EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-00780 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr1:39604950-39611790 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:39608709-39608721AAACAAACATTT-6.27
MEF2AMA0052.3chr1:39610068-39610080TTTATTTTTAGC-6.04
MEF2AMA0052.3chr1:39611648-39611660ACTAAAAATAGA+6.27
MEF2BMA0660.1chr1:39611648-39611660ACTAAAAATAGA+6.32
MEF2CMA0497.1chr1:39610067-39610082TTTTATTTTTAGCAA-6.33
RORA(var.2)MA0072.1chr1:39608627-39608641CTGACCTACTTTTC-6.66
TBXTMA0009.2chr1:39607083-39607099TAGCATATAGGTGTTA+6.01
TBXTMA0009.2chr1:39607083-39607099TAGCATATAGGTGTTA-6.07
Number of super-enhancer constituents: 18             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00416chr1:39607432-39609721Adipose_Nuclei
SE_02052chr1:39608108-39608826Aorta
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SE_25799chr1:39610422-39611638Duodenum_Smooth_Muscle
SE_32006chr1:39608179-39608893Gastric
SE_35822chr1:39605780-39609757HMEC
SE_35822chr1:39610429-39611513HMEC
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SE_42256chr1:39607415-39608945Lung
SE_42256chr1:39608965-39609690Lung
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SE_45768chr1:39610432-39611851Osteoblasts
SE_47164chr1:39606982-39608398Panc1
SE_51765chr1:39606612-39609191Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_54583chr1:39606659-39609601Stomach_Smooth_Muscle
SE_63563chr1:39606612-39609205HSMM
SE_64261chr1:39605649-39609602NHEK
SE_64261chr1:39609893-39612003NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr13960951339609564
chr13960680039608800
chr13960926939609360
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH01I039139chr13960551239609683
GH01I039146chr13961067239610873
GH01I039145chr13961116639611527
Enhancer Sequence
AAAATGTTAT CTGCCACTGT TTTTTTTTTT TTTCAGACAG TCTCGCTCTG TCGCTGCAAC 60
CTCTGCCTTC CAGGTTCAAG CGATTCTCCT GCCTCAGCAT CCCAAGTAAC TGGGATTACA 120
GGTGTCCCCT ACCACGTCCA GCTAATTTTT GTATTTTTAG TAGAGATGGG GTTTCACCAT 180
GTTGGCCAGG CTGGTCTCAA ATTCCTGACC TCAAGTGATC CTCCCATCTC AGCCTCCCAA 240
ATTTGCCACT ATTCTTTATA TTCCAGCTAA AATGAACTAG TGCTTTCTGC TTTTTTTTTT 300
CCTAGCTTTC CTGCTTTCAT GCCTTTGCTC ATGCTGTATC CTGTGCCTGC ATTTTCCTTT 360
AATTTCTACA TTATATTTGG TCCTTACATA TCCATCTCAA ATGTTACTTT TTGTGGATCC 420
TTCCCTGATT ATCTCAGATA CAAGTTATAT CATCTTTCTG AACTGACATA ATATTATTGA 480
AAGAAATACA CTTAAAAGTA ATAGTAATAA CTGACAACAT TCAGAGTCTG TTACAAAATG 540
TTTTCACATG TATTAGCTCA TTGGAACCTC ACAGATGTTT TTCATCACTC CTGTTTTACA 600
