EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-06518 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr11:12438950-12442080 
Target genes
Number: 9             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr11:12441553-12441564ATATTAATTAT+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr11:12440568-12440581ATTAAGTGGTTGA-6.1
Nkx3-2MA0122.3chr11:12439209-12439222TTTAAGTGTTTTT-6.64
RUNX1MA0002.2chr11:12441828-12441839GTTTGTGGTTT+6.02
SP1MA0079.4chr11:12439862-12439877CAGGCCCCGCCCACA+6.57
SP4MA0685.1chr11:12439862-12439879CAGGCCCCGCCCACAGG+6.05
Stat6MA0520.1chr11:12439688-12439703TTTTCTGAGGAAATC-6.22
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00622chr11:12430628-12440559Adipose_Nuclei
SE_25785chr11:12438937-12440995Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27361chr11:12439103-12440452Esophagus
SE_30737chr11:12439089-12440645Fetal_Muscle
SE_30737chr11:12441295-12443895Fetal_Muscle
SE_37068chr11:12429795-12444741HSMMtube
SE_44585chr11:12439210-12440544NHDF-Ad
SE_46317chr11:12438933-12440797Osteoblasts
SE_46821chr11:12439689-12440243Ovary
SE_54486chr11:12421685-12444313Stomach_Smooth_Muscle
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr111244001812440166
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH11I012417chr111243900312440650
GH11I012419chr111244129612443895
Enhancer Sequence
AAACAGTATT TATATATTTG TAAGGGTATA TATGTAAAAA TATATATGTT TATACTTGCA 60
TTGAATAAAG TCTGGAAATG TGTACCTACA GTATTAACAG TGACTACATC TGGAAGGTAG 120
GATTTGGAGT GATTTTAATT TTTCTGTCTG CATTTTCTAA TTTCTACCAT GAATATGTAT 180
TACTTGCCTA ATATAAAAAA CAATCAGTAG GAGAGGAGGA TTTTTCACTC TGCAAGACTG 240
AAAAATGCAA GAGGATTTAT TTAAGTGTTT TTCCACAGAG AAGGGCCCAA GTTAAGTTTG 300
TATTTACAGA GTCCCTCCCA ATGTTGGGAA GGGAAAAAAC TTTCCCAAAT GTCAAAATCC 360
TGTTTCTGGA TCTTTTTTGT CCTCAGGGCC CCCCGGGTGC CAAGCCTTCC TTCTTGCTTA 420
TGGCCTGACC TGAGTTTTCT TCTGGAGCCA ACAGCCCCTT CTAGCTGGGC AGCTCCCAGG 480
GGCGAGGCAT CTCTGGCCAG GGAGCACCTC CTACAAGGCA CCCTTTCCTC CAGATTAGAG 540
ACCCCAGCAG TGCCAGATGC TGATGCAGAG TGCCTGTAGG CCACCTAAGG CTGGCTTGGA 600
GTGGGGTGGG GAAGAGAAGT CACTTGAGAG AAAAAAACAA AAAACATCTG AAACTGCAAG 660
TCATTGGAAG GTTCCTGCTG GCACCCCCAC TGGGCTCAGA TAAGAATCAG GAACCGAATT 720
CCTGCCACAT TTCAGAAATT TTCTGAGGAA ATCAGCATGG GCCAAGGGGC CCAATGAGAG 780
TCTGAGGTGG AAGTGGGTCA TTGGAGCCCA GGCCGCCTAC CTGGGCCTAA TACTCTGTGA 840
CAGACACTCC CAGTCCCTGG GTGGGTGATG TGAGTTTTGT TCCCTTAGTT TGGGCTGGGT 900
GATGGTGCCC AGCAGGCCCC GCCCACAGGC CTCTGTGGCT TCCTGTTTGG GTCTTGCCCT 960
TCCATCTGCT TGAGGGCCGT AGTGGTGACC TCTGGATCCA GCTTCCCACT TTGGGCTTGC 1020
