EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-03419 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr1:208353870-208359510 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:208357277-208357288ATATTAATTAA+6.62
Gfi1bMA0483.1chr1:208354739-208354750AAATCACAGCT+6.14
IRF1MA0050.2chr1:208359065-208359086AAAAAAAAAAAGAAACTATCA-6.07
IRF1MA0050.2chr1:208355780-208355801AAAGAAAAAAAGAAAGAAAGA-6.34
LMX1BMA0703.2chr1:208357280-208357291TTAATTAAAAT-6.62
NR2C2MA0504.1chr1:208354977-208354992AGAGGTCAGAAGTCA+6.18
RREB1MA0073.1chr1:208356950-208356970GAGGGGGGGGTCTTTGGGGG-6.08
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_23661chr1:208352142-208355560Colon_Crypt_1
SE_23661chr1:208355735-208357908Colon_Crypt_1
SE_23661chr1:208357955-208358868Colon_Crypt_1
SE_31633chr1:208355878-208357061Gastric
SE_31633chr1:208357397-208358885Gastric
SE_33895chr1:208356937-208358912HCC1954
SE_54968chr1:208352258-208355238Stomach_Smooth_Muscle
SE_54968chr1:208355867-208359565Stomach_Smooth_Muscle
SE_58948chr1:208347899-208379506Ly3
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1208356200208356752
chr1208354600208354873
chr1208357276208358800
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I208176chr1208349541208359979
Enhancer Sequence
CCAAGAGCTC ATGCTTAACT TTCATGTATC AGGCACCGCG TTACACCCTC TGCATCTGCT 60
TTATGTTGAA TCCAAACAAC ATTGGCATCC ATCCTAGAAA GGCACTATTA TTTACTCCGT 120
TTGGCAGACG AGGAAACTGA GAGTCACAGT GGTTAACTTT ACACAGCTAG CAAGGGGTGG 180
AAGAAGTGTG GAGACACGGG TGAGTCTTCA GAGATTTTGT CTGAAGTTGT TGCCCCTCAT 240
GAGTATTCGC TGTCATTGCC CCACACCCTA AAGCAATCGA GGGGAACTGG GATGGAAGAT 300
ATCCCAGGAG GGGTAAAAAG GACTGTGATG AGGGAAATGG GGGTAGGAGG GAAAGGGAGT 360
AACCGCTATT GGCCCTGGCC ATGTCAAGCT TCTGGGGTCT CCCCCTGCCC AAGTTTGAGA 420
GGGGATGGCG GAGGCTGACT TCTCTGCGAC CCCAAACTCC AGCCTTCCAA GCCTTCCAAA 480
GTTCACTCAG TGAGAAACCT CTAGTGTCCA GGCTCTGAGC CTGTGACCTC TTCCTTCCTT 540
TCAGATTTTA ATTTGCTGGA CTGGGAGACA AATGCATGTG GGAGGTTCTC TGGAGTGATA 600
