EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-02032 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr1:110500310-110504760 
Target genes
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs12036565chr1110503963hg19
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:110500498-110500509ATAATTAATAT-6.02
HSF1MA0486.2chr1:110502314-110502327GAATATTCTGGAA-6.46
Lhx3MA0135.1chr1:110503960-110503973AACTAATTAATTA-6.22
Lhx3MA0135.1chr1:110503963-110503976TAATTAATTAACC+6.98
MEOX1MA0661.1chr1:110503953-110503963GCTAATTAAC+6.02
MyogMA0500.1chr1:110504244-110504255CTGCAGCTGTT-6.02
NR2F1MA0017.2chr1:110502767-110502780CTTTTGACCTTTG-6.87
Tcf12MA0521.1chr1:110504244-110504255CTGCAGCTGTT-6.62
mix-aMA0621.1chr1:110503961-110503972ACTAATTAATT-6.62
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
SE_32320chr1:110502294-110502773Gastric
SE_34099chr1:110500834-110504596HCC1954
SE_47194chr1:110500087-110506717Panc1
SE_50838chr1:110502272-110503454Sigmoid_Colon
SE_53269chr1:110502238-110503062Small_Intestine
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1110502317110503316
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I109958chr1110500903110504624
Enhancer Sequence
TCACATATTA AATATACTTA TTTTTGAAGA GTTCTTATTG AACATGCTTT CACCTAATGG 60
GTCTGAAGTT TACTAGGTCT CAGAAATGAT TTATGGGAGG AAAGTCACAA AATTGTAGAG 120
CTGGACTCTG TCCTGCACTA TTATCCACTC TATAGAAGAC AATAGTGGTC AAATAACAGA 180
GTTAAAACAT AATTAATATT TCATTTTGTA ATACTATGGC CAAAGTTTCA TCTCCTTCAT 240
TTCACCAAGA TGTTGCTAGT TGTGGAGACA TCGCCCAGTC CCGATGTATT GTTGTTTGAA 300
TTAAAGCTTC TTTCCCTGGA GAATGTTGTA AAATATAAAT GTAGTTTTAG ATGTGCTATT 360
TTTACTTGGC ATGGTCTGTG GGATAGCCTC AAAGGTATTT AAAATGCAAA AAAACAAAAA 420
CAAAAACAAA AACAAACAGT AAGACAGGAA TGAATAGGAA AAAGAAAAAA CATGTTTGAA 480
AGAAATTGGA CCTTCGAAAC AACACTTGCC CTAGAGAATT AACCATTTAT TTGTGCACCC 540
AACCCCCTCC CCCCCCCATT GATTTAACTT GTACATCCTT CTGGCATAAC CCCAAGACAA 600
TTTTAATGTC ATTTAATTAT TTATAGTCCA TCCCTCCTGG CCAGACGGAA GCAAGCCATG 660
CCTACATTTA ATTCCAGGGC TTAGCCTAGA GCCTGAAACA GAATAGTTGC TTAAAACACA 720
TTTCTGAAAT GAATGAAATA AAGAGTAGGT CAATGAATTA ACCCAAGTCC TTTGAAAGCT 780
TCTTCTGATG TCATCATTTC TTCCTCCAAC CCCACCTGGA CTCTGGGGTC CCACTGTGCC 840
