EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-09618 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr12:66284840-66288520 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr12:66286154-66286165TTTTATTGCTT-6.32
GATA2MA0036.3chr12:66288115-66288126TTCTTATCTTT+6.62
Lhx3MA0135.1chr12:66286238-66286251TAATTAATTAACA+6.12
ZNF263MA0528.1chr12:66284853-66284874TCTTCCTTTACCTCCTCTTTC-6.03
Number of super-enhancer constituents: 13             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02499chr12:66284529-66288046Astrocytes
SE_32830chr12:66285808-66287020H1
SE_32830chr12:66287048-66291390H1
SE_34269chr12:66283219-66291902HCT-116
SE_35398chr12:66285112-66292459HepG2
SE_38126chr12:66283924-66287896HUVEC
SE_44338chr12:66282989-66288567NHDF-Ad
SE_45560chr12:66282479-66292664Osteoblasts
SE_47171chr12:66282476-66298578Panc1
SE_52144chr12:66284514-66287877Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_55829chr12:66283472-66288702u87
SE_63908chr12:66284500-66288016HSMM
SE_67652chr12:66283472-66288702u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr126628584466286273
chr126628669866286979
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH12I065888chr126628267066294672
Enhancer Sequence
TGAGCCTTCC ATTTCTTCCT TTACCTCCTC TTTCATCCAT TGGAACCAGT TGACTTTTTA 60
ATGTAAAGTA TAGAAACTCA GCCGCTCTGA CCCTGTTTTG ATTCCAAACC CTTGTACCTA 120
CCAGACCATT TAGGAAGACT GGGATAAATA AGCATTATAA CTCCAGGGAG CTTTCTGATT 180
TCATGATCCA TTTCTGTTTC TTAGGGGCCA GACAGTGCTA GGCTTACAGG AGACTCAAAA 240
TCTGTAGTTA ACCACAGCAA TAAATGAACA CAAAGGAAAT GCAGATGTAA GTAGGGGATA 300
AACTTTGAGT GGTTCCATCA GTAGTGATTC ATGATGTTGA ACTACAATAA TATTTTCCTC 360
CACACACTCT CCCAGTTCCC ATTGTGACAC TGGAGCAGCA TTTAGGGAAG ACAGTTAGGC 420
TTGGGGGTGC GTTCTGTGGT CATGGCTGTG GAAGATTGGT CCTACGGCTG TTAATCTGGC 480
TGACAAATGT TTCATCAACA TGCATTGTTG AAAGTGACAT GATGCACAGT GCTGGTTAAG 540
AGTCGCGTAA ATAATAAAAT GCCCAAGATG GGAGAAGAGC AGTTTTCCTG GCTTCTCCAA 600
GTTTGAGCTG CAGAATCAGA AGCAGTAGAA TAGAGAGAGA AGAGACAGGA CACTAGCTTG 660
GGTTCCAGCC CCAACTCTGC TGCCCTGTGC TGCGTGGCTG CAGCAAGTGA CTTATCTAAT 720
AACTGTGGGT CTCAGTTTCC TCACTCATAG TATTAATGAT CATTTCTCAG GAGTATTAAA 780
TAAGAGCATG AGTTTAAAGA GCCCAGTCCC GTGCCCAGCA CAACGGAGGC TACCCTCCAA 840
AGGTCAGTCC CTTTTTCTGT GTGTTTCATC CTCTCTTGGC AGCCTGTTTG CTGCATCTCT 900
CAGCTGACTT TTGTCCCTTC CTGCTCACTT AGTCAATTCA GAGATTACAG TTTGTACAAT 960
AATGCGCTGC CTTGTCTTCT CGCTGGTGAA TCTGGACCGG AGTGCTCTGC CTCTGCGCCG 1020
ACACTCACTC TGATGGTCTT GGCTGGAGGA CAGAGGCTGC TGGCAAAAAC CTAAGAGGGA 1080
ACATACCGTG GTAGCAGCAT GAAAGAATTT GGCAAGGAGG TGCTCGTCAC ATGATTGTGA 1140
TTCATACTGT ACTCTCAAAA TGTGGCAGGA GGGCTAGGAG AGACTTTTAA TGCCAGCACA 1200
CAGAGCAGAG ACACTCATTT TCAAACATCA CATTCTTTTT ATAGTACAGG CATGCCTCAC 1260
AGGGAAAATA TTGAACTTGG CCTGCCAGCA CCACGAGAGT CGTCCCAACT GTGATTTTAT 1320
