EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-00789 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr1:39862630-39866120 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MafbMA0117.2chr1:39863354-39863366AAAGTGCTGACT+6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:39863017-39863032GAGGTCAGAAGTTCA+6.38
Nr5a2MA0505.1chr1:39864021-39864036GCCGGCCTTGAACTC-6.01
PRDM1MA0508.2chr1:39863451-39863461TCACTTTCAC+6.02
RARAMA0729.1chr1:39863017-39863035GAGGTCAGAAGTTCAAGA+6.88
RUNX1MA0002.2chr1:39864323-39864334TTCTGTGGTTT+6.32
Number of super-enhancer constituents: 15             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00753chr1:39863212-39865727Adipose_Nuclei
SE_02098chr1:39862162-39863067Aorta
SE_02098chr1:39863552-39864939Aorta
SE_02863chr1:39863503-39865158Astrocytes
SE_26157chr1:39855144-39866292Duodenum_Smooth_Muscle
SE_30690chr1:39860149-39865801Fetal_Muscle
SE_37092chr1:39855581-39868937HSMMtube
SE_38617chr1:39862318-39865931HUVEC
SE_46332chr1:39860146-39866167Osteoblasts
SE_47389chr1:39856575-39867060Panc1
SE_55086chr1:39859150-39865239Stomach_Smooth_Muscle
SE_55918chr1:39856681-39866226u87
SE_64104chr1:39860136-39863063HSMM
SE_64104chr1:39863212-39866034HSMM
SE_67929chr1:39856681-39866226u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr13986336239865691
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I039391chr13985681239867008
Enhancer Sequence
GTTAATGGAA TACACTTACT CTCTAGGACG TCATAAACTA TTTTTCTACC ACCAGTCATG 60
TCATTTGAAA TATGGATCTT TGCTACACAT GGTGATGGTT CATGGATGGA GGTTAAAAGG 120
AAGTGATTCC ATATTCCTTT TAACCCATCC TTACTGGGCA GTTGCTCTGT GCTAGTCCTT 180
GTGGTGGGTA CTGGAGTCTC AGATAGTCTC TAGTTAACAG TGTACAGATG TGCCTTGACT 240
TACAGTGAAA TTATGTCTGG AAAAACCCAT CATAACTCGA AACTATTGTA AGTCAGAAAT 300
GCATTTAATG TACCTACTGA CAGCCGGGTA TGGTGGCTCA TGCCTGTCAT CTCAGCACTT 360
TGGGAGGCCG AGGTGGGTGG ATCACCTGAG GTCAGAAGTT CAAGACCAGC CTGGTCAACA 420
TGGTGAAACC CGGTCTCTAC TAAATATACA AAAATTAGCC GGGCGTGGTG GCGAGCGCCT 480
GTAATCCCAG CTACTCAGGA GGCTGAGGCA GGAGAATTGC TTGAACCCGG GAGGCAGAGG 540
TTGCAGTGAG CTGAGATCAT GCCATTGCGC TCCAGCCTGG GCAACGAGCG AAACTTCGTT 600
CCAAAAAAAA AAAAAAGTAG CTACTGACCA TCATAGCTCA GCTTAGCCTA CCTTAAACAT 660
ACTCAGACAC TTACATTAGC CTACAGTTAG GCAAAATCAT CTATCAGAAA GCCTATTTTA 720
TAATAAAGTG CTGACTCGCT CATGTAATTT ATTGAATATT GTACTGAAAT AGAGAAACTG 780
AATGATTGGG TACTTGAAGT ATGGTTTCTA CTGAATGCAT ATCACTTTCA CCATCATAAA 840
GTTGAAAAAT CTTCAGTTGA ACCATTGTTA AGTCAGAGAC CATCTATAGT AAGGGAAACA 900
GATACAGAGA ATTACAGTGG TACTGATGTA GTGGTAAATG CAGTAAGAAA GATCTGAGTC 960
TAAATGATCT CTGAAAAAAA CTCTAAATCA GACATTTAAA ATCCTATTTT GCAGATAAGA 1020
AAACTTAAGA CTTGAAGAGG TTAAAATAAC TTGTTCGAGC CACATAGCAA GTAAATATTA 1080
GAGTTGGGAT TGGGAAGGTC TGTTTGGCAC CAAAGTTTAT GCTACACCAG TGGTTGTCAA 1140
