EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-03325 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr1:204261460-204266440 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RESTMA0138.2chr1:204266068-204266089TGCAGTACCATGGAAAGCTTA+6.1
Number of super-enhancer constituents: 18             
IDCoordinateTissue/cell
SE_06666chr1:204264675-204266436Brain_Hippocampus_Middle
SE_08425chr1:204265074-204266568Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_28816chr1:204262665-204264136Fetal_Intestine_Large
SE_28816chr1:204264392-204266746Fetal_Intestine_Large
SE_31690chr1:204261355-204262348Gastric
SE_31690chr1:204263134-204263799Gastric
SE_31690chr1:204264508-204266226Gastric
SE_37243chr1:204260462-204271182HSMMtube
SE_39222chr1:204262606-204267246IMR90
SE_50227chr1:204261359-204262386Sigmoid_Colon
SE_50227chr1:204262676-204263764Sigmoid_Colon
SE_50227chr1:204264504-204267158Sigmoid_Colon
SE_52903chr1:204261407-204262315Small_Intestine
SE_52903chr1:204262622-204263864Small_Intestine
SE_52903chr1:204264563-204266197Small_Intestine
SE_65374chr1:204261212-204262231Pancreatic_islets
SE_65374chr1:204264438-204265442Pancreatic_islets
SE_65374chr1:204265532-204266322Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr1204262810204263933
chr1204263200204264406
chr1204264279204264369
chr1204264529204264782
chr1204264870204266225
chr1204265400204266196
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I204292chr1204261217204267182
Enhancer Sequence
GAAGTGTTGG CTGAGATAAC CCACCTCATA TACCTGAGGC AAGGCTAACC TCGGGGTCTG 60
TTAACCTCAG TCCGAAGCTC TTTCCTCAGG GCCACAAGGA GCTGCCCCGA CCTGGCTGAT 120
GCCCACCTAT GTCCCTCACC CGGGCACTAT GTCCCTCACC CTGGCTGATA CCCACCTGTG 180
TCCCTCACCC TGGCTGACGC CCACCTATGT CCCTCACCCT GGCTGATGCC CACCTGTGTC 240
CCTCGCCCTG GCTGATGCCC CCCATTTCCC TCACCCTGGC TGACGCCTAC CTGTGTCTCT 300
TGCCCTGGCT TGGTCTTTGT GGTGCTCACC CAGCACTGGG TGGATGCTCC TGGAGCATGC 360
CAGTGGCAGC ACCTGAGAGG CTCCTGGGAT GGATGGAAAC AGGGTCAGGA CAGGTCAACT 420
AAGGGGAGCA CTGCAAGACA GGGAAGACTG ATAGAAATGA GGGATGCAAA GTCTAATTAG 480
ATCACACATT TGATGTGAAG AGGGGGAATA AAAAACAACC AAATGCCACT CCCAAGGCGG 540
AAGTCTGGAG GTTGTGGAAG CAGCTGGAAG CTGTTAGTGT TAGAGAGCTC CCGGCCAGAC 600
ACACGGCTGC GTTCCAGGCC TCTGTACCCC TCCCCTCCCG CCTCTTCTCT GTACCCTAAC 660
CTTCCTCCTC CTGGCATGGA GCCCCACCTC TCTCCCCCAA CTTGTTCTGA GGGTGGGATG 720
ACTGGGAGAG GGAGCAAGCC CACACTGTGG GAGTGGGGGA GGGAGCACAA AGTTTAAGGG 780
GCATCCAAAA ACTCAGTAAT CAGACTTTTT TTTTTTCTTT GAGATGGAGT CTTGCTCTGT 840