GGAACACACT GAGGGCTATA AGAAGCATCA GAGAGGCTTC ATGCTGGCTG GGGCCCTGAG 660
GACAATCCCA TCTACCACTT CCCGACCCAG GTAGGCAGAC CGAGCCTTTT CCTTCTGAGC 720
AAGCCCCTTT CCAGGCACTG CTGTCACCTC CTAAGGCTGA GGAGGGTGGT GGCAGGAGGG 780
TGCAGGGAAG GCCCTGTCTG TTCTCTGGTC TTTCCTTCAG GGGGCCAGAC CCTGAGGGGT 840
GCAGCCTAGT TCCCCAGAGC ACATGCTCCA AATCACAGCT CCAGTGACAG CTTTTGCTTT 900
CCCAGTGAGG GGGCTAGCTC AGGAGATGAA AGTCTGATCC CACTGGCAGC TCCACAGGCT 960
TCCTTTGCCA AAACACACTG TGAAAAGACC CCTGACCTCC ACCTCATACT TTCTCTGCTC 1020
CACCTCCCGT CAGCCCTGTT TGCTTCCCTC CTCCCTAGAG AGGGTTAGAC AGCCCAGTAA 1080
TTTAGGGATC ACTAGCAAGA AAGGTGCAGA GGTCAGAAGT CAGAGAGGGG CTGGGAGGGG 1140
AATCTCACCC CTGCTCTCTG GCAAAACCTC CCACCTCTTT CCGCCATCTG TAGACCAGGC 1200
CGTTGTGGGC CCGAGTTCAC TGTGAAGGTA GGGATGAGGT CCAGGGATGG GAAGTGGCGG 1260
AATACAGAGC GATAGGAGGA GAAGCTGTAA TTTTAAATTA TGTCCAGAAA AATAGCTTTT 1320
GGGAGGCAAA TGTTCTCCTC CAACTTTCTT ATTTTGAAAT TTTGCTAGGA AAGAAAATGT 1380
TACACTCCCC TGAGACCGTG TCCCATTTAG GAAGTTCTTT CTATTATCTC ATTTCAACTC 1440
CTCCCTGCTC TAGCTGCTAT ACAAACAAAG GCAAATTGAC TTAGTGTCTC TCCTGTCTCT 1500
TTCACCGTGG CCTGTTCAGT CTAGCTCAGC TCAGCTCAGC TCCAGAGCTT AGAACTCAAG 1560
ACAAAAGGAA TCAAACCAGT AGAAGGAGAT GAGCAATGGG TTCATCTCTC TTCCTTAAGA 1620
AATCAAAGGC CGGGTGCAGT GGCTCACGCC TGTAAACCCA GCACTTTGGG AGGCTGAGGC 1680
GGGCGGATCA CAAGGTCAGG AGTTCGAGAC CAGCCTGACC ACCATGGTGA AACCCCATCT 1740
CTACTAAACA TACAAAAATT AGCCGGGCAT GGTGGTGCCT GCCTATAATC CCAGCTACTT 1800
AGGAGGCTGA GGCAGGAGAA TTGCTTGCAC CAGGGAGGTG GAGGTTGCAG TGAGCCCAGA 1860
TCGCGCCACT GCACTCCAGC CTGGGTGACA GAGTGATACT TTGTCTCAGA AAAGAAAAAA 1920
AGAAAGAAAG ACAGAAAAAA GAAATCAGAA CCACCAAAAA ACTGCAAGAG AATTTTTTGG 1980
CAGTTCCATA GCTACTGAAA GCGTCTTGCT CTGCCCATGC GAGTGGCAAT GTTGGGACAC 2040
TGCATTCATG GAATGGAGCT CCGGAAGGGC CTTATGAGGC CGTCTCCTCA TTTTGCAGAT 2100
AGGAAAACTG AGGCGTATTT GCCATCACTC TGCTTGTTTG TAGCAAAACA GGGGCTCTCC 2160
TGCTTTCCCC TGTAGTTCTG AGCAAGAAAA GGGGTTTGAA GGGCAGCCTT TCAGCTGGGC 2220
AGAGCTGTGC GGGGAGTTTG CATCCAGTAC TGCTGGGTTC TAGCCCATTC CTAGGTTGGG 2280
