EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-09965 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr12:89736220-89741600 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr12:89740527-89740548AAAAAGAAAGAGAAAAGAAAT-6.07
IRF1MA0050.2chr12:89740521-89740542AGAAAGAAAAAGAAAGAGAAA-6.27
MecomMA0029.1chr12:89737331-89737345AACATAAGATAAAA+6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr12:89736519-89736534CGATCTCTTGACCTC-6
RFX5MA0510.2chr12:89739671-89739687GGTTGCCCTAGTAACC+6.25
SPICMA0687.1chr12:89740280-89740294TACTTCCCCTTTGT-6.47
SPICMA0687.1chr12:89741405-89741419TACTTCCTCTTTGG-6.51
Stat6MA0520.1chr12:89738048-89738063TATTCTCAGGAAATC-6
Number of super-enhancer constituents: 22             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00690chr12:89736686-89749897Adipose_Nuclei
SE_25495chr12:89737202-89749426DND41
SE_26301chr12:89738766-89749678Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27644chr12:89739368-89741580Fetal_Intestine
SE_28566chr12:89739453-89741345Fetal_Intestine_Large
SE_30143chr12:89738982-89742175Fetal_Muscle
SE_31980chr12:89739391-89740790Gastric
SE_34489chr12:89739228-89741819HCT-116
SE_35929chr12:89740392-89750597HMEC
SE_38477chr12:89738992-89749161HUVEC
SE_41177chr12:89739166-89741735Left_Ventricle
SE_42423chr12:89739274-89741688Lung
SE_43823chr12:89737701-89749582MM1S
SE_45220chr12:89740269-89741084NHLF
SE_48925chr12:89739317-89741128Right_Atrium
SE_50215chr12:89739271-89741701Sigmoid_Colon
SE_52692chr12:89739104-89741673Small_Intestine
SE_53425chr12:89738103-89741838Spleen
SE_57109chr12:89739987-89741122VACO_400
SE_67349chr12:89737701-89749582MM1S
SE_67873chr12:89740020-89749518u87
SE_68915chr12:89739205-89740987H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr128973919489741546
chr128974008489740418
chr128974042789740813
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH12I089344chr128973783389738159
Enhancer Sequence
ATATAATGTT TTCTCTGACA AAATAAAAAA ATTAATATTC TTTTATAAAA ACTGTTTTAT 60
TTTATGGGTC AATCTAAAAA TTTTTTTGTT TCTTTGTTTG AGCTGGAGTC TCGCTCTGTC 120