TGCTTGAGTC ACTCCCTGAA TCAGATACTG GCTGCACGGA GGAAGTCTTC TATTAGGGAT 1380
GCTTTGAAAT TGTGTTTTTA ATTAATTAAC ACCAACTCTG GACAGGTTTT TCATTTACTC 1440
CTAGCTGACT CTTTTTTGTC TTTTCTTTTT TTGCCTGAAA CTTGTTAGAC ATTTTTGTAA 1500
GGTCTCAGTT GGATCGCTTT TAAGTATCCT GGTGAAAGAG TCATCTGTGT TGGGTGACCA 1560
AAGCGAGGGG ACCCTTCAAA GTAGAGTTTG TCATCTCCGA GAGAATCTGA TCCATGGGAA 1620
TGGGGTCGTC AGGAAAACGG TCCCTAAAAG TCTGGCATAG CACTTTTTGA TGCCTTCAGC 1680
CGTCCTCAAT CCATTCATCC TGTTGTTAAA ACTTAAAACT AGAGCTGGCC AGCTGTTGAG 1740
AAAAGTCCTC AGTTTTATTT CAACCAAATG ATGCTGCCTC CTGGGGCTGG AAGGGGGCTG 1800
ACTTCAAGCA CAATTATAAA TGTGTAGCTC TTTCAAGCGG CGGAAACCTA CAAAATGGCC 1860
TTGATTCACA GGGCCCCTCT GGCTCAAAGA CTCTCTGCTT CCCGTGTGTC ATAAATCTGT 1920
ATCTGCATCA AAAAGTGTAA AGACGGCAGT GTATGGAAGT CCCTCTTCCT CTGCGAGTGT 1980
GTCTATGACA GATTTATACT GATGGCTACA CTGCACCCCG GTCACAGGCT CCTATTATAG 2040
TCATGCCCCA CTGACTCAGC CCCCATTTCC TGTGGAAGGG GAGACAAGGT CCTGCATGAA 2100
GGAGGGTGAA ATTACAGCTC AACTCTCGAA TTGCTGTTAG TACAGGAGGA CCTTTAAGGG 2160
CTGCAGCAAG ACCCATTTTG TTCATAGCAA CATCTACTGT CTCCTCACCC CAGTGTGGTC 2220
ACAGCTAAAA CCTAAGGCAT TTAGTTTCAT GACAAGATAT GCCATGACAG GGTACTCCAG 2280
AATTCAACAA GGCCAAATGG ATACATGCGA AAAGAACAAA CCACCTCATT TGTTATAATT 2340
TTTGTTTCTT CAAAGTGGTT TTCTTTTTCT TCCTGAGGGT ACAAGTTTCA AATGTGGAAA 2400
TTTTTTAAGG TAGCATTTGA ATCCACCTCT CTATTAGTAT TTGCAAATGG ATGCAGAACA 2460
GGACTGGTTT TTGAAACCAC CTCCTTGTTA GAGATTTTTC ATCCTTTGCA AACATTGTAG 2520
GGTTTCAGAG GTAGCGGCTG GTGAGAACCC TCTTGTGTTT GACTGCAGCC TTCGAGGTTT 2580
AGAGCTGTCC TGCATTTCAG GGGGTGAATG GCTACTGGTA AAGAGGTCAA AATGAGCTTT 2640
ATTCCAAGAG TTAAGCAATG AAGTTGCAAA GTTTAATTGG TGTAATTTTG GGAGATAAGG 2700
ATGGAAAGGG AAGGATGTTA GGATAGTTTG AATCCTCTAA GAGGAGAAAA GGCAAAACTG 2760
ATATTTGACT TTCCCACTGT ATTTAGAGTA TAGCCTTCAT GGGGTAGCTG TTTCTTCTTG 2820
TGTTTGGTAT GGCTCAGAGC ACTTGAAAAT GTCACTGGCT GAAGAAGAGT GCTTGTGATG 2880
ATATTTTTTA ATTCACTTTT TTTGTAGACT TTAGTACTAT AAAGAAATGA TACATAGAGG 2940
GGAGTAAAAA CTTGTCTAGC TAACAATTGG TATTATAATG GTTTTGAATG CACAGTTCTG 3000
ATTAAATTTT ATACATTTCT TCCGTTGGCC AACTTATCGT GAGCCTGGTT GTATGCCTCT 3060
GGTGTTTGTA TGATATTCAC TGCATTTTTT TCTAACGTGT TAAGGATTCT ATTTTAAATA 3120
GAAAATCAGA TTGCAGTTTG AAAAACTTAG TTTTAAAACT CTACCATCTG CTAGATTTGT 3180
GGAAGAGGAT CTGGTAAATG AAAATTGTGT GTGTATGTGT GTGGTTTATT TTATAGGCAC 3240
TGCATATTTC TTTGATGATC TATTTTCCAA GCTCATTCTT ATCTTTTAGA AGATGTTTCA 3300
AGGATTTATG CATCTGGCAA GATTTCAGAG AACTCTATAG TGGTGGAGAT GTACACTCCA 3360
TTTATAGGGA ATCCTGAATC AGGGTCATTG AGAGCATTTA TTTTGTTTTG CGCTTAAATT 3420
TATTTCTGCT CTGGACATTT CTTTCAAATG GATCATTTTT ACATGGTCAA ATCTAAGCAT 3480
TTTATTCATA AGAACTCTAA TAATAAAGCT TTTTCAGTCC AGACATAGGT GGAAATTTGC 3540
AAAATGCATC AGGAAAGTAT GGCAATTGCT TTTCAAGCCA TCTTGTATTT GAGAAAGTAT 3600
TGCATTCATT AGTGTTTGCA AAACTACCTT TAATGGTGCA AAAGTAAAGC TGACCTCTCC 3660
CTTTTGGTGC ACAGATGTAT 3680