EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-02950 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr1:179109570-179112060 
Target genes
Number: 11             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr1:179111617-179111627TTTAATTAGA-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:179110820-179110838ATTTCCTTCCTTTCTTCT-6.36
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:179110824-179110842CCTTCCTTTCTTCTTTCT-6.56
Nkx3-2MA0122.3chr1:179110906-179110919ATATCCACTTAAA+6.41
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
SE_36579chr1:179109514-179114792HMEC
SE_38819chr1:179108447-179114258HUVEC
SE_46058chr1:179108548-179114790Osteoblasts
SE_63943chr1:179109677-179113945HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1179110934179111289
chr1179110615179111403
chr1179110907179111290
Enhancer Sequence
CTCCATAGCT CTTATTACCA CCAAACATAG TGTATAATTT ACTTATTTAT TATTATATTC 60
ATGTATCTAA GTCTCCTTGC TAAAATGTAA GTTTTATGAG GACCAGGATT GTTGTCTGTT 120
TTGTTCACTG AACAGTGACT CCAGAACAGT GTCTACATAT AAGAGGCTCT CAAAAAAGAT 180
TTGCTGAATG AATGAACTAT GTATACATCC TTACTCACAG AGGATGCTAT GAGAGGAAAG 240
AATATAAAAC AAAACTCTAG AGTCTGGCAA GGTTTCAGAC TTAAAATTAG ATAAACATTT 300
AAACTGGATG AACGCAGGCC AGGCACAGTA GCTCATGCCT ATAATCTCAG CACTTTGAGA 360
AGCCAAGGCG GGAGGATCAC TTGAGGCCAG GAGTTCAAGA CCAGCCTGGG CAACATCATG 420
AGACTTCATC AGGTGTGGTG GCTAGCGTCT GTAATCCCAG CACTTTGGGA GGCCGAGGTG 480
GATCACCTGA GGTCAGGAGT TCGAGACCAG TCTGGCCAAC ATGGCAAAAC CCTGACTGGG 540
TGTGGTGGCG GGTGCCTGTA ATCCCAACTA CTCGGGAGGC TGAGGCAGGA GAATTGCTTG 600
AACCCGGGAG GCAGAGGTTG CAGTGAACTG AGATCAGACT GCTGCACTCC AACTTGGGTG 660
ACAAAGCAAG ACTCTGTCTC AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AATTAAGTAT TGGCTGGGCA 720
TAGTGGCACA CAACTGTAGT CCCAGCTACC CAGGAAGCTG AGGTAGGATT GTCTGAGCCT 780
GGGAGGTTGA GCCTGCAGTG AGCCAAGATC ACACCATTGT ACTCCAATCT AGACAATAGA 840
ACAAAACCCT GTCTTTAAGA AAAAAAAAAA TTAGATTAAT AGGAATTCTG CACTGATGAC 900
AGTAGAGTGA CAGACTGTCA ATACGCAAGG ACATGTTTAT AATAAGGGGA AACTCTGAAC 960
CCAAAAGAGG ACTCTTAAAG ACAAGTCAAC TTCCTGAAAG TTGTGTTATC TGACAAAAGG 1020
AGAAAACAGA ATGAGATCTA CAGCACGATT TTATGTAAAT TTAGAAGATA TATGCAGGCC 1080
AAACAATATT ATATTTCTGA AATATGTAAA GTAATAACTA TAGGATAAAA GTAATTTTTG 1140
AGGCCAAAGT ACTAAAAGAA CCACAACTTA GAAAACAATC CTTCTTATTC CCCATTCCCC 1200
TTCTTCCCGT CTCTGGTTTT ACGGTCTTTT TGGTTGAGTC AAAAGATCTT ATTTCCTTCC 1260
TTTCTTCTTT CTTCCCACTC CTCTTTTGTT CTCAAAGAAC TTAGGGTCAA TTTCCTGCAC 1320
AATCTGTCTG CACAGGATAT CCACTTAAAC ACCATTCTAC CCATTAGCAC CAAACAAAAG 1380
GAAAACTTTT TCAAAGAGAA AAACACCCTA ACATTTTTCT GAAGCTAAGA ACGAACATAT 1440
TTTGAATCAT AAAGAGTAAG GGAACTAAAT GAGGGGGAAC AAGATAAGGG ATAAAGGCAA 1500
AAACAAAAGA AAACAAAAGC CTGTGGGAAG AGCAAGTAAA TGTCAGTGTT ACCCAGTAGC 1560
TATAGTCTAT GTCACTTTCC TCATTGGTTA AGACAGACAT GTCTGGATGA TTCAGATGTA 1620
CTGTATACGC CCAAATGCAA GTGTGTGGGC TGGGAATGGT TTATTTTTGA ACAAAATGAA 1680
ATGACTACTA TAAATTAGGT AACTTAGATA TCAAGTTAAC TTATCTTCCA TTATTCACTG 1740
CTATAGAGGT AGATCAGAGA TTTAAGATGG GATAAGAGAA GACTGATTTT CACTCACATG 1800
TAAAGAACCT AGATAACAGA AATATATTAT CACAATTTAA AAAAGGCATT TTTTTTCTAT 1860
TGCTACAGTT GCAGGCTACA ACAAAAATAA AGCAAAACAG AATAGCCACT TGTACAAAGT 1920
AAATTATCAT GATTGAAAAA GTTAAAACCC AAAATAATAA AACTGAAATT GAGAAAATTC 1980
CTAAGCTTCA TGTTTAATTT TATTAAAAAT ACTTTTCACC AGTTAGTCAT TCAGTAACTT 2040
TTATCAGTTT AATTAGAAAT TTGTCAGGTA GTAATAGGAG AAATTAATAT TACAAATTTT 2100
TAGTTTAGGC ATTTTCAAGT ATTTTATAAA CATTATCTTG CCAGAATTCT ACTTTATCTG 2160
ACTGTATATT CTCTAAGAAG CTAATAAGTT TTAATAACTT CTTTTAAAAA TTATGTAAGG 2220
TAAATTATTC AACAGTTTTC AATATAGCTT AAGTTCTTCA CATCAAGCCA TCTATATCTT 2280
ATTATTACAA AATACTACAT ATTATCCATA CATTCTTCCA TTCAGTATTT ATTGAGATCC 2340
TACTATGAGA TATTCCCCCA AGAAAGCACA CAAACTTTCA CTGACCAAGA ATGAAGACAA 2400
AAACAGTAGC AGATAAGATG AATTTTTTGA AATCTTCATT CACACTTGAT TAATGTGGTT 2460
ATCAAGCCTC CCTGAAACTA TCAACTCTGA 2490