ACCAGGCTGG AGTGCAGTGG CATGATCTCG GCTCACTGCA ACCTCTGCCT CCCGGGTTCA 180
AGCGATTCTC CTGCCTTAGC CTCCGGAGTA GCTGGGACTA CAGGCGTGCG CCACCACGCC 240
CAGCTAATTT TTGTATTTTT AGTAGAGACA GGGTTTCACC ATGTGGGCCA GGATGGTCTC 300
GATCTCTTGA CCTCGTGATC CACCCGCCTC AGCCTCCCAA AATGCTGGAA ATACAGGCGT 360
AAGCCACCGC ACCCGGCCTT TAAAGAGTGT TTTGACGGCA TTACTCTACT GTTAACGTTA 420
GAAACAGATG AAAAAAATAG GAATAAAGGA ACAATTATAG CAGTTGTTGA ATGTTTTCAA 480
GATTGAACCA AGAAATTAGT ATGGCTAAAC ACTTTCATAT CTATCTCCGT GGGTACTCAC 540
TATTACTCTC ACAGTCCCAC ATTGAAACAA CATTCACGCA ACCAAGATGT GGCACATTGT 600
ACTTTCCAAG AACAACTGCA ACAATATTTT CCATCTCTTG TGCTTTTTCA GAATTTTTCC 660
TCTCCTCCAT TAAAAGATGG ATTTTTACGT TCTTTCTCCT TAAACTTTGT ATGCAGCAGA 720
AGTGACCTCT GAGCAGGTCA TAAAAATCAA CATAGTTTCC ACCAGCCTCT CTCTCTCTCT 780
CTCTCTCTGG GGATTTCACC CATGGAACCC AGCCACCATA CTATGTGGAA ATTTAGGCCA 840
CATGGAGAAC CAAAGTCCCC AGCCCCGGCC CCTGGCAGAG GTCCCAGTGG GCAGCCAAAG 900
CCAAAACCAA CTCACCAGCA AAGTGAGTGA ACTATCTTAG AAATGAATCC TCTGGCCAGC 960
AGTTGAGCTG CCCCTGACAA AACTGCGCTG ATCAGAGGCC AGCCTCCCCT GCTGAGCCCT 1020
GACCAAATGC AGACTTAGGA ACAAAATAAA TGACTGTTAT TTGAAGCCAC TAAGTTTTGG 1080
GGCGCTTTGT AATGTAGCAA TAAATAAATG GAACATAAGA TAAAAGGGTA TTCCTGCTAC 1140
AATTTTTCAG AGAGCCAGGT ACACCCGAAG ATCCCCTGCT GCTCCTTCCG CTCTTTCTTT 1200
CCTCCTTCTG TTCGTGTTTG CAGTAGGAAT TAAACTGGAC CCAATGAAAA ATACTTAACG 1260
TGATAAATAC TTAGATTTTC CCCAAAAGTA GGAAACAGAA TTCTTTAGAA TTAGCAACCT 1320
TTTCCAGACT TGCTTCGTGC TTTCTCGGAT GTCATTATCA AAAAGTGAAT GATATTTCCT 1380
CACTTTTCCT TTGAGTGTCT GAGAGTTCAT GTTTGACGGT ATGGTGGTTT AACATGTTTT 1440
TATTACATCA GTGATGGCTA ATAGATATGC ACGCCTTCTC TAGTGGTGTT TTCCATGACA 1500
AAGTAAGAAA GTGAGTGGGT CAAATTGCAT ACATGTGGGC CATTAATCCT TTCCTATATA 1560
AAAAAATAAA ATGTGGGATC TAAAATGTTA GTTGGAAGCA GATAGGGAAA TACAAGACCT 1620
TGCCCGGTAG TTTCTTCAGG GCTCCTCTTT GATTTGGGCA CTTTAGCGGT TCCATCTAGA 1680
AACGGGTCAT TGCCTTCAGC CTCTGAGGGC TCCTGGGAGG TCTTTCGTTG CCTTTTATTT 1740
TTAACTTGTT TCATCGAACC AGTGCAATGC ACACCAAGGC CTGGATAAAT ATTTGTGAGT 1800
TGTTTGAACT TTGTTCTGTG CCCTTCAATA TTCTCAGGAA ATCGATTTTG GACTTTAAAG 1860
