EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

Tag

Content

EnhancerAtlas ID

HS094-19430

Organism

Homo sapiens

Tissue/cell

hMADS-3

Coordinate

chr19:46880550-46882750

Target genes

Number: 11
Name	Ensembl ID

PPP5C	ENSG00000011485
CCDC8	ENSG00000169515
PTGIR	ENSG00000160013
DACT3	ENSG00000197380
AC093503.1	ENSG00000243560
Y	ENSG00000222614
FKRP	ENSG00000181027
STRN4	ENSG00000090372
SLC1A5	ENSG00000105281
ARHGAP35	ENSG00000160007
snoU13	ENSG00000252071

TF binding sites/motifs

Number: 4

JASPAR ID

Coordinate

Motif Sequence

Strand

-Log10(p-value)

MEF2A	MA0052.3	chr19:46881627-46881639	GCTATTTTTAGA	-	6.52
MEF2B	MA0660.1	chr19:46881627-46881639	GCTATTTTTAGA	-	6.22
MEF2C	MA0497.1	chr19:46881626-46881641	GGCTATTTTTAGATC	-	6.76
Nr2f6(var.2)	MA0728.1	chr19:46882529-46882544	CGATCTCTTGACCTC	-	6

GeneHancer

Number: 1
ID	Chromosome	Start	End

GH19I046376

chr19

46880248

46883166

Enhancer Sequence

GCTTCACCTC TCTGTGCCTT GATTTCCTCC TCTGTGCAGT GGAGATAATC ATACTGTCTC 60
CACCAAGGGC TGTTGTAAGG AGTAACTGCG TGTAATCCAC ATCAGTGCTT CGAATAGTGC 120
CTAGCACATG GTTAGTGCTC TGTATGGGTT AGCTGTTGAT CATGTTGTTA AAGGTGAGAC 180
AGGAGGAGGA ATGTCCACAT TCCTGGTTGT TTTTAATTGA AGTATAATTA ATGCACAATA 240
AAATACACAA ATCTGAAGTG TCCTGTTAGA TGAGTTTTTA GAGTTTTATG TGCCCACTGC 300
CCAAACAAGT TACAGAACAT TTCCATCAAC CAGAAAGCTC CCTTTGACCC CTTTCTAGTC 360
AGCCCTCACT CCCATCCCAG GGGCAACCAC TGATCTGATT TTTCACCACT GTAAATTAAT 420
TCTGCCTGGT TTTGAATTTC ATTTCAATGT CATATGGGCT TACAGCGTTT AGTGTCTCTT 480
CTTTCATGTG GCACAATGTG TGTGGGATTC ATACATGGAT GTTGTGTATA TCGGTAGCTC 540
AAGTCCTCCA TTGTCTGAAC AGCCCATGAC TTGTTTATGC AGTCTTCTTT TGAGAGACAT 600
TTGGGTTATT TCTACTTTGT AGCTTTTATA AGTATAAGCT GCTATGAACT TCTTGGACAA 660
GTCTTTTTGT GAACATGTTT TCATTGTTCA TGTTGAATTT CTCTATTGAT TGTCTTTTGT 720
TTCATTGATT TTTCATTCAT TATTCTCTAT GCATGCTTGA GGTTTAATTT GCTTTCTTCT 780
GGCTTCTGAA GATGGACATT AATGCTGTTA ATTTTACATC TTTTCTTCCA CACAAAGCAT 840
TTAAAACTAA ATTTCCTTCC AGGCAGTAAG TTAGCTGCGT CCCGTGAATT TTAATACGTC 900
GTATTTTCAT TATCATTGAG TTAGAATTGT TTTCTAATTT TCTTTATGGT TTCTGATTTT 960
ATCCATAGAT TATTGAGAAG GGTATTGTTT AACTCCCAAA TATTTGGGGA CTTCTAGATG 1020
TTACTGTTAC TGATTTCTAA TTTGGTCAGA CAACACACTC TGGATGATTC CATTGGGGCT 1080
ATTTTTAGAT CTGTCTTGGC AAACATGCAG TATGTACTGG AAAATAGTGT GTATTTTGCA 1140
GTCGTTAGTC ATAGGGCTCT ATAAATGTCA ATTAGTTCAA GATGGTTGAG ACTGCTGTTA 1200
AAAATCTTTT ATAGCCTATT TTTTCTAATT GCTCAATCAT TTATTGAGGG GGCTGTTAAA 1260
AGCTCCGACT ATACTTGTAG ATTTGCCTAT TTCTCCCTAT AATTCTCAGT TTTTTGCTTC 1320
CTGTATTTTG AAATTTTTAT TAGGCACACA TTTAGGATTG TTATGCTTTC TTGATGAATT 1380
GACTCATTAT AATGAAGTGA CTTCAGTACT TTTTGGCTTG AAATCCCTGT TTTCTATTAA 1440
AATAGTTAAA CCAGATTTTT ACAGTTAATA TTTGCATGCT ATAACTTTTC TACCCTTTTG 1500
TATTTAACCC ATTGGTATCT TTATATTTAA AATGTTTTTC TTATAAACAG CATATACTTG 1560
GGTCTTGCCT TTTTATCCAG TTGGACAATC TTTACCTTTT TTTTTTTGAG GTGGAATTTC 1620
GCTCTTGTTG CCCAGGTTGG AGTGCAATGG TGTGATCTTG GCTCACTGCA ACTTCTGCCT 1680
CCTGGATTCA AGCAATTCTC CTGCCTCAGC CTCCAGAGTA GCTAGGATTA CAGGCACACG 1740
CCACTATACC CAACTAATTT TTGTTTCGTT TTGTTTTTTG AGACGGAGTC TCATTCTGTC 1800
ACCAGGGTAG AGTGCAGTGG CGCAATCTCA GCTCACTGCA ACCTCTGTGT CCCAGATTCA 1860
AGTGATTCTC CTGCCTCAGC CTCCCGAGTA GCTGGGACTA CAGGTGTGCA CCACCATGCC 1920
CAGCTAACTT CTGTATTTTT AGTAGAGATG GGATTGTACC ATGTTGGCCA GGATGGCCTC 1980
GATCTCTTGA CCTCGTGATC CACCTGCCTC AGCCTCCCAA AGTGCTGGAA TTACAGGCAT 2040
GAGCCACCAT GCCTGGCCTG ATTTTTGTAT TTTTAATAGA GACAGTGTTT CACCATGTTG 2100
GTCAAGTTGG TCTCAAACTC CTGACCTCAG ATAATCCACC CACCTCGGCC TCCTAAAGTG 2160
CTGGAATTAC AGGTGTCAGC CACCATTCCC AGCCAATCTT 2200