CTTTTACCTA ATCACTGACT TCCTCACTTG CCCATTTATG TGTCTGTCTT CCCCATCAAA 900
GTGTGAACTC TGAAGATGAC TGCCTTAATC ATTTTTATAC CCCTAGCACC TGATATACAC 960
TATAAACATT TGTGGGGTGA ATAAATGAAT GAATTACAGT TACAGAGGCA AGCAATTAGA 1020
AAAGCTCTGA AAGTTGTTAA GGGGAAGCTA GAGTATCTGG TCTTTGCATC CAGAAAAACA 1080
GACTTCTCTT TCCAAAGGAG AAAATGTGGT TAAGTAGAAA GCCCATATGC TTTGGAGAGA 1140
GAAGGCCTGA GTTCTAATTC CAGCTCTTCC ACTTACTTTG GGCAAGTCAC TTATCTTATC 1200
TGAGCTTCAG TTTCCTGCAC TGTAAACTGG GAATAGGATT GGAGATAATG TTTGGAGGTG 1260
TCCACCACAG GCATGGGCAT GTAGTAGGCT ATAGCTGTGC TTGGCTATTA TTACTATTTA 1320
CACTTATCGT TATTAAGAGG TGTAGGAGGA ATACAGAGCA AAGAGAGCCG TTAAATTTAG 1380
AATTTAGGGT TGTGTGCGGT GGCTCATGCC TGTAATCCCA GCACTTTGGG AGACTGAGGC 1440
AGGTGGATCA CTTGAGGTCA GGAGTTGGAG ACCACCCTAG CCAACATGGT GAGACTCCGT 1500
CTCTACTAAA AATACAAAAA AAATTAGCAG GGCGTGGTGG TAGTCCCAGC TACTCGGGAG 1560
GCTAAGGCAG GAGAATCGCT TGTACCTGGG AGGCAAAGGT TGCAGTGAGC CGAGATGGTG 1620
CCACTGCACA CCAGCCTAGG CAACAGGAGA CTCTGTCAAA AAAAAAAAAA AAAATTAGAA 1680
TTTGGGTAGC TTTGGAGGAG ATAGTTTGGG TGTGGAACGG AGTGAGGGGG ACCTCTAGTC 1740
ATTGTCATGG TGATACTAAC CATCAAATAC TGAGCCTACA CTCCAAACAC ATCATTTCAT 1800
TAATCCTCAC AATAAATCCT AACGTCAGTG GTATCACCCC AATTGTCAAA AGGAGGAAAC 1860
CAAACCTCAG AAAACATTTT TGAGTTTCAA GGTCACAGAG CTAGTAAGTG GTTGAGCTGG 1920
GTTCAAACCC AAACTCATTT GATTTCAAAG CATGTGCTCC AATTTTAACT TTTATTATCT 1980
TATTCTGAAT AATCTGGGAG CTGAGAATAT TCTGGAAATA AAATCCAGGT TAGAGACCTG 2040
CCAAGAGCCT AGACAGTGAG TTAAGCTGGG CTAAGGCACT GAGTAAACTC AGAAATGTCT 2100
GTTTGTCATC TCCCTGTGCT TACTGCTCCT GTTGTTAAAG ATGTCTTAGC ATCTTAAACA 2160
ACTGAGCTTG TGCTGAACCA GTGAACTACA TTGGGTGTGG GAGCTGGTCC TTGGGGGAAA 2220
AAAATCTCTC CCTGCACCCA TATGTTTAGA AGCAGAAAGT TACCCGTGAT TTTAAGAAAG 2280
CTGCCTTTTA GGAGACTGCC CTGGGCCTGG CTTATCACAT GAATACAGAA TACTGGTTTG 2340
CATTTCACCA GCCTACATCA GATGTTTGTT TTAGCATACC ATACATTCTT AAAGCATGCG 2400
GGACAAGGAG ATGCACTCCA GGAAGGGCCC TTTCAAAGTT TCGACTGGCT GTAACCTCTT 2460
TTGACCTTTG CTCTAGTGCA CAGGCTCATC CTAGTCAAAG ACTTGTCTTC AGCATTACAA 2520
AATTTAGAAA CCAACTCTGA ATTCACATGC ATTGTTTGCC AATGTTTTTC AAGTCTTCTC 2580
ACTTCCAGCT GGATGGTCTT AAATGTACTC TGACCCACAC AGTTTCAGGC AAGTTGCAGA 2640