GCTGAGGAAA TTAAGGCTTA AGGAGATTAA GTAACTTGCC TGAGGTTACC CATAATTAGA 660
ACTAAATCTT TTTTTTTTTT TTTAATTTTT TTTAGAGACA AGGTCTTGGC TGTTGCACAG 720
GCTGCAGTGC AGTGGTGTAA ACATGGCTCA CAGCAGCCTC AAACTCCTGG GCTCAAGAGA 780
TTGTCCCACT CCAGCCTCCT GAGTAGCTAG GACTATAGGT GTATGCCACT ACACCCAGCT 840
AAATTTTTGT GTTTTTTGTA GAGATGGGGT CTCACTGTGT TGCCCAGGCT GGTCTTGAAC 900
TCCTGACCTG AAATGATCCT TCTGCGTTAG TCCTCCAAAG TGCTGGGATT ACGGGCATGA 960
GCCATCATAC CTAGCATAAA TCTAAATCTT ATGACCTCAA ATCCCATGTT TTTTCCACCA 1020
AACAGTGCTA TCTTACGATT CTTATCACTT GCTACTATGG GTTAGAATTA CTTGTGTAAA 1080
TGTCACATCT GGCCTACTAC TTTGTACTGT CCTTAGATGA AGAGTTAATG CCTTATTCTT 1140
TGTCTCTGAC ATCCCATAGC ACAGAGTATT GCGTATAATA AGGCTTCAAT AACCATTGCT 1200
GAAAGGCTGA CAAGTTGAAG AAATGTTGAT GAATGCATGT GTCTAGCACA GTGCCTCGCA 1260
CATAGATGCC TAATAAACAT TTATTGAATT TAATTGTAAA ATGGATCAAA GACCATAGTT 1320
AATAAGAGCT TATAGGGCAC TTAATAAGTG CCGGGCAACT GGGCACGGTG GCTCACGCCT 1380
GTGATCCCTG CACTTTGGGA GGCTGAGGCA GGCGGATCAC GAGGTCAGGA GATCAAGACT 1440
ATCCTGGCCA ACATGGTGAA ACCCCGTCTC TACTAAAAAT ACGAAAATTA GCAGGGCTTG 1500
GTGGCACACG TCTGTAATCC CAGCTACTTG GGAGGCTGAA GCAGGAGAAT CTCTTGAACC 1560
CAGGAGGCGG AGGTTGCAGT GAGCCGAGAT TGCACCACTG CACTCCAGCC TGGGTGACAG 1620
AGTGAGACTC TGTCTCAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAGTGCC AGTCACTGTT 1680
ATAAATGCTT TATGTCAAAT TAACTAATTT AATCCTTAGA ACCTATCTCC ATTTTACACT 1740
GGAGTAAACT GAAGAACAGG AGGGCATAGT GATTTGCCCA GGGACACACA GCTGTTAAGC 1800
AGCAGAGTTA GGTTTCACAA TTTGCTCTAG AATTCTCATG TACTCAAACA TTATGCTATA 1860
ATCAGTTGTT CATAATATTT TCACGCTGTT AAATTCCTCC TGAATGCCTG TCTGTCTTGG 1920
GTGTAGCTCA AAGAATGAAA AGCAGAAGCA GCATAACTTG TTGAATATAC TCTTGAGCCT 1980
GCGTCAGAAT CACCTGCAGG GCATGTTAAA ACACAGATTG CTGGGTCCCA TCCTCAGTTC 2040
TGATTCAGTA GGTCTGGGGT GGGGCTTGAG AAATTATATT TCTAACAAGT TCCCAGGAGA 2100
TGCTGATGCT GCTGGTCTGG GGACCACTTG GTGTAGCATA TAGGTGTTAA GAGCATGGAC 2160
TCAAGCTGCT GAGGTTTGAA TCTCAGCTCT GCCATTTATT AACTGAACTT GGGCAAGTTC 2220
TTGAACCTTT CTGTGCTTCA GTTCTCATCT GTAAAGTGTT TTACTGTTAC CACATATATC 2280
ATAGGATTCT GACGGAGATT GAATGAAATA ACATGTAAAG TGCTTAAAAT GGTGCTTGGT 2340
TTGTAGTAAG CATGCAGTCT TAGCTACAGT AATGGGGATA GGACATGTTT CTTGCCTTGT 2400
AGATTTTAGA GTCTAGTTAT TAGACTTAAA TCTAATAATT TTAAAAAGTA CAAATTCAGG 2460
TATTAGTTTA CATGGTTCTG ATTCTACCTT AGATTTGGAA AGATGAAATG CGTGTATCTT 2520
GGGGGATATG GTGGGTAGTG GGAGACCAGG AGGAGGAAAG GTACATGAAA CTAGAAGATA 2580
ATGGAAAGTT ATATAGTCAG AATTTAGAAA GGTTGGAATT GCCAGTGGTT TTGGTATTAT 2640
