EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-02785 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr1:170378300-170381500 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs4656767chr1170379727hg19
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:170378982-170378994GATTATTTGTTT+6.07
GFI1MA0038.2chr1:170379634-170379646AAAATCACTGCA+6.11
LMX1BMA0703.2chr1:170379467-170379478AATTTAATTAA+6.32
MEF2AMA0052.3chr1:170378691-170378703TCTATTTTTAGT-6.27
MEF2BMA0660.1chr1:170378691-170378703TCTATTTTTAGT-6.32
MEF2CMA0497.1chr1:170378690-170378705TTCTATTTTTAGTTT-7.18
NR2C2MA0504.1chr1:170379961-170379976TGCCCTCTGCCCTCT-6.62
ONECUT1MA0679.1chr1:170378628-170378642TATATTGATTTTCT-6.05
ONECUT2MA0756.1chr1:170378628-170378642TATATTGATTTTCT-6.26
ONECUT3MA0757.1chr1:170378628-170378642TATATTGATTTTCT-6.48
PHOX2AMA0713.1chr1:170379466-170379477TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr1:170379466-170379477TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr1:170379466-170379477TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr1:170379466-170379477TAATTTAATTA+6.62
SPI1MA0080.4chr1:170380774-170380788TTCTTCCTCTTTTT-6.14
SPICMA0687.1chr1:170380774-170380788TTCTTCCTCTTTTT-7.01
TCF7L2MA0523.1chr1:170379109-170379123TTCCTTTGATGTGC-6.49
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1170379973170380371
chr1170379647170379894
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I170409chr1170378987170380770
Enhancer Sequence
TCTACTCTCT ATTTTTATGA GATCCACTTT TATAAGTCAC ACAGATGAGT GAGAACATGT 60
GATATTTGTC TTTGTGTGCT TGGCTCGTTT CACTTAACAT AATGACTTCC AGTTCCATCC 120
ATCTTGCTGC AAATTACAGA ATTTCTTTTT TTATGGCTGA ATAATATTTC ATTGTAGATA 180
GATAGATAGA TCACATTGTA TACCACATCT ATATACATCT CACATTTTCT TTATCCATTC 240
ACCCATTGAC GACCACATAG TTTGATTCCA TATTTTGGCT ATGGTGAATA GTGCTGCAAT 300
AAACACAGAA GTGCAGATAT CTCTTTGATA TATTGATTTT CTTTCTTTTG GAGATATACG 360
CAATAGTGGA ATTCCTGGAT CATATGGTAG TTCTATTTTT AGTTTTCTGA GAAACCTCCA 420
TACTGTTCTC CACAGTGGCT GCACTCATGT ACATTCCCAA CAACAGTGGG AGGGTTCCCC 480
TTTCTTTACA TTGTTGCCGG TATCTGTTAT TCTGTCTTTT GATAAAAGCC ATTCTAACTG 540
GGGTGAGATA ATATCTCATT GTAGCTTTGA TTGCATTTCC CTGATGATTA GTGATGTTGA 600
GCATTTTTCA TATACCTGTT GGTCATTTAT ATGTCTTCAT TTGAGAAATG TCTATTCACA 660
TATTTTGCCC ATTTTTAAAT CGGATTATTT GTTTTTGTGC TATTGAGTTG TTTTAGCTCC 720
TTATATATTC TGGTTTTGAA TCCCTTGACA GATGGATAGT CTGCAAATAT TTTCTTCCAT 780
TCTGTGGTTC TCTTCATTTT GCTGATTGTT TCCTTTGATG TGCAGAAGTG TTTTAGCTTG 840
ATATAATCTC ATTTGCCTAT TTTTGCTTTT GTTGCCTGTG CTTTTGAGGT CTTACACAAA 900
AAATCTTTGC TCAGACCAAT GTCCTGGAGC ATTTTCCCAA CATTTTCTTC TAGTGGTTTC 960
