EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-20583 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr2:54796660-54801040 
SNPs
Number: 3             
IDChromosomePositionGenome Version
rs67079536chr254798844hg19
rs10181201chr254799174hg19
rs10205410chr254799599hg19
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr2:54796996-54797007CTTGAGTGCCT-6.14
Number of super-enhancer constituents: 75             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00006chr2:54795695-54808079Adipose_Nuclei
SE_00896chr2:54796769-54797896Adrenal_Gland
SE_00896chr2:54798017-54798845Adrenal_Gland
SE_00896chr2:54799791-54802361Adrenal_Gland
SE_02562chr2:54796678-54802057Astrocytes
SE_04102chr2:54796918-54798099Brain_Anterior_Caudate
SE_04102chr2:54799690-54802108Brain_Anterior_Caudate
SE_07789chr2:54796529-54798132Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_10400chr2:54794677-54803227CD19_Primary
SE_11005chr2:54790737-54825699CD20
SE_11903chr2:54795467-54804954CD3
SE_12885chr2:54798660-54800004CD34_Primary_RO01480
SE_12885chr2:54800577-54801934CD34_Primary_RO01480
SE_13387chr2:54797492-54801918CD34_Primary_RO01536
SE_14098chr2:54797046-54797912CD34_Primary_RO01549
SE_14098chr2:54798186-54800123CD34_Primary_RO01549
SE_14488chr2:54795303-54804872CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15498chr2:54795663-54803273CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15859chr2:54795710-54797849CD4_Naive_Primary_7pool
SE_15859chr2:54798421-54804026CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16386chr2:54795629-54803366CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16936chr2:54795657-54803270CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17333chr2:54793892-54821363CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17873chr2:54795021-54811216CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18341chr2:54795035-54821330CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19520chr2:54795631-54804015CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20164chr2:54795681-54809753CD56
SE_20822chr2:54795629-54803439CD8_Memory_7pool
SE_21502chr2:54795741-54803316CD8_Naive_7pool
SE_21966chr2:54795626-54804551CD8_Naive_8pool
SE_22380chr2:54795196-54811289CD8_primiary
SE_23128chr2:54796037-54797962Colon_Crypt_1
SE_23128chr2:54797995-54802474Colon_Crypt_1