GCGCTTTGTA GGTATCCGAT AAGTATGCCC TGAATTGAGA GGCTAATTAA ACAAGAGGAA 2700
TTTAGCAATA TCACCTCTTG GCGTGAGTAT TATGTAGCAT CTGTAGTCGG GAGGGGTGGA 2760
GGGGTTGTAG AGCAGGGGTG ACTTCTTTAA AACCTCTCAG TTTGCATATA TGCCTCCCCT 2820
ACGAAAAGTC CTGCTGGTAA TAAACATAAT CTGCCCTGTG TGTTCCCACC ACAGGGGGGA 2880
CATATAGCAT GAATAAGAAC TGGCTTCCCT TAGAGAGCTT TTCCAAAGGA CACCATCTAT 2940
TTACTCAGCA AATATTTACT GAGCAAAATG GGAGGAGAAG GGCATTCTGG GGAGAGAGAA 3000
GAGTTTGAAC AAAGCTAAAA AGGAGGGAAA ACCAGGAGTA TGTATGGGAT ACACTGAATA 3060
GTCAAATTCA GGTGATAAAA TCTGAAAGGT AGGAGGGAAC TGATAAGTAG AGCTTTGAAT 3120
GCGTGGCAAG GAGTTTGGAC TTACTGAAAC AGGCAAAAGG GAGCCAAAGA AGATTTTGAG 3180
CAAGTGATAA ACATAATAAA AAATGCTTAT TAGGCAAGTT AATATGCCAG CAGTTCCTAA 3240
ATTGGACTGG GTTGAAGAAT AACAATATAA AGCAGCCAGC AATGATTGAG TAGTTACTAT 3300
GTACCCAGCA CCATGCCAAA CTCTTTGCAT ACATTTTCTC ATTTAATGAA AGTAATAATT 3360
AATGCATTTA AGACTCAGTG TCTGGCCCAT AATGTATTCC AACCCTCACA ATCATCCTGT 3420
AAATTGAGTA TTATTACCTC AGTTTTATAG GTGATGTCTA TATTGGTCTG TTTGCTATTG 3480
CTTATAACAG AATACCTGAA ACTGACTAAC TTCTAAAGAA GTTTATTTCT TACAGTGATG 3540
GAGGCTAAGA AGTCCCAGGC TGAGGGGCTG CATCTGGCGA GTCTTCTTGC TGGTAGGGAG 3600
TCCCCAGGTA GTTCGGGGCA CCCCATGGTG AGAGGCTGAG CAAGCTAATT AACTAATTAA 3660
TTAACCATTT AATCCATTAA TCCATGAATG AATTAATACA CAAATGAGGG CACTGTTCAC 3720
ATCAAATGTT TGAGAGTTTT TTTTGTTTTT TTTTTTTCTT TTTTCTGTGT CTAAAGGGTT 3780
TTTATTTAAG AGCCTGTAGT GCTGAGTTCC ACCAAGGATT TGGAAGGTCA CTCTCAGCAG 3840
CAGCCACTTC TGCCAGGACC AGTGGTGAGC ACCTGGCAGG GCCTTGCTGT TTCCACATAA 3900
GGCAAAGGAA TCCAGCTTTT CTGTAGGATT TTTGCTGCAG CTGTTCAAAA CCTTGTGTGA 3960
GCCAGCAGTT CCAGTTCAAA GGTTAAGAGG GCGCATAGCA CCTAGGTGGC CAGGTTCCTG 4020
TAAGTCACCA CTCAGGCCAT AAGTCACCAC GGAGGGGAGA GACAAAGCAG CCACAGCTGT 4080
TCTGTTTCCA GTCCCACCCC TCTGGCAAAC AGATGGGGGG AAATGGAGAA GAAAAGTTCA 4140
CAAAGTCGGT GAAATGGCCA GGCACGGTGG CTCACACCTG TAATCCCAGC ACTTTGGGAG 4200
GCCAAGGCAG GTGGATCACC GGAGGTCAGG AGTTTGAGAC CAGCCTGGCC AACATGATGA 4260
AACCCCATCT CTACTAAAAA TACAAAAATC AGCTAGGCAT AGTGGCAGCC TCCTGTAATC 4320
CCAGCCACTC GGGAGGCTGA GACAGGAGAA TCGCTTGAAC CCAGAGGTGG AGGTTGCAGT 4380
GAGCCAAGAT CACGCCACTG CACTCCAGCC TGGGCGACAG AGTAAGACCC CACCGAAAAA 4440
AAAAAAAAGT 4450