ATAGTGTTAG GTCTTAGATT TAAATATTTA ATTCCTTTTT ATTTGACTTT TGTATATCGT 1020
GAGAGATAGG GTCCTAGTTT TATTCTTCTG CATATGGATA TACAGTTTTC CCAGCATCAT 1080
TTATTTAAGA GGCTGTTCTT TCATCATTGT ATGTTCTTGG CTCCTTCTTT GTTGAAAATG 1140
AGTTGTAAGG AAGATTCTTT AATCAATAAT TTAATTAACT CAGCCATACA TCCCCCTAGA 1200
GTAGGCACAA TACCAAATTA TTTAGTTTTT GGACACTCTC TAATGTATTT TCTATCCTAA 1260
ATAGATATTG TTAAAAGCAT AGATTCCTAT ATGGAGCCTT ACTTTTTGGT TAGGATTTGT 1320
CCATACATTA AAAAAAAATC ACTGCATTCT GAAATTAGCT AAGACTTTAG TCAAGTACTT 1380
TCCCACCAGG GAAAAGACAG GAATTAAACT GAGACCTTAC GCATTCAAAT AAATGTTCGC 1440
AAGAGCTAAG GAATGCTTGG TGTGTTCACA ACTAGTAAAA ATAACCTAGG GTGAAGAAAG 1500
ATGACTGAGT CATCTCATAT TCCAGACCCA CTTTTTAAAA ATCCTAACTT GAAGGTCAAA 1560
AAAGTTCAGT AAACTTCTCA TTTCTATTTT TTTCTCCTCC TCTTTCTTCC TTTCTTTGTT 1620
GCTTTCTTTC TTTTCTTTTT CTTTTTTTTT TTTTTGTACT GTGCCCTCTG CCCTCTGCAA 1680
TTCTTGGCTC TTACAAGAGT AGGGGAAAAA CTGCCTAAAT ATCATGAGAT AGGTGGCCCT 1740
CAGGGGTACT TCTTGTCAAG CAGGAAGTGC CAAAGATCTT GTAAAATGTC CAATACAAAT 1800
TTTATTTTGC AGACTCTAGA GGTTTGCATC TGGATACACA TCTGCATTTT CTGGGTGCTG 1860
GGCCAAACTG AAACATTCAG TTTATCCATT GCTAATAAAC ATGTCAGCAG TTTCTTTGCT 1920
CTCACATCTG TTGTGAAAAA TGTTATCTTT CCTGAAGTAT ATTTATTTTG TCTTTAATAC 1980
CAGCTTTCAT GGATTACAAA CTCAAGATAT GCCTTCAGTT AACAAATTCA AAAGCATATG 2040
CTGGAAGGTG CCTCACTAGA GTGATGAGAT AAATTAAAGA TGTATATTAT ATCTTAGATT 2100
CTGAAGAGGA AATCAGTGTA AGGAATAACG ATGACTCTCA GGAAGGTTAT GTCAATTGAA 2160
ACAAGTTGCC TGTTAATCAA GTTCATCTCA AAATCTATTC AAGGTACTCT ATGCATCACA 2220
GCAATTCGAC AAAATGTTTT AAAAATTTAT CAGTTGTTTC ATTATTAAGG CTGTCTTCAG 2280
TCAAGCAGAT GACTTCCTTT CCTAAGGAAA CCACCCCCAG GTACTTGCTT CTCCTTCTAT 2340
ATTCTCTAGA ATACTTGCTT TACCCAACTC ACTGATAGTG GGGCTATTAG AGAATCAAAT 2400
GAGGTTTTGC TTATTCAGAT GTCTGAAAAA GAAAACTGTA AGTTATTATG TGAATGAAAA 2460
ATAATTGCCA ATATTTCTTC CTCTTTTTAT TTTTTCATTT TATCTCATAG TCAAGTGTAT 2520
TCATTTCAAG AATTCATTCC ATCCTCAGCA ATTCTATCTC CTTGTCTTCC CTTATTAATC 2580
GCTCACCCTG TCAAAATATT TAATCGGTGG GAAATTGTTA TCTCTCTCAT ATAGGTAAAA 2640
ATTGCATTTT TGGAAATTCA CCAGTATGTA GTTTAAACAA GCAAGTAAGA AAATCTTAGT 2700
ATCAAATGTA TGGTAATGTG ATTAGGGCTG TCAAAGGCAT ATGTGTATCC TCTTCAGACT 2760
CTGATGTTAT GGATATTCCT AATACCATAT ACCACCCTGT CGAACCCAAA GCTACTTTCT 2820
GCCCAACTGG GCAATAGCCA ATCTCTGCTA AAGTCAGGGA GGGAATGGTG TGAAATTCCT 2880
TAACCTGTCA CCTGTTCCTT CAGCAAACTG TGAACTCATT TATGAAGTTA TTTGCTAAAG 2940
GATTAGAGCA ATATCAGAAA GAAATGTACC ATTGAAGGAA TGGTGATGCG TTAATAAAAG 3000
AAAAATCAAA GATCCAATAG AGAGGATCAA AAAAGCCAAA AATGTATCTT CTAAAAGTCT 3060
AATAAAATTG ATCCACTTTT GGTAAGATTA AAGGGAAAAA AAGGAGGCAC AGATGAATAA 3120
TATTATGAAT ACAAAAGAGG ACACAACTGG AGAAGGAACT CCGTTTAAAA AGATAGCAAG 3180
AGACTATCAT TAAAGCCTCT 3200