AAGTTTGAAA ATTCGTTCAC CATAACTGGA CTGATTCAGG GCCAATTGCT AAGTGAGCAG 1920
TGAGAACACG GGAGGAACAA GGGTATTTGA AAGTCTTGCA GGATCTTTCC GAAAACGATT 1980
ATGGCTGTGT GAGGAACTGC ATATAAATTT ACACCCAAAG TAATCCTTCT GAAGCAGCTG 2040
AAAGTCTGAA GACTGACTTT TTTTAAGAGG ACATTTCAAG GATATTTTCT TACAGCCAGC 2100
TACCACATGA TCTGCCCTGG CTGTATCCTA AAAACCCCCA TCTCCATTAT TTGCTAATTT 2160
GCTGGTCAGT TTACCTCTCT TCTTCTGTAG ACCTGCACCA TATATATGTC TTCTGCCTCT 2220
CCTCCTTGCT TCTTCACACC CTTCCCCTTT CCCCTGACCC ACCTCCCTCT CCCAGTTTGC 2280
CTCTAGGAGG GATAAGAGTG AGGAAGTGAA CTTCTTTGGG GCCAGTTTAG TTGTGTCATC 2340
CTGAAAGGGG AGTATGGGCA AGGGTCAGGG TCAGGCCCTA TGCTAGCTGG TAGCCATTTT 2400
AGAGATACTT AGGAAAAGTA GTTTTATAAT TTAAGTGCCA ATGGGACCAA GGAAGAGCAA 2460
CTTCTCTGCG GAGAAGGAGG ATGGAAGTTT ACCCCCGGTG GACACCTCTC TGACAGCACA 2520
CCAGCTGGGG CCTCCCATGT GGCTGTGGAA TTCACATGGA ATTTGGCTAG TCATTTAACC 2580
TCTGCTTCCT CCACTTCCTC AGCTGTATAA TGGGGACAGC ATTTCCTAGC CGACATCATG 2640
AGACTTTATA AAGGGGAGCA AATACTGATG ACAAGCAGTT TCCAACAGGA AGAGCCAAAG 2700
GCTCAAGGTT CAGTTCTGCA GTAACAAGCA CTGGATATGC AAACCTTCTC TAACATTATG 2760
TGTCAGGTGT CCCATAAAGG TGGCTTTAGG CTTTATTGGC CTTTCTCTGC CTCAGTTTCC 2820
TCTTTGCAAA ATAAAGATAA TAATAGGACC TATCTCACAG AGCTGTTTTG AAGATTAAAT 2880
GAGATACAAA GTATAGTATC TGGTACTCAT GATAAATGTT AGTTATTTGT TTCACCTGCT 2940
CCGCACCTCA TTTTATCATG TAATAAGTGT CACCAATCCA TGAACAGAAG CTGGAATTAT 3000
GAGAGAATCC TAGAATGGGA GGTAAAAACT CCCTCATTTT TACAGACAAG AAAAAAGAAA 3060
TGCGGTAAGA TTGGGTGCCC TGCCCAGGGC TACCTGATTC ATTAGCAAGA AAGCAGCAGC 3120
TACAGTTCAG GTCTCCTAAT TGTCAAGGTT GGTGCAAGTC TCAGTTTTCA TTCCTTTGAA 3180
GACTGTGTTG GTATTTTTAT CCCCAGATAA CCCTTTTTCA TTCCTATTTT AACGCTAAGA 3240
CCAGTTCATA CTATTAACCA CTGCAATCTC TGTCTCCTGC AGCTCCCAGG AAACCTGCTG 3300
ATAACCTCCC CTTCCCAAAA GCCATACCCC ACCCTACCCC CCTGCCCCTG CAAAAGGCCA 3360
GGAAAGGTAG CGCTTTCTCA GAGACCTGAG GAAGCTACTA ATGGGGACAG CAGGTGAGGA 3420
AGGAGGCGGT GGAACTGCAG CTGCTGGCAA AGGTTGCCCT AGTAACCGTG CGGGCTCCAT 3480
TCAGGAAGCC AGCCCAACTC CAAGATGCAA AATGATCGCC TTCACGCGGC TACTGCAAGC 3540
ACAAAGGAAC CAGAGGAGCC CTGATATAGC TGGAAGAAAG GGAGGCACAG AGAGAGGTGG 3600
GGGCCCATGC TGTCAGTTAC AACCTTCCAC CTTCCACAGA AGAAAAAGAA GGAAAGAGAA 3660