CACCCAGGCT GCAGTGCAGT GGCGCGATCT TGGCTCATTG CAACCTCTGC CTCCCAAGTT 900
CAAGCGATTA TCCTGCCTCA GCCTCCCAAG TAGCTGGGAC TACAGGCATG TGCCACCACA 960
CCCAGTTAAT TTTTGTATTT TCAGTAGAGA TACGGTTTCA CCATGCTGGC CAGGCTGATC 1020
TCGAACTCCT GGCCTCAGGT GATCCGCCCG CCTTGGCCTC CCAAAGTGCT GGGATTACAA 1080
GCATGAGCCA CTGCACCCGG CCAATCAAGA CTTATTTTAA CGCGATATTT TTGAAATAAA 1140
AATTAACATT AAAAACCCAT GATGAATGAA ATACCAACAT TTCAAATAAA GACAGGACCA 1200
GTATCACTGG AATTTCCCTT TTGCCTCAGC CTCCAATTTG GCTTAAAGTG GCACTGTTTT 1260
AGATCCTGTC TTTATTTCGA ATGTTACTAT TTTGTTCTTC ATGAAATGTT TGCATTGATT 1320
TTGATTTTAA AATTATTGCA TTGAAATGTT ATTTATCTTG ACTACCGAGT TTTTTGGCAC 1380
CCATTTGGCA AAATGTAAGA CATTTTGTAC CTAAGGGGAG TGTATTAATC GCCTTACTCT 1440
AGTCAGCCCT GCTCAGGGAT GAGGAAAGAC GGGACAAGGC TCAGGAAGTC CCAGAGAGGA 1500
TCCTGTGCTC TTTAAGAAAA CTTCAATGCA TGAACATGGA GAAAGGCTGA GGGACTTTCC 1560
AGACTGAGAG GAAAGAGACA TGATCCTGAA TTGGATTCTA ATGACATTAT TAGGACAACT 1620
GGTGAAATTT CAATATGGAC TGTATATTAG ATAATAGAAT TGTATCGATG TTATTAAGTT 1680
TCCTGAGTCT GTTAATTGTA CTGTGGTTAT GCAAGAGAAT GTCCTTGTTT TTAAAAGGAA 1740
AAAGAGAAGA TGAAGAAAGA GTGGCCAGAG CGTGACAGCT GCTTGACAGC TGCATTAAGC 1800
CAAACACCCT TCTCTCTCTC CAGCCTGTCT CTCCTCCAAT TCCAGGCCAT CCCAGGAGGA 1860
TACGGAGGAA GTGGTGATGG CAGAAAATCT TGTCCAGAAG ATAGGGTACT GGAGGGCTGG 1920
TTGGACATTT CTTCTTGAAA TAAGAATTAA CCTTGAATTC CCAAATTACC CTTCACCCTC 1980
CCAGGAAAAC TTGACAACTA GCACAGAAAG AAAAAGGAAA TTAACACCTA TCCAAGTCAT 2040
GATGCTAGCG AATTCTCTGC TTAACCCCCA GAGATAGGTA TTGCTGTCCT GCTGTTGCGG 2100
AGGAAGAACC TGAGAGGTCA GGTTATTAGC CCAAGGCTAC ACAGTTAGGA AGTGAGAGAA 2160
CTGGGATTAG AGCCCAGGAC ACAGCCCAAA GCCAGCTTTC TTCCCACTTT ATGTTAGTTG 2220
TGCAACTTGA AATTCCCTTC TCATGCATCA TCCTACCAGC TAATCCTTTC GTTTATTTTT 2280
ATTGAGTTGA ATCCGCATTA GCCTTGAGAT TTTTGGCTCT GGAGTCAGAC TGCCCCAGTT 2340
CCAATCCCGG CTCCACCAGT TACTACCTAA GGGACTCTGG GTGAGAAACT TAACCTCTCT 2400
GTGCTTTCAT TCCCCCATCT GTGAAAACGG GATAATATAC GGACCTTCTT CATGGGTTCG 2460
TCACAGGAGT AAATAAGATT ATACCCACAA AAAATTTATG AAAGGTTCTG GCACTTAGTA 2520
AATGTTCAAT AAATGCTAAT AATCATTATT ATCTGTCTGC ATCTGCCTTG GGCTATTTAT 2580
CCTTAGGAGA CAGTGGCTCA ATTTTGATTA TAAAACCCCT CACCACTTTG ACACCTACAG 2640
ATGGATGCTT AATAATTTGT TCCTAAAGAA GTTATCCATC AAGATAGTAC CCTCTCCCCT 2700
GTACTTAGGA GCCAGAACAA TTAACACCTG AGAATCTCAA ATGTGAGGGA GGTCTGTTCC 2760
TAGTGTAATT TGAACTGGGA GGTGGGCTTT TGTGTGTGTG TCATGGTTGA AAGCAGTCCA 2820
TTCTAAGGGT CAACATTACT GGACAGAAAT AATTGACTAA GAAGACCCAG TTCTAGGCCA 2880
