EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-08689 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr12:12971170-12974140 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr12:12973794-12973812CCTTCTTTGCTTACTTCC-6.85
Sox3MA0514.1chr12:12972845-12972855CCTTTGTTTT+6.02
ZfxMA0146.2chr12:12971215-12971229GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02637chr12:12971569-12974511Astrocytes
SE_34747chr12:12971639-12974313HeLa
SE_35923chr12:12971371-12974243HMEC
SE_38164chr12:12971460-12974869HUVEC
SE_46034chr12:12965876-12978755Osteoblasts
SE_47244chr12:12964956-12978181Panc1
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr121297140012974000
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH12I012816chr121296967112977878
Enhancer Sequence
ATTGGCTGGG CGTGGTGGCT CACGCCTGTA ATCCTAGCAT TTTGGGAGGC CGAGGCGGGT 60
GGATCACGAG GTCAGGAGAT CGAGACCATC CCAGCTAACA CGGTGAAACC CCGTCTCTAC 120
TAAAAATACA AAAAATTAGC AGGGCGTGGT GACGGGCACC TGTAGTCCCA GCTACTCGGG 180
AGGCTGAGGC AGGGGAATGG CATGAACCCA GGAGGCGGAG CTTGCAGTGA GCCGAGATCT 240
CGCCACTGCA CCCCAGCCTG GGTGACAGAG CAAGACTCTG TCTAAAAAAA AAAAAAATCA 300
GTCCCATTGT CTGGTTTGAC TTGTATTTCA CATCTGTGCA TATGCTTTTG AATGGAAAAC 360
ACTGATGTTA ATGAAAAGAA GGCTAAAGAA TAGAATTCAC TAGGATACAC TGTATGTTAG 420
TCCTTTTTCA CACTGCTGAT ACAGACACAC CCGAGACTGG GAAGAAAAAG AGGTTTAATT 480
GGACTTACAG TTCTGTGTGT GGCTGTGGAG GCCCCAGAAT CATGGCAGGA GGCGAAAGGC 540
ACTTATTACG TGGTGGCGGC AAGAGAAAAT GAGAGACATG CAAAAGCAGA AACCCCTGAT 600
AAAACCATCA GATCTCATGA GATTTATTCA CTACCATGAG AACAGTATTG GGGAAACCAC 660
CTCCATGATT CAAATTATCT CCCACTGGGT CCTTCCCACA ACATGTGGAA ATTATGGGAG 720
TACGACTCAA GATGAGATTG GGTGGGGACA CAGCCAAACC ATATCACACT GTTGTCTGAT 780
CTGGCATGGC AGATCCTGGT TTAACTGATT AATGTTTAAG AGGTGGATCT TACAGGTCTG 840
TTCTACTTGA TCAGTGACAT TGAACGCCAC TGATCACTCT TCTTTCTTGA AGCTGCCTTC 900
CTCCTTAATT TCAAGACAGC ATTTTCTTCT GTCTTTCTAG CTGTTCTTTC TCAGTCTCTT 960
CTTCTGGTTC TTTTCCCTTT GCCTTACAAT ATTGATTCTG TCTTTACCCT TTTTTCTTAC 1020
TCTGAAATAC TACATAACAT TTCTCATTCA GTCCTCAAGC TTAAACCCTG TCTGCATCAG 1080
TGAGTCTGTA TTCTTCAGAA TCATCTATGG AGCTTTTTTT TTTTTTTTAA ATAGAGATTT 1140
CTAGGTCCCA GCCAAGACCT ACTGAATCAG AATTTCCAGG CATGGGACCG GGCATATATA 1200