TAGCTCTTTG AATCTTCTGG CCTATGTGAA CCGTAAAAAC CACCCATTTA ACATGAGTCC 3720
TTTGGTGAGA ATAGAGGGAA ACAGGCACCC CTCTGTTCAC CAGCCTTCTG AAACAATATG 3780
TCAGGAGAAG GGGGAGAAAC CTCAAACATT GCAACTTTAT GGAGGCTCTA AGCTCTTCAT 3840
ACTCTCTCTC TCCTTTATTC AGACTGGTGA CAAAGACCAT TTGCTCCCAA TTTATTGGAA 3900
ACTTTTTTTT TTTTCACAGC TTGAGCTGCT TAGATGCAGC GAGCTCCCTC TCCCCAAATT 3960
GCAGTCAGAC ACTTGCTGAA TGGGCCAGGC TCAATTATGC TCCCTCCACA GGTTCAGCTC 4020
ACACTGTGAC CCTGCATGGC TTCCTGCTAT TCATATGTGT TACTTCCCCT TTGTGGTAAT 4080
GGCTTGTGGC ACTTAGCCAG AAAACATTAT TAATTTCAGA AGTGGACTGA CAAACAACAA 4140
ACCCACAGTA AAACGAGAGG AAGTGCTGGG GAGGCCAGCT GTCGGCTTGA GCCAAGCAGT 4200
AGGAACTCAA TGTATGCAGG TTCTAGGAGG AAAGAGATAA TAATCCACAA AGAGGAAATG 4260
CACTAAAATT ATCCACAGCC CATATTTTTT TAAAAAACGA AAGAAAGAAA AAGAAAGAGA 4320
AAAGAAATCA GAGAAAAGAA AGGGGGGAAA AGCACCCAGC TACTTGAGCT GCAGCTGGAC 4380
AGGAAATTGC TAACGCTGCT TGCAAATCCT TACTTTGAAC AGGCAGTTTA GGGAATGCCA 4440
GGAGCGGAAA CCGTTCAGAA CTGGATTAAC ACGAGCCAAG TTGAACTGCA ATCCACTTCT 4500
CCTTTCTGTG CTCTTGCTGA CTTGGGACAC CCAAATAGGA CAGACTGACT TGGTATATAT 4560
ATATATTTGC ACTATTTCTG TTTGCTTTTT ATACTTAGTT GCTTAAAAAT CACCATGGAC 4620
AGTTTTATAT GATTGCCATC GAATGAAGGC CACTTGCCTC CTAAGTTAGT GTAGACGACC 4680
AAGCAGTCAA CTCATGTGCC ATGTAGGTGA AAAGCTCATT CTTCTCCCCA CTTCACATGA 4740
AGGGACTGAG CTCATGCAAA AAGAGCCCCA AATATAAGTA CGTTCTAGTT CTTTTGATTC 4800
CATACACCTG CCTTTTATTT TGGTTTGTGT ATTTTTACAT TTGAGGTAAG GAGAGGGTAG 4860
GTCCCAAGAA AAATGGCAAG ATATAAAGTC TTTAGCTTGA AAAGAAACTA AAATAATCCC 4920
CACAAGTTTC AATAAGGGTT TCTGACCCAC ATCCCAAGCC AGTTAAACAA AAAAGCACAT 4980
TACAACAGGG ATGACAAAGT TGCCTCCTAA GTGCCAATGT AAAATTCTAA AGCCATATCC 5040
TGACACGGTG AGGAAGCTTA GATATGCCTT GCCATGCGCA TGCTAGGGGA AAAAGTGGAG 5100
ACATCATTCT GGATTCAGCA TTCTCACACT AGGATATCTG CAGGTAGAAT TGCCCATGAC 5160
AACAGACTGG AAAAAGAATT ATCCCTACTT CCTCTTTGGC ATTATCTCAG CATTATAAAG 5220
CAGAAGATCC TGACAGTGAA GGATAGGGAG GAGGTTAACA TGTGGCTGTC ATCTTGGTAT 5280
TCTGCTACAC CTCTCTGTGG TTAATATCCA AATTGTATTC CTCAGCAAGC TATGCTCTAT 5340
AGGTTCATTT TTCTTCAGGG GCTTTAAAAT CTTAAGCCGG 5380