TACCTGAGAA CTTGAGGGAG ATAGAGGAAG GTGCCTGTGC TCTCTGTTTG CCAAAGAGAT 2700
AACTGACTCC TTTTCCCATT TCTCTTTCTT AGAGCTGGTA TCTGGTCTGC AGGCAGTTCC 2760
GGCAGCATTT GCTTTTTGTG GGGAACAGTG GCTAAGGAAG TGATTTGCTA CTGGCTTCAG 2820
AAGTTGGGCT CTGCTGCCTT TATCCTCCAC AGCTGCCTCA CATAGTTTTG ATTCTTCCTG 2880
AGAAAGGCAG TTGTTAGGTT TGGAAGTCTT CAGATTCCAG AGACAGCTGG ACAGCTGACC 2940
CTCTGGTAGC TATTTCCCAA ACTGCCAGCC TCCTGTTGCC TCATCTCCCT GGGCCCCTTC 3000
TTTTTTGCTT TGAAGCAATA TCCTATATTT AGTGAACTAA CCAATTTGAG GTTAGAGGAA 3060
ATTTGATGGG GGAGTCTCTC CCACCTTAAA ATCCTGGATG GATGGAGTAT TTGGGCCCAG 3120
GAACAAGATG TATCCTGTTA AAAAAAATTT AACACCTTCA TCAAGTATAC TCCAAATGAC 3180
AGCTTACAGT GCTATGAATG TACCTCTAGC TCATGGGTAA GGAGCAGTGT TTATTTTTGG 3240
GTGCCCTGAA GAAAATATTT GGGGGAAGGA GTGGGGAGAA GCTCAGGCAG CTCCATTTAT 3300
GGTTGAGCAA TGCTTGGTAT TCTACAGAAG GGACCATATG GACAGTGGAA GAGAGTTTAG 3360
CATTCTGATT GTTCACCTCT TGCTCCTTCC ATTCTGATGG CTAATTAGGG ACACCTCATT 3420
AGCTATCAGA GTGGAACAAG TATTTGCCAG GCTGACATGA GCCTCAGCCC TGCATCCTGC 3480
ATCTTCTGCT TTCCCAACCT GCTGAGTCAC CACCTAGGAA TGGCAGTAGC CAGGTTACCA 3540
CCTGGAGCAC CTGGAGCACT CTTGGCATAA TGCACTGTTG ACTGGTTTTG GTCTCCTAGA 3600
CACAGCTTGG GCCTCTCCAA GCCTGTTGGA GTGATAGGCT GGGTCTTAGC TCTCCTTCCA 3660
GCTTGTTCCA CAAGGCGCTG ACCTACTTTT CAGGGACAAT TAAGTGTTTG TGAGCAAAGG 3720
AAGGCGGTGA CCCGAGTGAA GGTGAACCAG AGCTGCATTA AACAAACATT TGGAGTCACT 3780
TTTTCTATCT TACACAGGAG GGCCCATCTC AGTCCAAATG GAATGGCAGA TCAGGCTGAT 3840
TGTGGTAGCC ACATTCTAGA TGCTTATCAA GATAGTCAAC TAACCCTTGA ATTTTTATTC 3900
TTTCTATCAA TGTACCTTAA TATCAGAAGT TACTTTTCAT AATCATTGTA CCCCTTGTCT 3960
GTGGGCTATA CGAAAAGATT TGGAAGCAAG TTGGGGCTCT TAGAGTGAAT TATTGATACA 4020
AGCTAGCTTT TGATATACCT TTTGGTGTAT CAAAGATACA CTTTCTGGTG GCAATGTCTG 4080
GTTCATTTGT AACATCTTGG AGAGGATTGG AATCTCTTTT CCTTTTTGTA TCAGGCCAGG 4140
ATAATAGGAT AGAGGAGAGG CCAGATCTGT AGAGAATGAG CAAGTGGCTT GTTTAGGGTT 4200
TCCTGCCCTT GTGAGGTAAG GGCTCAAGGA TTAGATTCAG TCTTTCCATT TGCAGTGAAA 4260
GGAAGTAAAC TCACTTTCCC ACCCTCATCC TGGAGGTTAC TTATGTTATT TGCAGACCCC 4320
AACTTCTGCC TCTCTGTTAA GTATACTTCT TATGCAGGTT GCCCTTACTG TTACATCTTA 4380
CCACTGGGGG AAAGATCCAA GGCTCTGGGA AGGACAGTGA CAGTTGTCCT ACATTGGCTA 4440
GTTTCAAGAC CCTGAGGGAA TTGCCAAGCC AGCAATTAGG CAATTTCTTT TTCTTTTCTT 4500
TTCTTTCCTT TTTTGAGATG GAGTCTTGCT CTGTCGCCCA GGCTGGAGTG CAGTGGCGCG 4560
ATCTTCACTC ACTGCAAGCT CCGCCTCCTG GGTTCACACC ATTCTCCTGC CTCAGCCTCC 4620
TGCCTCAGCC TCTGGAGTAG CTGGGACTAC AGGCACCAGC CACCATGCCT AGCTAATTTT 4680
TTTTCATTTT TAGTAGAGAT GGGCTTTCAC TGTGTTAGCC AGGATGATCT TGATCTCCTG 4740
