EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-11409 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr13:52216850-52220400 
Target genes
Number: 8             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr13:52217913-52217934TTTCCCTTTCTTTTTTCTTTT+6.03
IRF1MA0050.2chr13:52217907-52217928CTTTAATTTCCCTTTCTTTTT+6.15
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr13:52217032-52217047CGATCTCTTGACCTC-6
ONECUT1MA0679.1chr13:52218060-52218074ATTATTGATTATTC-6.08
ONECUT2MA0756.1chr13:52218060-52218074ATTATTGATTATTC-6.23
ONECUT3MA0757.1chr13:52218060-52218074ATTATTGATTATTC-6.63
RFX5MA0510.2chr13:52219526-52219542CATTGCTATGGTAACT+6.1
Number of super-enhancer constituents: 13             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03707chr13:52219761-52220743Brain_Angular_Gyrus
SE_04573chr13:52218442-52221125Brain_Anterior_Caudate
SE_05480chr13:52217329-52218766Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05480chr13:52218818-52220923Brain_Cingulate_Gyrus
SE_07504chr13:52218480-52221040Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08575chr13:52217596-52221358Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09352chr13:52216795-52223169CD14
SE_35418chr13:52217279-52220378HepG2
SE_37711chr13:52216329-52221251HSMMtube
SE_46288chr13:52216660-52221180Osteoblasts
SE_52202chr13:52216784-52220636Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_64009chr13:52216784-52220819HSMM
SE_64888chr13:52216731-52220999NHEK
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH13I051642chr135221644452221431
Enhancer Sequence
TCTGTCGCCA GGCTGAAGTG CAGTGGTGCA ATCTCACCTC ACTGCAACCT CCACCTCCCA 60
GGTTCAAGTG ATTCTCCTGC CTCAGCCTAC CGAGTAGCTG GGACTACAAG TGCACACCAC 120
CATACCCAGC TAATTTTTGT ATTTTTAGAG ATGGGGTTTC ACCATGTTGG CCAGGATGGT 180
CTCGATCTCT TGACCTCGTG ATCCGCTCAC CTTGGCCTCC CAAAGTGCTG GGATTACAGG 240
CGTGAGGCAC TGCGCCCAGC CATGTGGCCA TGTGTCTTTA ATTGCTGCAC CTTTGGCAAC 300
TCTATGAAGA CTACAGTTGT GGAGAGAGAG AATCATTCTG CTATTTTCCT TTTTTTTAAA 360
TTGTAAAATA TATATAACAT AAAGTGTATC ATTTTAACTA TTTGTAAGTG TTCAATTCAT 420
TGTCATTAGG TATAGTCACA GTCTTGTGCA ACCATCACCA CTGTCCATTT CCAGAATTTT 480
TTCATCATCC CAAGCGGAAA TTCTGTATCC ATTACACAAT CACTCCTTGT TCCCCTTCCC 540
CCAGGATCTG CTGCATTTTT AAGATGACTA TCCTGGAAGA CAACAGTTAA TCCATCTCAG 600
ATTCAGAACA GTAGCAGCCA GGGGCATCCT CTGAATCACT GCTCTTTCCA TTTACTGTTT 660
CATTGTTTCT ACTGAGCATT TTTCACATGC CTGCCACTGT AACTGGCTGG AGGAATATGG 720
TGGTGAGTAG GATGACACAG ACCATGCCCT CCCACTGTGT ATAGAGCCAA GAACAATATT 780
TAAATCTATA TTATTCCTCT AATGATATCA TCCCGATTTC TCCTACAGGG TGGTATTGAT 840
GAACACTCTC ATATTGTTGA ATTGCTTAGG CTGCCAGTTC AAGGGTGGTA CTCATGTTTC 900
TCTTGCCTGT GAGGGACTCT GGCTGTGTTG CAGATGGCAT GGCTGATGCT AATAACTAGG 960
GCCCTGTCCA GCCTCCATGA TCTTCTGGTG CATTGCTGTT CCTGCTACTT CCTTGTGGGT 1020
TCTTCCTCAC CACTGCTTGG ACAATATTCG TTTTTCTCTT TAATTTCCCT TTCTTTTTTC 1080
TTTTTTTCCC TGTATTTATA TGACCTTTTA AAAGCACTTC CTGTATGCTA AATACTGTAT 1140
