGGTGGTGGT 5220
TATAAAGGTA GTAGTCAAGA TCAACAAGAT TAGTGTAAAT ACCCTAAGTG GATCACTAAT 5280
CCATCTACCC ATCAGATACC ACCCCCTCAG ATGCCAGGGA TACAAAGATG AGTAAGACAC 5340
AGTCTCTGAT CTGAGTTATG AGACAAAGTG ATGAGAAGCA AGTAGAAGCC CAGGCAGCAT 5400
GGAGGAGGTG CCACTAAATC TGCACAGAAA GACCTCACAG AAGAGGTAAC GACTGCCACA 5460
AAGTGTATAA CTGGCCTACT GTGTGAATAT CCTTCCAATA AACAAGGGTT AAATCTATTT 5520
TCCAAAGGCC CAGCCCAAGT GGGCATTTGA AAGCAAAGGA GGCTATGGAG ATGGCAAGAA 5580
CACACAAGAA GTAAATAATC TCGGCTGGGT GCGGTGGCAC ACGCCTGTAA TCCCAGCACT 5640
TTGGGAGGCC GAGGCGGGCG GATCACGAGG TCAGGAGATG GAGACCATCC TGGCTAACGG 5700
TGAAACCCCA TCTCTACTAA AAACACAAAA AATTAGCTGG GCGTGGTGGT GGGCGCCTGT 5760
GTCCCAGCTA CTTGGGAGGC TGAGGCAGGA GAATGGCGTG AACCTGGGAG GTGGAGATTG 5820
CAGTAACCCA AGATCGTGCC ACTGCACTCC AGCCAGAAGG ACAGAGTGAG ACTCTGTCTC 5880
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAGTAAAT ACATCTCCAT TCTCTTTATA CATCCTTCGT 5940
CTCCCTTCTT GGTGGTGGCA ATGTTTTCCC TCATCTCCTC CCCAAGAGGC TCTGAGTCTC 6000
TAGCTCAAGG AAAATTCTCA TACATAAAGA GACTTCTTCC TCGTATTTTG ACTTTTCAGT 6060
TAGTATGACT CATCCATCTC AGCCAAGATG GGAATTACTG TTAATGCCAC ACTGTCACGG 6120
AACGCTACAA CTGGAAGGGA CCACAGGAAT CACCCAGACA GCCCCTCTTG TTTTGCAAAT 6180
AAGGGAACAG GTCTAAAGGG TGAGATCATT TGTGCAGGGT CAGAGGTCAA AGGATTATCA 6240
AACTACTAAG GGTCTACTTT TCTAATTTTA CAACTCTTGC CAAGTTATTT GGCAGAGGGA 6300
AAAGATCTTT GCTTCACCTT AATTCTTTTT AAATTAGCAT CTCTTGCTCT TGTCTGCTGG 6360
CCTCACAGGT ACCTAACAGC TTCTATTACA CCTGGTGTTT GCATACTTCA TGGTTTACAG 6420
GAGTGTTCAT GGGTGCTATC TCATTTGAGC CTCACTACAG TAGCATGAGG GAGTTGGGCC 6480
AGGTATTGTA GTCTTTTTTT TTTTTGAGAC AGAGTCTCAC TCTGTTGCCT AGGCTGGAGT 6540
GCAGTGGCAC AATCTCAGCT CACTGCAACC TCCACCTCCT GGGTTGAAGT GATTCTCCTG 6600
CCTCAGCCTC CCGAGTAGTT GGGATTACAG GCACCTGCCA CCATGCCCAG CTAATTTTTG 6660
TATTTTTAGT AGGGATGGGG TTTTGCCATG TTGGCCAAGC TGGTCTCGAA CTCCTGACCT 6720
CAGATGATCT GCCTGCCTCA GCCTCCCAAA GTGCTGGGAT TACAGGCATG AGCCACTGCG 6780
TCCAGCCTGT AATCTTCATT TCTAGATGAA CACGTTGAGG CTTCGGGGAT TAAGCAACCT 6840
GCCCCAAATC ACATATTCAC CAAGTAGCAG AGGCAGGACT CCAGTCCAGA CCTTCTGACC 6900
TTGAGCCTGG GAAGCTTGTC CACTGCTCCT TGGTGTTCAC ACCACAACAG ACACGTTCTG 6960
GAAACCACTT TAGCCCTGTG CCTTCTCCCA AGGCAGGAAA CTAAGAGTTA AAGGTCTGCC 7020
CTCTGGACAC TCAGACTTGC CTGCCCCATA CGACTTAACA GGCAAATCAG GCCAACGTAA 7080
CTTGCCTAAA GAGAGCTTAG CATTGAAATC AGGACAACTC CCTTGCATAG GGAGAGTTTT 7140
GCATTGAAAT CAGTCTTCCC ATAAAGCCAG TAATTACCCC ATACTTTGTA TGTCTTACAG 7200
GATTTTCTTA CTATGGTCTG ACTAAACTCA TTTAGGGCAT GAAAATGGCT TTTTAAAAAT 7260
AGATACCAGG TGTACATGGT ATAAGATTTA AAAGTTGCAA AAGTAATTTC CCAGTTACCC 7320
TCCTCCAAGG CAATCACTAG TATCAGGTTT TTTTTTGTTT TCTTAGGAAG CCATTAAATA 7380
CACACAATCG CATATAAGCA TAGTATCCCA CACTCATTTA ATATATTTTG GAGATGGTTC 7440
TACATCAGGG CACAGAGTTG TAAGTTGTCC CTTTTTCTTT TTTTTCTTTT TTTCTAAGAT 7500
AGGGTCTTGT TCTGTTGCCC AGGCTGGAGT GCAGTGGCAG AATCACAGCT CACTGCAGCC 7560
TCAACCTCCT GGGCTCAAGC AATCTTCCCA CCTCAGCCTC CTGAATAGCT GAGATTACAG 7620
GCATGTGCCA CTATGCCTGG CTAATATTTT ACTTTTTTTT TTTTTTTTTT GTACAGACAG 7680
GGTCTCACTA TGTTGCCCAG GCTGGTCTCA AGCAATCCTC CGGCTTCAGC CTCCCAAGGT 7740
GCTGGGATTA CAGGCGTGAG CCACTGCACC CAGACTTTGC CTCACTATTT TTAATGACTG 7800
GACATTATTT CATTACACAG 7820