EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-04013 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr1:243429400-243433400 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs28599724chr1243430818hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:243429611-243429632TTTTTCTTTTTCTTTTTTTTT+6.09
MEF2AMA0052.3chr1:243432695-243432707GCTATTTTTAGA-6.52
MEF2BMA0660.1chr1:243432695-243432707GCTATTTTTAGA-6.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:243429840-243429855TGAACTCTTGACCTC-7.64
RARAMA0729.1chr1:243429837-243429855TCTTGAACTCTTGACCTC-6.45
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02504chr1:243429597-243430307Astrocytes
SE_02504chr1:243430798-243434276Astrocytes
SE_07448chr1:243430547-243434541Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_10132chr1:243425915-243434523CD14
SE_13193chr1:243431192-243432252CD34_Primary_RO01480
SE_13791chr1:243430609-243434464CD34_Primary_RO01536
SE_14286chr1:243430759-243432150CD34_Primary_RO01549
SE_15055chr1:243430581-243434330CD4_Memory_Primary_7pool
SE_38593chr1:243430405-243434176HUVEC
SE_43371chr1:243431112-243431529Lung
SE_43371chr1:243431855-243433626Lung
SE_53968chr1:243430368-243431555Spleen
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1243431252243432294
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I243262chr1243425706243434391
Enhancer Sequence
TAAATTGTGG ATACAATGTG GAATAATTAA ATAAAGCTAG TTAACATATC CAATACTTCC 60
AATACATTTC TGTGATGAGA ACATCAATTT TGAAATGTGT AATACTCCAT TATTAAGTAT 120
ATGCACCACA CTGTACAATA GAACTCAAAA AAAGTATAAA ACATATTCTT CCTGTCTGAG 180
ATTTTGTACC CTTTGACCAT CACTGAATTT TTTTTTCTTT TTCTTTTTTT TTTTTTATGA 240
GACAGTCTCA CTCTGTCACC CAGCCTGGAA TGCAGTGGTG TGATCTCGGC TCACTGCAAC 300
CTCCGCCCCC CGGCTTCAAG CAACTCTGTT GCCTCAGCCT CCCCAGCAGC CAGGACCACA 360
GGCACACAAC ACCACAACCT GCCAACCTTT TTTGTATTTT TAGTACAGAT GGGGTTTTGT 420
CACGTTGTTC AGGCTGGTCT TGAACTCTTG ACCTCAGGTG ATCCACCCAC CTTAGCCTCC 480
CAAAGTCCCA GGACCACAGA CATGAGCCAC TGTGCCTGGA CTAAAATTTT TATGAGACAA 540
AATATCAATT TCAAAACAGC ATCAAAAAGT GAGTAGGCCA GGCACGGTGG CTCATGCCTG 600
CAATCCCAGC ACTTTGGGAG GCCGAGGTGT ATTTTTCTGT ACTAAAAATA CAAAAGTATT 660
TGTCTCTATT ATAAATACAA AAAAAAAAAA AGAAATTAGC TGGGCACTGT GGCACATGCC 720
TGCAATCCCA GCCACTCAGG AGGCTGAGGA AGGAGAACCA TCTGAACCCT GGAGGCAGAG 780
CCACAGTGAG CTGAGACTGC ACTACTTGCA CTCCAGCCTG GGCAACAAGA GTGCAACTTC 840
GTCTCAAAAA AAAAAAAAAA AAAATGCTGG GCGCGGTGGC TCACGCTTGT AACCCCAGCA 900
CTTTGGGAGG CCGAGGCAGG CGGATCACAA AGTCAGGAGA TCGAGACCAT CCTCGCTAAC 960
ACGGTGAAAC CCTGTCTGTA CTAAAAGTAC AAAAATTAGC TGCGCGTGGT GGCGTGTAAC 1020
TGTAGTCCCA GTTTCTCGGG AGGCTGAGGC AGGAGAATGG CGTGAACCTG AGAGGCGGAG 1080
GTTGTAGTGA GTGAAGATCG CACCACTACA CTGCAGCCTG GGCGACAGAG CGAGACTCCG 1140
TCTTAAAAAA AAAAAAAAGA AATATACATG ATAGGAATTC CAGGAATCTT ATGGATTCTT 1200
CTTTTAAGGT CCCGGTCACT GGGCGTGGTG GCTTACGCCT GTAATCCCAA GACTTTTGGA 1260
GGCTGAGACG GGCGGATTTC ACCTGAGGTC GGGAGTTTGA GACCAGCCTG ACCAACGTGG 1320
AGAAACCCCG TCTCTACTAA AAAAAAATAC AGAATTAGCC GGGCGTGGTG ACAGGTACCT 1380
GTAATCCCAG CTATTGGGGA GGCTGAGGCA GGAGAATCGC TTGAACCCGA GAGGCGGAGG 1440