GTGATAAAAA TGAAAGTATT GTAGGTACTC TAAAAAAACA AAAATGTTTG AATCTTTATT 1200
CAAATAAGGA ATTATTGATT ATTCAGGGAA TTTCTTGTGT CATAGGAAGA AGGACTTGCT 1260
AACTAACATT GATTAATGTG ATGTGTCCTA ACATAGGCCT GTGCAAGGTA CAGTGGGATT 1320
CTGGAGCTTA GTTTTGCCTG AGGAATTGCC AAGGCTTCAT AGGGAAAGTG GATATGTGTG 1380
TATCTCTGGG GAGAGACAGA GGGAGTCAGG GAAGTATAAA ACCCACAACT ATGCAAGGAC 1440
AGGAAGCAGT GCTTAAGCAT TAGTCAGTAA GAGTTAAATT ACTAAAAAAA CAAAAGCCAA 1500
GTCTGCAATA CAAGGGCACT ATCTGCAGAC ACAAAATAGT GCTATTTGTA AGAAAACTAC 1560
TCCGAATTAA GACCTTGTGG CTCATCTTTT CCTTCCCCCT CTCGAGGGTC TTACTACTGA 1620
CTGCTTAAGA CAACCATTTC CAGGTATATT GTTTGTAATT CTCACCTGGT ATATGGGTCC 1680
AATTAACCTC ATGTTGAGAC TTCATTTTAT AGATTTTAAA AACACTGAAA ATGTTGTCAC 1740
TTGACTGTAA TTTTAAAAAT TCTAAATTGT GAAGGCTTTC ACAGCCTTTG GATTAAGAGA 1800
AATGACCCAA CTGATAAAAA CTCCAAGGGG AGATGGCTGG AATAAATAAT ACACCTTGCT 1860
GATGCAAATA ACTGCAAATA ACTGGAATGG CGGTGAGTGT TTTGAAAGCA AGAGTGCCAT 1920
TAAAAGCCCA AGGTGTTGAA ATATAAAATA GCCATACCTC TTCTCTAGCC ACTGATTGCT 1980
GAGTTGCTAC AGCTGTGAGG AAAAAAAAAG TCCAGGTGTA TGATTCAGCA AAGTTATTTG 2040
GGTCTGTTGT ACCAAGGTCA TTAATGTGAG AACTGAGCTC CTTGGCAAGA GGGGACCAGA 2100
GGCTGGACAA TACTGGACAA CACCCAGCTT GAGTCTCTGA GTCTTGAAAC CGCTGGCCAC 2160
CTCAATTCAC TTGCAGTTTC CACACAGTAG CATCTGTCTA TCATGGAGAA ACCCTGGAAA 2220
CAAAAGATAC ACAGTGCATT GTAGAAGATT GGGTTTAGGT TATTTACTAT ATGTGGTTGG 2280
AATGCATTTG CTGGGAACCT CTCAGTTTGT TTTTATTACA AGTAATTAAA GAAATCTGAT 2340
AATCATAGAG AAATCAACTT TTAAAAAATC AGCTATGTTT TCTAAGAATC TCTGCAACAT 2400
TTTCTGCGTT TGAAGCTTTT TTTTTTCTTT TTTTTCTCTT TAAACAAATG ACTATGAAAA 2460
CTACATCCTG TTGCTCAAAG TTTTTCTATT AGTTTGCAGA TCGCTAGGGG CTGCCTTCCT 2520
TCTGTTTGTA TTGCTGTTGC AGGGTGTGAT CTGTAGAAAA GTATTCCCTG GAAATTCAGG 2580
GCCTTCAAAA CCCAGTGGGC TTCACTTCTC CCAGCCCCTA CCCCAAGTTA CTTCAGTTGT 2640
GGCAAAAATA ACAATTGTCC CCTGGGAAAT GAAGCTCATT GCTATGGTAA CTAATGAAGG 2700
TTGCATCATT CTAGGGCACA TTTTTAAAAG CCTGATTTCA ACATGGGTAG ACGCCCCGTC 2760
TTATTTTATT CAGTAGCTTA GCAACCTGTG GTATACTGTT TGTTGCCACC CCCAGCCTTC 2820
CCTTTTCTCT CAGAAAAATG ACCTATATAG ATAGTGTTTT ATTGTAGGCA CGTTTCCACT 2880
GTGAATATAG TTCAGCTCTT AGGTGTGCTT ATGATGACCT TATTTTCTGG ACCAAAATTC 2940
AGGACATATT TTGTGTCTGT AAAGTAAAGA AGGATTATTC TTCTGCCTCT CTGCTGGCTT 3000
GTGCTAAGGT CTTTGCAGAT GTTTTTCTCT TGACCACCCC TTAACTCTTG GTGTTTGTCT 3060
TTGTTGTTGG CCTTCTTTTC TTATTCTCTG GTAACTACTC CTTATATGCT GATGTCTCCC 3120
AAATCTTAAT TTTCAGCCCA GGTCTTACCC CTGAACTTCA TGTAGACAGT TTTCTCTGCA 3180
ACAGCCCTAA CTGGATTTTC CCTGCACTCA GGGTGTTCAA GATGAACTCA ACATTGCCTT 3240
CCACAAAAAT CACTTACTGA TGAATGACAC CACCATTCAT ATGACACCCT ACATCCAGCC 3300
AGCCCCCAAG TCCTGATGCT TCTACTTCCT GACTGCTCTA AAATCTGTCC TCTCTCTTCT 3360
AGGCCTTCAT CCTTTTTTAC TTGGTTTGCT GCCTACATCC TCCAAACTGG TTACTTCAGG 3420
GTAACCCCGC CTTTTCCAGG CTGCCCCCAA ACAAACAAGA ACAAGCGTGG TTTTGTGACC 3480
AGCTCCTCAT CCTCAGCATC GGTGGCCTTC TGCCTGTTCT TTGTCCAGGC TGGATTCTCA 3540
CGACTCCTGC 3550