EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-02453 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr1:151952060-151955380 
Target genes
Number: 10             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6587640chr1151955230hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HLTFMA0109.1chr1:151954271-151954281AACCTTATAT+6.02
IRF1MA0050.2chr1:151954644-151954665AAAAAAAAAAAAAAAGTAAAT-6
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00284chr1:151951696-151968835Adipose_Nuclei
SE_23217chr1:151952725-151953403Colon_Crypt_1
SE_27992chr1:151952928-151954104Fetal_Intestine
SE_33866chr1:151952354-151954192HCC1954
SE_34778chr1:151952258-151954373HeLa
SE_45267chr1:151953202-151954009NHLF
SE_47215chr1:151938610-151969225Panc1
SE_56104chr1:151952113-151954128u87
SE_64176chr1:151952790-151954114HSMM
SE_67706chr1:151952113-151954128u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1151952407151953865
chr1151953896151954151
chr1151954897151955036
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I151979chr1151952401151954214
GH01I151982chr1151955221151955370
Enhancer Sequence
GGTCGTGTGA ATTACATACC TATCAACAGT GACCAGAGGT GCCCATCACA TGTCTCCCTT 60
GCCAATGCTC TGTTGTGTTG ACGGAGTCTC GCTCTGTCGC CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC 120
ATGATCTCGG CTCACTGCAA GCTCCGCCTT CCGGGTTCAC GCCATTCTCC TGCCTCAGCC 180
TCCCGAGTAG CTGGGACTAC AGGCGCCCAC CACTGCGCCC AGCTAATTTT TTGTATTTTT 240
AGTAGAGACG GAGTTTCACC GTGGTCTCGA TCTCCTGACC TCGTGATCCG CCCGCCTCTG 300
CCTCCCGAAG TGCTGGGATT ATAGGCGTGA GCCACCGCGC CTGGCCTGCT TTATCTATTA 360
TCTTTCAATC TAGATTGTAA TCTTCTTGAG CAGGCACTGT GGTCATCTGC TTCTTCGTAC 420
CTGCCTTTAT ACAGAACATT GCTTGGTGCC ATTCACATGG TAGCCCTTGC TAATATTTGC 480
CAAGTGAATG AATTTCTATT CACAACTATC CCTGTGGGGT TAAGAGCTGG AGAAGGGACT 540
TGAACAATTA CTTGACCAAT CACGAATTGG TCAAATTTGA ATGAGAGAGG TTTGTAGACT 600
TGTCCTCGGT CTCCTAGTGA GATGGGTTAG GTAGAAAACT ATTAAATCAC AGGTAGTTGG 660
CCGCTGTTCA GGGGACTTGG ACAAGGGAGT GGGTCCAAGA GAGAAAAATG ATGTTTTTCA 720
GGGTCAGCTC TGCAGCGTGT TGGAAACTGA CTTTCTGCAC TGCTATTCAT TCTTTTTTTG 780
TAACTGGGTG TGGGGAGGGG CGGGATCTAC TTTTTACAAC TCAGCCATGT AGCAGAATGA 840
GTGGAATTTT CCAGATGGTT CCTCTTGATG ACTGTTGGCA TAATGGCAGT TTTGCCCCTT 900
GGGAGCCATT GGGCTGCAAC CCCTGAAGCC TAGACAGCAG TTTTAGCAGG TCAGATTGTG 960
GGATCCGTGT GTTTTTGTTG GCACAAAGAG CCATGTGGGA TTTCAAGCCA TAAATACCAT 1020
TTTTATTTTC CTCATACAGC TCCCTACTAA ATGAGCAATG AGGCCAAAGC GAGGAAGGTG 1080
CCATAACCCT TTCCCTCAAT ACACATACAC ATCCATCCCA AATACAGTGA CTCAGATCAT 1140
TTCCTGGCAC TGGGCACCTT CTGAATGAGA GTTTGGGGTA ATCTGCTGGG AATAACACAT 1200