GTTCTCTTTG TTGGATCCAG CTGGTCTCAT CCCTGGGGCA GGATGGGTGT GGGAGGAGGA 1080
CGAAGACAGT TGGGATTCTT TAGCGGGTGG GTTGTTGGCT TGGAGCAGAG CCCAGCTTCT 1140
CAGCGTGCCT GCCACAGCCT CCCCCACCCA GTTCATGGTC TGGGCCAGCG TGATGACTGC 1200
TTGATTCTCT ATCAGGCAAC TGCACCTCAC TGGAGCCAAA TTCCATCTTT ATTCTGCTCC 1260
CCATTACCAC CCCGCCACCG GCTTTGTGAC CTAGACTGAT CACTGAATGC CTCTGAGCCT 1320
CTATGTCCTC ATCTGTAAAA TTTAGCTGTG TTGAAAGTGG AAGTGGGGAG TTGAAGACTA 1380
AATGCCACAA CATAGGAAAG CACTTTGAAT GCTGCCTTGC ACCCTGTAAC AATAATAACC 1440
ATTATTGCTG TGATAACTGA TGTGTATTGA ACAATACTTT GCACCAGGAA CTCTTAGAAA 1500
CCCTTTACAT GTAGTAATTT ACTTAATCCT CACAATGGTT TATGAGGTAG GTACTAATCA 1560
ATCCCATTTG CAGATGAGTA AATTGAACCA TGAAGAGATT GAATAACTTG CCGAAGTTAT 1620
TAAGTGGTTG AATTTATGAA GTAACCAGGC TCTGACCAAG GAGCTGCTTT TTTAAAATTT 1680
TTTGGTTTTA AAAAAGTCTT TCCAGCCATC TTAAAAAAAT TGTAGTAAAA TACATATAAC 1740
TTAAATTCTT AACCATTTTA AGTGTACAGT TCAGTAGTAT AAAGTGCATT CACACTGTTT 1800
TGTAACCAAC CTCCTAAACC CTTTTCATCT TGCAAAACTG AAACCCTATA CCCATTAAAC 1860
AACTCCCCAT TCTCCCCACC CCCCAGGCCC CAGCAGCCAA TATCCTGTTT TATGTCTCGA 1920
TGAATCTGAG TACTCTTGGT ACCTCCTATG AGTGGAATCG TATGATATTT GCCTTTTTAT 1980
GACTGACTTA CTTCACTCAG TATAATGTCC AGAGCTATAT CTGTGTTGTA GCATGTGTCA 2040
GAATATTCTT TCTGTTTGAG GCTGAATGAT ATTCCATTGT ATGTGTATAC CACATTTTGT 2100
TTATCCATTC ATCCATTGTC GGACACTTGA GTTGCTTCCA TCTTTTGACT ATTGTGAGTA 2160
ATGCTGCTCT GGACATGGGT GTACAACTAT ATCTTCAAGA CTGTTTTCAA TTCTTTTGAG 2220
TGTATGCAGA AGTTAAATTG CTGGATCTTA CAGGTAATTC TATGTTTAAT TTTTTGAGGA 2280
ACGGCCATAC TGTTTTCCAC AGTAGCTGCA CCATTTTACA TTCCACAGCA GGGCACAAGG 2340
GTTCCAGTTT CCCAACATCC TCACCAATAC TTATTGTTAT TTTTGTTATT AATAGTAACC 2400
ATCCTAATGG ATATGAAGCA GAGTCTAGCC CTACCGTGGT TAATGTCAAA CTGAATTCTT 2460
CTTACGTTGT TGCTGAAGGT GTGGTGGCAA AACCTAGGTA AATGCTGGCG GAAACACTTT 2520
TAAGATTCAT ATATACTGCT GTTCAGAATG TCTCCCATCA TTATGAGGAA AATATATTAT 2580
TTTTAGCAGA TGTTAAATCA ACTATATTAA TTATAAGTTC TGTTCAGTAA TGTTCCGAAT 2640
ACATACGTAG CTAGTTCTCA AAATGCATTC CTTGAAGTCT TTGAGTTTCC ACTAATAAAG 2700
AAAACTAAGG AAATCAGGCA TTCATGGCTC TAGACAGGAA TGAAGACTTT AGGAGAAAAA 2760
AAGGGTTAGT TCTGGGAGAC TCAGCTTCTA ATGTGGACCC ATTAAAAATT CCTAATAGGC 2820
ATTTATTGTA CACATCTGTT ATTCCTTTTG GAGGCACTAA TTTCAGCAAA GAATGTAGGT 2880
TTGTGGTTTT TTGAAAAACA CTAGATCAAA TTATTGTGTG TTTAATTTGA ACGGGAACTT 2940
CATGAATGAG ATGTCTCCCA AGTGCACCAA GCAAGAGTGA GGAAACGTAG GTTTAAACCT 3000
TTTGTTCTGT TTGGAAGTGT AAACAGTGTA TTCAAATTCT TAAATATAGA GAAAAGATCT 3060
AGAACAGAGG GACAGTGAAG CTAATGTGTC TTGAGAGATT GGAGCAGACA CATGGAAAAT 3120
ACCTATACCT 3130