TATATGTAAG TCTCATCGAT TATTCTGAAG CATCTGCCCC TGAGGAAGTA CCAGTGGTAG 1260
GATACTCATG GCTCCCATGT CTGTTCTAAC CCCCACTTTT TTCCTGAGCT CCAAACAAGT 1320
ATGTCCAGCT GGTTTTTAGA CATACCTCCA AATAATTATG CCCAACTGGT TTTTAGACAT 1380
ATCTCTAAAC AAGTATGTCC AACTGGTTTT TAGACATATC TCTTTGAGTT TACTATAGGA 1440
ATCTTAAGTT CCAAGTTCCC TGTGTGGAAA CCAAAGTCCT TATTTTCCTC ACCAGGACTA 1500
ATTTTTCTGT TGCCTATATT GCAGTTTTTG GCTTTTGAGT GTCCCGTACT AAAAATGTGT 1560
GAGTCACCCA CATTTCCTTT TGTTAGTTTC TGAATCTCAT TCCTGTGCTC ATTCCTGGCC 1620
TCAGTTCAGG CCACCATCAT ATCTCCCCTG AATTACATCC AATGTCCCAG TTAAGCCTTT 1680
GTTTTCCCTG TTCTGGTCAT TTAAGTCATT TCTGATTGTA AGTCATGTTC AGGTTATGTC 1740
AGGGAAAAGA GATTTGTTTA TTGTAGGATT ATCTTCTAGG TAAAGAAAAC TTCTCAGCAG 1800
TTACACAGTC AGAACAGGGG CAGCAACTGT AGGGGTCATG ATTTAATAGG GAGCATTCTC 1860
ACTGGCCACT GTGGTAGTGC ATAGCTACCT CATGGGCTAC AGCCAGCTCG GAGATAGTGA 1920
TCTCAACTCA GGAGTTAATT TCCAAGTCTT ATGAGTTGTG GCTTGAGTGG TGATAGCAAA 1980
CAGTGGTGAC CTGTTCTTAA AGAATTACTT AGAGCATTCT TCCCTCAGAA GGAGCAGTAA 2040
CTGGCATGCA CTGTTAAGTT CCTTGGCTCC TCCTTATGCC ATCAGGTCTA GAGTTTATCT 2100
TCCTAAACAG TAATATTGAT CATGATATTC CCTGTTTAAA ATCCTTTAAT TCTTTCTTAT 2160
AGGAAAACAT CAAAACTCTA GCCTCATTCT TCCCTCTTTC TCCCTTAACA CTTCTGTGTT 2220
CCAGCCACAT TGTACTTCTC AGCCTAACTA TGCATGCTAT GTTCTTTTTA TTTTTTGAGA 2280
TGGAGTTTCG CTCTTGTTGC CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC ACGATCTCCG CTCACCGCTG 2340
CCGCAACCTC CGCCTCCCGG GTTCAAGCAA TACTCCTGCC TCAGCCTTCC GAGTAGCTGG 2400
GATTACAGGC ATGCACCACC ATGCCCGCCT AATTTTGTAT TTTTAGTAGA GACAGGGTTT 2460
TTCCTTGTTG GTCAGACTGG TCTCGAACTC CCAACCTCAG GTGATCTGCC TGGCTCGGCC 2520
TCCCAAACTG CTGGGGTTAC AGGCGTGAGC TACCATGCCC AGCCAGCATG CTATGTTCTC 2580
TAAAGCCTTA ATTCTCTTTC CTCTTACAGG AATATCCTTT CTTCCCTTCT TTGCTTACTT 2640
CCAGTTTTAA CTCACTTATC ACCTCTGTTA GCCTTTTCTG ACTCTTCTGG GCAGTAGTTA 2700
CTTTTCCTTG TGTTCTCGCT GTATTTTGCA GGGGCTTATA TTAAAACTCT TATCACATTA 2760
TAATGCATTT GTATATTTGT CTGTCTCACC ACTGGGTTTT GAGCTTATCT AAGAGAGAGG 2820
CCATGTCTTT TCTGTTTATT CAACTTTCCT CTCTCCCCAG TTCATCAGAT ATTTATTAAG 2880
CGTCTACTTT GTGCCCAGCA TTGTGTCATT GTAGAAAACA CAGAAATAGC GCAAAGAGAT 2940
TACTTGGCTG TTGAATTTCT TTTTCTTTTA 2970