CAGCTCAGCC TCTCCTAGAG GAGACTCTGG CTGCTGAGTG ACCCGGTGAA TTAATGCAGC 2340
TTCTGGCTAG GGGTAGGGGA CAGTAAAAGC CAAGGAGCCA AGATCAGAAA AAGGAATAGC 2400
TTCTTCCCAT GTGGAATCAA GCTGGGGCTG CCAACCTCCT AGTCAAGAAA GAAAGCTTTT 2460
CCTCTCTCTT CCTCCTGTTT ACCCACAGCG ACTGGGGGAG GCTGTACAGA GAGGCAGGTT 2520
GAATGTATTC AGTCTGGGAT AGGGAGGGAA AGTTCCTCTG GGGCTCCCCC TTCGTCTAGG 2580
GGAGAGGTCA GAAGAACAAA GGTCACAGAT GGACCTGCCA TGATATGGGA GGAGGCACAT 2640
GTGTTGCAGT GAGCCATGGA GGGTGGGGGC ACAAGAGTTT GGCAACTCAG ACAGGGGAGA 2700
AGCCACTGAT GGCTTATAAA CCAGACAAGG TTCATCCTGA ATCCGGAGGG AGGGCAGTGA 2760
GAGCCCCATG AACTCACTTT CTTGAATGTC ACTAACATTT CATTTCACCC TCACTCTGCC 2820
TTCCTGTCTC TTTTTTTCTC TTTCTCCCTT AACCTTCCTC AGCAGGGGAT GGGGGAGTAG 2880
AGGGAGCCGG AAAGGAGGTC TGCAGGCCTC GTTGACTCTG CTGACCATCC ACAGCCAGGA 2940
GCTGTTGCTG ACAGAAAAGA AATGAAGGGG CAGAGATGGG AGGGAAACCA GATGTCCGCA 3000
GTTGCAGCAC CATTCTGCGC AGCGTCCCCA CTGGGGTCCC TGCTGTAGAC GAGAAGCCAG 3060
AGCCAGGTGC CAGAGAGGGA GAGGGGGGGG TCTTTGGGGG TGGGGGACGG TGCTGGGCCC 3120
CACTCCTGCT TATCTACCCC TCAGTTTCTT TTACCTGGGA AACAGATCAC CAAGAGAGGC 3180
CCGTCTGATG CTTTAAGCTG GGAATTTGGT TTATTCTGGG GCAGATGAAA AAGAAATTGC 3240
ACTGTAGCAT CTTACAAAAC TGCCCCCTTT TCAACTGGGA CTGAGAGTTG GAGACTTTTC 3300
CTTTAGGCTT TCATGGTACC CTAGACTTCT AAGTTATTTC TACTTCATAT TCTAGAACTG 3360
TACCATCCAG TGTAATAGCC ACTAGCCACA GGTAGCTATT TATCCTTATA TTAATTAAAA 3420
TTAAGTAAAA TAAGAAATTC AGCTTTTCAG GCACACTAAT ATATGTCAAT CTCTCAATAG 3480
CCACATGTAG CTAGTGGCTA TTGTATTGAA CAGCACAGAT ATAAAAGTTT TTTCTCATCA 3540
CAGAATGTTA TCTTGGACAG TGCTGTTCTA GGAAGTTTTT ACTCAAGTGT AACTTTCATT 3600
CTTGATTTCC CCAGATGTTC ACATGATAGC CTGCTCCTTA GGAATGAGGG CTAACTGGCC 3660
CAGAGGATAG ATGTGGGGTG GGTTGAGACA GGGAGGAGGG AAGGGACGGG TAAGAATGTT 3720
TATTCTGCCA ACCCGAAGGT TTTCTTTAGA CTCTGAGTCT CTTTGCCAGT CCTAAGCAAT 3780
TTAACTTGCC TGGGGAGGAA GGGGGACGCT GTCTGTAGCA AAAGAGGAAT TCAGGTGGTA 3840
GCTACAGCCA AATAGGTTTT GCAATCATAT TCTGCCTCCC TTCTCCACCC CCTGCTTAAA 3900
AAAAAAAAAA CCAAGGAAAG TATACCAAGG CCAGCCCTAG ATAATGTGGG TGTGGTGTCA 3960