CCAAGCATAG CTTTGCAGAG ACTCCCACTC CCCGCCACTC CTTTTTTTTT TTTTTTTTTT 1200
AAACAGTTTC ACTCCCATCA CCCAGGCTAG AGTGCAGTGG CACAATCATG GCTCACTGCA 1260
GCCTCGACCT CCCAGTCTCA AGTGATCCTC CTGCCTCAGC CCCACAAGTA GCTGGAATTA 1320
CAGGTGCATG CTGCCATTCC TGGCTAATTT TTGTATTTTT TGTAGAGATA GAGTTTCACC 1380
ATGTTGCCAA GGCCGGCCTT GAACTCCTGA GCTCAAATGA TCTGCCTACC TCAGCCTCTC 1440
AGAGTGCTGG TATTACAGGA ATGAGCCACA GTGCCTGGCC CAGAGACATT TTTTATTGTT 1500
ATGACTGGAA AAGCTGCTAC TGGCATCTAG TAAGTGCTGC GAAACAACCT ACAATACACA 1560
GGATGACGGC CCCTTACAAT GAAAGAATTA TTCAGCTTAC TTCTAGAAAG CTAGGGAATT 1620
TGATTTTTGC CATCTTCAGA TCCCATGACA AGTAAGAGTT AACTGATTAA ATAGTTCCAC 1680
TCGCTGGGGG TGCTTCTGTG GTTTTCCTCT CCTTTTAAGA AAATTAGTTA AGAAATAGTG 1740
TTGCTTCCGG GAGTGACTTA CACAGATAGA GTCAGGATCT TGGGGAACTA ATCTGAGTCA 1800
GCGACTGAAG AATTTTCTCT ATGCCTGACC AGTCCCCACC CCACACTGCC ACAAGGCTCC 1860
TGCTGTGGAA ATCAATCAGC TGTGTATCTC AGGCTGCTTC CTGTAGGGTG TGTTATGGAA 1920
TGGCATCAGC CCTTGCACCA GCTGGGAGTA CTGATCTCAG TGTGATTTTA TCAGACTATG 1980
TTTCTTTTGA GCCTTACTGT TTGGAACAAA GGACCCTCTG TTAAGAATGC AGAGAGCTGG 2040
TGTGATTGGA TAGCTAGCAT ATACATACAT GGTTCCTATG GGAAAAAAAC AGACATAAAT 2100
TATGCTATAG CCCTCTAAAA TTTTCATCTC CAAAATGATT TCCTGACCTT CTGTCTGTAT 2160
TCACAGTTCT TTCTGTAAGT GCTTATCCTT CCCCCAAAGC AATTCGAAGG CCATCTGATC 2220
TGATAAATGG TTGTATCCTT CAGAACTAGC CTATTTCTGT GTCTCCAGTC TTGGATGTAT 2280
TTGATCCCCA CTATCTTTCC AGTGTTATTT CCTATATAGA CCATACACTA CATCCAGTTA 2340
CCCCAGACAC TCCTTATACA TTTTAGGTAT TTGATTTCTG AAGTCATAGC TCAAGTCCAC 2400
TTCTTTATAA AGCTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTGAGATG GATTCTGGCT CTGTCACCCA 2460
GGCTGGAGTG CAGTGGTGCG ATCTCGGCTC ACTGCAATTT CTGACTCCCA GGTTCAAGCG 2520
ATTCTCTTGC CTCAGCCTCC CAAGTATCTG GGATTACAGG CACGCACCAT CTTGCCTGGC 2580
TAATTTTTTT GTATTTTTAG TAGAGACAGG GTTTCGCCAC GTTGGCCAGG CTGGTCTCGA 2640
ACTCCTGACC TCAGGTGATC CACCCACCTC GGCCTCCCAA AGTGCTGGGA TTATAGGCGT 2700
GAGCCACCAT GCCCGGCCTT ATAAAGGCTT TTGATCTCCC CAGCTCACTA CTCCTGATCT 2760
CTTAATCATT TACAATGTAT AACTCACTTG GCTTTTATCA CATACCACCT AATTTTGACA 2820
TTTTCTGATT ATATCCATTT GTCCTATCCC CTCAGTTAAT TCACTTTTGT GTCCCTTAAT 2880
GTAGTTAGCA TATTGGTATA TACACAGTTG GAGATGAGAC AATATTTGAC TGACTGGATG 2940
AACATTCTTT ATTTCTCATA AGCCATGTGA GCTCTAGGAT TCAAAATGCT ATCTACTCTG 3000
CAAGACTTGA GGTATATATC CTTGTGTGTC CTGAAGAAAT TCTAATCTTA GCCTGATTTC 3060
CTCAGTTCTC CATCTTTCTT CTGGGCTTCC TTCCTTCTCT GCTAGTTAGT ATATGTTAAG 3120
GGAACACAAT CTTTTTTCAG TATAAGAGGG CAAAACTAAG AAAGAAATGT GCTACTTCTT 3180
ATGCACAGAG TCATTGCTAC TTACTCAATT AGTTGACAGT TTGGTGTAGT GAAAAAAACT 3240
GAATACAAGT TCTAGTCAGA AGTATCCAGG TTTGAATCCT GGCTCTATCA TTTACTAGCT 3300
GAGTGACCTT CAGGGAAATT ACTTAACCTC TCTGAATCTT ACTTACTTTA ACTGTAAAAT 3360
ACAAATATTG GTAAATCATA CCTTTAGGAT TTTTATGAAA ATTAAATGAA GTGATATATC 3420
TAAAAGTATT AGGCTTATAT TTGGTGCTCA GCTCACTAGA TGATAATATG CTTTTTTTTA 3480
AAAAGAAGCT 3490