SE_23914chr2:54796781-54797605Colon_Crypt_2
SE_23914chr2:54799575-54801320Colon_Crypt_2
SE_25070chr2:54795905-54797954Colon_Crypt_3
SE_25070chr2:54797970-54802593Colon_Crypt_3
SE_25877chr2:54795570-54803197Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27348chr2:54796675-54797759Esophagus
SE_27348chr2:54797982-54798877Esophagus
SE_27348chr2:54798913-54803836Esophagus
SE_27627chr2:54794756-54809409Fetal_Intestine
SE_28537chr2:54794775-54810703Fetal_Intestine_Large
SE_29772chr2:54796534-54797841Fetal_Muscle
SE_29772chr2:54797867-54801835Fetal_Muscle
SE_31160chr2:54795567-54803312Fetal_Thymus
SE_31545chr2:54796712-54798915Gastric
SE_31545chr2:54798932-54799520Gastric
SE_31545chr2:54799542-54802418Gastric
SE_32493chr2:54794685-54809919GM12878
SE_35301chr2:54797810-54803653HeLa
SE_35875chr2:54796741-54804603HMEC
SE_38000chr2:54795734-54802579HUVEC
SE_39396chr2:54795484-54802646Jurkat
SE_40773chr2:54796706-54802488Left_Ventricle
SE_42137chr2:54796708-54803360Lung
SE_43945chr2:54794597-54799592MM1S
SE_46220chr2:54795768-54803253Osteoblasts
SE_47832chr2:54799847-54801132Pancreas
SE_49907chr2:54795402-54803294RPMI-8402
SE_50115chr2:54795848-54803359Sigmoid_Colon
SE_52386chr2:54795955-54803388Small_Intestine
SE_53342chr2:54795939-54803322Spleen
SE_55277chr2:54796750-54798969Thymus
SE_55277chr2:54799481-54802818Thymus
SE_56813chr2:54796632-54797886VACO_400
SE_56813chr2:54798007-54799425VACO_400
SE_56813chr2:54799680-54801306VACO_400
SE_57612chr2:54799687-54800303VACO_503
SE_60008chr2:54784446-54818579Ly4
SE_61167chr2:54784367-54847020HBL1
SE_61474chr2:54749764-54818736Toledo
SE_62304chr2:54783676-54846716Tonsil
SE_64270chr2:54795687-54804439NHEK
SE_66257chr2:54795484-54802646Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr25479692454797237
chr25479924154799892
chr25480004554800558
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH02I054566chr25479411254810964
Enhancer Sequence
TAGAAGTGTT AATATAGACG AGTTTTGTCT TGGCTTTTTA TTTTTTACTT AACATCATCT 60
TAAGCTTTTC ATATGTGGTT ATTTCTGTGC CTCTTACCAA ATATTGGCAA TTCACTTTCC 120
AAATCAGACA ATTACTTACC AGTCTGAGAG CCTGCTTCTC ATCTATGGGA TGAAGGTCAT 180
ACAAATTCTG TGTAATGAGA TTGTTGTAAG AATTAGGTGA GATTCTGTGT GGAAACTGTG 240
TTTGGCACAG TCCCTGGTAC ATAATAAGGG CTCATAGGAT TATTACAGAT CCTAGTTAAA 300
TGGCAAGGCA GGGCCCAGCA GGGTGAGCCT TGTAAACTTG AGTGCCTCAA CTCCCACCCC 360
CACCCCCAAA CCTGTTCTGG GTGTGGTTTC CTTTAGCATG TTGGGAGAGT GTTTAGTTTG 420