TTACCCTGAC TTACTCATCA CACCCCAGGG CCTCTACAGG GTTGGGTGTA GGCAGGGATG 4020
GAAGGGGCAC ACAGGCTGGG GATGAAGCAA GCAGTTATGC TTCAGTCAAT CTTGAAAGCT 4080
GTTGACATGA TGGAGATGGA ATGAGAGATG TTAAAGCCAG ATATTGGGCA CACCCAGCAA 4140
AGCCTCCCGC CCAGCTCACC CTTGAGCCTG CGCTGCTTTA CTCACATTAA GAGATCCGCT 4200
GGTGCAGAGA AATCACAAAG AGTACACACA CACACACACA CGCCTCATGC AGTTCCAGGG 4260
AGATTTCTGG AAAGAATCTT TAGCCCAATT TCTCAGTAAG CCTCAGCTGT TCCCCCAGGC 4320
TTAAGCGGGG GGCCAGCAGA TGGTCCCAGC TAAATAGGCA AGCCTCCCAG TTCCTCTAAA 4380
AGCAGGGTCT GGGCCCTTCC AAGCCCAACA GTCCAATTAA GCTTTTTGCC CACAGGTGGA 4440
AGCAAAAATG AATTTGGGGC CATTCTTCCC TTCTTTTAGG CATGGAGCAC TCAGCCCTCC 4500
CATCAGCCCC CTCCCTACTC CTGGCATTGG CCCATAAGGA ATCCCTGCCT CTCACACTCT 4560
GCTCTGAACA TTAGGTTCCT CAGGGATCAA AGACTCCCAG AAAGATTTCC TTCTAAGGTG 4620
TCTTCTAGGC TGCAGGGATT TGACTGAACC GTTCAAAGGA AAACTCCTGG CTTGGCCTTG 4680
TTAAGGAGGC CCTCTCAGTC CAGGAGGTGG GGCCTCTCAG GATTAAGGCC ACAGATCCAG 4740
GTACCTTCGA TGATGTTCTT ATTTCCTTTT CCCAAGGGCC AGAAAGTGCT GCAGGGAGAT 4800
CCTGGTGCCC TGCTCTTCTC TAGAGGCCTC TCCTCGCTGC AGAGCTCATT GGCATGACTG 4860
GCATAAATAT ATCCATATAT CTCTCTATAA ATATACATGT CTTTAGCTAT ATATATCTTT 4920
TCTTCTAAAG ACTTGGCAAG AATTCCCTAC AATCCTTTTC CATGACACTA TAGAAAATCA 4980
GCAGAGTCAT CAGTTTGATG GTTCCCACAA AGACTGCTTG GGGTTGACCT CTGCAAAGCT 5040
CCCTTGAATC TTGCTTCCAG TAACCCAACC TCTTCAGCCC TCGCCAGCCC CCAACCCCCT 5100
GGCAACACAA AACACAACTC GATTTCCTGA AGCTGAAGCT GCCCCTTTAT TCCTTGTTGG 5160
TCTCTGAAAG CAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAGGAAAAA AAAAAAGAAA CTATCACTTT 5220
TGAGCTATTG TCTTAAGAGA GTAATAAGCT TTGTGTTCCT CCAGCTGGCT GCAAAAGGGA 5280
ATTAGTTGTG CAGTGGGATC CAATGGCACT TAGAGACAGG TGTGGCAAGG AAGAGGTGCT 5340
GGTGGTTTCA GAATGGGCCA CATCTCTGTG GGTGAGCAGG AGGGCAGGGC AGATAGAGGT 5400
GGTGTCTATC AAGACTTAGC AACCACTGGG GCAGCAGACT AGATGTAGCC CTCCCTGCAA 5460
TGACTCCTTG CATAAACAGA AGAAACACCA GTGTACACGC ACAGGTGGGG AAAGCATCCC 5520
CATGACTTTC TGAGGGAGTT ATCACTAGGC ACAGATTCTG AGAGCGCTAT CTTCATCACC 5580
CTGCATCATC ATTTGTTGGA AGGAGGCCCA GGAGGGTAGG AGGAAAAGGC TGGCTCCTCC 5640