EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-03393 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr1:206896350-206898650 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr1:206898157-206898169GAGTAAACAGAA+6.27
ZNF263MA0528.1chr1:206898138-206898159AGGGAAGGAAGAGGGGAGGGA+6.06
ZNF263MA0528.1chr1:206898137-206898158GAGGGAAGGAAGAGGGGAGGG+6.27
ZNF263MA0528.1chr1:206898141-206898162GAAGGAAGAGGGGAGGGAGTA+6.63
Number of super-enhancer constituents: 13             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00569chr1:206896263-206899023Adipose_Nuclei
SE_26063chr1:206896911-206897832Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27575chr1:206896788-206897982Esophagus
SE_31968chr1:206896177-206898053Gastric
SE_40628chr1:206895804-206901110Left_Ventricle
SE_42239chr1:206895807-206899639Lung
SE_45992chr1:206895715-206899777Osteoblasts
SE_48186chr1:206895731-206898976Psoas_Muscle
SE_48619chr1:206895766-206899519Right_Atrium
SE_50514chr1:206896723-206897930Sigmoid_Colon
SE_51178chr1:206895519-206898417Skeletal_Muscle
SE_52589chr1:206896810-206897958Small_Intestine
SE_59174chr1:206876376-206918919Ly3
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1206896794206898600
chr1206897147206897463
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I206722chr1206895928206898137
Enhancer Sequence
CACATACCGC ACCACACACC CACAACACAC TTGGTGCCAG AATCAGCCTT TTGCATCGCT 60
CTTGGCGCTG AATCAGAGTC TGTCTTGGGG AGGGATGTCT TCCTTCTCTC ATTACATGCG 120
CCCAGCTTAG GTGGTGTAGT GAGGGAGTGT ACAGGGCTGG GATGCCACAG CCTGCTTTCC 180
TCCCCGTGTC CTGGGGTCCC CCGTCTGTCC AGTGCCCAGA GCTATTAATA ACACCTTCAT 240
TGAAATGGGT GTAATGGAAT CCCAGTTGCC CCCCCCAGTG GGACTCCAAC ACATGGGGAG 300
TGGGGAGCAG AATAATAATA GCAAACACGG ATGCAGTACT TATTACGTGC CAAGCGTTAT 360
TCTTAGTTAT TTACATCATG CACATCTATT AACTCATCTT GTATAGCAAG CCCATGAGGT 420
GGGGACTATT ACTGTCCTAT TAATGGGTAA GGGAACCAAG GCACAAAGGG GTTGGAAACT 480
TTTCCCAGTT CACATAGCTA GTGAGCAGTG GCGCTTGTGA AGGGGGTCCT CCTGAGGGCC 540
TGGGGCCTGC TCCTTCCCAG TCTTGTCTTC ATGTCCACCT TGCTGACGAG TGGCACATCA 600
GGCCCTGGGT GCCGGCTGCT TTCCTGTCCT CTGGCTCAGC CAGGCTTCTA ATGCTGACCA 660
CTCCTGAGTC TTTCCACGTG GCTCCACAAT GGCAGACTTG CAGGAGGAGA TGAGGGGAAC 720
CATGCATACC TTGAATAGGG GGAGGGGTCC TGTCCTTCTT CCCCTCAGGT GCTGGAAGAG 780
ACAGAGAGGC ATGGGACTGT ATTTAGGCAG CTCCCGCAGC TCCCTCACTG CCGCTGTCCT 840
AGAGCTTCCT TCCCAGGCAA TGCGCTCTGT GGCTTGGGCC CCTGCCCCTG CCACAGTTGG 900
CAGGGGGCCT TGCCTGTGGC GTTGCAGCTG AGCACACGCA ATCATTAACC TTTTCTACGT 960
GTAAGAGAAT TTCAGGCACA AACTGTGGGG CTGAGGTGAG TCACAATGTT GGACCGGGGC 1020
TTAGTTTGGG CTTAAAATAT TTCACAATTC CTCCAGGCAT TCTTTGACTA ATGATCTATG 1080
GCTTTTTAGT GGGAAGACCC TTCCTTCTTC TAGTCTCCAG TCCTCAGAGC ATGGTTCAGG 1140
GCCTGTTGGC CTTCACTGCC CATGGCCATG CCCATGCCCA AGGAGCAGGG GCCTTGGCTT 1200
CTGGGTGGAC CTGCCGCCTC GCTCTGCTGG TGGCCTCTGG CAGTGCCCTA GGAGTCCTGC 1260
TTTCCTTCCC TGTCTCTTCT TTGGCTTGGA GTGCAGGCCA CCTCCCCTGC TGTTCTTTAC 1320
TTAGCCCTGT ACTCCAGATT AGCACATTCT TGGTTTCCTC TCTCCAGGCC TTCTGCGCTC 1380
CACACTTGTC CACAGAGCCA CTTTGGCACT TCAGGGCTGT GCCCCCAGGA CGTCAGCCAG 1440
CCTGCCTCGC CCATCTGAAG GGCTTTCATT GCTTGGGTTG ATTTTCTTAT CCAGTCAGGG 1500
ATTTCTGATA AACATGTGCC TGGATGGATG TCAATGACCA GTCCTTTTTT TTTTTTTTTT 1560
TGTTAAATTT AATTTAAGTT CTGGAATACA AATGCAGGAT GTGCAATGAC CAGTCTTCAT 1620
GGGAAATTCT TGCTAAGTTT CTCTAAGAAA TTTAAAATAC TACCTTTTCC AATTTATTTC 1680
AGGATGGAAA GGACAGCTCA CCCTCAGTCA CTGGGGGAGA GAGTTTAGTA GGGAGAAGAA 1740
GCAACAGAAT GAGGGGGTGT TAGCTCAGAA GTTCCTAACC ACTAGGTGAG GGAAGGAAGA 1800
GGGGAGGGAG TAAACAGAAA TCAAATTAGA TCTTGCCCAT TAGAAACTCA GTTAGGTTGG 1860
GCAGATAAGG CATAAATATG CAAAATGGTA AATTTTTTCA AAGTGGAAAC TACCCTATAT 1920
AGAGTTTCTG AAGCACCTTC AAGGATATTA TTTCACGAAG TTGAATCTAA TTTTACAGAT 1980
GAGGAAACCC TTTCCAGAAA GATAGGTGGG CTTGCATGAC ACAAGCTAGG AAGTGCAGAA 2040
CTGGGATTCA AAATGCATGC GATTGCAAAG CCTAGGTTCA CTGTGCTACA TCCGTCTCCT 2100
CTAATGGGTA GAGAGTTTGT GCAAGTCTGG AAGTGTGATG TGAACCTAGC CCTTCTTGCA 2160
CAAACTCTCC TTTGCCTTGT GCCACGCACT CCTAACGTGT TCAGGGCAGA AAGTGCGGAA 2220
GTTGCAGTGA GCGCTTGGAA TTCAGGGGGT GCTAAGGAGC ATGCATTTAG ATTTGGATCT 2280
TGGTGCATCC TCACTTAGCA 2300