CCTGAAAATG CACCCAACTG AAACCATTCC CCCCCCCCTT TAGAAAGATT AGAAGGTTCA 480
GTCACTTGGG CCTGGTGACT TTTGATGTAG TTTGAAGGTC ACAATGCTGG TTCCTCTCTC 540
AAGTTCATAA AAGCCTCTGG AGCAGCTATT GCTGCAGCCA GCGAGCATCC AGCACTTGGT 600
CAGAGAGCCG CCTTTGTCAG AGAGCGCTCC TGTAGCCAGA CTCATATTAA CTGCCCCCCA 660
TGGGTGTGTT GAATGCCTCT ACTGTGTTTG CCTTTGAAAG GCCCTTCTTA GCCTTTCTCT 720
CTCCCCCAAC CCCATTTTCA AGAGGCACAA GACCTTTAAG TAGCAAATAC AGTAATCACA 780
GTAGCATGGA GACACAGGCT GGCCTATATT TGGTTTCACA AAGGCCTTGT GAAAGATCTG 840
GCCTTAAAGT CCCTTTTTAA TGCTGAAATT ATGCAAGTGG AAAGTTAATT TGAGGATCAC 900
TGAGGCACGC TTTATTCATG AAGAATGTGA GCAAAACATA AATACAAAGT CTGGAGGCTC 960
TGTTCTACGC TGGTGGCAAG GAAATTACAT AGGTGGTATC TTTATTTGGC TGAATCCCCC 1020
TCCCTCCACC AAGAGTGCAA CTGTGATAGA ATTTTGGAGT GAGAGCTATT GTTTTAAGCA 1080
CTGACTGGTT GCAGGTGTGT GTGTGCATGT TGCCTGAAAC TCTCTACAAA CCATAGACAT 1140
GATTTTGGTG GAATTGGCGT GCCAACAGTG GTTACAGCTA AGATTGTAGA AGACCAAACA 1200
TTCTGTTGGA ATGTGACCTT AACATTTTGA ATTATGTTTC TTAAGTAAGA TAAATTTCGA 1260
AGGTCTATTT TATTTTTATC TTTATTCTTT GAAGGCCTGC TTTAAAGTTT ACCGTGTCTT 1320
TGAAAGTCTA GTCTGTTGAA CTCTTAAATC CCAGTGAGTT CCTATAGATT GCTAGCTTGA 1380
GTGTATAGTA TTTGAGATGT GAATAAAGTC TAGTGCAAAG TGTGTTTCTT GTGCTTGAAA 1440
ATGGTGCCCT GATTTCTGTT GAGGGAGACG TTTATTCCTA TAAAGGTTTA AACGACTTGC 1500
TGTACAATTC AGTCTTGCAA TGACAGAGAG ATTACACACT ATCTGCAAAC AACTGCCAAG 1560
CAGATGAAAT CCTGGCTGTG GGAAGTCTGC GGTGAAGAGT GGTGGGGGTG GTCAGGAGAG 1620
CAGTGGAAGG GAAGTGGCTC AGAACATTGT AGTGGTGGTT TGGCGTGCCT GTCAAGGGCT 1680
GTGGGACGTT TTCTCTCTCA TTTCAGAAAC AAGGGTGGTG GGAAACACAT GGGCCGTGGA 1740
TTTGCATAAA CCAACAGTCA AATCCTAGCT CTACCAGTGA CTTCACTGAG CCTCATTTTC 1800
TTCAGGGGGA AAGAATAAAT AGCCCTTGGG GTGATTGTAA AGCCTAATTA GGTATGTTAT 1860
AATTGTATTA AGAGGATGAC GAGTTCACCG TTTGCCAGGG AGTTTTCCGG TTTTAGTGCC 1920
AAACATTCCA CATCCGGGGA ATCTTCCTCA GTCCCAGGCA CACTGGGTGG TGAGTCCCCC 1980
AGTTATATAT GAAGATACCT ATTACTGTTC CCTAATTGTA TGTACACACA CACACACACA 2040
CACACACACA CATACACACA CACACACACA CACACACATA TCTATAAATA AAGGGCTTCT 2100
GGAAGCTGGC TGCCTATTAC TGTGTACCTG ATACTCAGTG GGTATTTGTG AACTCCCAGG 2160
AGGATAGTGT GTTAGTGTGT TTGCGTGTAT CTCTGTATTC CTTCTTAGGG ATGGCATACA 2220
AATAAATGTT TCATGAATAA AGGGATGAAT GAGTAGGTAA AGTAATATAA GCAGTAATGC 2280
ATATGTTTTA AAGTGATTTA GCTGGTTTTC CTTCCAGGGG CCTCTTCCCT GAGAAAAGAG 2340
CCACTTAATA AATGATGTCT TGAATGAAAG AATACATCAT GAAAATAATT TTGTCCATGA 2400