TGCTTCAGAA TTTTTCTGAA TCTACACACC CACTGTGAAG ATGAGTTGAT GCTTCCTTTC 1260
TCTTACCCTG AGAGCCTCCC TCCTCCTGGG ATAGTTGTGT TTTTGTTTTC AGGTAAAAGA 1320
GGCTTAGAGT GTGAAAGTTT GCTATGGATT TCAGGACATG TGAGCTCATA ATATCTCCCT 1380
TTTATAATCT TCCCCATTCA TTTGTGAGTT GACCACTAAT CCTCCTAATA CCCAGTAAAC 1440
ACAGTTGCCC AGGAGGCAGG TTAACCAAAG GGGTGAATCT GGACTGACAC AAATTCTCAT 1500
GGATTGCCTT ACTGTGATGG GCCAGTTTTT TTTTCTTGTC TCTATTACAG ACGTCATCTT 1560
CCAGAGCCTC CTTTCCTTAG AGCCACAATT TCTTTAACTT CCAGGTTGGA AGACTTCACG 1620
TAGGATTAGG AATTGTCACT GTGGTAGAAT CAGCTGCTAA TGTGCAAAGG TTGGAAAATG 1680
TTAGAACTTT ATTTCCCAGA GTCCCTTGCG GTTAGGAATT TGTTGTGGTT AAGGCTCTGC 1740
CAGTCAGATG CACCTCACTG AGACTTGGAT ATGAGAGCCC AGCCGTATGT GGAAAGAGGG 1800
AGGGTGATGG GGATGTGCGT TTGCTTGTGC AGACTGTGCC ATGGTCCTGG AGCAGCCAGC 1860
TGTGGCTATG GCTCCTCATT CAGCAGGCAG CTTCCTGAGC CAGCAGCTCC TTGGCGGCCC 1920
AGTTCTGTAG CATGGGTTTG GAAGTCATTC CTGGAGTCAA TCTAGAGTCA CTTCTTTAAC 1980
TAATCAACTC CCCTCCTTCA TTAATACTCC CGTAATAAAT TCCTCTTTGT AAACTTGCTG 2040
ATATAATGCT TCAGCCGCAA AGCTATGGTT TGTTTTACAC TGTTCATTTG TTGACTGAGA 2100
AAAAATAAAA TGGTTGGAAT GTTTTCCTTT TTTATTATGG ATTTCTTTCT ACCAAAGCCA 2160
GTTTTGAACT ATCCTGTTCT CTTTTGCATG CTTTTCCTTG TGACTATCGA TAACCTTATA 2220
TTGCACTTTT TCCCAGAGTG AGATGGAAGT TTTTCCCAGA GTTAATATTG ATGTGTCCAA 2280
TCAAAAAAGT AAATATTCCA GGCCGGGCGC GGTGGCTCAC GCCTGTAATC CCAGCACTTT 2340
GGAAGGCCGA GGCGGGCAAA TCACAAGGTC AGGAGATCGA GACCATTCTG GCTAACACGG 2400
TGAGGCCCCG TCTCTACTAA AAATACAAAA AATTAGCTGG GCATGGTGGC AGGCGCCTGT 2460
AGTTCCAGCT ACTCGGGAAG CTGAGGCAGG AGAATGGTGT GAACCTGGGA AGGTGGAGTT 2520
TGCAGTGAGC CGAGATTGCA CCACTGCACT CCAGCCTGGG TGACAGAGCA AGCCTCCGTC 2580
TCAAAAAAAA AAAAAAAAAG TAAATATTCC ATCTTCTTTG ACCTATTTAC TTGGAACAAT 2640
GCTATGTGCC AATTCATGGA ATTCATATAT CACCTCTCCA TAAAAGCATA GAGTACTGTG 2700
TTATTAATAA GCATATAGCA TTGATGCACA TATACCCTGA AGCTTCTAAC AGGCACAAAA 2760
AAGGGCTAGG AGGAACATTT TGCATTGATT ATCAAGACAT CAGTACTGAC ACTTCATTTT 2820
CAACAAAAGT GTACTGCCCC GTGTATAAGT CATGCCTACC ATATTTCCTG ACATCTGGGA 2880
GTTGACTTAA TAGATGCTAA TGTGATGTTA TTACCAAGGT GTCAAGCTAC ACCCTCTCCT 2940
GATTGGTTCT CCTAGTTCTG CCTTAGGTTT GCTGACACTT TGCTATGAAA ATTGGATTCA 3000
GACATTGCAG GCATGCAAAG TGCTGGCTAG AAAAGCACTG ATTTAACTGG GCAAAACTGT 3060
GCCCAGTAAT TATAAACTTA CCATCTATTC CTGTAGAGCC TTCTCCTAAT CCTTCAAGTT 3120
TGAGTCCTTC ATATAGACAC AGCTACAAGG GCAGAACAAT TAGAGAAGTC AGACTCCAAG 3180
CCTGAATGAA GAGTGTTTTC TCATTTTGCC AGTTCTGTGA GAAAAGCTCT GCTGTGTAAG 3240
AAAAGCTCTG CTGTGTGCTG GCTGCCCAAG GGCAAGCTGC CTCTTGGGGA ACAAGAATTT 3300
CTGAGGGAAC AACAAACATT 3320