ACCTCGTGAT CCGCCCGCCT CGGCCACCAA GGTGCTGGGA TTACAGGTGT GAGCCACGGC 4800
GCTTTTTTTT TTTTTTTTTT GAGACGGAGT CTTGCTCTGT TGCCTAGGCT GGAGTGCAAT 4860
GGCACGATCT CGGCTCACTG CAACTTCCGC CTCCCAGGTT CAAGCGATTC TCCTGCCTCA 4920
GCCTCCCAAG TAGTTGGGAT TACAGGTGCC TGCCACCACC CCCAGCTAAT TTTTGTATTT 4980
TTAGGAGAAG CGGGGTTTCA CCATGTTGGC CAGGCTGGTC CCGAACTCCT GACCTCAGGT 5040
GATCCACCTG CCTCGGCCTC CCAAAGTGCT GGGATTATAG GGGTAAGCCA CCGCCCCCAG 5100
CTGGAAATTT CTTAAACTTT TATTTTTAGC AACTCCATAT TCATGAGAAC TCTCATAATC 5160
TTCTAGTCAG TAAAAAGAAA AGTTATTGAA GTTATTGATA CTGCACCCAG AGATCCAGAT 5220
CAAATCTTAA GGAAGGAAGA AGCTTAGAGG AGAACTTCAC CCTGCCACTC TCTCATTGGA 5280
ATTCCCTTCT AACAACGTGT GAGGTGTCAG CCCCATTTGA AGAACTAGTT TATATATCAG 5340
AGCATGGCCT GGAAATCAGC GTGGCATCAA TTTTGGTCTT TTTTTTTTTT CAAATAGAGA 5400
CAAGGTCTCA CTATGTTGCC CAGGCTGGTC TCAAACTCCT GGGCTTAAAT GATCCTCTCT 5460
CCTTGGCCAC CCAAAGTGCT GGGATTACAG GTGTGAACCA CTGTGCCTCA CCAGTTTTGG 5520
TCTTACAGAT GACTAAGTTT TTTGGGGGAG GGTATTTTAG GTGACGTGCA ATTGCTCCAT 5580
TCCTCCTAGA CATCCCAGAA TCTGGTCACA ACCTCCTTTT TTCCACTTAT CCTTTCCTTT 5640
ATGCACATTA AACCTGTTCT CTGCTGTTTC CCAGTCTGTC AGCCCCTTTA TGGTGTCAGT 5700
GCTTCCTGAC CTATCATGTA CAATAGGGCT CGTACTGGCA TTCTCAGATC TCTTTTTTTT 5760
CTTCCACGCC TTTTCTATCC CCAGTGCTGG ACCTGTGTTC ATTTTCTCCA CTGAGCTACT 5820
GAGTGCCACT GCATAACAGT GTGCTGACTG ACTCTATTAC AGATTTATGA GCTCTAGCCA 5880
CAGCCTGGCT CTCAATCCTA TCCTGAAACC TTTTTATTCT CTTCTGGTTG ACTGCCATTC 5940
ATTTTTTTCT GCAGCAGCCA TTCCAGTCTT TCACCATTCT CTTCAAACTT GTTGCTCCAC 6000
CCCACCTTAT AAACTCTCAA TAAGTAATTT AGTCTTTTAC GTCTCAATTT ATCTGTAGGC 6060
TTTACCAGTC CTTACCACAT TCCCTCCTAT TTCAGAGGCA GGTCTCTGGG CATATACATA 6120
TATATTTTGT GTTCTTAGTT CCTCCCTTCC TAGTGACTCT TTGTAAAGAT ATTCAGGTTT 6180
TCTCCATCCT AAGATAAAAA TTCCTTTAAG CTTATCTCTT CTTCAGACTA ACTCTCTGTG 6240
CTTTTTTTTT CTTTACCACC AAACTACCTC AACAGCCTTT CTTCTACTTC TTTAGTCATC 6300
GTGAGCCACT ATAGCCAAGG TTTGTGCCCA CCATCCCAAT GAAAGGCTCT TGTTTGTGAT 6360
GACTTGCTTG CAGAACTCAG CAGCCTCTTT TTGTTCTCAC GCTGTTTCAT CTTGTCACAG 6420
CATCTGACAC CATTTGGACC TCTTTCCTTC CCTGACTGTG TGCTATCTCT GGATGAGTTG 6480
ACCTACTCTG GTGATTTCAT TTAGGAATTT CATCTGTGTG TACAGTGATG ACTCTCTTGT 6540
CAGAATCTGT AACTACCTAT TGTATGAGCT TTTCCCCCAG GTCCAAACTT GTATTTCCAA 6600
ATGACTACTC TCCTTTTCCA CTTTGTAGCC TACAGAAATT TGCATGTAAT GTATCCAAAA 6660
TTCAGCTTAT ACAACCACTA TGGAGAATGG TTTGGAGAAC TAAAAATAGA GCTACCATAC 6720
AGTCCAGTAA CCCCACTCCT TAGGTTTATA CCCAAAAGAA AGGAAATCAG TATATTGAAG 6780
AGCTATCTGG ACTCACATGT TTATTACAGC ACTGTTCACA ATAGCCAAGA TTTGGAAGCC 6840