TGTGGCTAAA CTAAAACTCC AGGAAGGGCT TAGGCTGGGC CTATCTACTT TTTTTGATAA 2460
AATGAAGTTT AATATGACCC TAGTGACAAC CTCCCCTCAT CCCCTTAAAG CTCAAATTTA 2520
GGGAACTCTT GTGGTTGGAC TCTCACATAC TCCCTAGGAC TCTGCTGGGT GCTGGGGAAT 2580
TTACTAAACT TTGGTGAGGA GAAGAGGAGA GGAGAGGGAA GCCACGGTAC TAAGGTACTT 2640
AGGGAGACAG AAACAGTTCC CCTAGAAATT AGACATCACA TTGTCTTTTT CCCCCCTTTC 2700
TTTTGAATGA GATGGGGCAA GAATATTTGG ACCAGGATAA AGTTTTAAGA TGCATTTACA 2760
CTAATGTAAT CAGGTTACAT AGCAAAAAAA TGTTAAAAAT GTACCCTGGG AAATTGAAAT 2820
CTATCCATTC TTCTAGGTGT GGCAGCTTAT TCAGATTTTT ATGTTGTGTG ACCATAAAAC 2880
GAACACAGCT TTTCTAACCG CGAGTGTCTT TGTTTACAGA GATAACAGTG TGAGTAATGC 2940
TTTGCTAGAA GCCAGGCAGT TAAATCACAC TCTGAGCAAA TAGAGGCTGG GCTTCAGAAA 3000
CTTAGATAGC ACACGAATGT GCAAACTTGG TCTTTTAAAC TGAAGACATA TCTGAAAGAA 3060
AACTGCTTTT GGCCCATGAA CTACTTTCCC AGCCCTTTGT GCCTCCCAAT CTCTGCCCCC 3120
CTTTACAAAA AATCTTTGTT TTTCCTCTAC AAATATACAT ATATGATTTC AATTTGGAGG 3180
TGGGATGTTA TTTTTTTCAC TTGAAACACA AGGAAGCAAT TTTTAAAAGT CATACTCGTT 3240
CAGCAGTGGG CTTGACTGTA GCCAGTTTGA CTAGGAGTTC TTGGCTACAG AACCATACAC 3300
TTGCAGTCTT TATCAGGGTA GTAAATTCAG ATGGGTTTTT GGAAAGGGAG AGGGCTGGAG 3360
TTGAGGGAAG GGCACTAGAG CAGTGTGACC CACGGCCCAG GAGCAGTGTG AGTGGGAAGG 3420
GGCTCTAGAA GCTGACTGCC TTTGTGTTTG CCACAGCGTG CTGGGAATCA GATGAGAAGG 3480
CGGGCCCAGA CCCCACCAGA TACTCATCTC AGCCATTGTT GTCATTAAAT GACTCTGAAA 3540
TGACCTTTCT TACCTCAGTT TCCTGTGAGC TCATAGTTGT CTGCAGATGT GAATTATGTC 3600
ATTGATCTTT GCTCCCTCTT TGCTTATAAG GAGTAGCTGT TCTGCTCCAT GTTTCTGGAA 3660
GAGGAAAGTG ATGCACAGGT CACTTAGTAA AGCGGTCCCC AGCCTTTTTG GCACCAGGGA 3720
CTGGTTTTGT AGAAGACAAT TTTTCCACAG ATAGGGTGGA GGAAATGGGG AGTTGGTTTC 3780
GTGATGAAAC TCTTCCACCT CAGATCATCA GGCATTAGAT TCTTATTAAG GAGTGGTAAC 3840
CTAGATCCTT TGCATGCACA GTTCATGATA GGGTTTGGCT CCTGTGAGAA TGCTGCTGCT 3900
GATCTGACAG GAGGCAGAGC TCAGGCAGTA ATGCTTCCCA TCCACCACTC ACCTCCTGCT 3960
GTGTGGCCGG TTCCTAATAG GTCACGGGCC AGGACCAATA CCGGTCTGTG ACCTGGGGGT 4020
TGGGGACCCC TGACTCGGTG ATTCAGCAGT TGATTTGGGA TCCTCTGTCT TTGTTCCTCC 4080
TCCCTCAGCG GGAATTCACA GTGTAACTCA TTTGCTAAGG TTTTCTGCGT TAGAAACAGA 4140
ACTCCTTTTG GACTACTAGG AGACATGGTC ATTAGAATAA TTATGATTCT TAGTATGACT 4200
CAACCCCTTT TTAATATTCA GCCTTATGGA GGGCCTCTGC CTGCGGCTCT TTGCTCAGGC 4260
ACTAGGGCCA CAGGGGTGTA ATTTCTATCT CTGCCCTCAG GAAGCTCACA AACAAGTCAA 4320
GAGACAGGAA AACGGATCCT GTTTTTCTAA TGGGATTTGA ATGGATGTAT TTATGGGAGG 4380