GGCGCATTGG CTCATGCCCA TAATCCCAGC ACTTTGGGAG GCCAAGGTGG GTGGATTTCC 2940
TGAGGTCTGG AGTTCAAGTA CAGCCTGGCC AACATAATGA AACCCTGTTT CTACTAAAAA 3000
TACAAAAAGT AACCAGGTGT GGTGGCACAC GCCTGTAGTC CCAGCTACTC GGGAGGCTGA 3060
GGCAAGAGGA TCGCTTGAAT CCGGGAGGCG GAGGTTGCAG TGAGCTGAGG TCATGCTATT 3120
GCACTCTAGC CTGGGTGACA GAGGGAGATG CCATCTCAAA AAAAAAAAAA CAAACAACAA 3180
AAAAAAAATT CTAGTGCTTA TGCTGCTATC CAGCTGCATA AGGTGTGTAG CAAGTCCTTG 3240
TTCTCTTGGG GCCCACTAGA CCTGAGAAAG GGAATCTCAT TGCCCCTAGA GCAAATTATA 3300
GGACAAAAGA GCTGCTCATC CTGAGCACCT TCGGTTCTTC AGGGAAGCGC TCCTTCCAAA 3360
GGCTGCCTGC TCATCTGAAA CCCTCACCCC ATTTTAGAGG CTTAGATTCA GCTGGGGAGG 3420
ACCCACAGCC CGAGAAGGAA AACAAACCAA CAGATTATGC TTCTAGGTGG CCACAGCAGG 3480
CCAAGCCAAG GGCAGGGTGG CCAAAGGTCA AGCAGCAGTC AGACTGAGCC AACACGAGCC 3540
TCCTGTGACA AAGCCAGAGC CAGAGCAGGG CAATTTTCTA ACTATAAACG GAAACTCAAG 3600
AAGCTCCAAA CCGCACAAAC ACACGTGGGA AGATGAGGGT AAGGCACAGA AGCTACGGGG 3660
TGCACGCACA CAGAGGAAGG GGCTTCATGA CGTGCAGGCA GGGGACCAAG GAAGGGCATA 3720
TGTGTCAGTG TCGTGGATGC AGCAACAGAT CTGGGTTTCT GGGGTCCTGG AGCTTATACA 3780
ATTTGTGGTG GGAGGGGCGT GGTCCTCATT AAGGAAAAGA CTATAGGTAC AAATTTGTGT 3840
GTTAGATATG GCCTTGGAAG GGGCCAGTGC AAGTGCATCC TCCTCCCCAT GTGGATTTCT 3900
GAACACTGGT GCACACTCAC ATGCGTGTGT TTCGTGGCCT CCTGGTTCCC GTCTCAGCAC 3960
TATTTCTCTT TCCTCTCACA CAGTGCTTTG CCTGATTTTT TTTTTTAATG GTAGAGAGCA 4020
TGAATTAAAG CCCCCACATC TTGGAATTCA ATTCCTCTCC AACACATGTG ATGGGCATTT 4080
AGATTTTGCA TGCCTTCCCC TACCCTCCTC CAATGCCCTG CACCATCATC ACTATCTACC 4140
AGAGCAGAGT CCCTCCCCAC TCCCCTACTC GCTTTGCTGT GGGTAGCCCC ACCTTCCCCA 4200
AAGGGCATTG CAGCGGCCCT CTAAGCTGCC AGAAGGGTGA AACCACAGCT CCCCCCAGCT 4260
GCCTGGCCCC TTGCATTCCA GCCCTGCACC CAGAGTTTGA CCTTCTCTGT GGCTGGCTGC 4320
AGACGTGCTC TGTGTTACAG AAATAGTCCA GCTCCTGAGC CCCTCCAGGC CTCCCTCTGC 4380
TTCACTCAGA GACACCCCCA CCTCACTGGC TCCAAAAGAG TCAGGCAGGA TCAGAGAGAA 4440
GTGCTCCGTT CTCCAGCCTC CTCCCACACA CTACTCAGAG CAGAGAGTGG GGCCTGCCTG 4500
TTCCCCTCCT TCTCCTTCCA GCCTCAGTAC TCTGTGTCTG CAGAGAGCGT GGACGGAAAT 4560
GAGAGGTTTG AGGCATCGCA GAGTGAAGGG GAGCAGAAAG AAAAAGCCTG CAGTACCATG 4620
GAAAGCTTAT GCAATTTGAC CTGAAGAAAG GAGTTCAGAT TTAGGAACAT GGCTATTACC 4680
ACCATAACCA GAGAGCCACC GTACCCATCC CTGCAGATTT CTTTTTTTAA ACTACCAGCT 4740
CCATGGAGAG AGAAAGGAAA AGAATTTAGT GACAACAGTA GAGATAAAAT CCGAATCAGA 4800
TGGAGAAAGT CACTAACTAA CATATCCTTC TTCCTAGAAA GAAAAATCTC CTGGCTCTAA 4860
CATTTGTCTT TGATGTGACA TTTAACTCCT AAACACTACC TTCTGGTAGG AAAATACATG 4920
GATACATGGA GTGTCTAAAT GTAAATTTCT CTTGTTGGAA AGTCTCAAGA CAAAGACTAA 4980