GTGCGGTGAG CCGAGATTGC GCCATCGCAC TCCAGCCTGG GCGACAAGAG CCAAACTCCC 1500
TCTCAAGAAA AAAAAAAAAA AAGTCCCGGT CAACTGTGGG CACAATGTAA CACTTACACA 1560
CACTTAGGCT GAGTTACTCT CTGTACTAAG CAGTCATGTG CATAGGTTCC TGTGTGTGTA 1620
CATGGTAATT GTTCAAATCT TGGATCCTTG GCGATCCTTA GAGCCACTCA ATACTTCTGC 1680
CCCAATTTCT CAATTTCAGC CATTACACAA TCAGTTATAC AAGGGATACA CTTGACATGC 1740
AGACAGCCCA TCATTGACTG CACTAAGTCC AGTTTGGCTT TTATGGAAAA GTTGATAAAG 1800
TTGGTATCAA CGAGGATGTG GTAAGGTGGG CCCAGCTGTG TATTATATTG GCAAAATAAT 1860
CAGGAAAGGT GTTGCGGAAC TTCTCTTTCC TTTAACGCGC TGGGATCCTT CTTTTCTTTC 1920
TCTTTAGGTT TTAATCTATC CTTTTCTTTA AGCCTCTGAT CTCTGAGACT AAGCGTTTGC 1980
TTCATGGTTG TATAGTTCCT CATTTTCTTT TGCTTCCTCA TGGTCACACC ACACTCCTGT 2040
TTCTTCCGTA ATCACCAACG GTGCAATGCT TTTACCTGGA ATACATTTTT ATGTTAGTCA 2100
AACTGTCTCG TTCCTTTCTA ATAGATTCAA TAAAGATAAG TGTTTTATTC GTGGATTTAA 2160
GGGCATAAAT CTAAAGCTCC ATGAACTGAA TTGCTTATCA TGTAACACTT TGATTTTCCT 2220
TTTCCATGAC CAAATCGCTT TTCTATTCTA TTTTCTAATA CTAAGTTATT GTAAAACTAT 2280
CACAGTTTCA TATATTCCCA AAACCAGGAA TGCGTCTTAT CTGAACTTCC TTAAACTCAT 2340
GATGAGTCAG AGGAGGCCAG TTTTCATTAG TAATCAGCGC CAAATTCATT TCAAAGAAAG 2400
ATCTGTGTGG ACATAGGATT GGTATGGAGA AAAATATGGT GATAAATTAA CTGTGTCTCT 2460
TGTATAGTTG AGTAATAGAA TTTCATTGTC GAACCCTGAC CTGAAATACA TGTTTTCTTT 2520
TATCAAAGTA GAAAATGAGT TGCTGCAAGT AAAGAAACTG TATTAGATAT TGTATAACAG 2580
AGACTTTTTT TTTCTATTAA GTACTAACAT TGCTTTTGTT TCTGTTCCAA ACTTTGAAAT 2640
CAGTGCACTT GGACAAAATG GAAACTGCTT TTCAAGGTCC TACAGAATAT ATGTTTATAA 2700
ATGTATTTTT ATACATGGTT GGTAATGAAT CAGGTCTCTT TCGTGCCATT GCAGTTAGAG 2760
GGCCTCTGGT GCTGGAGTCC TCTGGAGGAC TGGGCTGTCA GAGTGGGGCA GCGGGGTGCA 2820
GCGCGGGGAG GGCTTTTCTC TTTCTTCGTG CCTCTGGTGC TGGAGTCCTC TGGAGGACTG 2880
GGCTGTCAGA GTGGGGCAGC GGGGTGCAGT GCGGGGAGGG CTTTTCTCTT TCTTCATGGG 2940
GTCTCAGGGC CTCTCTCTTC CTCTCCACGT ATGCTCTTCA CAGGTCTCTC CAGCAGGGTA 3000
GTCAGATATC TTACATAGCG GCTTAGGGCT CCCAAAAGCA AACATTCCAA GAGGAAGCAG 3060
AAGCTGCCAG TCCTTTTAAA GATGAGGCTT GGGTGTGACA TGGTATAACT TTTATTGCAT 3120
TCTATTGGTT AATGCAGATT ACAGGCCCAG TCAGTTTCAG ATTAGAAGAG AACAAGGGAA 3180
TGAGGCTGGG TTCCTTGGAG GCTATTTTTT TTTTTTTTTT TTTCTGAAAC AGTCTCGCTC 3240
TCTTGCCAGG CTGGAGTGCA GTGGTGCGAT CTCGGCTCGC TGCAACCCCT TGGAGGCTAT 3300
TTTTAGAGAT GAACTATCAC AGTAATATAC CTTAAAATAC TTCATTTTAG ACAGTTTTTG 3360
TGTGTTCTAG GGGTGGTCAG TTGCACTAAC CAAGAATCTA TGAGGTGTGG TTGGCCAGCA 3420
GTATATAGAA AGAGCTGTAC CGCCGGGGCT GCCACTATAA GCACTTCAGC TATGCAAATT 3480
TTGATCAAAA CTAGGCCAGA CATGTGGATG TCTCTTGGTG GGGGAGGGAT TTCCTGTCCC 3540
CAGGGACAAT GAGGCTTCCC TAGGTTGGAA CTGGGTGTGA CGCAGTCCCT TTTGCTGGCT 3600
CTTCCCACCT CCCCACTGCT CCTTTCGTCC CCCTCTGTCT CCAAGTTGGT AAAGGAGTCA 3660
GGCATGGTGG GAAGGAGAGC ACTTCCCTTA GCAAGTTATT GTTTAATGGG AGCTGGTGGG 3720
AAGAGTTCTG TCATTTAATC CTTGCCGGTG GTGCTATATG TAGTGAAATC AACTGCTACA 3780
GTGGTAGGGG CCTTAGAGAT CATCAAGTCC TACCTCTAAA CCATGAAGTT AATCTTCTCT 3840
CACCATCTTT GGCACATCCC TCAGCAAGCT AGAAACAGAA CTCTGCGTTT TTTCCATAAA 3900
GTACGAGAAA TAATGATTTC ACCTTTAAAA ACTGCCTTCC TGAGTAAGTG TCCGTTTGGT 3960
CAACCAGACT CCATGGGTCC TAACTTTCGT CAGGTTGTTC 4000